More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_3481 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007413  Ava_3481  methionyl-tRNA formyltransferase  100 
 
 		 334 aa  683    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.902308 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3851  methionyl-tRNA formyltransferase  76.58 
 
 		 333 aa  533  1e-150  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.183398  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1548  methionyl-tRNA formyltransferase  65.76 
 
 		 332 aa  457  1e-127  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1572  methionyl-tRNA formyltransferase  65.15 
 
 		 332 aa  453  1.0000000000000001e-126  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1769  methionyl-tRNA formyltransferase  67.17 
 
 		 336 aa  448  1e-125  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.161248  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0883  methionyl-tRNA formyltransferase  66.26 
 
 		 334 aa  443  1e-123  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3948  methionyl-tRNA formyltransferase  63.25 
 
 		 334 aa  432  1e-120  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2110  methionyl-tRNA formyltransferase  54.13 
 
 		 327 aa  347  2e-94  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.102637  normal  0.6282 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0513  methionyl-tRNA formyltransferase  42.99 
 
 		 319 aa  269  5e-71  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.690355  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0649  methionyl-tRNA formyltransferase  42.77 
 
 		 318 aa  265  7e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.95229e-24 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0130  methionyl-tRNA formyltransferase  42.51 
 
 		 317 aa  263  3e-69  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0635  methionyl-tRNA formyltransferase  42.77 
 
 		 318 aa  261  8e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0157901  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3217  methionyl-tRNA formyltransferase  41.69 
 
 		 316 aa  259  4e-68  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.163749  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3339  methionyl-tRNA formyltransferase  42.22 
 
 		 311 aa  258  9e-68  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.376602  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1592  methionyl-tRNA formyltransferase  42.77 
 
 		 359 aa  255  1.0000000000000001e-66  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1755  methionyl-tRNA formyltransferase  49.59 
 
 		 310 aa  253  3e-66  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0244  methionyl-tRNA formyltransferase  41.32 
 
 		 315 aa  251  9.000000000000001e-66  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1005  methionyl-tRNA formyltransferase  39.09 
 
 		 317 aa  251  1e-65  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00554605  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0192  methionyl-tRNA formyltransferase  42.94 
 
 		 312 aa  250  3e-65  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0196  methionyl-tRNA formyltransferase  42.86 
 
 		 318 aa  249  5e-65  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00869838  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0568  methionyl-tRNA formyltransferase  40.84 
 
 		 311 aa  248  2e-64  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000116959  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3852  methionyl-tRNA formyltransferase  42.94 
 
 		 320 aa  247  2e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0090  methionyl-tRNA formyltransferase  43.71 
 
 		 314 aa  246  4e-64  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0186427  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2096  methionyl-tRNA formyltransferase  43.71 
 
 		 314 aa  246  4e-64  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.156857  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0819  methionyl-tRNA formyltransferase  40.42 
 
 		 313 aa  246  4.9999999999999997e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1996  methionyl-tRNA formyltransferase  39.7 
 
 		 309 aa  244  9.999999999999999e-64  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1307  methionyl-tRNA formyltransferase  39 
 
 		 338 aa  243  1.9999999999999999e-63  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1176  methionyl-tRNA formyltransferase  38.18 
 
 		 309 aa  244  1.9999999999999999e-63  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0139658  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1714  methionyl-tRNA formyltransferase  39.7 
 
 		 309 aa  244  1.9999999999999999e-63  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0083  methionyl-tRNA formyltransferase  40.9 
 
 		 310 aa  241  9e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.417966  decreased coverage  0.00000000000000611556 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1705  methionyl-tRNA formyltransferase  40.24 
 
 		 317 aa  241  1e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00190  methionyl-tRNA formyltransferase  41.67 
 
 		 314 aa  241  1e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.767541  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0086  methionyl-tRNA formyltransferase  40.48 
 
 		 310 aa  239  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.2251  hitchhiker  0.0000000986218 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1529  methionyl-tRNA formyltransferase  37.84 
 
 		 312 aa  239  4e-62  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.525395  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14401  putative methionyl-tRNA formyltransferase  37.54 
 
 		 342 aa  239  6.999999999999999e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0067  methionyl-tRNA formyltransferase  40.3 
 
 		 310 aa  238  1e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.196453  unclonable  0.000000439837 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0083  methionyl-tRNA formyltransferase  40.3 
 
 		 310 aa  238  1e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.217446 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0026  methionyl-tRNA formyltransferase  42.06 
 
 		 318 aa  238  1e-61  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0905739 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0028  methionyl-tRNA formyltransferase  41.74 
 
 		 318 aa  237  2e-61  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.709441  hitchhiker  0.00475764 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0034  methionyl-tRNA formyltransferase  41.92 
 
 		 329 aa  238  2e-61  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0590691 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0019  methionyl-tRNA formyltransferase  40.48 
 
 		 310 aa  236  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.107334  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4228  methionyl-tRNA formyltransferase  41.54 
 
 		 312 aa  236  5.0000000000000005e-61  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.47776 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0034  methionyl-tRNA formyltransferase  41.43 
 
 		 318 aa  235  7e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000257015 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10281  putative methionyl-tRNA formyltransferase  36.28 
 
 		 328 aa  235  9e-61  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.477504  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0031  methionyl-tRNA formyltransferase  40.81 
 
 		 318 aa  233  2.0000000000000002e-60  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00392  methionyl-tRNA formyltransferase  41.64 
 
 		 315 aa  234  2.0000000000000002e-60  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0864  methionyl-tRNA formyltransferase  37.58 
 
 		 311 aa  234  2.0000000000000002e-60  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000069502  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0178  methionyl-tRNA formyltransferase  39.7 
 
 		 314 aa  233  3e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0016  methionyl-tRNA formyltransferase  39.3 
 
 		 332 aa  233  3e-60  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.982881  normal  0.112275 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0023  methionyl-tRNA formyltransferase  42.68 
 
 		 319 aa  232  5e-60  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1168  methionyl-tRNA formyltransferase  39.18 
 
 		 338 aa  232  6e-60  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10271  putative methionyl-tRNA formyltransferase  35.1 
 
 		 346 aa  232  6e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.360927  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0959  methionyl-tRNA formyltransferase  35.4 
 
 		 328 aa  231  1e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.500083  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0023  methionyl-tRNA formyltransferase  41.27 
 
 		 318 aa  231  1e-59  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0054  methionyl-tRNA formyltransferase  40.9 
 
 		 314 aa  230  2e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3737  methionyl-tRNA formyltransferase  40.81 
 
 		 324 aa  230  3e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00219855 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0037  methionyl-tRNA formyltransferase  41.02 
 
 		 320 aa  229  4e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.553222 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0355  methionyl-tRNA formyltransferase  41.85 
 
 		 313 aa  228  1e-58  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.36252  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0031  methionyl-tRNA formyltransferase  40.81 
 
 		 318 aa  228  1e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0020  methionyl-tRNA formyltransferase  41.36 
 
 		 322 aa  228  1e-58  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0022  methionyl-tRNA formyltransferase  41.27 
 
 		 315 aa  228  1e-58  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0030  methionyl-tRNA formyltransferase  40.81 
 
 		 318 aa  227  2e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00109779 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0438  methionyl-tRNA formyltransferase  40.6 
 
 		 313 aa  226  4e-58  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10481  putative methionyl-tRNA formyltransferase  36.92 
 
 		 336 aa  226  4e-58  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.360492  hitchhiker  0.00290754 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2474  methionyl-tRNA formyltransferase  39.25 
 
 		 315 aa  226  5.0000000000000005e-58  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2491  methionyl-tRNA formyltransferase  37.54 
 
 		 319 aa  226  5.0000000000000005e-58  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0030  methionyl-tRNA formyltransferase  40.5 
 
 		 318 aa  226  6e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000188499 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002056  methionyl-tRNA formyltransferase  39.25 
 
 		 315 aa  225  7e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0366  methionyl-tRNA formyltransferase  37.61 
 
 		 336 aa  225  8e-58  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0858  methionyl-tRNA formyltransferase  39.1 
 
 		 311 aa  225  9e-58  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0018  methionyl-tRNA formyltransferase  39.7 
 
 		 314 aa  224  1e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3719  methionyl-tRNA formyltransferase  41.23 
 
 		 315 aa  225  1e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.236435  hitchhiker  0.00730816 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0898  methionyl-tRNA formyltransferase  40.24 
 
 		 311 aa  225  1e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.212157  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0026  methionyl-tRNA formyltransferase  40.19 
 
 		 318 aa  224  1e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0023  methionyl-tRNA formyltransferase  40.81 
 
 		 318 aa  223  3e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09241  putative methionyl-tRNA formyltransferase  37.46 
 
 		 339 aa  223  4e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0403377  hitchhiker  0.00000992021 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0030  methionyl-tRNA formyltransferase  39.82 
 
 		 321 aa  222  9e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09900  methionyl-tRNA formyltransferase  39.1 
 
 		 316 aa  221  9e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0782  methionyl-tRNA formyltransferase  37.95 
 
 		 310 aa  221  9.999999999999999e-57  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.606283  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3225  methionyl-tRNA formyltransferase  38.32 
 
 		 313 aa  221  9.999999999999999e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0188786 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2313  methionyl-tRNA formyltransferase  39.52 
 
 		 312 aa  221  9.999999999999999e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.490925  hitchhiker  0.0006759 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3177  methionyl-tRNA formyltransferase  39.82 
 
 		 315 aa  219  3.9999999999999997e-56  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000345004  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3969  methionyl-tRNA formyltransferase  40.92 
 
 		 315 aa  219  5e-56  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.483115  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3920  methionyl-tRNA formyltransferase  38.1 
 
 		 325 aa  219  5e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1439  methionyl-tRNA formyltransferase  35.93 
 
 		 314 aa  219  7e-56  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4512  methionyl-tRNA formyltransferase  38.77 
 
 		 314 aa  218  8.999999999999998e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.017466  hitchhiker  0.000185831 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0042  methionyl-tRNA formyltransferase  40.72 
 
 		 320 aa  218  1e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.601603  normal  0.144256 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3790  methionyl-tRNA formyltransferase  40.62 
 
 		 315 aa  218  1e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.243321  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00160  methionyl-tRNA formyltransferase  39.58 
 
 		 325 aa  217  2e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2844  methionyl-tRNA formyltransferase  39.82 
 
 		 308 aa  217  2e-55  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0186  methionyl-tRNA formyltransferase  36.8 
 
 		 308 aa  218  2e-55  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000823971 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2582  methionyl-tRNA formyltransferase  40.06 
 
 		 328 aa  216  4e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.0097642  normal  0.0138205 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0016  methionyl-tRNA formyltransferase  37.91 
 
 		 319 aa  216  5e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000109798  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1300  methionyl-tRNA formyltransferase  37.92 
 
 		 311 aa  215  8e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.247026  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1275  methionyl-tRNA formyltransferase  37.92 
 
 		 311 aa  215  8e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2232  methionyl-tRNA formyltransferase  38.3 
 
 		 313 aa  215  9e-55  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0143  methionyl-tRNA formyltransferase  36.72 
 
 		 312 aa  214  9.999999999999999e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0856282  normal  0.608581 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1395  methionyl-tRNA formyltransferase  37.88 
 
 		 305 aa  213  3.9999999999999995e-54  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0426  methionyl-tRNA formyltransferase  39.38 
 
 		 315 aa  213  4.9999999999999996e-54  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03089  hypothetical protein  39.38 
 
 		 315 aa  213  4.9999999999999996e-54  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.633166  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>