154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4287 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_4287  iron permease FTR1  100 
 
 		 290 aa  554  1e-157  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.486354  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25520  high-affinity Fe2+/Pb2+ permease  56.81 
 
 		 294 aa  278  9e-74  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0297463  normal  0.133563 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7009  iron permease FTR1  58.74 
 
 		 291 aa  276  4e-73  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.103758  normal  0.35089 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1914  iron permease FTR1  58.11 
 
 		 281 aa  274  1.0000000000000001e-72  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.347806 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5686  iron permease FTR1  51.87 
 
 		 287 aa  256  2e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.435606  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3388  iron permease FTR1  53.51 
 
 		 294 aa  253  2.0000000000000002e-66  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0229  iron permease FTR1  51.85 
 
 		 284 aa  247  2e-64  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4773  iron permease FTR1  52.36 
 
 		 303 aa  238  6.999999999999999e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3403  iron permease FTR1  47.74 
 
 		 702 aa  221  9e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1952  iron permease FTR1  51.17 
 
 		 304 aa  219  6e-56  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.495146  normal  0.377352 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1568  iron permease FTR1  44.89 
 
 		 304 aa  210  2e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1777  iron permease FTR1  47.19 
 
 		 691 aa  209  5e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3348  iron permease FTR1  47.23 
 
 		 677 aa  206  4e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1733  iron permease FTR1  46.18 
 
 		 304 aa  193  3e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.997501  normal  0.21644 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2597  Iron permease FTR1  42.4 
 
 		 290 aa  182  6e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3859  iron permease FTR1  38.99 
 
 		 280 aa  172  6.999999999999999e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.627947  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1660  iron permease FTR1  43.36 
 
 		 278 aa  170  2e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1811  iron permease FTR1  41.09 
 
 		 283 aa  168  9e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.668278 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0188  iron permease FTR1  41.07 
 
 		 283 aa  163  3e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0228999 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2929  iron permease FTR1  36.2 
 
 		 281 aa  161  1e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00359497  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0433  iron permease FTR1  41.8 
 
 		 278 aa  160  2e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00287745 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3143  iron permease FTR1  36.1 
 
 		 281 aa  160  3e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2872  Iron permease FTR1  38.95 
 
 		 279 aa  157  2e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.121627  normal  0.121811 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3367  Iron permease FTR1  40.66 
 
 		 284 aa  156  4e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.226405  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3898  iron permease FTR1  41.9 
 
 		 537 aa  155  7e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0247335 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1545  FTR1 family protein  37.68 
 
 		 277 aa  153  2.9999999999999998e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.884821  normal  0.11427 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1954  iron permease FTR1  43.49 
 
 		 289 aa  152  7e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.860822  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3314  iron permease FTR1  43.07 
 
 		 281 aa  151  1e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3352  iron permease FTR1  44.57 
 
 		 277 aa  150  3e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.404846  normal  0.257454 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3596  hypothetical protein  38.75 
 
 		 284 aa  149  4e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2784  iron permease FTR1  36.13 
 
 		 281 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2366  iron permease FTR1  36.8 
 
 		 282 aa  145  8.000000000000001e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0450502  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2040  ferrous iron permease EfeU  36.43 
 
 		 285 aa  145  8.000000000000001e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.19312 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2106  iron permease FTR1 family protein  37.31 
 
 		 276 aa  144  3e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.178558  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2264  ferrous iron permease EfeU  36.8 
 
 		 282 aa  143  4e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2579  FTR1 family protein  37.31 
 
 		 276 aa  142  6e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0388425 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1258  iron permease FTR1 family protein  37.31 
 
 		 276 aa  142  6e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.20725  normal  0.52486 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01026  hypothetical protein  37.31 
 
 		 276 aa  142  6e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.377125  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1132  iron permease FTR1 family protein  37.31 
 
 		 276 aa  142  6e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0198612  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1136  FTR1 family iron permease  37.31 
 
 		 276 aa  142  6e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.161686  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01019  putative membrane protein  37.31 
 
 		 279 aa  142  7e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.348057  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4913  iron permease FTR1  38.24 
 
 		 579 aa  135  9.999999999999999e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2612  iron permease FTR1  31.87 
 
 		 308 aa  131  1.0000000000000001e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000110205  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1177  iron permease FTR1  39.54 
 
 		 279 aa  127  3e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0971353  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0839  iron permease FTR1  34.91 
 
 		 308 aa  126  3e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5535  Iron permease FTR1  33.21 
 
 		 280 aa  112  6e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5870  iron permease FTR1  33.46 
 
 		 280 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.647838  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2207  iron permease FTR1  33.46 
 
 		 280 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2231  iron permease FTR1  33.46 
 
 		 280 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0883  FTR1 family iron permease  32.68 
 
 		 280 aa  110  3e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1923  FTR1 family iron permease  32.68 
 
 		 280 aa  110  3e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2033  FTR1 family iron permease  32.93 
 
 		 280 aa  110  3e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1742  OFeT family iron transporter  32.68 
 
 		 280 aa  110  3e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0322131  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0012  OFeT family iron transporter  32.68 
 
 		 280 aa  110  3e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0608  OFeT family iron transporter  32.68 
 
 		 280 aa  110  3e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.189417  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0510  OFeT family iron transporter  32.68 
 
 		 280 aa  110  3e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0912  OFeT family iron transporter  32.68 
 
 		 280 aa  110  3e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.29643  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2245  iron permease FTR1  32.72 
 
 		 280 aa  107  3e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.998183  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2124  iron permease FTR1  32.1 
 
 		 280 aa  106  5e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.640841  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1070  iron permease FTR1  32.82 
 
 		 280 aa  105  7e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.599025  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2875  iron permease FTR1  35.14 
 
 		 280 aa  104  2e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.834604  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1955  iron permease FTR1  30.4 
 
 		 281 aa  101  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0621861  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3473  iron permease FTR1  30.58 
 
 		 308 aa  99.8  4e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.361735 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1870  iron permease FTR1  31.84 
 
 		 417 aa  98.6  1e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0389897  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3150  oxidase-dependent Fe2+ transporter, (OFeT)family, FTR1-like  29.78 
 
 		 281 aa  97.4  3e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.92636  normal  0.80164 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1789  iron permease FTR1  28 
 
 		 315 aa  96.7  4e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3323  iron permease FTR1  30.86 
 
 		 307 aa  92.8  6e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1399  iron permease FTR1  29.55 
 
 		 281 aa  92.4  7e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0193139  normal  0.052775 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1763  Iron permease FTR1  30.87 
 
 		 315 aa  92  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2421  high-affinity iron transporter  32.31 
 
 		 305 aa  90.9  2e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.328401  normal  0.0402063 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0383  FTR1 family iron permease  32.43 
 
 		 278 aa  89.7  5e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.978993  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0331  FTR1 family iron permease  32.43 
 
 		 276 aa  89.7  5e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1834  iron permease FTR1  28.98 
 
 		 288 aa  88.6  1e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.163431  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3631  iron permease FTR1  32.02 
 
 		 279 aa  87.8  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0110382 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5173  iron permease FTR1  28.21 
 
 		 314 aa  87.4  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000262497 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1783  iron permease FTR1  34.62 
 
 		 634 aa  86.7  4e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.498306  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1385  iron permease FTR1  34.78 
 
 		 634 aa  83.6  0.000000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0164  high-affinity Fe2+/Pb2+ permease  33.19 
 
 		 653 aa  82.8  0.000000000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.00534559  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0450  FTR1 family iron permease  33.98 
 
 		 679 aa  81.6  0.00000000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.000168197  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3198  iron permease FTR1  30.77 
 
 		 280 aa  81.6  0.00000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.521431  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0160  iron permease FTR1 family protein  30.58 
 
 		 572 aa  79.3  0.00000000000006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.31653 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2954  iron permease FTR1  31.08 
 
 		 652 aa  79.3  0.00000000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1255  high-affinity Fe2+/Pb2+ permease  30.67 
 
 		 603 aa  79  0.0000000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1356  iron permease FTR1  32.02 
 
 		 271 aa  75.5  0.000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.861658 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2141  FTR1 family iron permease  31.78 
 
 		 639 aa  75.1  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2252  iron permease FTR1  31.78 
 
 		 639 aa  75.1  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2132  FTR1 family iron permease  31.78 
 
 		 639 aa  75.1  0.000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0517239 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6336  Iron permease FTR1  31.6 
 
 		 278 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1058  iron permease FTR1  27.21 
 
 		 683 aa  72.8  0.000000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0352795  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1108  FTR1 family iron permease  31.39 
 
 		 278 aa  72  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2353  permease  30.77 
 
 		 653 aa  71.6  0.00000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2722  FTR1 family iron permease  31.39 
 
 		 278 aa  72  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.112826  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2373  iron permease FTR1  32.13 
 
 		 278 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2987  iron permease FTR1  32.13 
 
 		 278 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2897  iron permease FTR1  31.5 
 
 		 278 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3007  iron permease FTR1  32.13 
 
 		 278 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4257  iron permease FTR1  25 
 
 		 303 aa  70.5  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2875  high-affinity Fe2+/Pb2+ permease  31 
 
 		 278 aa  70.1  0.00000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0141  lead uptake protein, putative  30.4 
 
 		 632 aa  69.3  0.00000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0304  hypothetical protein  32.34 
 
 		 276 aa  69.7  0.00000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.190446 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>