188 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4929 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_4929  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 395 aa  740    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.127537  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1048  major facilitator superfamily MFS_1  59.35 
 
 		 477 aa  380  1e-104  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.137816  normal  0.36117 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0291  major facilitator superfamily MFS_1  46.7 
 
 		 411 aa  250  4e-65  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.505334  normal  0.0430819 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1826  major facilitator superfamily MFS_1  40.21 
 
 		 415 aa  240  4e-62  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.793514  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1426  major facilitator superfamily MFS_1  39.95 
 
 		 415 aa  237  3e-61  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.681295  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3208  major facilitator transporter  41.6 
 
 		 415 aa  228  2e-58  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.54065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4972  major facilitator transporter  34.68 
 
 		 425 aa  189  7e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.702579  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2309  major facilitator transporter  38.16 
 
 		 426 aa  181  2e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.559549 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1618  major facilitator transporter  33.43 
 
 		 412 aa  179  1e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4586  major facilitator transporter  37.47 
 
 		 426 aa  178  2e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.101779  decreased coverage  0.00026814 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4715  major facilitator superfamily MFS_1  36.92 
 
 		 413 aa  172  7.999999999999999e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0900  major facilitator transporter  35.83 
 
 		 420 aa  172  1e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2602  major facilitator superfamily MFS_1  37.97 
 
 		 422 aa  170  3e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.954157  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1445  major facilitator transporter  35.79 
 
 		 419 aa  170  5e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.804439  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1463  major facilitator superfamily transporter  35.79 
 
 		 419 aa  170  5e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0911464  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5855  major facilitator superfamily transporter  35.15 
 
 		 420 aa  169  7e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4237  major facilitator superfamily MFS_1  37.13 
 
 		 422 aa  169  8e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4559  major facilitator transporter  34.93 
 
 		 421 aa  160  4e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4198  major facilitator transporter  35.2 
 
 		 418 aa  156  7e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4264  major facilitator superfamily transporter  35.2 
 
 		 418 aa  156  7e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.396919  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4425  major facilitator transporter  35.2 
 
 		 418 aa  156  7e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.226942  normal  0.426578 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10866  integral membrane transport protein  33.75 
 
 		 419 aa  138  2e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.25313  hitchhiker  0.00190628 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2181  multidrug resistance protein MdtH  29.63 
 
 		 401 aa  136  7.000000000000001e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.815188  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1802  multidrug resistance protein MdtH  31.79 
 
 		 401 aa  134  3e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.888492  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2050  multidrug resistance protein MdtH  31.48 
 
 		 401 aa  133  5e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2443  multidrug resistance protein MdtH  31.48 
 
 		 401 aa  133  5e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.313716  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2162  multidrug resistance protein MdtH  31.48 
 
 		 401 aa  133  5e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.976846  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01061  predicted drug efflux system  30.25 
 
 		 402 aa  132  6.999999999999999e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2581  major facilitator superfamily MFS_1  30.25 
 
 		 402 aa  132  6.999999999999999e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.487081  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2079  multidrug resistance protein MdtH  30.89 
 
 		 401 aa  133  6.999999999999999e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0994516  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01069  hypothetical protein  30.25 
 
 		 402 aa  132  6.999999999999999e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2261  multidrug resistance protein MdtH  30.25 
 
 		 402 aa  132  6.999999999999999e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1188  multidrug resistance protein MdtH  30.25 
 
 		 402 aa  132  6.999999999999999e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2064  multidrug resistance protein MdtH  30.25 
 
 		 402 aa  132  6.999999999999999e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.182289 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1444  multidrug resistance protein MdtH  30.25 
 
 		 402 aa  132  7.999999999999999e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.723421  hitchhiker  0.006681 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1188  multidrug resistance protein MdtH  30.25 
 
 		 402 aa  132  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.812353  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2535  multidrug resistance protein MdtH  30.25 
 
 		 402 aa  132  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.327464  normal  0.203452 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2206  multidrug resistance protein MdtH  29.88 
 
 		 402 aa  131  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.151391 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1579  multidrug resistance protein MdtH  31.69 
 
 		 402 aa  132  2.0000000000000002e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2022  multidrug resistance protein MdtH  29.88 
 
 		 402 aa  131  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1263  multidrug resistance protein MdtH  29.88 
 
 		 402 aa  131  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.21889 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1278  multidrug resistance protein MdtH  29.88 
 
 		 402 aa  131  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.742422 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1234  multidrug resistance protein MdtH  29.57 
 
 		 402 aa  130  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.182579 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1664  major facilitator superfamily MFS_1  32.63 
 
 		 406 aa  126  7e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2796  multidrug resistance protein MdtH  30.06 
 
 		 401 aa  126  9e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.141154 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4401  major facilitator transporter  32.92 
 
 		 414 aa  122  9.999999999999999e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.868968  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0239  multidrug resistance protein MdtH  27.69 
 
 		 411 aa  122  1.9999999999999998e-26  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2276  multidrug resistance protein MdtH  27.52 
 
 		 398 aa  120  4.9999999999999996e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0744  major facilitator transporter  31.27 
 
 		 408 aa  115  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.871557 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0231  major facilitator transporter  27.17 
 
 		 424 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4228  hypothetical protein  29.38 
 
 		 443 aa  77.4  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.642554  normal  0.06951 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0229  major facilitator family transporter  25.99 
 
 		 423 aa  77  0.0000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.421152  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0216  permease; multidrug resistance protein  25.99 
 
 		 423 aa  77  0.0000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0218  permease; multidrug resistance protein  25.99 
 
 		 423 aa  77  0.0000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0244  major facilitator family transporter  25.99 
 
 		 423 aa  77  0.0000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0256  major facilitator family transporter  25.99 
 
 		 423 aa  77  0.0000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5066  major facilitator family transporter  26.28 
 
 		 423 aa  77  0.0000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00487655  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0264  major facilitator family transporter  25.62 
 
 		 423 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0402115  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0259  major facilitator family transporter  25.68 
 
 		 423 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.129777  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0485  major facilitator superfamily MFS_1  22.06 
 
 		 485 aa  75.5  0.000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.165691  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1861  hypothetical protein  23.05 
 
 		 398 aa  74.3  0.000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0278  major facilitator family transporter  25.62 
 
 		 423 aa  74.3  0.000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.248198  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3387  hypothetical protein  23.28 
 
 		 395 aa  73.9  0.000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.113682  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3364  hypothetical protein  23.05 
 
 		 397 aa  72  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0222  major facilitator transporter  24.62 
 
 		 424 aa  72  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3386  hypothetical protein  22.99 
 
 		 393 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5676  major facilitator transporter  24.45 
 
 		 424 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.858387  decreased coverage  0.000722949 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3391  major facilitator family protein  22.69 
 
 		 399 aa  70.5  0.00000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.271693  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3060  membrane protein; TGF-beta receptor, type I/II extracellular region  21.6 
 
 		 393 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000191911  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2847  major facilitator family transporter  25.93 
 
 		 424 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000000267919 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2112  major facilitator superfamily permease  28.11 
 
 		 405 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.954954  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2132  major facilitator transporter  21.71 
 
 		 393 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3166  hypothetical protein  22.09 
 
 		 393 aa  68.2  0.0000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0358769  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3416  hypothetical protein  22.09 
 
 		 393 aa  68.2  0.0000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3150  membrane protein; TGF-beta receptor, type I/II extracellular region  22.09 
 
 		 393 aa  66.6  0.0000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000153748  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4592  major facilitator superfamily MFS_1  30.43 
 
 		 408 aa  62.4  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0896  major facilitator transporter  27.44 
 
 		 395 aa  62.4  0.00000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_880  major facilitator family transporter  25.62 
 
 		 423 aa  60.5  0.00000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4862  putative permease  23.38 
 
 		 397 aa  59.7  0.00000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4473  permease; multidrug resistance protein  23.38 
 
 		 397 aa  59.7  0.00000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4876  putative permease  23.38 
 
 		 397 aa  59.3  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4638  permease  23.08 
 
 		 397 aa  58.5  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.3147  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4992  permease  23.08 
 
 		 397 aa  58.5  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.976695  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0385  putative permease  23.08 
 
 		 397 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4852  putative permease  23.08 
 
 		 397 aa  58.9  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.320137  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4491  permease; multidrug resistance protein  22.77 
 
 		 397 aa  57.8  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.341266  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3507  major facilitator transporter  27.5 
 
 		 398 aa  56.2  0.0000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1452  hypothetical protein  29.92 
 
 		 604 aa  56.2  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4388  major facilitator superfamily MFS_1  28.48 
 
 		 419 aa  56.2  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4255  major facilitator transporter  27.58 
 
 		 419 aa  55.1  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.89322  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4649  major facilitator superfamily MFS_1  29.81 
 
 		 426 aa  54.7  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.788298  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4410  major facilitator superfamily MFS_1  26.97 
 
 		 419 aa  54.7  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4571  major facilitator transporter  21.78 
 
 		 397 aa  53.9  0.000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4917  major facilitator transporter  25.98 
 
 		 419 aa  53.1  0.000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0995629 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2859  major facilitator transporter  24.02 
 
 		 381 aa  53.1  0.000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.223141 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4883  permease, putative  22.77 
 
 		 397 aa  52.4  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0936  major facilitator family transporter  21.69 
 
 		 418 aa  50.8  0.00004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.98458e-20 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5044  major facilitator transporter  24.93 
 
 		 403 aa  50.8  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.183022  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3730  hypothetical protein  22.82 
 
 		 412 aa  50.8  0.00004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.218361  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2690  major facilitator transporter  22.14 
 
 		 401 aa  50.8  0.00004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0667129  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>