More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2169 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_2169  transcriptional regulator, LacI family  100 
 
 		 337 aa  654    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2405  LacI family transcriptional regulator  65.96 
 
 		 333 aa  416  9.999999999999999e-116  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.475476 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1296  LacI family transcription regulator  64.55 
 
 		 334 aa  397  1e-109  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1842  transcriptional regulator, LacI family  63.14 
 
 		 323 aa  387  1e-106  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.312267  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4934  transcriptional regulator, LacI family  58.13 
 
 		 336 aa  373  1e-102  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.129155  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5557  transcriptional regulator, LacI family  58.01 
 
 		 327 aa  341  8e-93  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.687181  normal  0.634318 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2988  transcriptional regulator, LacI family  55.72 
 
 		 328 aa  331  9e-90  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.922053  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1083  transcriptional regulator, LacI family  53.8 
 
 		 335 aa  320  3e-86  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0310257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4675  transcriptional regulator, LacI family  50.44 
 
 		 335 aa  314  1.9999999999999998e-84  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1766  transcriptional regulator, LacI family  50.45 
 
 		 340 aa  310  2.9999999999999997e-83  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0293304  normal  0.0298236 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10110  transcriptional regulator  51.5 
 
 		 342 aa  305  8.000000000000001e-82  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.625648 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1322  transcriptional regulator, LacI family  50.75 
 
 		 336 aa  288  9e-77  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1191  transcriptional regulator, LacI family  50 
 
 		 336 aa  276  3e-73  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.218553  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0414  regulatory protein LacI  49.25 
 
 		 333 aa  266  2.9999999999999995e-70  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.265718 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1317  transcriptional regulator, LacI family  45.09 
 
 		 353 aa  244  9.999999999999999e-64  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2612  transcriptional regulator, LacI family  43.47 
 
 		 342 aa  241  1e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.109106  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3464  LacI family transcription regulator  39.04 
 
 		 340 aa  214  9.999999999999999e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13620  transcriptional regulator  40.24 
 
 		 333 aa  214  1.9999999999999998e-54  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1242  LacI family transcription regulator  38.94 
 
 		 340 aa  206  6e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6905  transcriptional regulator, LacI family  39.47 
 
 		 334 aa  201  9.999999999999999e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00908765  hitchhiker  0.00367965 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4925  transcriptional regulator, LacI family  36.81 
 
 		 358 aa  178  1e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.344925  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3594  transcriptional regulator, LacI family  36.91 
 
 		 339 aa  178  1e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4931  transcriptional regulator, LacI family  40.06 
 
 		 340 aa  177  3e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.699714  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01800  transcriptional regulator  36.95 
 
 		 341 aa  176  5e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3601  transcriptional regulator, LacI family  37.95 
 
 		 358 aa  175  8e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0229751  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0384  regulatory protein LacI  36.31 
 
 		 339 aa  167  2.9999999999999998e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.899866  normal  0.153938 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0183  transcriptional regulator, LacI family  35.28 
 
 		 344 aa  160  2e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1061  LacI family response repressor  32.83 
 
 		 328 aa  152  8e-36  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.023904  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4929  LacI family transcription regulator  36.06 
 
 		 346 aa  150  4e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.33528  normal  0.200034 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0582  alanine racemase  32.94 
 
 		 337 aa  149  7e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000548778  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5484  LacI family transcription regulator  36.06 
 
 		 345 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00238485 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01470  transcriptional regulator  33.63 
 
 		 351 aa  147  2.0000000000000003e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17790  transcriptional regulator  43.9 
 
 		 332 aa  142  8e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.255976  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2204  transcriptional regulator, LacI family  30.19 
 
 		 337 aa  142  9.999999999999999e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3513  LacI family transcriptional regulator  34.81 
 
 		 337 aa  138  1e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.390726  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3199  LacI family transcription regulator  36 
 
 		 338 aa  132  9e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.13351 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0909  LacI family transcription regulator  32.16 
 
 		 338 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4583  transcriptional regulator, LacI family  33.91 
 
 		 343 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0718425  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1515  transcriptional regulator, LacI family  31.49 
 
 		 339 aa  130  4.0000000000000003e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4580  LacI family transcription regulator  35.74 
 
 		 351 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000821982 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5204  LacI family transcription regulator  35.74 
 
 		 351 aa  129  9.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.210784  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5655  LacI family transcription regulator  35.74 
 
 		 351 aa  129  9.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.447148  normal  0.330046 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14510  transcriptional regulator, LacI family  27.76 
 
 		 333 aa  129  9.000000000000001e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000207214  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2575  transcriptional regulator, LacI family  26.84 
 
 		 340 aa  127  2.0000000000000002e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000166441  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2354  LacI family transcription regulator  32.18 
 
 		 344 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0756754  normal  0.112701 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2870  transcriptional regulator, LacI family  31.03 
 
 		 342 aa  127  3e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09530  transcriptional regulator, LacI family  27.54 
 
 		 340 aa  125  1e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00123183  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0699  transcriptional regulator, LacI family  29.88 
 
 		 341 aa  125  1e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0952  LacI family transcription regulator  24.48 
 
 		 341 aa  124  3e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1846  LacI family transcription regulator  29.29 
 
 		 324 aa  123  4e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2203  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  24.41 
 
 		 336 aa  123  5e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000348221  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4199  LacI family transcription regulator  32.06 
 
 		 353 aa  123  5e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5637  LacI family transcription regulator  31.16 
 
 		 338 aa  122  6e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.339737  normal  0.425271 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0402  transcriptional regulator, LacI family  25 
 
 		 339 aa  122  8e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000159796  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6322  LacI family transcription regulator  34.39 
 
 		 337 aa  122  8e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.382059  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2155  transcriptional regulator, LacI family  32.04 
 
 		 338 aa  122  9e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.677334  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0275  transcriptional regulator, LacI family  33.63 
 
 		 339 aa  121  9.999999999999999e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.555598 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20880  transcriptional regulator, LacI family  27.33 
 
 		 343 aa  122  9.999999999999999e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2275  transcriptional regulator, LacI family  34.49 
 
 		 342 aa  122  9.999999999999999e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.995394  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6022  LacI family transcription regulator  34.19 
 
 		 337 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1895  LacI family transcriptional regulator  29.28 
 
 		 339 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.371942 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1798  LacI family transcription regulator  31.63 
 
 		 473 aa  120  3e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.651793 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2711  alanine racemase  29.33 
 
 		 342 aa  120  3e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000872573  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0161  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  27.65 
 
 		 336 aa  120  3.9999999999999996e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2863  putative catabolite control protein A  26.41 
 
 		 332 aa  119  4.9999999999999996e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.953072  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2548  catabolite control protein A, putative  26.41 
 
 		 332 aa  119  4.9999999999999996e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3767  maltose operon transcriptional repressor  29.03 
 
 		 343 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2681  LacI family transcription regulator  28.57 
 
 		 335 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0416  LacI family transcription regulator  26.17 
 
 		 330 aa  118  9.999999999999999e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4896  transcriptional repressor RbsR  30.81 
 
 		 333 aa  118  9.999999999999999e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000156613  hitchhiker  0.000000782419 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4811  catabolite control protein A  27.51 
 
 		 332 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4813  catabolite control protein A  27.81 
 
 		 332 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16200  transcriptional regulator, LacI family  27.67 
 
 		 336 aa  117  1.9999999999999998e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00346268  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3919  maltose operon transcriptional repressor  29.03 
 
 		 343 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3751  maltose operon transcriptional repressor  29.03 
 
 		 343 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4226  maltose operon transcriptional repressor  29.03 
 
 		 343 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4028  maltose operon transcriptional repressor  29.03 
 
 		 343 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4116  maltose operon transcriptional repressor  29.03 
 
 		 340 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.271073  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3342  global transcriptional regulator, catabolite control protein A  28.32 
 
 		 332 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000152618  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4134  maltose operon transcriptional repressor  29.03 
 
 		 340 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4061  maltose operon transcriptional repressor  29.03 
 
 		 343 aa  117  3e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0449  catabolite control protein A  26.11 
 
 		 332 aa  117  3e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.486602 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1789  transcriptional regulator, LacI family  31.72 
 
 		 343 aa  117  3e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3896  LacI family transcription regulator  31.18 
 
 		 339 aa  117  3e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1344  transcriptional regulator, LacI family  31.01 
 
 		 365 aa  117  3.9999999999999997e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0420  LacI family transcription regulator  26.5 
 
 		 330 aa  117  3.9999999999999997e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.130171  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3838  LacI family transcription regulator  29.03 
 
 		 343 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4790  catabolite control protein A  26.11 
 
 		 332 aa  116  5e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1119  LacI family transcription regulator  33.92 
 
 		 347 aa  116  5e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00140598 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4506  global transcriptional regulator, catabolite control protein A  28.53 
 
 		 332 aa  116  6e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0038285  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0736  transcriptional regulator, LacI family  32.73 
 
 		 354 aa  116  6e-25  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.585027  normal  0.948547 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1123  maltose operon transcriptional repressor  28.74 
 
 		 343 aa  116  6e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4575  catabolite control protein A  27.22 
 
 		 332 aa  116  6.9999999999999995e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4929  catabolite control protein A  27.22 
 
 		 332 aa  116  6.9999999999999995e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4410  catabolite control protein A  27.43 
 
 		 332 aa  115  8.999999999999998e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4795  catabolite control protein A  27.43 
 
 		 332 aa  115  8.999999999999998e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2273  LacI family transcription regulator  31.4 
 
 		 333 aa  115  1.0000000000000001e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0311079  hitchhiker  0.000018406 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4882  LacI family transcription regulator  33.53 
 
 		 337 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3283  LacI family transcription regulator  33.53 
 
 		 337 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.815296 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3227  LacI family transcription regulator  32 
 
 		 362 aa  115  1.0000000000000001e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>