More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_0158 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_0158  Cof-like hydrolase  100 
 
 		 265 aa  548  1e-155  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2739  Cof-like hydrolase  54.96 
 
 		 263 aa  292  5e-78  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1574  Cof-like hydrolase  29.28 
 
 		 261 aa  138  8.999999999999999e-32  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.34557  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1549  Cof-like hydrolase  36.53 
 
 		 279 aa  137  2e-31  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.678007  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06933  hypothetical protein  30.74 
 
 		 265 aa  132  7.999999999999999e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0719  HAD family hydrolase  31.09 
 
 		 262 aa  130  2.0000000000000002e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00565065  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0709  HAD family hydrolase  30.34 
 
 		 262 aa  126  4.0000000000000003e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000934  predicted hydrolase  30.27 
 
 		 267 aa  123  3e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.330573  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1251  Cof-like hydrolase  33.2 
 
 		 256 aa  114  1.0000000000000001e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000202118  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1724  HAD superfamily hydrolase  30.42 
 
 		 265 aa  108  1e-22  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000483617  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0905  Cof-like hydrolase  30.92 
 
 		 263 aa  107  2e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000138509  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2852  Cof-like hydrolase  27.48 
 
 		 265 aa  104  1e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.592712  normal  0.107324 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0062  HAD superfamily hydrolase  30 
 
 		 270 aa  102  6e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3309  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  29.78 
 
 		 281 aa  102  7e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0977  hypothetical protein  28.41 
 
 		 273 aa  100  2e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5654  Cof-like hydrolase  29.3 
 
 		 267 aa  99.8  5e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.166656 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4150  putative sugar phosphatase  28.52 
 
 		 266 aa  99  6e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000304841  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0339  phosphatase  27.65 
 
 		 269 aa  98.2  1e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0257026  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3960  putative sugar phosphatase  28.16 
 
 		 266 aa  97.4  2e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0460666  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00811  hypothetical protein  28.73 
 
 		 271 aa  97.4  2e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2798  Cof-like hydrolase  28.73 
 
 		 271 aa  97.4  2e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.260626  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0486  HAD superfamily hydrolase  28.02 
 
 		 262 aa  97.4  2e-19  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0954828  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1772  HAD superfamily hydrolase  29.26 
 
 		 272 aa  97.4  2e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00828  hypothetical protein  28.73 
 
 		 271 aa  97.4  2e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2501  phosphatase YbjI  28.73 
 
 		 271 aa  97.1  3e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2798  Cof-like hydrolase  28.73 
 
 		 271 aa  97.1  3e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.373732  normal  0.741017 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0871  phosphatase YbjI  28.73 
 
 		 271 aa  96.7  3e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.464954  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0906  phosphatase YbjI  28.73 
 
 		 271 aa  96.7  3e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.742575  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0197  Cof-like hydrolase  29.14 
 
 		 265 aa  95.5  7e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00730737  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3994  putative sugar phosphatase  27.99 
 
 		 269 aa  95.5  8e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0559  putative sugar phosphatase  27.99 
 
 		 269 aa  95.5  8e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1105  HAD superfamily hydrolase  29.93 
 
 		 273 aa  95.1  9e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0222  putative sugar phosphatase  27.61 
 
 		 269 aa  94.7  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003397  predicted hydrolase  26.39 
 
 		 270 aa  94.7  1e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2525  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  26.98 
 
 		 282 aa  94.4  2e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1335  Cof-like hydrolase  26.06 
 
 		 270 aa  93.2  3e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.136423 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03524  hypothetical protein  30.19 
 
 		 270 aa  93.2  4e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03580  predicted hydrolase  30.19 
 
 		 270 aa  93.2  4e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0006  Cof-like hydrolase  30.19 
 
 		 270 aa  93.2  4e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4062  sugar phosphatase  30.19 
 
 		 270 aa  93.2  4e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4206  sugar phosphatase  30.19 
 
 		 270 aa  93.2  4e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.24952  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0036  sugar phosphatase  28.62 
 
 		 271 aa  93.2  4e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.148039 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0108  HAD family hydrolase  27.72 
 
 		 273 aa  93.2  4e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.126849  normal  0.569654 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1377  HAD superfamily hydrolase  26.3 
 
 		 270 aa  93.2  4e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.110042  hitchhiker  0.00000000000523684 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2000  HAD superfamily hydrolase  26.15 
 
 		 273 aa  93.2  4e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5125  sugar phosphatase  30.19 
 
 		 270 aa  93.2  4e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.231854 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0725  HAD superfamily hydrolase  27.13 
 
 		 265 aa  92.8  5e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0197  putative sugar phosphatase  26.42 
 
 		 266 aa  92.8  5e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.226044  normal  0.0522792 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2677  Cof-like hydrolase  25.95 
 
 		 257 aa  92  9e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00196441  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0246  Cof-like hydrolase  28.42 
 
 		 266 aa  91.3  1e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.163876  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3909  sugar phosphatase  29.06 
 
 		 270 aa  90.5  2e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0006  sugar phosphatase  29.06 
 
 		 270 aa  90.5  2e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3081  Cof-like hydrolase  27.27 
 
 		 283 aa  90.5  2e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.313968  hitchhiker  0.00000030315 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0836  HAD superfamily hydrolase  27.76 
 
 		 273 aa  90.9  2e-17  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.781364  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3216  Cof-like hydrolase  26.69 
 
 		 287 aa  90.5  3e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000076604  hitchhiker  0.00135645 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3826  Cof-like hydrolase  27.72 
 
 		 273 aa  90.5  3e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.503819  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1155  Cof-like hydrolase  28.31 
 
 		 270 aa  90.1  3e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.269988  normal  0.0161592 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0393  Cof-like hydrolase  27.82 
 
 		 269 aa  90.1  3e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02386  hypothetical protein  25.71 
 
 		 268 aa  89.4  5e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0815  HAD superfamily hydrolase  27.37 
 
 		 274 aa  89.4  6e-17  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.493378  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0909  Cof-like hydrolase  25.69 
 
 		 268 aa  89  8e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000198866  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1887  Cof protein  26.3 
 
 		 270 aa  88.6  9e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0437079  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0853  Cof-like hydrolase  30.5 
 
 		 265 aa  88.6  9e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0916  phosphatase YbjI  28.73 
 
 		 271 aa  88.2  1e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0939  phosphatase YbjI  29.66 
 
 		 271 aa  87.4  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0971  phosphatase YbjI  29.66 
 
 		 271 aa  87.8  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1162  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  24.23 
 
 		 257 aa  87.4  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.352736  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4223  sugar phosphatase  27.97 
 
 		 281 aa  87.8  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0997  phosphatase YbjI  28.36 
 
 		 271 aa  87.4  2e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.100252 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0258  hypothetical protein  26.94 
 
 		 268 aa  87.8  2e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2123  Cof-like hydrolase  24.35 
 
 		 266 aa  87.4  2e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000204309  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2847  phosphotransferase  26.77 
 
 		 273 aa  87.8  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4024  HAD superfamily hydrolase  23.46 
 
 		 257 aa  87  3e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4116  sugar phosphatase  27.97 
 
 		 281 aa  87  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4043  sugar phosphatase  27.97 
 
 		 270 aa  87  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4060  sugar phosphatase  27.61 
 
 		 270 aa  87  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4149  sugar phosphatase  27.82 
 
 		 269 aa  87  3e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.680051  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0005  sugar phosphatase  27.82 
 
 		 269 aa  87  3e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4095  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  23.46 
 
 		 257 aa  87  3e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000603342  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0156  Cof-like hydrolase  26.91 
 
 		 273 aa  86.3  4e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.937674 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1000  phosphatase YbjI  29.28 
 
 		 271 aa  86.3  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4165  sugar phosphatase  27.97 
 
 		 281 aa  86.3  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.639249  normal  0.797935 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3970  putative sugar phosphatase  26.18 
 
 		 266 aa  85.9  6e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.35132  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2934  phosphotransferase  26.77 
 
 		 273 aa  85.9  7e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0053  Cof-like hydrolase  24.74 
 
 		 277 aa  85.5  7e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0228565  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0971  HAD family hydrolase  28.06 
 
 		 278 aa  85.5  8e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1019  phosphatase YbjI  28.14 
 
 		 271 aa  85.5  8e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.130253  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4173  sugar phosphatase  27.44 
 
 		 269 aa  85.5  9e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.729204  hitchhiker  0.0085653 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3733  HAD superfamily hydrolase  23.08 
 
 		 257 aa  85.5  9e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03705  predicted hydrolase  26.3 
 
 		 266 aa  85.1  0.000000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4078  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  23.46 
 
 		 257 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00227623  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1083  Cof-like hydrolase  26.59 
 
 		 257 aa  85.1  0.000000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0903  phosphatase YbjI  27.76 
 
 		 271 aa  84.7  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03654  hypothetical protein  26.3 
 
 		 266 aa  85.1  0.000000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4193  putative sugar phosphatase  26.3 
 
 		 266 aa  84.7  0.000000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00213999 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5023  Cof protein  27.74 
 
 		 271 aa  84  0.000000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4182  putative sugar phosphatase  26.3 
 
 		 266 aa  84.7  0.000000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.152006 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0247  HAD superfamily hydrolase  27.82 
 
 		 270 aa  84.3  0.000000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00065793  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3802  Cof-like hydrolase  24.15 
 
 		 257 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.438125  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5111  Cof-like hydrolase  27.74 
 
 		 271 aa  84  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.569864 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>