51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_1317 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_1317  hypothetical protein  100 
 
 
140 aa  281  1.0000000000000001e-75  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000855908  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4122  membrane protein-like protein  68.18 
 
 
150 aa  182  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4296  DoxX family protein  41.32 
 
 
133 aa  89.7  1e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.479506  normal  0.170558 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5051  hypothetical protein  44.14 
 
 
115 aa  76.6  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.780189 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2365  membrane protein-like protein  42.34 
 
 
118 aa  75.9  0.0000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.274553  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3270  hypothetical protein  47.11 
 
 
121 aa  73.2  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.218398  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2315  hypothetical protein  38.32 
 
 
148 aa  71.6  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.20145  normal 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3281  membrane protein-like protein  36.52 
 
 
167 aa  68.2  0.00000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2311  hypothetical protein  37.17 
 
 
135 aa  65.5  0.0000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2209  hypothetical protein  38.39 
 
 
116 aa  65.5  0.0000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2171  membrane protein-like protein  38.39 
 
 
116 aa  65.5  0.0000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0138  hypothetical protein  37.62 
 
 
117 aa  64.3  0.0000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.620738  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07520  hypothetical protein  35.78 
 
 
108 aa  60.8  0.000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.984561  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1742  hypothetical protein  36.36 
 
 
116 aa  60.1  0.00000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3783  membrane protein-like protein  39.32 
 
 
137 aa  59.3  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00217188  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1790  membrane protein  32.28 
 
 
150 aa  59.3  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0469935  hitchhiker  0.000576942 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0969  hypothetical protein  40.7 
 
 
118 aa  56.6  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2333  membrane protein-like protein  34.86 
 
 
131 aa  53.9  0.0000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.296457 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1635  DoxX family protein  32.2 
 
 
168 aa  53.9  0.0000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.364562 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53830  hypothetical protein  37.65 
 
 
131 aa  53.5  0.0000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.623323  normal  0.810149 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1803  hypothetical protein  34.91 
 
 
134 aa  52  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0443122  normal  0.0591067 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4712  hypothetical protein  37.37 
 
 
156 aa  52  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.880265  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1649  hypothetical protein  35.48 
 
 
174 aa  51.2  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.37839  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5798  hypothetical protein  36.36 
 
 
169 aa  51.2  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.233745 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0434  hypothetical protein  33.33 
 
 
124 aa  50.8  0.000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.491399  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1137  membrane protein  31.63 
 
 
134 aa  49.7  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.396168  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2150  membrane protein-like  31.53 
 
 
147 aa  49.7  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0271562 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01390  predicted membrane protein  33.62 
 
 
148 aa  49.7  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.723159  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5384  DoxX family protein  31.03 
 
 
137 aa  48.9  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.901088 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3912  membrane protein-like protein  31.73 
 
 
140 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0622055 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2608  hypothetical protein  34.26 
 
 
175 aa  48.1  0.00004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.253615 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07620  hypothetical protein  36.99 
 
 
129 aa  47.8  0.00005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.196696 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0545  hypothetical protein  29.41 
 
 
155 aa  46.2  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0849  hypothetical protein  32.71 
 
 
127 aa  45.8  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6239  hypothetical protein  31.53 
 
 
132 aa  45.8  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000127344  normal  0.694726 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09920  predicted membrane protein  30.19 
 
 
111 aa  45.8  0.0002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.728497  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4384  membrane protein-like protein  31.13 
 
 
140 aa  45.4  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.764117  normal  0.999315 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4279  membrane protein-like protein  30.77 
 
 
140 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.566511 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1405  hypothetical protein  31.3 
 
 
141 aa  45.1  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.78031  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1423  hypothetical protein  31.3 
 
 
141 aa  45.1  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3838  hypothetical protein  32.2 
 
 
162 aa  43.9  0.0007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0996285  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4763  DoxX family protein  37.97 
 
 
149 aa  43.5  0.0009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2364  hypothetical protein  33.33 
 
 
127 aa  43.5  0.0009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.773644  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5136  hypothetical protein  40.79 
 
 
152 aa  43.1  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4664  hypothetical protein  30.19 
 
 
144 aa  43.5  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.592546 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5367  hypothetical protein  33.33 
 
 
129 aa  43.5  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.352789  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3912  hypothetical protein  32.2 
 
 
143 aa  43.5  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.326133  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3824  hypothetical protein  32.2 
 
 
143 aa  42.4  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.161652  normal  0.397741 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0323  hypothetical protein  31.08 
 
 
164 aa  41.6  0.003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2616  DoxX family protein  34.18 
 
 
167 aa  41.6  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0141703  normal  0.011068 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0961  hypothetical protein  34.71 
 
 
124 aa  40.8  0.007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.383849  normal  0.472599 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>