More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_1833 on replicon NC_013164
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013164  Apre_1833  two component transcriptional regulator, winged helix family  100 
 
 		 227 aa  453  1.0000000000000001e-126  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1665  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.39 
 
 		 232 aa  223  1e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0488  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.7 
 
 		 235 aa  222  4e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00220414 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2313  two component transcriptional regulator  48.47 
 
 		 228 aa  205  4e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0313786  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2021  regulatory protein VanR  47.6 
 
 		 228 aa  203  2e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0294  DNA-binding response regulator  45.02 
 
 		 233 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4801  response regulator protein  44.25 
 
 		 234 aa  196  3e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000584394  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0322  DNA-binding response regulator  45.02 
 
 		 233 aa  196  3e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000418869  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0303  DNA-binding response regulator  44.98 
 
 		 233 aa  195  5.000000000000001e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0610099  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5021  DNA-binding response regulator  44.98 
 
 		 233 aa  195  6e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0330449  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0256  DNA-binding response regulator  45.41 
 
 		 233 aa  194  7e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0245  response regulator  45.41 
 
 		 233 aa  194  7e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0271  DNA-binding response regulator  45.41 
 
 		 233 aa  194  7e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.439326  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0296  DNA-binding response regulator  44.98 
 
 		 233 aa  194  1e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0242  response regulator  44.98 
 
 		 233 aa  194  1e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0249  two component transcriptional regulator  44.98 
 
 		 233 aa  194  1e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0382139  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4980  DNA-binding response regulator  45.98 
 
 		 232 aa  192  2e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0257  DNA-binding response regulator  45.54 
 
 		 232 aa  192  3e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0117449  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4963  DNA-binding response regulator  45.09 
 
 		 232 aa  192  4e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4745  DNA-binding response regulator  45.09 
 
 		 232 aa  192  5e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4583  DNA-binding response regulator  45.09 
 
 		 232 aa  192  5e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.510578  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5106  DNA-binding response regulator  45.09 
 
 		 232 aa  192  5e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5254  regulatory protein VanR  43.81 
 
 		 234 aa  191  7e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5010  DNA-binding response regulator  44.64 
 
 		 232 aa  191  1e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4991  DNA-binding response regulator  44.64 
 
 		 232 aa  191  1e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4605  DNA-binding response regulator  44.64 
 
 		 232 aa  190  1e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000523811  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4666  two component transcriptional regulator  42.92 
 
 		 233 aa  191  1e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0255  two component transcriptional regulator  46.02 
 
 		 246 aa  189  2e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000922211  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4692  two component transcriptional regulator  44.64 
 
 		 232 aa  188  5e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0459  DNA-binding response regulator  44.1 
 
 		 234 aa  187  9e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.025631  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3518  two component transcriptional regulator  44.05 
 
 		 234 aa  187  1e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2526  DNA-binding response regulator  44.16 
 
 		 231 aa  186  2e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2796  DNA-binding response regulator  44.16 
 
 		 231 aa  186  2e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.512352  hitchhiker  0.00000533196 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0283  regulatory protein VanR  42.92 
 
 		 233 aa  186  2e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2658  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.98 
 
 		 234 aa  187  2e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1897  two component transcriptional regulator  44.39 
 
 		 227 aa  186  3e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.151466  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0448  DNA-binding response regulator  43.67 
 
 		 234 aa  186  3e-46  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.223302  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2302  DNA-binding response regulator  43.72 
 
 		 231 aa  185  4e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0827  two component transcriptional regulator  42.15 
 
 		 256 aa  185  4e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00211389  normal  0.244563 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2564  DNA-binding response regulator  43.72 
 
 		 231 aa  184  7e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0589521  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2574  DNA-binding response regulator  43.72 
 
 		 231 aa  184  7e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000040017 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2385  DNA-binding response regulator  43.72 
 
 		 231 aa  184  7e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.534853  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2617  DNA-binding response regulator  43.72 
 
 		 231 aa  184  7e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.993672  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2341  DNA-binding response regulator  43.72 
 
 		 231 aa  184  7e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000166477  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2561  DNA-binding response regulator  43.72 
 
 		 231 aa  184  7e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.630654  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3169  regulatory protein VanR  44.44 
 
 		 229 aa  184  7e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.16404  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2813  two component transcriptional regulator  41.85 
 
 		 231 aa  183  2.0000000000000003e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000151023  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1336  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.48 
 
 		 228 aa  182  3e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0802102 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2216  two component transcriptional regulator  43.05 
 
 		 224 aa  181  7e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1728  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.71 
 
 		 233 aa  181  1e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2940  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.48 
 
 		 228 aa  181  1e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0012757  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1413  DNA-binding response regulator  41.96 
 
 		 223 aa  179  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2981  two component transcriptional regulator  43.75 
 
 		 229 aa  179  2.9999999999999997e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000201285  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1453  DNA-binding response regulator  41.96 
 
 		 223 aa  179  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0867  two component transcriptional regulator  41.38 
 
 		 236 aa  179  4e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.145735  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0963  two component transcriptional regulator  42.79 
 
 		 225 aa  179  4e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2219  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.04 
 
 		 240 aa  179  4e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1351  DNA-binding response regulator  41.96 
 
 		 223 aa  178  5.999999999999999e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1815  two component transcriptional regulator  42.61 
 
 		 232 aa  178  5.999999999999999e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.101184  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1021  two component transcriptional regulator  41.96 
 
 		 223 aa  178  7e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1191  response regulator  41.52 
 
 		 223 aa  177  8e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3993  DNA-binding response regulator  41.96 
 
 		 223 aa  178  8e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.910988 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1213  DNA-binding response regulator  41.52 
 
 		 223 aa  177  1e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.203275  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1193  response regulator  41.52 
 
 		 223 aa  177  1e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1389  DNA-binding response regulator  41.52 
 
 		 223 aa  177  1e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04710  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.15 
 
 		 237 aa  177  1e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1312  DNA-binding response regulator  41.52 
 
 		 223 aa  177  1e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4198  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.44 
 
 		 226 aa  177  2e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1215  two component transcriptional regulator  41.07 
 
 		 223 aa  175  6e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.533573  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05730  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  38.05 
 
 		 242 aa  174  7e-43  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.587783  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0266  two component transcriptional regulator  41.23 
 
 		 237 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.262207  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1157  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.25 
 
 		 233 aa  173  1.9999999999999998e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3069  two component transcriptional regulator  42.29 
 
 		 230 aa  173  1.9999999999999998e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000467461  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1924  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.57 
 
 		 225 aa  173  1.9999999999999998e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2373  two component transcriptional regulator  44.24 
 
 		 231 aa  172  3.9999999999999995e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0367191  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2674  DNA-binding response regulator  41.41 
 
 		 232 aa  172  5e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00069138  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1200  two component transcriptional regulator  38.5 
 
 		 238 aa  170  1e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2250  two component transcriptional regulator  42.22 
 
 		 225 aa  171  1e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000295266  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2359  DNA-binding response regulator  40.97 
 
 		 232 aa  171  1e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.596616  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3288  two component transcriptional regulator  42.22 
 
 		 225 aa  170  2e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0366247  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0080  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.15 
 
 		 230 aa  170  2e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3627  DNA-binding response regulator  42.22 
 
 		 225 aa  169  3e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000456124  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3612  DNA-binding response regulator  42.22 
 
 		 225 aa  169  3e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.20142e-22 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3620  DNA-binding response regulator  42.22 
 
 		 225 aa  169  3e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0597824  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3396  DNA-binding response regulator  42.22 
 
 		 225 aa  169  3e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000765328  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1606  DNA-binding response regulator  42.22 
 
 		 225 aa  169  3e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00543423  hitchhiker  0.0000000112462 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3358  transcriptional regulatory protein  42.22 
 
 		 225 aa  169  3e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000200566  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3308  transcriptional regulatory protein  42.22 
 
 		 225 aa  169  3e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000872353  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3709  DNA-binding response regulator  42.22 
 
 		 225 aa  169  3e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000227696  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0940  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.81 
 
 		 237 aa  169  3e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.324642  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3661  DNA-binding response regulator  42.22 
 
 		 225 aa  169  3e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000222084  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1903  two component transcriptional regulator  41.7 
 
 		 230 aa  168  5e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1827  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.57 
 
 		 227 aa  168  7e-41  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1181  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.3 
 
 		 234 aa  167  9e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00335068 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2918  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.04 
 
 		 232 aa  167  9e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0255  DNA-binding response regulator  40.35 
 
 		 237 aa  167  1e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1527  two component transcriptional regulator  38.67 
 
 		 230 aa  167  1e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.255733  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0316  DNA-binding response regulator  38.84 
 
 		 237 aa  167  1e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13280  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.54 
 
 		 227 aa  166  2e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000536961  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0287  DNA-binding response regulator  39.91 
 
 		 237 aa  167  2e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.42222  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>