More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2383 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_2383  transcriptional regulator, AsnC family  100 
 
 		 152 aa  310  4.999999999999999e-84  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000000319505  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7861  putative transcriptional regulator, AsnC family  58.39 
 
 		 150 aa  176  1e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0789573  normal  0.974187 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3254  transcriptional regulator, AsnC family  58.46 
 
 		 134 aa  156  9e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3355  putative transcriptional regulator, AsnC family  53.85 
 
 		 150 aa  150  5.9999999999999996e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.417846  normal  0.0189646 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3658  AsnC family transcriptional regulator  51.05 
 
 		 149 aa  143  8.000000000000001e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0071  AsnC family transcriptional regulator  49.65 
 
 		 155 aa  139  1.9999999999999998e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3514  AsnC family transcriptional regulator  48.59 
 
 		 153 aa  124  4.0000000000000003e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0500665  normal  0.428471 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3737  transcriptional regulator, AsnC family  48.57 
 
 		 150 aa  124  5e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.659957  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1361  AsnC family transcriptional regulator  44.97 
 
 		 167 aa  123  1e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.658235  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3989  AsnC family transcriptional regulator  46.53 
 
 		 151 aa  120  6e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2253  AsnC family transcriptional regulator  47.14 
 
 		 150 aa  119  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.41621 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2477  putative leucine-responsive regulatory protein  44.97 
 
 		 154 aa  119  9.999999999999999e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.728563 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3768  transcriptional regulator, AsnC family  46.15 
 
 		 151 aa  119  1.9999999999999998e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7984  transcriptional regulator, AsnC family  45.71 
 
 		 150 aa  118  3e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0181  putative transcriptional regulator, AsnC family  45.77 
 
 		 150 aa  118  3e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0427  transcriptional regulator, AsnC family  44.37 
 
 		 150 aa  117  3.9999999999999996e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2249  AsnC family transcriptional regulator  46.43 
 
 		 150 aa  117  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.17304  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3654  AsnC family transcriptional regulator  45.71 
 
 		 150 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.652565  normal  0.0825689 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1485  AsnC family transcriptional regulator  41.61 
 
 		 159 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.457516  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46460  Transcriptional regulator, AsnC-fanily  46.43 
 
 		 151 aa  114  5e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2076  AsnC family transcriptional regulator  45 
 
 		 150 aa  114  6e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5150  transcriptional regulator, AsnC family  40.82 
 
 		 154 aa  113  8.999999999999998e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0301  AsnC family transcriptional regulator  40.94 
 
 		 160 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0951908  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1319  AsnC family transcriptional regulator  40.94 
 
 		 160 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2510  AsnC family transcriptional regulator  40.94 
 
 		 160 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.161372  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1253  AsnC family transcriptional regulator  40.94 
 
 		 160 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0213  AsnC family transcriptional regulator  43.06 
 
 		 153 aa  112  2.0000000000000002e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.757841 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0576  AsnC family transcriptional regulator  40.94 
 
 		 160 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0991  AsnC family transcriptional regulator  40.94 
 
 		 160 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0873  AsnC family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 156 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.286103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1325  AsnC family transcriptional regulator  40.94 
 
 		 160 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2309  AsnC family transcriptional regulator  40.14 
 
 		 157 aa  110  5e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00293447 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2497  AsnC family transcriptional regulator  40.14 
 
 		 156 aa  110  6e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.38008  normal  0.590435 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2774  AsnC family transcriptional regulator  43.84 
 
 		 150 aa  109  1.0000000000000001e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.315931  normal  0.712036 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0928  AsnC family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 158 aa  109  1.0000000000000001e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0505  AsnC family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 181 aa  108  3e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.287922  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0319  transcription regulator AsnC  42.18 
 
 		 152 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3685  AsnC family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 174 aa  107  5e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.930939  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1616  AsnC family transcriptional regulator  39.46 
 
 		 155 aa  107  5e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.636289  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1553  AsnC family transcriptional regulator  37.41 
 
 		 154 aa  107  7.000000000000001e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0410589  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0023  AsnC family transcriptional regulator  39.6 
 
 		 159 aa  106  9.000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.28543  normal  0.347248 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4242  AsnC family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 176 aa  106  9.000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4756  AsnC family transcriptional regulator  39.31 
 
 		 165 aa  106  1e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06912  transcriptional regulator  41.22 
 
 		 171 aa  106  1e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2221  transcriptional regulator, AsnC family  42.86 
 
 		 154 aa  106  1e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.17044  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3163  AsnC family transcriptional regulator  43.06 
 
 		 150 aa  106  1e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5660  AsnC family transcriptional regulator  39.46 
 
 		 155 aa  105  2e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3724  AsnC family transcriptional regulator  39.46 
 
 		 155 aa  105  2e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.201895  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0500  AsnC family transcriptional regulator  41.55 
 
 		 150 aa  105  2e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0245  transcriptional regulator  41.78 
 
 		 169 aa  105  2e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4644  AsnC family transcriptional regulator  39.46 
 
 		 155 aa  105  2e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.52735  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3252  AsnC family transcriptional regulator  40.69 
 
 		 153 aa  105  3e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4561  AsnC family transcriptional regulator  40.67 
 
 		 156 aa  105  3e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00127893  normal  0.163186 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2442  AsnC family transcriptional regulator  39.6 
 
 		 168 aa  105  3e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.127715  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0512  AsnC family transcriptional regulator  40.15 
 
 		 158 aa  104  4e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.981269 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1187  leucine-responsive transcriptional regulator  38.16 
 
 		 158 aa  104  4e-22  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3973  AsnC family transcriptional regulator  41.96 
 
 		 154 aa  104  5e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.918788  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2213  regulatory proteins, AsnC/Lrp  40.69 
 
 		 153 aa  104  5e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.214008  normal  0.442221 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1165  AsnC family transcriptional regulator  40.94 
 
 		 147 aa  104  5e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.403646 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2098  transcriptional regulator, AsnC family  38.78 
 
 		 155 aa  103  6e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0671  transcriptional regulator, AsnC family  41.91 
 
 		 145 aa  103  7e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0943569  hitchhiker  0.00922833 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0361  leucine-responsive regulatory protein  40.14 
 
 		 152 aa  103  8e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0551  transcription regulator AsnC  40.14 
 
 		 152 aa  103  8e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0374  leucine-responsive regulatory protein  40.14 
 
 		 152 aa  103  8e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2738  AsnC family transcriptional regulator  40.41 
 
 		 152 aa  103  9e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.579335  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3022  regulatory proteins, AsnC/Lrp  38.93 
 
 		 155 aa  103  1e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.00000000242064  normal  0.0404205 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2022  AsnC family transcriptional regulator  38.69 
 
 		 157 aa  102  1e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1494  leucine-responsive transcriptional regulator  42.18 
 
 		 164 aa  102  1e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000974852  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1530  AsnC family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 157 aa  102  2e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.14965  normal  0.648234 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2760  leucine-responsive transcriptional regulator  37.75 
 
 		 158 aa  102  2e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1612  leucine-responsive transcriptional regulator  38.1 
 
 		 164 aa  102  2e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000163573  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5540  transcriptional regulator, AsnC family  39.42 
 
 		 203 aa  102  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1042  HTH-type transcriptional regulator, AsnC family  39.85 
 
 		 147 aa  102  2e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3221  AsnC family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 155 aa  102  2e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1175  transcriptional regulator, AsnC family  42.21 
 
 		 157 aa  102  2e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3830  AsnC family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 158 aa  102  2e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.676178  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1742  leucine-responsive transcriptional regulator  40.38 
 
 		 166 aa  102  2e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00000000110042  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3954  AsnC family transcriptional regulator  39.46 
 
 		 152 aa  102  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2066  AsnC family transcriptional regulator  39.6 
 
 		 156 aa  102  2e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2597  leucine-responsive transcriptional regulator  38.1 
 
 		 164 aa  102  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000282665  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1018  AsnC family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 162 aa  102  2e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000336802  hitchhiker  0.00248451 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01796  leucine-responsive transcriptional regulator  41.89 
 
 		 164 aa  102  2e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2686  leucine-responsive transcriptional regulator  38.1 
 
 		 164 aa  102  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.247423  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0764  AsnC family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 156 aa  101  3e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.267919  normal  0.248385 
 
 
-
 
NC_003296  RS02081  transcription regulator protein  40.14 
 
 		 152 aa  102  3e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2299  AsnC family transcriptional regulator  41.26 
 
 		 156 aa  101  3e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00073028 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5188  transcriptional regulator BkdR, putative  37.41 
 
 		 156 aa  101  4e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.354058  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5229  AsnC family transcriptional regulator  40.14 
 
 		 152 aa  101  4e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.104749  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5248  AsnC family transcriptional regulator  37.41 
 
 		 156 aa  101  4e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.58536  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5095  AsnC family transcriptional regulator  37.41 
 
 		 156 aa  101  4e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1794  leucine-responsive transcriptional regulator  40.14 
 
 		 165 aa  101  4e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000016537  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0275  AsnC family transcriptional regulator  36.91 
 
 		 156 aa  101  4e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1058  leucine-responsive transcriptional regulator  41.22 
 
 		 164 aa  100  5e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.000658641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2829  AsnC family transcriptional regulator  38.62 
 
 		 153 aa  100  5e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0655  AsnC family transcriptional regulator  41.1 
 
 		 196 aa  100  5e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1024  leucine-responsive transcriptional regulator  41.22 
 
 		 164 aa  100  5e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00000719526  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1073  leucine-responsive transcriptional regulator  41.22 
 
 		 164 aa  100  5e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.000166195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2234  leucine-responsive transcriptional regulator  42.18 
 
 		 167 aa  100  5e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000872232  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0993  leucine-responsive transcriptional regulator  41.22 
 
 		 164 aa  100  5e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000182939  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0964  leucine-responsive transcriptional regulator  41.22 
 
 		 164 aa  100  5e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000969196  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>