More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_0995 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_0995  peptidase U32  100 
 
 		 876 aa  1811    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02320  collagenase-like protease  37.83 
 
 		 828 aa  508  9.999999999999999e-143  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.265597  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08360  collagenase-like protease  37.57 
 
 		 825 aa  500  1e-140  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.593453 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0587  peptidase U32  37.02 
 
 		 840 aa  490  1e-137  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.684095  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1848  U32 family peptidase  31.67 
 
 		 783 aa  346  8e-94  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2136  U32 family peptidase  31.48 
 
 		 783 aa  345  2.9999999999999997e-93  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2086  peptidase U32  30.41 
 
 		 839 aa  335  2e-90  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0176  peptidase U32  32.42 
 
 		 835 aa  333  6e-90  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1511  peptidase family protein U32  29.06 
 
 		 886 aa  305  2.0000000000000002e-81  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1637  peptidase U32  29.68 
 
 		 847 aa  302  2e-80  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0544  peptidase U32  30.26 
 
 		 835 aa  300  1e-79  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.814985  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1107  peptidase U32  29.13 
 
 		 836 aa  298  4e-79  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0104488  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1861  peptidase U32  29.74 
 
 		 810 aa  296  2e-78  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0229  peptidase U32  30.12 
 
 		 872 aa  291  3e-77  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.277324  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2391  peptidase U32  29.43 
 
 		 848 aa  291  3e-77  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.740262  normal  0.817298 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1374  peptidase U32  29.93 
 
 		 838 aa  287  5.999999999999999e-76  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.466002  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1712  peptidase U32  29.45 
 
 		 862 aa  282  2e-74  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000390003  normal  0.623925 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2047  peptidase U32  29.28 
 
 		 783 aa  282  2e-74  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0426  peptidase U32  33.21 
 
 		 767 aa  266  2e-69  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1336  peptidase U32  26.83 
 
 		 817 aa  265  3e-69  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0126233  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2268  peptidase U32  27.65 
 
 		 826 aa  259  2e-67  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1572  peptidase U32  28.13 
 
 		 832 aa  251  6e-65  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.812702  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1622  proteinase  31.95 
 
 		 823 aa  244  6e-63  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0350786 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3702  protease  28.52 
 
 		 878 aa  242  2e-62  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.204118  normal  0.320272 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1159  hypothetical protein  41.18 
 
 		 783 aa  242  2.9999999999999997e-62  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.904079  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1732  peptidase U32  35.8 
 
 		 873 aa  239  2e-61  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1293  peptidase U32  32.18 
 
 		 839 aa  238  4e-61  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.461857  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3761  peptidase U32  40.39 
 
 		 835 aa  238  5.0000000000000005e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0962396  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2966  peptidase U32  32.66 
 
 		 877 aa  232  3e-59  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.484686  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1337  peptidase U32  25.67 
 
 		 736 aa  231  4e-59  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_10034  predicted protein  28.15 
 
 		 826 aa  230  1e-58  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3347  U32 family peptidase  34.27 
 
 		 790 aa  228  5.0000000000000005e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0296  peptidase U32  28.94 
 
 		 837 aa  226  1e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0064  collagenase-like protease  39.07 
 
 		 790 aa  226  1e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0699  peptidase U32  24.38 
 
 		 722 aa  224  4e-57  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3552  peptidase U32  43.54 
 
 		 792 aa  224  6e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0917  peptidase U32  27 
 
 		 835 aa  224  6e-57  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0024  peptidase U32  39.36 
 
 		 792 aa  222  1.9999999999999999e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000675639  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3618  peptidase U32  39.65 
 
 		 790 aa  222  1.9999999999999999e-56  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1649  peptidase U32  30.21 
 
 		 852 aa  221  3.9999999999999997e-56  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1459  peptidase U32  29.98 
 
 		 723 aa  220  8.999999999999998e-56  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1237  putative peptidase U32 family protein  29.91 
 
 		 851 aa  220  1e-55  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1028  peptidase U32  41.27 
 
 		 834 aa  219  2e-55  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0040  peptidase U32  39.49 
 
 		 790 aa  218  2.9999999999999998e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0071  U32 family peptidase  38.94 
 
 		 746 aa  218  4e-55  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0370  peptidase U32  30.6 
 
 		 818 aa  217  7e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2502  collagenase-like protein  33.63 
 
 		 746 aa  217  9e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.503721  normal  0.268664 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0065  peptidase U32  30.28 
 
 		 822 aa  216  9.999999999999999e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1744  peptidase U32  30.63 
 
 		 622 aa  216  1.9999999999999998e-54  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0703  peptidase U32  27.43 
 
 		 841 aa  215  2.9999999999999995e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0153  peptidase U32  43.9 
 
 		 805 aa  214  7e-54  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1338  U32 family protease  30.44 
 
 		 621 aa  209  1e-52  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.138533  normal  0.134167 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2286  peptidase U32  24.04 
 
 		 716 aa  210  1e-52  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2182  peptidase U32  36.81 
 
 		 805 aa  204  4e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0246456  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1010  peptidase U32  36.79 
 
 		 411 aa  204  5e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0738  peptidase U32  39.41 
 
 		 439 aa  203  9e-51  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2261  peptidase U32  39.2 
 
 		 404 aa  203  9.999999999999999e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00105658 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1655  peptidase U32  27.17 
 
 		 833 aa  203  9.999999999999999e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.296071  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1242  putative peptidase U32 family protein  27.33 
 
 		 843 aa  202  1.9999999999999998e-50  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.648851 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0943  peptidase U32  37.15 
 
 		 411 aa  202  1.9999999999999998e-50  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.600634  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1278  peptidase U32  26.7 
 
 		 847 aa  202  3e-50  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.615717 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1775  peptidase U32  33.81 
 
 		 419 aa  201  3.9999999999999996e-50  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.768163  normal  0.436207 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05840  peptidase U32  37.21 
 
 		 406 aa  198  3e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000158903  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3754  peptidase U32  34.76 
 
 		 747 aa  198  3e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1474  peptidase U32  39.16 
 
 		 406 aa  197  5.000000000000001e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00296183  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2556  U32 family peptidase  37.88 
 
 		 404 aa  197  9e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1721  peptidase, U32 family  28.62 
 
 		 654 aa  196  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.687379  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1557  peptidase, U32 family  28.62 
 
 		 654 aa  196  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1782  peptidase, U32 family  28.62 
 
 		 654 aa  197  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1718  peptidase, U32 family  28.62 
 
 		 654 aa  196  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.378979  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0664  peptidase U32  34.77 
 
 		 696 aa  196  2e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0317421  normal  0.243634 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1738  peptidase, U32 family  28.46 
 
 		 654 aa  195  3e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0901  peptidase U32  32.69 
 
 		 407 aa  195  3e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.451276  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0818  peptidase U32  29.25 
 
 		 637 aa  192  2e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1176  U32 family peptidase  36.25 
 
 		 422 aa  192  2.9999999999999997e-47  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2008  peptidase U32  39.64 
 
 		 420 aa  192  2.9999999999999997e-47  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2024  U32 family peptidase  36.28 
 
 		 409 aa  191  4e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0764  peptidase U32  27.85 
 
 		 649 aa  191  5e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001056  peptidase U32  38.11 
 
 		 663 aa  191  5.999999999999999e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0547  collagenase  34.67 
 
 		 422 aa  191  7e-47  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1741  U32 family peptidase  36.28 
 
 		 409 aa  190  8e-47  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1301  peptidase U32  34.85 
 
 		 748 aa  190  1e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.506544  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1703  peptidase U32  35.71 
 
 		 422 aa  190  1e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1669  peptidase U32  35.71 
 
 		 422 aa  190  1e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3218  peptidase U32  36.98 
 
 		 757 aa  189  2e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000467027 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04781  peptidase  38.11 
 
 		 663 aa  189  3e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1499  peptidase U32  35.96 
 
 		 405 aa  188  4e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0753  protease  31.12 
 
 		 635 aa  187  5e-46  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0532  peptidase U32  38.74 
 
 		 410 aa  187  7e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1796  peptidase U32  29.55 
 
 		 629 aa  187  8e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.191326 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2127  peptidase U32  36.25 
 
 		 415 aa  187  8e-46  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00706152 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1793  peptidase U32  30.21 
 
 		 655 aa  187  9e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0888  peptidase U32  37.73 
 
 		 403 aa  187  9e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0335605  hitchhiker  0.0000000000241821 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0949  peptidase U32  29.98 
 
 		 641 aa  185  3e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3270  peptidase U32  36.44 
 
 		 413 aa  185  3e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000903684  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1739  U32 family peptidase  26.81 
 
 		 653 aa  185  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00264856  hitchhiker  0.0000000000000113195 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2211  peptidase U32  26.81 
 
 		 653 aa  184  6e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.722535  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01393  predicted peptidase  26.81 
 
 		 653 aa  184  8.000000000000001e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2040  peptidase, U32 family  26.81 
 
 		 667 aa  184  8.000000000000001e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0020805  hitchhiker  3.90569e-18 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01403  hypothetical protein  26.81 
 
 		 653 aa  184  8.000000000000001e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>