244 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_1705 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010655  Amuc_1705  Endoribonuclease L-PSP  100 
 
 
156 aa  313  7e-85  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.182301  hitchhiker  0.0000000000000067862 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1427  endoribonuclease L-PSP  52.67 
 
 
155 aa  150  7e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.426351 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3343  Endoribonuclease L-PSP  47.65 
 
 
152 aa  147  6e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0721684  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2448  endoribonuclease L-PSP  51.33 
 
 
155 aa  146  1.0000000000000001e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.514496  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3546  Endoribonuclease L-PSP  48.67 
 
 
155 aa  145  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0435  endoribonuclease L-PSP  47.68 
 
 
155 aa  144  3e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4853  Endoribonuclease L-PSP  49.34 
 
 
154 aa  144  4.0000000000000006e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2153  endoribonuclease L-PSP, putative  47.62 
 
 
152 aa  144  6e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3735  endoribonuclease L-PSP  49.66 
 
 
170 aa  144  6e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0323381  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2408  endoribonuclease L-PSP  48 
 
 
155 aa  142  1e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.628638  normal  0.167618 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4751  putative endoribonuclease L-PSP (protein synthesis inhibitor)  50.33 
 
 
155 aa  142  2e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.708532  normal  0.751414 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3043  endoribonuclease L-PSP  48 
 
 
155 aa  142  2e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.574471 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3313  endoribonuclease L-PSP  48 
 
 
155 aa  139  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.129795  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3793  endoribonuclease L-PSP  46.98 
 
 
154 aa  139  1.9999999999999998e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.756407 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3144  endoribonuclease L-PSP  46.36 
 
 
152 aa  138  3e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.147772 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1645  Endoribonuclease L-PSP  44.67 
 
 
156 aa  137  4.999999999999999e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.827325 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6055  Endoribonuclease L-PSP  46.26 
 
 
162 aa  136  1e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.316335  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1092  endoribonuclease L-PSP  45.95 
 
 
151 aa  136  1e-31  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0200  endoribonuclease L-PSP  47.71 
 
 
153 aa  136  1e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.151399  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3580  endoribonuclease L-PSP  48.63 
 
 
153 aa  131  3e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.45612  normal  0.209775 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2027  endoribonuclease L-PSP  46.36 
 
 
154 aa  130  6e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0633724  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2706  Endoribonuclease L-PSP  44.59 
 
 
153 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.253512  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0894  hypothetical protein  48 
 
 
152 aa  129  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.324074  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2553  endoribonuclease L-PSP  48 
 
 
152 aa  129  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0137  endoribonuclease L-PSP  46.36 
 
 
155 aa  128  3e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0250  endoribonuclease L-PSP  48.34 
 
 
152 aa  128  3e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2736  endoribonuclease L-PSP  47.97 
 
 
146 aa  127  5.0000000000000004e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.947  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5091  hypothetical protein  44.3 
 
 
163 aa  127  5.0000000000000004e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2030  Endoribonuclease L-PSP  40.79 
 
 
156 aa  126  9.000000000000001e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00146961  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2319  endoribonuclease L-PSP  45.86 
 
 
157 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.278154 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1122  hypothetical protein  44.37 
 
 
154 aa  124  4.0000000000000003e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.457332  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0986  hypothetical protein  43.23 
 
 
156 aa  124  5e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0698758  normal  0.152684 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1944  Endoribonuclease L-PSP  44.52 
 
 
153 aa  124  6e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1165  hypothetical protein  44.37 
 
 
154 aa  124  6e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2457  endoribonuclease L-PSP  43.05 
 
 
153 aa  123  8.000000000000001e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1379  endoribonuclease L-PSP  43.05 
 
 
158 aa  123  8.000000000000001e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1554  Endoribonuclease L-PSP  42 
 
 
168 aa  123  9e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.30004 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13709  hypothetical protein  45.27 
 
 
151 aa  123  1e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0525391 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2803  endoribonuclease L-PSP  45.7 
 
 
155 aa  123  1e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.117143  normal  0.432336 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2477  endoribonuclease L-PSP  44.37 
 
 
153 aa  122  1e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.738257  normal  0.0496442 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6138  endoribonuclease L-PSP  44.74 
 
 
153 aa  122  1e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0927  endoribonuclease L-PSP  41.72 
 
 
152 aa  122  2e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.553211 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6426  endoribonuclease L-PSP  44.74 
 
 
153 aa  122  2e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.576265 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4551  Endoribonuclease L-PSP  44.23 
 
 
157 aa  121  3e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4070  endoribonuclease L-PSP  43.59 
 
 
162 aa  120  7e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.256894  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0713  Endoribonuclease L-PSP  45.1 
 
 
152 aa  120  7e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0841  endoribonuclease L-PSP  43.33 
 
 
164 aa  120  9.999999999999999e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3462  endoribonuclease L-PSP  44.83 
 
 
159 aa  120  9.999999999999999e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0120904 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1212  Endoribonuclease L-PSP  41.78 
 
 
154 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2118  endoribonuclease L-PSP  38.96 
 
 
154 aa  118  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.124484  normal  0.0891562 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1252  endoribonuclease L-PSP  45.75 
 
 
156 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.476616  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1749  endoribonuclease L-PSP  43.79 
 
 
151 aa  119  1.9999999999999998e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.470188  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4437  Endoribonuclease L-PSP  43.59 
 
 
157 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.062411  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5691  endoribonuclease L-PSP  40.4 
 
 
152 aa  117  3.9999999999999996e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1470  endoribonuclease L-PSP  46.71 
 
 
157 aa  117  3.9999999999999996e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1477  endoribonuclease L-PSP  42.76 
 
 
174 aa  118  3.9999999999999996e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3039  Endoribonuclease L-PSP  43.31 
 
 
157 aa  117  4.9999999999999996e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2270  endoribonuclease L-PSP  39.74 
 
 
152 aa  117  6e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.724419  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1792  endoribonuclease L-PSP  40.65 
 
 
156 aa  117  6e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.282183  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3105  endoribonuclease L-PSP  43.71 
 
 
155 aa  117  6e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.473778  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8908  Endoribonuclease L-PSP  44.08 
 
 
152 aa  117  6e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.974502 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1740  endoribonuclease L-PSP  39.74 
 
 
152 aa  117  6e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1272  endoribonuclease L-PSP  42.11 
 
 
153 aa  117  6e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.103554  hitchhiker  0.00713107 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2388  endoribonuclease L-PSP  39.74 
 
 
152 aa  117  6e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.921996  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2352  endoribonuclease L-PSP  39.74 
 
 
152 aa  117  6e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0950  L-PSP family endoribonuclease  38.82 
 
 
164 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.449669  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2373  endoribonuclease L-PSP  39.07 
 
 
152 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0168  endoribonuclease L-PSP  45.45 
 
 
153 aa  115  1.9999999999999998e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2531  hypothetical protein  42.11 
 
 
156 aa  115  1.9999999999999998e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1313  L-PSP family endoribonuclease  38.96 
 
 
164 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.221061  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0708  L-PSP family endoribonuclease  38.96 
 
 
155 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1577  Endoribonuclease L-PSP  39.61 
 
 
156 aa  114  3.9999999999999997e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.401191  normal  0.481334 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2609  endoribonuclease L-PSP  42.95 
 
 
152 aa  114  5e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.56142 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_37922  predicted protein  40.38 
 
 
185 aa  114  5e-25  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00476754  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47655  predicted protein  40.38 
 
 
185 aa  114  5e-25  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00618585  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2223  L-PSP family endoribonuclease  39.07 
 
 
152 aa  114  6e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2542  L-PSP family endoribonuclease  39.07 
 
 
152 aa  114  6e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.455947  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1153  putative endoribonuclease L-PSP  39.07 
 
 
152 aa  114  6e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1162  putative endoribonuclease L-PSP  39.07 
 
 
152 aa  114  6e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.749409  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2072  putative endoribonuclease L-PSP  39.07 
 
 
152 aa  114  6e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.110705  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2699  Endoribonuclease L-PSP  42.86 
 
 
162 aa  114  6.9999999999999995e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.396345  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1123  endoribonuclease L-PSP  41.72 
 
 
155 aa  113  7.999999999999999e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.321047  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7458  Endoribonuclease L-PSP  42.68 
 
 
157 aa  113  8.999999999999998e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.462626  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2111  Endoribonuclease L-PSP  44.9 
 
 
163 aa  113  8.999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1348  Endoribonuclease L-PSP  42.21 
 
 
157 aa  112  1.0000000000000001e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.22562 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6667  Endoribonuclease L-PSP  43.24 
 
 
165 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0416868  normal  0.0241604 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3178  Endoribonuclease L-PSP  40 
 
 
177 aa  112  2.0000000000000002e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.738101 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7001  Endoribonuclease L-PSP  42.67 
 
 
153 aa  112  2.0000000000000002e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.29749  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1774  Endoribonuclease L-PSP  39.61 
 
 
156 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.98491  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0228  Endoribonuclease L-PSP  42.18 
 
 
152 aa  112  2.0000000000000002e-24  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2555  hypothetical protein  41.72 
 
 
154 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.853817 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5312  Endoribonuclease L-PSP  45.1 
 
 
153 aa  111  3e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.688432 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6842  Endoribonuclease L-PSP  39.73 
 
 
168 aa  111  3e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.173433 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4883  endoribonuclease L-PSP  38.31 
 
 
157 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000371063  normal  0.434406 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1369  endoribonuclease L-PSP  44.59 
 
 
153 aa  111  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.324136 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0465  hypothetical protein  44.3 
 
 
152 aa  111  5e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.346493 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2988  endoribonuclease L-PSP  43.24 
 
 
164 aa  110  5e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1180  Endoribonuclease L-PSP  44.85 
 
 
153 aa  110  6e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1062  Endoribonuclease L-PSP  45.89 
 
 
151 aa  110  6e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0904  endoribonuclease L-PSP  41.06 
 
 
151 aa  110  8.000000000000001e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>