67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_5767 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_5767  Putative FAD-dependent dehydrogenase-like protein  100 
 
 		 425 aa  823    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0312  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  22.32 
 
 		 483 aa  89.7  9e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.82561 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1600  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  23.08 
 
 		 483 aa  87.4  4e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.00906255  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0535  FAD dependent oxidoreductase  22.71 
 
 		 483 aa  85.9  0.000000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0222553  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0072  FAD dependent oxidoreductase  28.05 
 
 		 475 aa  78.2  0.0000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0525129  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2408  FAD dependent oxidoreductase  27.63 
 
 		 479 aa  78.6  0.0000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1879  FAD dependent oxidoreductase  26.83 
 
 		 479 aa  73.9  0.000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000394734  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1281  FAD dependent oxidoreductase  24.58 
 
 		 464 aa  72.8  0.00000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.133559  normal  0.330956 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0127  FAD dependent oxidoreductase  25.21 
 
 		 484 aa  70.9  0.00000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2322  FAD dependent oxidoreductase  25.55 
 
 		 462 aa  70.1  0.00000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.0000572952  unclonable  0.0000196984 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1411  FAD dependent oxidoreductase  23.46 
 
 		 454 aa  70.1  0.00000000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.839277  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1221  HI0933 family protein  22.83 
 
 		 469 aa  69.7  0.00000000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.362725  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0164  FAD dependent oxidoreductase  25.32 
 
 		 479 aa  69.3  0.0000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2634  FAD dependent oxidoreductase  23.55 
 
 		 463 aa  68.6  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3119  hypothetical protein  24.41 
 
 		 463 aa  66.6  0.0000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000253637  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2846  hypothetical protein  21.72 
 
 		 479 aa  66.6  0.0000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0410024  normal  0.0365316 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1195  FAD dependent oxidoreductase  24.95 
 
 		 479 aa  65.1  0.000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2668  hypothetical protein  25 
 
 		 447 aa  64.7  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0826556  normal  0.985407 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1923  FAD dependent oxidoreductase  22.15 
 
 		 462 aa  65.1  0.000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000227487  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0497  FAD dependent oxidoreductase  26.43 
 
 		 460 aa  63.9  0.000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000000325665  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2310  FAD dependent oxidoreductase  25.9 
 
 		 466 aa  63.5  0.000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000884654  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0865  FAD dependent oxidoreductase  23.4 
 
 		 461 aa  63.2  0.000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.969698  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1001  FAD dependent oxidoreductase  29.68 
 
 		 471 aa  63.2  0.000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0145  FAD dependent oxidoreductase  24.42 
 
 		 482 aa  62.8  0.00000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.1054 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0014  FAD dependent oxidoreductase  22.72 
 
 		 468 aa  62  0.00000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000000216552  normal  0.0136445 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1583  glucose-inhibited division protein A  24.56 
 
 		 477 aa  62  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000827555  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1203  FAD dependent oxidoreductase  25.63 
 
 		 526 aa  60.8  0.00000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1403  FAD dependent oxidoreductase  23.2 
 
 		 466 aa  59.7  0.00000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000635691  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07360  FAD-dependent dehydrogenase  28.52 
 
 		 468 aa  59.3  0.0000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.991458  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02150  FAD dependent oxidoreductase  22.64 
 
 		 462 aa  57.8  0.0000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.753086  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1155  hypothetical protein  24.26 
 
 		 477 aa  57.4  0.0000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000301579  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0018  FAD dependent oxidoreductase  22.55 
 
 		 472 aa  56.2  0.000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.417531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2133  FAD dependent oxidoreductase  27.5 
 
 		 464 aa  55.1  0.000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000832319  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0834  FAD dependent oxidoreductase  26.37 
 
 		 534 aa  54.3  0.000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0279  FAD dependent oxidoreductase  25.81 
 
 		 519 aa  53.9  0.000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2355  FAD dependent oxidoreductase  21.63 
 
 		 460 aa  53.5  0.000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000540757  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0605  glucose-inhibited division protein A  22.41 
 
 		 480 aa  53.1  0.000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2676  FAD dependent oxidoreductase  28.32 
 
 		 533 aa  52.8  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.585305 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0425  hypothetical protein  24.34 
 
 		 477 aa  52.8  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000428075  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2210  FAD dependent oxidoreductase  25 
 
 		 458 aa  52  0.00002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.626184  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1411  NAD(FAD)-dependent dehydrogenase  25.34 
 
 		 534 aa  51.6  0.00003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.142599 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1429  FAD dependent oxidoreductase  25.45 
 
 		 467 aa  50.8  0.00004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.174684  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0321  hypothetical protein  23.73 
 
 		 457 aa  50.8  0.00004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000214801  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3601  FAD dependent oxidoreductase  25.9 
 
 		 513 aa  50.4  0.00007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0826  FAD dependent oxidoreductase  24.93 
 
 		 532 aa  49.3  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.757728 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1017  putative uncharacterized dehydrogenase  33.33 
 
 		 532 aa  48.1  0.0003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1635  FAD dependent oxidoreductase  25.61 
 
 		 539 aa  48.1  0.0003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.000302713  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0009  FAD dependent oxidoreductase  22.36 
 
 		 460 aa  47  0.0006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.225553  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2641  FAD dependent oxidoreductase  23.73 
 
 		 542 aa  46.2  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0332  hypothetical protein  25.94 
 
 		 538 aa  45.8  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1737  putative FAD-dependent dehydrogenase  24.52 
 
 		 553 aa  45.4  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0998961  normal  0.247417 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1023  FAD dependent oxidoreductase  25.88 
 
 		 525 aa  45.1  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.271687  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12613  Uncharacterized FAD-dependent dehydrogenase  25 
 
 		 518 aa  44.7  0.003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3599  FAD dependent oxidoreductase  36.62 
 
 		 524 aa  44.7  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2014  uncharacterized FAD-dependent dehydrogenases  28 
 
 		 530 aa  44.7  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.766468  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0257  hypothetical protein  23.62 
 
 		 270 aa  45.1  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8970  DNA polymerase beta domain protein region  32.2 
 
 		 732 aa  44.3  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.330578  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07721  hypothetical protein  25.95 
 
 		 558 aa  44.3  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0740094 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0439  FAD dependent oxidoreductase  26.52 
 
 		 532 aa  44.3  0.004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0262472  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07290  FAD-dependent dehydrogenase  23.86 
 
 		 467 aa  43.9  0.005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0429  FAD dependent oxidoreductase  25.77 
 
 		 537 aa  43.9  0.006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.321003  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7300  FAD dependent oxidoreductase  22.66 
 
 		 520 aa  43.5  0.008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01511  hypothetical protein  25.56 
 
 		 539 aa  43.1  0.008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1436  FAD dependent oxidoreductase  38.57 
 
 		 556 aa  43.5  0.008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2930  hypothetical protein  38.03 
 
 		 537 aa  43.1  0.009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.039165  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0717  FAD dependent oxidoreductase  26.55 
 
 		 537 aa  43.1  0.009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2466  hypothetical protein  28.37 
 
 		 515 aa  43.1  0.009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0591389  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>