More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_0517 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013171  Apre_0517  ABC transporter related  100 
 
 
221 aa  440  1e-123  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0501  ABC transporter related  45.45 
 
 
223 aa  194  8.000000000000001e-49  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0305427  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4399  putative cation ABC transporter, ATP-binding protein  43.66 
 
 
256 aa  179  2e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0939704  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0837  putative cation ABC transporter, ATP-binding protein  43.66 
 
 
256 aa  179  2e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00154907  hitchhiker  0.00000902148 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0548  ABC transporter related protein  45.54 
 
 
259 aa  180  2e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.324241  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4361  cation ABC transporter, ATP-binding protein, putative  44.13 
 
 
256 aa  179  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.129987  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4183  cation ABC transporter ATP-binding protein  44.13 
 
 
256 aa  179  2.9999999999999997e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.420645  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4021  cation ABC transporter, ATP-binding protein  44.13 
 
 
256 aa  179  2.9999999999999997e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0100127  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4505  cation ABC transporter ATP-binding protein  44.13 
 
 
256 aa  179  2.9999999999999997e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.345764  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4303  putative cation ABC transporter, ATP-binding protein  44.13 
 
 
256 aa  179  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.9910000000000006e-20 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4415  putative cation ABC transporter, ATP-binding protein  44.55 
 
 
256 aa  179  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00132022  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4031  cation ABC transporter, ATP-binding protein  44.55 
 
 
256 aa  179  4e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00593261  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0043  ABC transporter related  38.71 
 
 
247 aa  177  1e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000016055  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2403  ABC transporter related  43.13 
 
 
252 aa  176  3e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4134  ABC transporter related  43.66 
 
 
256 aa  174  6e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1579  ABC transporter related protein  39.81 
 
 
255 aa  172  3.9999999999999995e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3009  ABC transporter-related protein  41.78 
 
 
257 aa  169  4e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.12216  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0277  ABC transporter related  40.72 
 
 
254 aa  168  7e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.210378  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0168  ABC transporter related protein  40.76 
 
 
255 aa  167  1e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1634  ABC transporter related protein  40.55 
 
 
245 aa  167  1e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2646  ABC transporter related  38.68 
 
 
257 aa  160  2e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4183  ABC transporter related  40.99 
 
 
250 aa  160  2e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00136273  normal 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3314  ABC transporter related  37.91 
 
 
262 aa  159  3e-38  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0964  ABC transporter related protein  39.02 
 
 
250 aa  159  4e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.0000527176  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2138  ABC transporter related  36.79 
 
 
250 aa  159  4e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000174943  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7034  ABC transporter related  39.6 
 
 
286 aa  156  2e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0852  ABC transporter related  37.44 
 
 
246 aa  156  2e-37  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.478961  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3815  ABC transporter related  34.7 
 
 
253 aa  156  3e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0507934 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3479  ABC transporter related protein  37.56 
 
 
246 aa  156  3e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.319887  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2064  ABC transporter-related protein  36.87 
 
 
254 aa  155  4e-37  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.443264  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3599  ABC transporter related  35.85 
 
 
250 aa  155  4e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3533  ABC transporter related protein  35.85 
 
 
250 aa  155  5.0000000000000005e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2985  ABC transporter, ATP-binding protein  35.24 
 
 
250 aa  154  8e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3438  ABC transporter related  34.25 
 
 
253 aa  154  8e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.824241  normal  0.104948 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2434  ABC transporter related protein  37.61 
 
 
246 aa  153  2e-36  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000150378  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1192  ABC transporter related  38.86 
 
 
259 aa  152  5e-36  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.00000000837637  hitchhiker  0.00000450172 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3025  ABC-type transport system, ATP binding component  37.9 
 
 
257 aa  151  7e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2048  ABC transporter related protein  35.45 
 
 
247 aa  151  7e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.833471 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2422  ABC transporter, ATPase subunit  39.44 
 
 
243 aa  151  8.999999999999999e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1834  ABC transporter related  34.91 
 
 
249 aa  150  1e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.269804  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1122  ABC transporter, ATP-binding protein  38.5 
 
 
260 aa  150  2e-35  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.570761  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0097  ABC transporter ATP-binding protein  38.79 
 
 
281 aa  148  6e-35  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00699805  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1682  ABC transporter related  40.85 
 
 
247 aa  147  1.0000000000000001e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2569  ABC transporter related  36.03 
 
 
311 aa  147  1.0000000000000001e-34  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.630319  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2845  ABC transporter related  36.74 
 
 
288 aa  147  2.0000000000000003e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0047  ABC transporter related  34.25 
 
 
250 aa  146  3e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0492  ABC transporter-related protein  32.42 
 
 
256 aa  145  6e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17090  ATPase component of Mn/Zn ABC-type transporter  35.47 
 
 
244 aa  145  6e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.469587  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1648  ABC transporter related  40.76 
 
 
261 aa  145  7.0000000000000006e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.168951  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1614  ABC transporter related  40.76 
 
 
261 aa  145  7.0000000000000006e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.507834  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00190  ABC transporter related  35.59 
 
 
418 aa  144  1e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00177587  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1214  ABC transporter related protein  37.44 
 
 
245 aa  144  1e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1112  ABC transporter related  40.1 
 
 
259 aa  143  2e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2191  ABC transporter related  38.36 
 
 
249 aa  143  2e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000419302  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1762  ferrichrome transport ATP-binding protein FhuC  36.36 
 
 
258 aa  143  2e-33  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0401  ABC transporter-related protein  37.33 
 
 
257 aa  143  2e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0155  zinc ABC transporter, ATP-binding protein  35.68 
 
 
236 aa  143  3e-33  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0247418  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2418  zinc ABC transporter ATP-binding protein  35.51 
 
 
245 aa  142  3e-33  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2734  ABC transporter related  35.05 
 
 
258 aa  142  4e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18340  ABC transporter related  34.56 
 
 
239 aa  142  5e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000733695  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0223  ABC transporter related protein  38.83 
 
 
236 aa  141  7e-33  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0442  ABC transporter related  38.46 
 
 
261 aa  141  7e-33  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0623  ABC transporter related  37.07 
 
 
294 aa  141  8e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.512401  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0736  ABC transporter related protein  32.39 
 
 
277 aa  140  9.999999999999999e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1016  ABC transporter, ATPase subunit  36.49 
 
 
249 aa  140  9.999999999999999e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2087  ABC transporter related  36.62 
 
 
258 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.454279  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1601  ABC transporter related protein  32.11 
 
 
261 aa  139  1.9999999999999998e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.219906  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1014  ABC transporter related protein  36.32 
 
 
287 aa  140  1.9999999999999998e-32  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13670  ATPase component of Mn/Zn ABC-type transporter  35.87 
 
 
276 aa  139  3.9999999999999997e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.548604 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3228  ABC transporter related protein  35.29 
 
 
262 aa  138  7e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0605029  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2184  ABC transporter related protein  37.27 
 
 
256 aa  138  7.999999999999999e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0845202 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1010  ABC transporter related  37.09 
 
 
242 aa  138  7.999999999999999e-32  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.645133 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1534  ABC transporter related  33.78 
 
 
259 aa  137  1e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.261317  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0462  ABC transporter related  35.35 
 
 
220 aa  137  1e-31  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2342  ABC transporter related protein  36.14 
 
 
259 aa  137  1e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.104836  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1774  ABC transporter related  33.03 
 
 
278 aa  136  3.0000000000000003e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.124685  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5757  ABC transporter related protein  33.83 
 
 
263 aa  135  5e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.329137  normal  0.47815 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0858  ABC-type Mn/Zn transport systems ATPase component  33.18 
 
 
264 aa  134  7.000000000000001e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.442109  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1057  ABC transporter related  30.29 
 
 
284 aa  134  7.000000000000001e-31  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0689  ABC transporter related protein  32.51 
 
 
258 aa  134  8e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.010451  normal  0.0371148 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3554  ABC transporter related  34.48 
 
 
259 aa  134  9e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0438538  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4029  ABC transporter related  34.09 
 
 
248 aa  134  9e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.218483  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2583  ABC transporter related protein  33.94 
 
 
293 aa  134  9.999999999999999e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.641759  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1257  ABC transporter related  35.94 
 
 
271 aa  134  9.999999999999999e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0480594  hitchhiker  0.000898687 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0234  ABC-type Mn/Zn transport system, ATPase component  33.33 
 
 
235 aa  134  9.999999999999999e-31  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000000539035  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1590  ABC transporter related  35.94 
 
 
262 aa  134  9.999999999999999e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2739  ABC transporter related  30.77 
 
 
269 aa  134  9.999999999999999e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0723  AfeB  35.38 
 
 
280 aa  134  9.999999999999999e-31  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0402622  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2169  ABC transporter related protein  33.48 
 
 
279 aa  134  1.9999999999999998e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0174657  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0815  ABC transporter-related protein  35.51 
 
 
255 aa  133  1.9999999999999998e-30  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.120726  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0839  ABC transporter, ATPase subunit  35.16 
 
 
260 aa  133  1.9999999999999998e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.483975  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0329  ABC transporter-like protein  34.76 
 
 
256 aa  133  1.9999999999999998e-30  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1936  ABC transporter related  32.72 
 
 
287 aa  133  1.9999999999999998e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.681734  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0597  ABC transporter related protein  41.5 
 
 
230 aa  133  1.9999999999999998e-30  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1277  ABC transporter related protein  33.81 
 
 
247 aa  133  1.9999999999999998e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1352  ABC transporter related  31.51 
 
 
262 aa  132  3e-30  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0517  manganese transport system ATP-binding protein MntA  39.63 
 
 
273 aa  132  5e-30  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2830  ABC transporter-like  32.59 
 
 
268 aa  132  6e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.652667  normal  0.515297 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001242  ABC transporter ATP-binding protein  34.39 
 
 
579 aa  131  6.999999999999999e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1821  ABC transporter related  32.57 
 
 
274 aa  131  7.999999999999999e-30  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.77339  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>