244 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2034 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_2034  Integral membrane protein TerC  100 
 
 		 334 aa  653    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0331  integral membrane protein TerC  77.47 
 
 		 325 aa  485  1e-136  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5015  Integral membrane protein TerC  70.92 
 
 		 344 aa  395  1e-109  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3613  integral membrane protein TerC  67.88 
 
 		 342 aa  395  1e-109  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0083  Integral membrane protein TerC  66.08 
 
 		 344 aa  396  1e-109  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2416  Integral membrane protein TerC  59.49 
 
 		 313 aa  351  1e-95  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2919  Integral membrane protein TerC  55.35 
 
 		 331 aa  341  1e-92  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000105664  normal  0.323377 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5098  integral membrane protein TerC  53 
 
 		 322 aa  327  2.0000000000000001e-88  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.137745  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5186  integral membrane protein TerC  53 
 
 		 322 aa  327  2.0000000000000001e-88  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0800835  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5477  integral membrane protein TerC  53 
 
 		 322 aa  327  2.0000000000000001e-88  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.409981  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3448  Integral membrane protein TerC  47.34 
 
 		 360 aa  325  8.000000000000001e-88  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000597859  hitchhiker  0.00065247 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1438  integral membrane protein TerC  53.5 
 
 		 329 aa  324  1e-87  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1705  integral membrane protein TerC  52.27 
 
 		 320 aa  323  4e-87  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2303  integral membrane protein TerC  58.9 
 
 		 314 aa  321  9.999999999999999e-87  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1628  integral membrane protein TerC  52.87 
 
 		 334 aa  320  1.9999999999999998e-86  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0016  integral membrane protein TerC  51.36 
 
 		 328 aa  320  3e-86  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0168  integral membrane protein TerC  46.98 
 
 		 321 aa  315  5e-85  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.0000000120388  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0184  TerC family membrane protein  50.52 
 
 		 321 aa  314  9.999999999999999e-85  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.36035  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0514  integral membrane protein TerC  54.09 
 
 		 328 aa  314  9.999999999999999e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.139671  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0543  Integral membrane protein TerC  54.09 
 
 		 328 aa  313  1.9999999999999998e-84  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2946  integral membrane protein TerC  48.79 
 
 		 322 aa  311  1e-83  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0216006  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_173  membrane protein, TerC family  49.48 
 
 		 308 aa  310  2e-83  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000225812  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1472  integral membrane protein TerC  53.43 
 
 		 318 aa  307  1.0000000000000001e-82  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0736705  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0547  Integral membrane protein TerC  54.57 
 
 		 328 aa  300  2e-80  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.386888  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2511  integral membrane protein TerC  48.36 
 
 		 335 aa  299  5e-80  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.168713  normal  0.0111876 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0923  integral membrane protein TerC  52.04 
 
 		 322 aa  299  5e-80  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1155  integral membrane protein TerC  48.78 
 
 		 311 aa  298  8e-80  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000825766  normal  0.0331018 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1897  Integral membrane protein TerC  44.95 
 
 		 339 aa  298  8e-80  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0567869  normal  0.451222 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1793  integral membrane protein TerC  51.13 
 
 		 318 aa  298  9e-80  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0291  integral membrane protein TerC  51.83 
 
 		 308 aa  297  1e-79  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2602  hypothetical protein  53.94 
 
 		 325 aa  297  2e-79  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.127831  normal  0.661335 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2053  integral membrane protein TerC  55.66 
 
 		 373 aa  297  2e-79  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.2838  normal  0.603844 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0056  integral membrane protein TerC  49.2 
 
 		 329 aa  296  2e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.963752 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0265  Integral membrane protein TerC  51.45 
 
 		 320 aa  295  5e-79  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0751  Integral membrane protein TerC  50.65 
 
 		 317 aa  293  3e-78  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3507  Integral membrane protein TerC  50 
 
 		 317 aa  293  3e-78  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3347  integral membrane protein TerC  50.32 
 
 		 330 aa  293  4e-78  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1153  integral membrane protein TerC  48.02 
 
 		 334 aa  292  6e-78  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0968  Integral membrane protein TerC  47.59 
 
 		 306 aa  291  7e-78  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.562577 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1025  Integral membrane protein TerC  47.9 
 
 		 327 aa  291  9e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.237996  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0855  TerC family membrane protein  47.24 
 
 		 311 aa  291  1e-77  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0835081  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1576  Integral membrane protein TerC  50.48 
 
 		 325 aa  290  2e-77  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2016  integral membrane protein TerC  50 
 
 		 320 aa  289  5.0000000000000004e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5359  TerC family protein  49.04 
 
 		 325 aa  288  7e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.114229  hitchhiker  0.00169974 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3259  integral membrane protein TerC  49.2 
 
 		 325 aa  287  1e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.153995 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1926  transporter  49.83 
 
 		 352 aa  287  1e-76  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0390  integral membrane protein TerC  49.36 
 
 		 354 aa  287  2e-76  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0875594  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1144  integral membrane protein TerC  46.05 
 
 		 310 aa  287  2e-76  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000129998  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1947  Integral membrane protein TerC  48.77 
 
 		 320 aa  286  2.9999999999999996e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.204992  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0534  Integral membrane protein TerC  48.05 
 
 		 317 aa  286  2.9999999999999996e-76  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3485  inner membrane protein alx  51.16 
 
 		 322 aa  286  4e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1862  Integral membrane protein TerC  49.12 
 
 		 320 aa  286  5e-76  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.201743  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3632  Integral membrane protein TerC  49.84 
 
 		 321 aa  283  2.0000000000000002e-75  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.443887  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3281  Integral membrane protein TerC  47.24 
 
 		 307 aa  283  2.0000000000000002e-75  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3415  inner membrane protein alx  50.49 
 
 		 322 aa  283  2.0000000000000002e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2138  hypothetical protein  46.58 
 
 		 317 aa  283  3.0000000000000004e-75  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0550  Integral membrane protein TerC  48 
 
 		 312 aa  283  4.0000000000000003e-75  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0040107  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3519  hypothetical protein  50.49 
 
 		 322 aa  283  4.0000000000000003e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.742561  hitchhiker  0.000693905 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3581  inner membrane protein alx  50.49 
 
 		 322 aa  283  4.0000000000000003e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.081228 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3412  inner membrane protein alx  50.49 
 
 		 337 aa  282  6.000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3524  protein Alx  50.16 
 
 		 321 aa  282  7.000000000000001e-75  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02957  predicted inner membrane protein, part of terminus  50.16 
 
 		 321 aa  281  1e-74  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0613  Integral membrane protein TerC  50 
 
 		 321 aa  281  1e-74  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4403  protein Alx  50.32 
 
 		 321 aa  281  1e-74  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.49414  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3270  protein Alx  50.16 
 
 		 321 aa  281  1e-74  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02907  hypothetical protein  50.16 
 
 		 320 aa  281  1e-74  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31610  TerC family protein  50 
 
 		 347 aa  281  1e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0594051 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0612  integral membrane protein TerC  50 
 
 		 321 aa  281  1e-74  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3380  protein Alx  51.5 
 
 		 321 aa  280  2e-74  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.568911  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2194  Integral membrane protein TerC  44.22 
 
 		 350 aa  280  3e-74  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2993  integral membrane protein TerC  45.82 
 
 		 339 aa  280  3e-74  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2440  integral membrane protein TerC  51.15 
 
 		 327 aa  280  3e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.127814  normal  0.55186 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3555  protein Alx  49.84 
 
 		 321 aa  279  4e-74  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4156  integral membrane protein TerC  51.85 
 
 		 323 aa  279  4e-74  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2113  hypothetical protein  46.58 
 
 		 317 aa  279  5e-74  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3568  integral membrane protein TerC  51.03 
 
 		 312 aa  278  7e-74  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00256618  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2688  hypothetical protein  48.73 
 
 		 346 aa  278  8e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.409159  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2606  integral membrane protein TerC  49.68 
 
 		 327 aa  278  1e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.271005 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2384  integral membrane protein TerC  48.54 
 
 		 359 aa  278  1e-73  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0331794  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1004  Integral membrane protein TerC  47.84 
 
 		 312 aa  278  1e-73  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.144845  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4318  integral membrane protein TerC  50 
 
 		 325 aa  276  3e-73  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1570  TerC family membrane protein  48.81 
 
 		 314 aa  275  5e-73  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2438  integral membrane protein TerC  49.19 
 
 		 329 aa  275  6e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.622946  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3305  TerC family membrane protein  49.18 
 
 		 327 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0231665 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0781  integral membrane protein TerC  50.18 
 
 		 314 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00541452  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3381  Integral membrane protein TerC  50.66 
 
 		 319 aa  274  2.0000000000000002e-72  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2183  Integral membrane protein TerC  44.97 
 
 		 330 aa  273  3e-72  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.157717  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5513  Integral membrane protein TerC  43.64 
 
 		 330 aa  272  5.000000000000001e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.195308  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3543  integral membrane protein TerC  49.68 
 
 		 322 aa  272  6e-72  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.45062 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2086  integral membrane protein TerC  43.15 
 
 		 354 aa  272  7e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0811  Integral membrane protein TerC  47.71 
 
 		 313 aa  271  8.000000000000001e-72  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2438  hypothetical protein  44.05 
 
 		 354 aa  271  9e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1240  Integral membrane protein TerC  46.55 
 
 		 338 aa  271  1e-71  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0237698 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0510  hypothetical protein  49.68 
 
 		 316 aa  271  2e-71  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1557  integral membrane protein TerC  47.59 
 
 		 328 aa  270  2e-71  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1747  hypothetical protein  46.79 
 
 		 325 aa  270  2.9999999999999997e-71  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2793  Integral membrane protein TerC  47.59 
 
 		 328 aa  270  2.9999999999999997e-71  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.611411  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2543  integral membrane protein TerC  46.2 
 
 		 327 aa  270  2.9999999999999997e-71  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2610  integral membrane protein TerC  46.2 
 
 		 327 aa  270  2.9999999999999997e-71  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1553  integral membrane protein TerC  47.59 
 
 		 328 aa  270  2.9999999999999997e-71  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.729834  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>