43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_7265 on replicon NC_011981
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011981  Avi_7265  Ethanolamine kinase  100 
 
 
311 aa  648    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.664683  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2597  putative ethanolamine kinase  75.32 
 
 
307 aa  461  1e-129  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.852231 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4005  Choline/ethanolamine kinase  74.28 
 
 
311 aa  460  9.999999999999999e-129  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.354936  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4045  Choline/ethanolamine kinase  73.95 
 
 
311 aa  459  9.999999999999999e-129  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.264948 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3750  choline/ethanolamine kinase  73.63 
 
 
311 aa  456  1e-127  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.375489 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3054  choline/ethanolamine kinase:aminoglycoside phosphotransferase  53.07 
 
 
311 aa  341  7e-93  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.125609  normal  0.246659 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3188  choline/ethanolamine kinase  53.07 
 
 
311 aa  340  2e-92  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0045  Choline/ethanolamine kinase  48.88 
 
 
313 aa  305  5.0000000000000004e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0106  choline/ethanolamine kinase  49.84 
 
 
314 aa  301  7.000000000000001e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0648967 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1457  putative choline kinase  49.84 
 
 
314 aa  301  7.000000000000001e-81  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2590  choline/ethanolamine kinase  28.47 
 
 
305 aa  110  3e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0594  choline/ethanolamine kinase family protein  27.82 
 
 
622 aa  105  1e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0311348  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0608  MarR family transcriptional regulator  27.44 
 
 
622 aa  104  2e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2289  aminoglycoside phosphotransferase  26.62 
 
 
307 aa  103  4e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.190277 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1363  hypothetical protein  25.56 
 
 
383 aa  100  3e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0105  aminoglycoside phosphotransferase  28.06 
 
 
314 aa  96.7  5e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0176137 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7266  aminoglycoside phosphotransferase  23.46 
 
 
321 aa  95.9  9e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.105045  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1359  hypothetical protein  24.22 
 
 
383 aa  94.7  2e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1456  hypothetical protein  28.46 
 
 
314 aa  90.9  3e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2596  hypothetical protein  23.36 
 
 
321 aa  84  0.000000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.647212 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3288  choline/ethanolamine kinase  25.47 
 
 
304 aa  80.5  0.00000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0044  aminoglycoside phosphotransferase  25.17 
 
 
316 aa  79.3  0.00000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3751  aminoglycoside phosphotransferase  25.15 
 
 
326 aa  77  0.0000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.154507 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4046  aminoglycoside phosphotransferase  24.85 
 
 
326 aa  75.9  0.0000000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.411074  normal  0.268471 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3189  hypothetical protein  24.47 
 
 
317 aa  73.2  0.000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.854112  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3055  aminoglycoside phosphotransferase  24.86 
 
 
317 aa  73.2  0.000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.214453  normal  0.616074 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4006  aminoglycoside phosphotransferase  24.19 
 
 
326 aa  72.4  0.000000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0797  choline kinase involved in LPS biosynthesis- like protein  24.24 
 
 
324 aa  70.1  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.26463  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2027  aminoglycoside phosphotransferase  24.09 
 
 
589 aa  68.9  0.0000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.32446  hitchhiker  0.00000463346 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1260  cholinephosphate cytidylyltransferase/choline kinase  23.68 
 
 
522 aa  60.5  0.00000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00193493  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4349  Choline/ethanolamine kinase  25.74 
 
 
291 aa  55.1  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000124909 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42574  predicted protein  24.04 
 
 
421 aa  53.9  0.000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.202848  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05790  CTP:phosphocholine cytidylyltransferase  25.26 
 
 
611 aa  53.9  0.000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0000926703  hitchhiker  0.00200733 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10156  ethanolamine kinase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G11550)  22.35 
 
 
413 aa  52.8  0.000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.348276  normal  0.68664 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4020  Choline/ethanolamine kinase  24.63 
 
 
291 aa  52.4  0.000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14740  CTP:phosphocholine cytidylyltransferase  26.86 
 
 
590 aa  50.1  0.00004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000102014 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1461  LicA protein  22.36 
 
 
267 aa  50.1  0.00005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1003  transcriptional regulator, MarR family  24.6 
 
 
596 aa  50.1  0.00005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08320  CTP:phosphocholine cytidylyltransferase  23.7 
 
 
592 aa  46.6  0.0006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.212122 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2795  thiamine kinase  28.65 
 
 
297 aa  45.4  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4016  hypothetical protein  24.57 
 
 
255 aa  44.7  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_59919  ethanolamine kinase  19.51 
 
 
526 aa  44.7  0.002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.671475  normal  0.729563 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2431  Choline/ethanolamine kinase  21.4 
 
 
595 aa  44.3  0.003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>