More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2150 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_2150  histidine kinase  100 
 
 		 456 aa  877    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00536221  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0586  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.97 
 
 		 477 aa  218  1e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1694  histidine kinase  37.69 
 
 		 474 aa  212  1e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000263761 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4513  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.03 
 
 		 461 aa  211  3e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.95033 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1538  Signal transduction histidine kinase-like protein  36.19 
 
 		 464 aa  202  9.999999999999999e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.474799  normal  0.22547 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1696  ATPase domain-containing protein  36.85 
 
 		 469 aa  194  4e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.862129 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5696  histidine kinase  32.85 
 
 		 455 aa  193  5e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0454325  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0714  histidine kinase  36.63 
 
 		 480 aa  188  1e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1446  histidine kinase  35.16 
 
 		 461 aa  174  1.9999999999999998e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1460  histidine kinase  37.24 
 
 		 328 aa  119  9.999999999999999e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.530686  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4752  histidine kinase  35.92 
 
 		 454 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2794  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.76 
 
 		 475 aa  109  9.000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.383004  normal  0.0334865 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1550  Signal transduction histidine kinase-like protein  34.72 
 
 		 1162 aa  109  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2846  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.69 
 
 		 364 aa  108  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3030  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  25.97 
 
 		 576 aa  107  4e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.280253 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2057  sensor histidine kinase  26.67 
 
 		 452 aa  104  4e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2213  sensor histidine kinase  26.67 
 
 		 452 aa  104  4e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2241  sensor histidine kinase  29.32 
 
 		 452 aa  104  4e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5912199999999999e-27 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1945  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  31.02 
 
 		 371 aa  103  5e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4137  histidine kinase  30.15 
 
 		 448 aa  103  7e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0476  histidine kinase  29.02 
 
 		 364 aa  103  8e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0490  histidine kinase  29.02 
 
 		 364 aa  103  9e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.184842  normal  0.399326 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6209  histidine kinase  32.46 
 
 		 343 aa  102  1e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1308  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  27.87 
 
 		 457 aa  102  1e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1211  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  29.19 
 
 		 461 aa  102  1e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000020096  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2971  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  28.74 
 
 		 455 aa  102  2e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3099  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  29.19 
 
 		 461 aa  101  2e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000430471  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4461  histidine kinase  30.96 
 
 		 452 aa  102  2e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1328  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  29.19 
 
 		 461 aa  101  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1623  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.14 
 
 		 352 aa  101  3e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.238567  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4354  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.87 
 
 		 361 aa  100  4e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.693923  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0716  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.41 
 
 		 515 aa  100  5e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.880509  hitchhiker  0.00000493136 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2195  sensor histidine kinase  27.67 
 
 		 452 aa  100  5e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00104327  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4100  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.39 
 
 		 477 aa  100  6e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1604  sensor histidine kinase  25.68 
 
 		 455 aa  100  7e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0207  histidine kinase  33.86 
 
 		 566 aa  100  7e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1175  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.21 
 
 		 359 aa  100  7e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.169908 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1392  sensor histidine kinase  25.68 
 
 		 455 aa  100  8e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1446  histidine kinase  28.83 
 
 		 486 aa  99.8  9e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1227  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25 
 
 		 491 aa  99.4  1e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0255402  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2486  histidine kinase  32.99 
 
 		 347 aa  99  1e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4709  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.67 
 
 		 504 aa  99.8  1e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4423  ATPase domain-containing protein  35.95 
 
 		 449 aa  99.8  1e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.272251  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2867  sensor histidine kinase  29.14 
 
 		 463 aa  99  2e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0147797  normal  0.0868919 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7563  histidine kinase  34.39 
 
 		 389 aa  98.6  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.939415  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0959  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.53 
 
 		 471 aa  99  2e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0274092 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3054  histidine kinase  24.58 
 
 		 397 aa  98.2  3e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.784699  hitchhiker  0.000293992 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2702  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  29.79 
 
 		 443 aa  97.8  3e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.118263 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2314  histidine kinase  34.26 
 
 		 450 aa  97.8  3e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.697892  normal  0.500466 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1438  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.63 
 
 		 394 aa  97.4  5e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.210229  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1456  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.63 
 
 		 394 aa  97.4  5e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.746847 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0896  histidine kinase  23.32 
 
 		 491 aa  97.1  6e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3062  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.7 
 
 		 458 aa  97.1  6e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1067  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.01 
 
 		 425 aa  96.7  8e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.312987  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2265  histidine kinase  32.17 
 
 		 429 aa  95.9  1e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.19602  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05645  two-component sensor histidine kinase transcription regulator protein  30.97 
 
 		 512 aa  95.9  1e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5006  histidine kinase  32.1 
 
 		 426 aa  96.3  1e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5524  histidine kinase  33.54 
 
 		 857 aa  96.3  1e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0316  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.12 
 
 		 461 aa  95.9  1e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0648  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.95 
 
 		 515 aa  96.3  1e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2491  histidine kinase  26.71 
 
 		 472 aa  95.1  2e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.147009  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0259  sensor histidine kinase  31.02 
 
 		 440 aa  95.5  2e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0804  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.41 
 
 		 358 aa  95.1  2e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5981  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.95 
 
 		 515 aa  95.5  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0679423 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4166  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.1 
 
 		 445 aa  95.1  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0754013 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6217  putative two component sensor histidine kinase  29.02 
 
 		 467 aa  95.1  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1803  histidine kinase  30.74 
 
 		 360 aa  94.7  3e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.295005  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1397  Signal transduction histidine kinase  24.64 
 
 		 513 aa  94.7  3e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000010063  hitchhiker  4.02057e-23 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3675  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.58 
 
 		 379 aa  94.7  3e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.203937  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0141  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 365 aa  94.7  3e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.733195 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0812  sensor histidine kinase  31.63 
 
 		 518 aa  95.1  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.237942  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0227  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.02 
 
 		 482 aa  94.4  4e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.60128 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2357  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.78 
 
 		 458 aa  94.4  4e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.837767  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3486  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.49 
 
 		 471 aa  94.4  4e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09570  signal transduction histidine kinase  31.62 
 
 		 382 aa  94  5e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.224646 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2402  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.73 
 
 		 428 aa  94  6e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0032  histidine kinase  30.49 
 
 		 423 aa  93.6  6e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0702  histidine kinase  32.09 
 
 		 523 aa  93.6  6e-18  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3293  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.33 
 
 		 428 aa  93.6  6e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.931435 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3736  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.69 
 
 		 483 aa  93.6  6e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.509679  hitchhiker  0.0032323 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1979  sensor histidine kinase  30.28 
 
 		 433 aa  93.6  7e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.690956 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0970  two-component sensor kinase transcriptional regulatory protein  31.97 
 
 		 817 aa  93.6  7e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.862903  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3071  histidine kinase  31.34 
 
 		 369 aa  93.6  7e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000550678 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2670  sensor histidine kinase  31.29 
 
 		 505 aa  93.6  7e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00937  sensor histidine kinase  28.9 
 
 		 458 aa  93.6  7e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.000560614  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04930  signal transduction histidine kinase  30.29 
 
 		 389 aa  93.2  8e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2706  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  28.27 
 
 		 453 aa  93.2  8e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.46719  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01700  signal transduction histidine kinase  34.87 
 
 		 492 aa  93.2  8e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.560312  normal  0.659062 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3973  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.42 
 
 		 364 aa  93.2  8e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3282  histidine kinase  33.47 
 
 		 483 aa  93.2  9e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5446  Signal transduction histidine kinase-like protein  30.85 
 
 		 425 aa  93.2  9e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0114827  normal  0.17199 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0270  sensor histidine kinase  31.29 
 
 		 505 aa  92.8  1e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.258994  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0613  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  26.73 
 
 		 472 aa  92.4  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0773099  normal  0.773415 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1308  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  25.87 
 
 		 452 aa  92.8  1e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.116262 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1229  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.85 
 
 		 396 aa  92.8  1e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.177188 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3556  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  27.09 
 
 		 460 aa  92.8  1e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0808  sensor histidine kinase  31.29 
 
 		 523 aa  92.8  1e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0464  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.26 
 
 		 614 aa  92.8  1e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.778528  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2475  histidine kinase  33.33 
 
 		 472 aa  91.7  2e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000186434 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4250  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.93 
 
 		 969 aa  92  2e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.356606  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>