212 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_3508 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_3508  amine oxidase  100 
 
 
435 aa  877    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2268  amine oxidase  38.16 
 
 
431 aa  249  8e-65  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.284727 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2975  amine oxidase  33.97 
 
 
480 aa  243  5e-63  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05276  Putative monoamine oxidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5B2F4]  31.57 
 
 
492 aa  196  1e-48  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006681  CNL05910  amine oxidase, putative  31.02 
 
 
537 aa  182  1e-44  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0298175  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4453  amine oxidase  32.25 
 
 
443 aa  171  2e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4436  amine oxidase  33.33 
 
 
480 aa  162  1e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.511902  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2361  amine oxidase  31.51 
 
 
419 aa  157  2e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000435651  normal  0.0173751 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4155  amine oxidase (flavin-containing)  31.26 
 
 
465 aa  155  1e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.326684  normal  0.0591967 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0586  amine oxidase  27.91 
 
 
427 aa  134  3e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1178  amine oxidase  29.02 
 
 
454 aa  104  4e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0392628  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08359  flavin containing amine oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G01470)  26.65 
 
 
378 aa  102  1e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1866  amine oxidase  26.67 
 
 
447 aa  97.4  5e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.591896  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4452  Amine oxidase (flavin-containing)  28.14 
 
 
498 aa  97.1  6e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.383006  normal  0.183412 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2005  amine oxidase  25.76 
 
 
492 aa  95.5  2e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1556  amine oxidase (flavin-containing)  26.43 
 
 
450 aa  92.8  1e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1580  amine oxidase (flavin-containing)  26.43 
 
 
450 aa  92.8  1e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2742  twin-arginine translocation pathway signal  28.08 
 
 
490 aa  90.9  4e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00724146  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4501  amine oxidase  27.29 
 
 
446 aa  90.1  7e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.129259  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6833  amine oxidase  26.98 
 
 
532 aa  89  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.574218  normal  0.40808 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4441  Amine oxidase (flavin-containing)  26.62 
 
 
498 aa  89  1e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.358617 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4331  Amine oxidase (flavin-containing)  26.62 
 
 
498 aa  89  1e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0789189 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0040  amine oxidase  30.53 
 
 
463 aa  87  6e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2893  amine oxidase  24.34 
 
 
456 aa  85.9  0.000000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.400001  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1526  amine oxidase (flavin-containing)  25.56 
 
 
439 aa  85.5  0.000000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.028024  normal  0.955332 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5037  amine oxidase (flavin-containing)  26.52 
 
 
493 aa  84  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5823  amine oxidase (flavin-containing)  26.52 
 
 
493 aa  84  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.105573  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6401  twin-arginine translocation pathway signal  26.91 
 
 
493 aa  83.6  0.000000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4356  amine oxidase  26.3 
 
 
493 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0745  amine oxidase (flavin-containing)  24.56 
 
 
469 aa  81.6  0.00000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5048  twin-arginine translocation pathway signal  28.13 
 
 
578 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4367  amine oxidase (flavin-containing)  28.13 
 
 
494 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5812  amine oxidase; FAD dependent oxidoreductase  28.35 
 
 
494 aa  81.6  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.377478  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0040  putrescine oxidase  31.13 
 
 
462 aa  80.5  0.00000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1150  amine oxidase  23.96 
 
 
491 aa  79.7  0.0000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5286  amine oxidase  24.02 
 
 
592 aa  79  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.456502  normal  0.921895 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6829  amine oxidase  26.36 
 
 
492 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.423551  normal  0.420009 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2259  amine oxidase  26.74 
 
 
459 aa  78.2  0.0000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00770255  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5789  amine oxidase  28.48 
 
 
444 aa  77.4  0.0000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2738  amine oxidase  25.82 
 
 
494 aa  76.6  0.0000000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13191  flavin-containing monoamine oxidase aofH  28.64 
 
 
454 aa  76.6  0.0000000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.28865 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2710  twin-arginine translocation pathway signal  22.51 
 
 
469 aa  76.3  0.0000000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5603  amine oxidase, flavin-containing  25.22 
 
 
492 aa  76.3  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.296815  normal  0.150795 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0389  amine oxidase  24.89 
 
 
449 aa  75.5  0.000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.22597  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1418  polyamine oxidase  26.03 
 
 
436 aa  74.7  0.000000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.103525  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03291  flavin-containing amine oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G00100)  25.37 
 
 
457 aa  72.4  0.00000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0113455 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0369  putative flavin-containing monoamine oxidase  26.27 
 
 
484 aa  71.2  0.00000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.431172 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2278  amine oxidase  53.12 
 
 
435 aa  71.2  0.00000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.682646 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1822  amine oxidase  25.95 
 
 
445 aa  70.9  0.00000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1864  amine oxidase  26.14 
 
 
478 aa  70.1  0.00000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.866463 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2594  amine oxidase  25.6 
 
 
478 aa  69.7  0.00000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.317944 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2283  Polyamine oxidase  28.83 
 
 
427 aa  69.3  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.844558 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0682  Putrescine oxidase  28.36 
 
 
512 aa  69.3  0.0000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.016891  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0585  amine oxidase  26.7 
 
 
442 aa  68.6  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.991791  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2381  amine oxidase  23.46 
 
 
496 aa  68.9  0.0000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.325197  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4388  amine oxidase  56.14 
 
 
445 aa  67.8  0.0000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.48846  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1588  amine oxidase  39.6 
 
 
543 aa  67.8  0.0000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.790833 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0521  hypothetical protein  23.14 
 
 
496 aa  67.4  0.0000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1846  amine oxidase, flavin-containing  23.98 
 
 
485 aa  67  0.0000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.921085  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0575  amine oxidase  26.56 
 
 
442 aa  66.6  0.0000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1230  amine oxidase (flavin-containing)  24.2 
 
 
457 aa  66.6  0.0000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.333981  normal  0.164061 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10320  monoamine oxidase  27.3 
 
 
510 aa  66.6  0.0000000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2074  amine oxidase  49.15 
 
 
479 aa  66.2  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4983  amine oxidase  24.84 
 
 
619 aa  66.2  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05480  hypothetical protein  23.54 
 
 
496 aa  65.9  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4856  amine oxidase  24.84 
 
 
619 aa  66.2  0.000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.314626  normal  0.125904 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5074  amine oxidase, flavin-containing protein  24.62 
 
 
625 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5032  amine oxidase  24.62 
 
 
616 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2098  amine oxidase, flavin-containing  24.2 
 
 
490 aa  64.7  0.000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1830  amine oxidase, flavin-containing  24.27 
 
 
482 aa  64.7  0.000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2131  amine oxidase, flavin-containing  23.2 
 
 
490 aa  65.1  0.000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.764398  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5079  amine oxidase  26.92 
 
 
459 aa  63.9  0.000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.392573 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1880  amine oxidase  22.08 
 
 
490 aa  63.5  0.000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.277928  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0838  Putrescine oxidase  29.14 
 
 
463 aa  63.2  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.272774  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1876  amine oxidase flavin-containing  24.07 
 
 
482 aa  62.8  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2018  amine oxidase, flavin-containing  24.07 
 
 
482 aa  62.8  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2053  amine oxidase, flavin-containing  24.07 
 
 
487 aa  62.4  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0482  amine oxidase  23.97 
 
 
565 aa  62  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3289  amine oxidase, flavin-containing  23.14 
 
 
487 aa  62  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0549  amine oxidase  25.97 
 
 
450 aa  60.8  0.00000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.281302  normal  0.915784 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3628  amine oxidase  26.37 
 
 
465 aa  60.8  0.00000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.533226  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0455  amine oxidase  25.11 
 
 
624 aa  60.5  0.00000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0846  amine oxidase  20.69 
 
 
525 aa  60.1  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0141  amine oxidase (flavin-containing)  23.98 
 
 
452 aa  59.7  0.00000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0817  Amine oxidase (flavin-containing)  20.31 
 
 
528 aa  59.7  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1906  amine oxidase (flavin-containing)  23.74 
 
 
487 aa  59.7  0.0000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.46762  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2955  amine oxidase  27.54 
 
 
413 aa  59.3  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000016357  unclonable  0.0000000469192 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4699  amine oxidase  44.44 
 
 
445 aa  59.3  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0922876  normal  0.472473 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3468  amine oxidase  27.1 
 
 
436 aa  59.3  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.43202  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3178  amine oxidase  25.64 
 
 
426 aa  59.3  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC01400  conserved hypothetical protein  45.16 
 
 
470 aa  58.5  0.0000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2278  amine oxidase  23.06 
 
 
464 aa  58.5  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.381011  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2020  amine oxidase, flavin-containing  23.08 
 
 
487 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL05890  conserved hypothetical protein  24.02 
 
 
492 aa  57.8  0.0000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.314478  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1280  amine oxidase  25.16 
 
 
433 aa  58.2  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4000  amine oxidase (flavin-containing)  50 
 
 
499 aa  58.5  0.0000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.812077  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2472  amine oxidase  22.32 
 
 
459 aa  58.2  0.0000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5578  amine oxidase (flavin-containing)  25.93 
 
 
456 aa  57.8  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3007  amine oxidase, flavin-containing protein  24.31 
 
 
527 aa  57.4  0.0000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.306413  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1160  hypothetical protein  40.35 
 
 
495 aa  56.6  0.0000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>