More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_1897 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012034  Athe_1897  glycine cleavage H-protein  100 
 
 		 106 aa  212  1.9999999999999998e-54  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000281988  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0849  glycine cleavage system protein H  41.25 
 
 		 126 aa  65.5  0.0000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000024227  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0832  glycine cleavage system protein H  41.25 
 
 		 126 aa  65.5  0.0000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00486711  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2695  glycine cleavage system protein H  38.27 
 
 		 123 aa  64.3  0.0000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0447  glycine cleavage system H protein  33.33 
 
 		 126 aa  63.2  0.000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.197212  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0485  glycine cleavage system protein H  38.75 
 
 		 126 aa  61.2  0.000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1870  glycine cleavage system protein H  37.04 
 
 		 123 aa  61.6  0.000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.510899  normal  0.111412 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3183  glycine cleavage system protein H  39.02 
 
 		 126 aa  61.6  0.000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.0000000182392  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0050  glycine cleavage system H protein  33.33 
 
 		 124 aa  60.8  0.000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.968123  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2348  glycine cleavage system H protein  36.59 
 
 		 134 aa  60.5  0.000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2298  glycine cleavage system protein H  37.5 
 
 		 118 aa  58.9  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1497  glycine cleavage system H protein  37.5 
 
 		 126 aa  59.3  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0869  glycine cleavage system protein H  37.5 
 
 		 118 aa  58.2  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.731856  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1698  glycine cleavage system H protein  40.24 
 
 		 126 aa  58.5  0.00000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2194  glycine cleavage system protein H  37.5 
 
 		 118 aa  58.2  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0712  glycine cleavage system protein H  38.27 
 
 		 122 aa  58.5  0.00000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4814  glycine cleavage system protein H  40.24 
 
 		 127 aa  58.5  0.00000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00016491  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0736  glycine cleavage system protein H  37.04 
 
 		 122 aa  57.8  0.00000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0533  glycine cleavage system H protein  34.57 
 
 		 121 aa  57.8  0.00000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.412806 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5130  glycine cleavage system protein H  38.75 
 
 		 127 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000365083  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5133  glycine cleavage system protein H  38.75 
 
 		 127 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000135708  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2210  glycine cleavage system H protein  33.33 
 
 		 121 aa  56.6  0.0000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.194358  normal  0.155334 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3586  glycine cleavage system protein H  37.5 
 
 		 127 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000166607  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0396  glycine cleavage system H protein  37.66 
 
 		 123 aa  56.2  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4859  glycine cleavage system protein H  38.75 
 
 		 127 aa  56.2  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000908449  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4700  glycine cleavage system protein H  38.75 
 
 		 127 aa  56.2  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000213752  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4716  glycine cleavage system protein H  38.75 
 
 		 127 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000916909  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1893  glycine cleavage system protein H  35.63 
 
 		 127 aa  55.8  0.0000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.262641 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1612  glycine cleavage system protein H  36.78 
 
 		 127 aa  55.8  0.0000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.645617  normal  0.608002 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1183  glycine cleavage system protein H  30.86 
 
 		 120 aa  55.5  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.157974  normal  0.140639 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5228  glycine cleavage system protein H  38.75 
 
 		 127 aa  56.2  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000143615  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5097  glycine cleavage system protein H  38.75 
 
 		 127 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27674  predicted protein  31.46 
 
 		 134 aa  55.5  0.0000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5135  glycine cleavage system protein H  38.75 
 
 		 127 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00103553  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0105  glycine cleavage system protein H  38.75 
 
 		 127 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000835004  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2869  glycine cleavage system protein H  36.25 
 
 		 129 aa  55.8  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0813  glycine cleavage system protein H  32.1 
 
 		 120 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.388148  normal  0.22287 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0390  glycine cleavage system H protein  37.66 
 
 		 123 aa  55.5  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.927773 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0689  glycine cleavage system protein H  34.52 
 
 		 125 aa  55.5  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.904294  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1619  glycine cleavage system protein H  32.47 
 
 		 121 aa  55.1  0.0000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.209831  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1017  glycine cleavage system protein H  33.75 
 
 		 122 aa  55.1  0.0000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1982  glycine cleavage system H protein  37.5 
 
 		 130 aa  55.1  0.0000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0297807  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3300  glycine cleavage system H protein  37.5 
 
 		 123 aa  55.5  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.906564  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0854  glycine cleavage system protein H  32.1 
 
 		 120 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0728621  normal  0.0870942 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0897  glycine cleavage system H protein  31.71 
 
 		 135 aa  55.1  0.0000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00473644  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4386  glycine cleavage system protein H  34.57 
 
 		 121 aa  54.7  0.0000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.548766  normal  0.706573 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1569  glycine cleavage system protein H  31.17 
 
 		 121 aa  54.7  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00108538 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1095  glycine cleavage system protein H  30.49 
 
 		 122 aa  54.7  0.0000005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.171201  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3739  glycine cleavage system protein H  31.17 
 
 		 121 aa  54.3  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0626114  normal  0.594072 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2460  glycine cleavage system protein H  36.36 
 
 		 126 aa  54.3  0.0000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2933  glycine cleavage system protein H  37.5 
 
 		 127 aa  53.9  0.0000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00141908  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0984  glycine cleavage system H protein  30.49 
 
 		 135 aa  53.9  0.0000008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.052829  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2673  glycine cleavage system H protein  37.35 
 
 		 124 aa  53.5  0.0000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1732  glycine cleavage system protein H  32.47 
 
 		 121 aa  53.9  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3298  glycine cleavage system H protein  35.37 
 
 		 129 aa  53.9  0.0000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.123967  normal  0.480249 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1328  glycine cleavage system H protein  32.22 
 
 		 126 aa  53.5  0.0000009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1467  glycine cleavage system protein H  33.75 
 
 		 126 aa  53.1  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0733861 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1851  glycine cleavage system protein H  33.33 
 
 		 123 aa  52.8  0.000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0324659  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23430  glycine cleavage system H protein  35.56 
 
 		 128 aa  53.5  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000556712  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_32847  glycine decarboxylase  30.86 
 
 		 157 aa  53.1  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4038  glycine cleavage system H protein  33.75 
 
 		 128 aa  52.8  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0664903  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2347  glycine cleavage system H protein  35 
 
 		 118 aa  53.5  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.250825  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0778  glycine cleavage system protein H  32.1 
 
 		 120 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.068818 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05972  glycine cleavage system protein H  29.55 
 
 		 126 aa  52.4  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3154  glycine cleavage system H protein  32.95 
 
 		 124 aa  52.4  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1944  glycine cleavage system H protein  35 
 
 		 130 aa  52.8  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000190356 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1867  glycine cleavage system H protein  32.5 
 
 		 122 aa  52.8  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0347749  normal  0.181057 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6034  glycine cleavage system protein H  29.63 
 
 		 120 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0418539  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2200  glycine cleavage system protein H  34.09 
 
 		 125 aa  52.8  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.330883 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4466  glycine cleavage system H protein  35 
 
 		 126 aa  52.8  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.332161 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0376  glycine cleavage system H protein  33.73 
 
 		 124 aa  52  0.000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2684  glycine cleavage system H protein  33.75 
 
 		 123 aa  51.6  0.000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.418167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1738  glycine cleavage system protein H  40.26 
 
 		 122 aa  51.6  0.000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.000000301495  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0726  glycine cleavage system protein H  30.86 
 
 		 122 aa  51.6  0.000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1711  glycine cleavage system H protein  33.75 
 
 		 126 aa  51.2  0.000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.147296  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3621  glycine cleavage system protein H  32.47 
 
 		 120 aa  51.6  0.000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.666557  normal  0.082734 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0055  glycine cleavage system protein H  37.65 
 
 		 126 aa  51.2  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4142  glycine cleavage system H protein  34.48 
 
 		 124 aa  51.6  0.000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2253  glycine cleavage system protein H  28.75 
 
 		 120 aa  51.6  0.000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0487645  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1516  glycine cleavage system H protein  33.75 
 
 		 125 aa  51.6  0.000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0307602  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1107  glycine cleavage system H protein  35.06 
 
 		 126 aa  51.2  0.000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1662  glycine cleavage system protein H  38.75 
 
 		 135 aa  51.6  0.000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.293907  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0680  glycine cleavage system protein H  30.86 
 
 		 122 aa  51.6  0.000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2004  glycine cleavage system H protein  35.63 
 
 		 127 aa  51.2  0.000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.829681  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1285  glycine cleavage system protein H  29.87 
 
 		 121 aa  51.2  0.000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.390609  normal  0.169764 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0225  glycine cleavage system protein H  31.25 
 
 		 127 aa  50.8  0.000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0929838 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3084  glycine cleavage system protein H  36.25 
 
 		 127 aa  51.2  0.000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4267  glycine cleavage system H protein  32.1 
 
 		 120 aa  51.2  0.000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.231851  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2836  glycine cleavage system H protein  34.94 
 
 		 120 aa  50.8  0.000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000136421  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1890  glycine cleavage system protein H  32.1 
 
 		 120 aa  50.8  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0467152  hitchhiker  0.00604337 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4864  glycine cleavage system H protein  32.18 
 
 		 128 aa  50.8  0.000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3863  glycine cleavage system protein H  32.1 
 
 		 122 aa  50.8  0.000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.394687  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1353  glycine cleavage system H protein  32.1 
 
 		 125 aa  50.8  0.000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000233  glycine cleavage system H protein  30.68 
 
 		 126 aa  50.4  0.000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0436  glycine cleavage system H protein  36.25 
 
 		 126 aa  50.4  0.000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0338  glycine cleavage system H protein  31.33 
 
 		 125 aa  50.4  0.000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0357579  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0864  glycine cleavage system protein H  31.82 
 
 		 128 aa  50.1  0.000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.786548  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0868  glycine cleavage system protein H  31.82 
 
 		 128 aa  50.1  0.000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3755  glycine cleavage system H protein  33.7 
 
 		 128 aa  50.4  0.000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.301262  normal  0.144879 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3831  glycine cleavage system protein H  31.82 
 
 		 128 aa  50.1  0.000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.396771  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>