More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_0686 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010655  Amuc_0686  ABC transporter related  100 
 
 		 843 aa  1729    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.409076 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0836  excinuclease ATPase subunit  62.7 
 
 		 862 aa  1042    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1467  ABC transporter related  64.86 
 
 		 843 aa  1089    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1665  excinuclease ATPase subunit  46.9 
 
 		 846 aa  752    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19390  Excinuclease ATPase subunit  68.03 
 
 		 837 aa  1155    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000025916 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2119  ABC transporter related  57.75 
 
 		 836 aa  932    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0955  ABC transporter related  47.34 
 
 		 837 aa  774    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6311  excinuclease ABC, A subunit  36.75 
 
 		 843 aa  565  1e-160  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.420844  normal  0.88955 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2496  excinuclease ABC, A subunit  36.84 
 
 		 838 aa  563  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.630053  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0866  excinuclease ABC, A subunit  36.84 
 
 		 853 aa  561  1e-158  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.249589  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4773  excinuclease ABC, A subunit  36.85 
 
 		 850 aa  557  1e-157  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.235666  normal  0.0143445 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1839  excinuclease ABC, A subunit  36.74 
 
 		 822 aa  547  1e-154  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.351475  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0906  excinuclease ABC, A subunit  37.1 
 
 		 860 aa  547  1e-154  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3087  excinuclease ABC subunit A  35.87 
 
 		 838 aa  545  1e-153  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2636  excinuclease ABC, A subunit  35.87 
 
 		 838 aa  544  1e-153  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03329  putative excinuclease ABC subunit A  35.61 
 
 		 834 aa  540  9.999999999999999e-153  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3139  excinuclease ABC subunit A  35.04 
 
 		 877 aa  541  9.999999999999999e-153  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0918  excinuclease ABC subunit A  36.11 
 
 		 899 aa  541  9.999999999999999e-153  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0838  excinuclease ABC, A subunit  36.75 
 
 		 844 aa  538  1e-151  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.503748  normal  0.281681 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5906  excinuclease ABC subunit A  35.59 
 
 		 897 aa  536  1e-151  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3073  excinuclease ABC, A subunit  36 
 
 		 950 aa  538  1e-151  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0673699  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0594  ABC transporter related  36.68 
 
 		 848 aa  533  1e-150  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.43104  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0603  ABC transporter related  36.91 
 
 		 848 aa  533  1e-150  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.100941  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2778  excinuclease ABC, A subunit  36.22 
 
 		 838 aa  533  1e-150  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0742019  normal  0.349743 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0616  ABC transporter related  36.91 
 
 		 848 aa  533  1e-150  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.254325  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3664  excinuclease ABC, A subunit  36.97 
 
 		 832 aa  533  1e-150  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4722  excinuclease ABC, A subunit  36.49 
 
 		 861 aa  535  1e-150  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.286456  normal  0.774067 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2085  excinuclease ABC, A subunit  37.49 
 
 		 851 aa  528  1e-148  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.56515 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1904  excinuclease ABC, A subunit  36.78 
 
 		 843 aa  525  1e-147  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000110525 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0207  ABC transporter related  34.92 
 
 		 898 aa  523  1e-147  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.328362  normal  0.710281 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6320  excinuclease ABC, A subunit  36 
 
 		 885 aa  520  1e-146  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.687364  normal  0.941375 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0151  ABC transporter related  34.7 
 
 		 898 aa  521  1e-146  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.160582 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5800  ABC transporter related  35.2 
 
 		 899 aa  518  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.177592  normal  0.587186 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0102  excinuclease ABC, A subunit  35.24 
 
 		 894 aa  515  1e-144  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0951  ABC transporter related  36.64 
 
 		 833 aa  513  1e-144  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.321909 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1887  excinuclease ABC, A subunit  37.79 
 
 		 776 aa  509  1e-143  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.72737 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3676  excinuclease ABC subunit A  35.91 
 
 		 880 aa  511  1e-143  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.090284  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19620  excinuclease ABC, A subunit  35.35 
 
 		 863 aa  509  1e-143  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4737  excinuclease ABC, A subunit  36.11 
 
 		 881 aa  501  1e-140  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6072  ABC transporter related  35.42 
 
 		 827 aa  491  1e-137  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.163743  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2036  Excinuclease ABC subunit A  36.46 
 
 		 944 aa  483  1e-135  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0663505  hitchhiker  0.000130956 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2123  excinuclease ABC, A subunit  34.55 
 
 		 944 aa  484  1e-135  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.429692 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2991  excinuclease ABC subunit A  37.98 
 
 		 954 aa  481  1e-134  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.9416  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0329  excinuclease ABC subunit A  38.16 
 
 		 939 aa  481  1e-134  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5271  excinuclease ABC subunit A  37.22 
 
 		 958 aa  477  1e-133  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5328  excinuclease ABC subunit A  37.36 
 
 		 958 aa  478  1e-133  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5015  excinuclease ABC subunit A  37.22 
 
 		 958 aa  476  1e-133  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.93666  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4844  excinuclease ABC subunit A  37.22 
 
 		 958 aa  476  1e-133  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5395  excinuclease ABC subunit A  37.22 
 
 		 958 aa  476  1e-133  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5251  excinuclease ABC subunit A  37.22 
 
 		 958 aa  476  1e-133  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0337  excinuclease ABC subunit A  38.16 
 
 		 939 aa  478  1e-133  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3174  excinuclease ABC subunit A  37.84 
 
 		 955 aa  477  1e-133  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2265  ABC transporter related  33.14 
 
 		 820 aa  479  1e-133  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.285501  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4859  excinuclease ABC subunit A  37.22 
 
 		 958 aa  476  1e-132  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5285  excinuclease ABC subunit A  36.93 
 
 		 958 aa  473  1e-132  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5672  excinuclease ABC subunit A  37.07 
 
 		 958 aa  474  1e-132  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1999  excinuclease ABC subunit A  37.07 
 
 		 946 aa  474  1e-132  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0576024  normal  0.88061 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0800  excinuclease ABC subunit A  38.23 
 
 		 948 aa  474  1e-132  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0783  excinuclease ABC subunit A  38.23 
 
 		 948 aa  474  1e-132  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.686779  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18501  excinuclease ABC subunit A  37.66 
 
 		 979 aa  471  1.0000000000000001e-131  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.95453  normal  0.0541711 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4958  excinuclease ABC subunit A  36.7 
 
 		 959 aa  471  1.0000000000000001e-131  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2119  excinuclease ABC, A subunit  37.46 
 
 		 942 aa  468  9.999999999999999e-131  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000168396  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3709  excinuclease ABC subunit A  36.89 
 
 		 956 aa  469  9.999999999999999e-131  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2009  excinuclease ABC, A subunit  34.55 
 
 		 880 aa  468  9.999999999999999e-131  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0252  excinuclease ABC (subunit A)  34.86 
 
 		 942 aa  466  9.999999999999999e-131  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00117135  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0374  excinuclease ABC subunit A  36.98 
 
 		 952 aa  468  9.999999999999999e-131  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0411  excinuclease ABC, A subunit  36.84 
 
 		 957 aa  466  9.999999999999999e-131  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1015  excinuclease ABC subunit A  37.07 
 
 		 977 aa  468  9.999999999999999e-131  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.198775 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1322  excinuclease ABC, A subunit  36.42 
 
 		 934 aa  467  9.999999999999999e-131  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0124703  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07070  Excinuclease ABC subunit A  37.36 
 
 		 954 aa  466  9.999999999999999e-131  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.478607 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0885  excinuclease ABC, A subunit  36.81 
 
 		 947 aa  462  1e-129  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4529  excinuclease ABC subunit A  37.39 
 
 		 1004 aa  466  1e-129  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.388668 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2823  excinuclease ABC, A subunit  36.94 
 
 		 980 aa  463  1e-129  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.179729  normal  0.122251 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2038  excinuclease ABC, A subunit  35.72 
 
 		 963 aa  459  9.999999999999999e-129  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.225095  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0649  excinuclease ABC subunit A  36.61 
 
 		 1002 aa  462  9.999999999999999e-129  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0774  excinuclease ABC, A subunit  36.58 
 
 		 946 aa  462  9.999999999999999e-129  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0384  excinuclease ABC subunit A  36.32 
 
 		 954 aa  460  9.999999999999999e-129  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000942847  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_19211  excinuclease ABC subunit A  36.41 
 
 		 967 aa  459  9.999999999999999e-129  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_19031  excinuclease ABC subunit A  36.22 
 
 		 966 aa  460  9.999999999999999e-129  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0546  excinuclease ABC, A subunit  36.76 
 
 		 946 aa  458  1e-127  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0457921  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1437  excinuclease ABC, A subunit  36.83 
 
 		 942 aa  457  1e-127  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2882  excinuclease ABC, A subunit  36.02 
 
 		 964 aa  457  1e-127  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0522  excinuclease ABC subunit A  36.06 
 
 		 944 aa  456  1e-127  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0045705  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0157  excinuclease ABC, A subunit  36.03 
 
 		 954 aa  457  1e-127  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.352383  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2024  excinuclease ABC subunit A  37.38 
 
 		 945 aa  457  1e-127  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.136428  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0596  excinuclease ABC, A subunit  36.62 
 
 		 943 aa  458  1e-127  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.56752e-16 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_487  excinuclease ATPase subunit  36.62 
 
 		 946 aa  458  1e-127  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0328859  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1804  excinuclease ABC subunit A  36.13 
 
 		 967 aa  456  1e-127  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0255  excinuclease ABC subunit A  36.34 
 
 		 971 aa  457  1e-127  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1160  excinuclease ABC, A subunit  35.94 
 
 		 953 aa  459  1e-127  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.216625  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_19021  excinuclease ABC subunit A  35.94 
 
 		 967 aa  456  1e-127  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0554  excinuclease ABC, A subunit  36.5 
 
 		 938 aa  457  1e-127  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1109  excinuclease ABC subunit A  37.04 
 
 		 947 aa  456  1e-127  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.57709  normal  0.229428 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1518  ABC transporter related  32.48 
 
 		 823 aa  456  1e-127  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.168965 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2191  excinuclease ABC, A subunit  36.3 
 
 		 946 aa  452  1.0000000000000001e-126  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.109423  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1750  excinuclease ABC, A subunit  35.69 
 
 		 951 aa  453  1.0000000000000001e-126  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.173115 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2691  excinuclease ABC subunit A  36.87 
 
 		 987 aa  453  1.0000000000000001e-126  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0440  excinuclease ABC subunit A  37.38 
 
 		 916 aa  456  1.0000000000000001e-126  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.674144  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1422  excinuclease ABC, A subunit  36.92 
 
 		 963 aa  455  1.0000000000000001e-126  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0151035  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0976  excinuclease ABC subunit A  36.13 
 
 		 931 aa  453  1.0000000000000001e-126  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.177637  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>