More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_2009 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_2009  glycosyl transferase  100 
 
 		 810 aa  1674    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2921  glycosyl transferase family protein  40.76 
 
 		 880 aa  598  1e-170  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1492  glycosyl transferase family 2  39.81 
 
 		 958 aa  398  1e-109  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0852  glycosyl transferase family protein  37.52 
 
 		 765 aa  396  1e-108  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1503  glycosyl transferase family 2  39.32 
 
 		 733 aa  388  1e-106  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00968  putative glycosyltransferase family 2 protein  39.2 
 
 		 731 aa  383  1e-105  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0933  glycosyl transferase family 2  39.18 
 
 		 1152 aa  373  1e-102  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0906  glycosyl transferase family 2  39.12 
 
 		 1152 aa  372  1e-101  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3926  glycosyl transferase family protein  37.18 
 
 		 1509 aa  367  1e-100  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.554209  normal  0.869546 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1840  glycosyl transferase family 2  38.69 
 
 		 710 aa  365  1e-99  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0202284  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2225  glycosyl transferase family 2  38.46 
 
 		 717 aa  365  2e-99  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.432582 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2296  glycosyl transferase family protein  36.41 
 
 		 632 aa  362  2e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.870587  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1949  glycosyl transferase family protein  38.65 
 
 		 717 aa  359  9e-98  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.603088  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3973  glycosyl transferase family protein  33.01 
 
 		 1275 aa  359  9.999999999999999e-98  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1948  glycosyl transferase family 2  38.16 
 
 		 721 aa  352  1e-95  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0883  glycosyl transferase family 2  35.86 
 
 		 723 aa  349  1e-94  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0396  glycosyl transferase family protein  35.02 
 
 		 625 aa  349  1e-94  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0878  glycosyl transferase family protein  35.02 
 
 		 625 aa  349  1e-94  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0288  glycosyl transferase family protein  37 
 
 		 709 aa  348  3e-94  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0772  glycosyl transferase family protein  37 
 
 		 709 aa  348  3e-94  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1576  glycosyl transferase family 2  37.9 
 
 		 746 aa  345  1e-93  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0849  glycosyl transferase family protein  35.5 
 
 		 625 aa  343  5e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.33844 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1253  glycosyl transferase family 2  36.52 
 
 		 1067 aa  340  5.9999999999999996e-92  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1729  glycosyl transferase family protein  37.59 
 
 		 728 aa  340  8e-92  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.95068 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2408  glycosyl transferase family 2  35.24 
 
 		 1334 aa  339  1.9999999999999998e-91  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0315  glycosyl transferase family protein  38.52 
 
 		 775 aa  338  2.9999999999999997e-91  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.177291 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2042  glycosyl transferase family 2  36.43 
 
 		 832 aa  331  4e-89  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.635088  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2052  glycosyl transferase family 2  36.46 
 
 		 794 aa  328  3e-88  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.039975  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1360  glycosyl transferase, group 1  33.33 
 
 		 1991 aa  327  7e-88  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.976549  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1074  glycosyl transferase, group 2 family protein  36.36 
 
 		 1561 aa  324  4e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.755532  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0725  glycosyl transferase family protein  34.69 
 
 		 734 aa  324  4e-87  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.492928  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2999  glycosyl transferase family 2  36.11 
 
 		 988 aa  322  9.999999999999999e-87  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0192  glycosyl transferase family protein  36.14 
 
 		 996 aa  315  2.9999999999999996e-84  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1525  glycosyl transferase family 2  35.98 
 
 		 857 aa  306  8.000000000000001e-82  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15980  Glycosyl transferase, family 2  34.03 
 
 		 1182 aa  306  9.000000000000001e-82  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.967945  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4777  glycosyl transferase family 2  33.52 
 
 		 742 aa  303  9e-81  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4260  glycosyl transferase family protein  31.58 
 
 		 742 aa  300  8e-80  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.109167  normal  0.249298 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4626  glycosyl transferase family 2  31.83 
 
 		 742 aa  297  6e-79  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.18553  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1815  glycosyl transferase family 2  28.68 
 
 		 958 aa  294  6e-78  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.613695  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2707  glycosyl transferase family protein  32.57 
 
 		 1486 aa  283  7.000000000000001e-75  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.228337 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0236  hypothetical protein  33.28 
 
 		 783 aa  282  2e-74  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00000717832  normal  0.75423 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1971  glycosyl transferase family 2  33.88 
 
 		 1084 aa  281  3e-74  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0354  glycosyl transferase family protein  32.45 
 
 		 658 aa  280  8e-74  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4005  glycosyl transferase family 2  33.77 
 
 		 790 aa  272  2e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.318857  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0542  glycosyl transferase family protein  32.39 
 
 		 983 aa  268  2e-70  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.211097  normal  0.295918 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1479  methyltransferase type 11  31.13 
 
 		 2046 aa  251  3e-65  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.604446 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0767  glycosyl transferase family 2  32.89 
 
 		 602 aa  231  4e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4407  glycosyl transferase family protein  32.75 
 
 		 1359 aa  229  1e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1841  glycosyl transferase family 2  31.74 
 
 		 652 aa  228  4e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.333459  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1792  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.37 
 
 		 809 aa  226  2e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0102114 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0589  glycosyl transferase family protein  30.74 
 
 		 684 aa  226  2e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.271762  normal  0.0559054 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4883  glycosyl transferase family protein  31.05 
 
 		 653 aa  225  3e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.830469  normal  0.0228705 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0620  glycosyl transferase, group 2 family protein  35.92 
 
 		 610 aa  221  3.9999999999999997e-56  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1401  glycosyl transferase family protein  32.77 
 
 		 808 aa  221  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0564  glycosyl transferase family 2  30.34 
 
 		 670 aa  219  1e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.501276 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0775  glycosyl transferase family 2  30.95 
 
 		 617 aa  219  1e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0929  glycosyl transferase family protein  33.09 
 
 		 796 aa  211  4e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.283533 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0729  glycosyl transferase family protein  28.15 
 
 		 586 aa  206  1e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.155064  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2613  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 		 556 aa  204  4e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0769  glycosyl transferase family 2  28.86 
 
 		 732 aa  204  5e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.034944 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0600  glycosyl transferase family 2  30.93 
 
 		 684 aa  203  8e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.149205 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2836  glycosyl transferase family protein  33.67 
 
 		 1759 aa  203  9.999999999999999e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0244809 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1495  glycosyltransferase protein  29.73 
 
 		 632 aa  202  9.999999999999999e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.403758  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2719  glycosyl transferase family 2  31.17 
 
 		 662 aa  203  9.999999999999999e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0845  glycosyl transferase family protein  28.36 
 
 		 725 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  decreased coverage  0.00935412  normal  0.295818 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3207  glycosyl transferase family protein  31.19 
 
 		 576 aa  199  2.0000000000000003e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3489  glycosyl transferase family protein  30.24 
 
 		 635 aa  197  9e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.473052  normal  0.0475235 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1062  glycosyl transferase family protein  30.55 
 
 		 783 aa  196  2e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0804  glycosyl transferase family 2  28.36 
 
 		 725 aa  194  4e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.16838 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3720  glycosyl transferase family protein  25.61 
 
 		 1193 aa  191  4e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0402  methyltransferase FkbM  27.36 
 
 		 1644 aa  191  4e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0882  FkbM family methyltransferase  27.36 
 
 		 1644 aa  191  5e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1508  glycosyl transferase family protein  29.84 
 
 		 1198 aa  190  1e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1842  glycosyl transferase family 2  29.13 
 
 		 531 aa  189  1e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3223  glycosyl transferase family protein  30.38 
 
 		 729 aa  188  3e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3488  glycosyl transferase family protein  34.87 
 
 		 539 aa  188  4e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0396544 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4882  glycosyl transferase family protein  31.55 
 
 		 526 aa  187  7e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.763618  normal  0.0207356 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0563  glycosyl transferase family 2  35.45 
 
 		 555 aa  184  6e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.158623 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0548  glycosyl transferase family protein  31.83 
 
 		 784 aa  182  2e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0588  glycosyl transferase family protein  35.32 
 
 		 551 aa  182  2e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.231059  normal  0.109318 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6327  glycosyl transferase family 2  30.28 
 
 		 872 aa  182  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2886  glycosyl transferase family 2  27.08 
 
 		 1213 aa  176  1.9999999999999998e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.242978  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0599  glycosyl transferase family 2  30.68 
 
 		 551 aa  175  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.144427 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1043  glycosyl transferase family 2  28.19 
 
 		 1009 aa  174  5e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0124689  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0422  glycosyl transferase family protein  26.58 
 
 		 1297 aa  170  9e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1555  glycosyl transferase family 2  28.27 
 
 		 1188 aa  169  2e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1946  glycosyl transferase, group 2 family protein  25.39 
 
 		 1191 aa  164  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.678208  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50300  hypothetical protein  27.44 
 
 		 1694 aa  162  3e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0552832  decreased coverage  0.000853187 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3348  glycosyl transferase family protein  26.97 
 
 		 1074 aa  150  1.0000000000000001e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0861977  normal  0.0615574 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2031  glycosyltransferase  33.6 
 
 		 1003 aa  147  7.0000000000000006e-34  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3469  glycosyl transferase family protein  24.86 
 
 		 1190 aa  146  2e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.65715  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2650  glycosyl transferase family protein  25.98 
 
 		 1177 aa  145  3e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1529  glycosyl transferase family 2  26 
 
 		 748 aa  142  1.9999999999999998e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1947  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.86 
 
 		 968 aa  140  1e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3468  glycosyl transferase family protein  26.92 
 
 		 968 aa  138  4e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1517  glycosyl transferase family protein  25.83 
 
 		 974 aa  134  6.999999999999999e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.206981  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06183  O-antigen biosynthesis protein  29.23 
 
 		 1165 aa  133  1.0000000000000001e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.00444077  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00983  O-antigen biosynthesis protein  29.23 
 
 		 1165 aa  133  1.0000000000000001e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4280  hypothetical protein  27.73 
 
 		 1171 aa  132  3e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1918  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.74 
 
 		 1173 aa  128  5e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>