More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_1173 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_1173  two component transcriptional regulator, winged helix family  100 
 
 		 232 aa  451  1.0000000000000001e-126  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1196  two component transcriptional regulator  44.25 
 
 		 240 aa  165  5e-40  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2246  KDP operon transcriptional regulatory protein kdpE  43.75 
 
 		 230 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.683582  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2051  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  43.95 
 
 		 230 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.191031  normal  0.53595 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3248  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.48 
 
 		 224 aa  163  2.0000000000000002e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3482  two component transcriptional regulator  43.95 
 
 		 231 aa  160  2e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1865  response regulator receiver  43.36 
 
 		 224 aa  160  2e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.59899  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1269  two component transcriptional regulator  44.89 
 
 		 228 aa  159  4e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3729  two component transcriptional regulator  43.53 
 
 		 231 aa  158  5e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5362  two component transcriptional regulator  43.75 
 
 		 230 aa  159  5e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0748621 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4157  winged helix family two component transcriptional regulator  43.53 
 
 		 231 aa  158  6e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.507569  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2927  two component transcriptional regulator  44.89 
 
 		 228 aa  158  7e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1711  two component transcriptional regulator  43.72 
 
 		 231 aa  157  1e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5029  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.53 
 
 		 225 aa  155  5.0000000000000005e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3780  two component transcriptional regulator  42.92 
 
 		 233 aa  155  6e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1708  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.59 
 
 		 228 aa  152  4e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.476364 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4029  two component transcriptional regulator  43.11 
 
 		 241 aa  152  5e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.871415 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1159  two component transcriptional regulator  42.98 
 
 		 230 aa  150  1e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43340  two-component response regulator KdpE  44.83 
 
 		 230 aa  150  1e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.807414  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3077  two component transcriptional regulator  41.07 
 
 		 227 aa  150  2e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0535977  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1875  response regulator receiver  42.53 
 
 		 230 aa  150  2e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.72432  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2274  two component transcriptional regulator  42.34 
 
 		 231 aa  149  3e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0287  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.77 
 
 		 237 aa  149  5e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0371836  normal  0.118342 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1100  two component transcriptional regulator  42.79 
 
 		 230 aa  147  1.0000000000000001e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6070  two component response regulator  41.96 
 
 		 228 aa  147  2.0000000000000003e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24530  Response regulator KdpE  43.61 
 
 		 232 aa  147  2.0000000000000003e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0689152  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3235  two component transcriptional regulator  44.84 
 
 		 228 aa  147  2.0000000000000003e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.40462  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1791  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.11 
 
 		 240 aa  146  3e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000442123 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3122  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.29 
 
 		 235 aa  145  4.0000000000000006e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3636  two-component response regulator KdpE  44.1 
 
 		 230 aa  144  9e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.9171  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4649  two component transcriptional regulator  39.73 
 
 		 230 aa  144  1e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.424735  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1222  two component transcriptional regulator  43.91 
 
 		 235 aa  144  1e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2213  DNA binding response regulator KdpE  42.41 
 
 		 231 aa  143  2e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2694  two component transcriptional regulator  41.07 
 
 		 235 aa  144  2e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.154697  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3288  two component transcriptional regulator  37.6 
 
 		 272 aa  143  2e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.234797 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1172  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.04 
 
 		 235 aa  143  2e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2094  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.26 
 
 		 231 aa  143  2e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0299  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.63 
 
 		 231 aa  143  2e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.867846 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1017  two component transcriptional regulator  42.29 
 
 		 229 aa  142  4e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.957911  normal  0.735899 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5960  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.71 
 
 		 226 aa  142  5e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.891848  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0772  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.81 
 
 		 229 aa  142  6e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0828  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.56 
 
 		 232 aa  141  8e-33  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.159677 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2051  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.62 
 
 		 247 aa  140  1.9999999999999998e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.520505  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11045  transcriptional regulatory protein kdpE  39.13 
 
 		 226 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2053  two component transcriptional regulator  41.89 
 
 		 232 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.745879 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1884  response regulator receiver protein  40.44 
 
 		 244 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.365735  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4763  two component transcriptional regulator  40.34 
 
 		 230 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.96205  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3087  response regulator transcription regulator protein  43.3 
 
 		 234 aa  139  3e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.160744  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1879  two component transcriptional regulator  41.67 
 
 		 224 aa  139  3e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0517799  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3050  two component transcriptional regulator  39.82 
 
 		 224 aa  139  3e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.519152  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6752  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.53 
 
 		 230 aa  139  3.9999999999999997e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5840  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.35 
 
 		 230 aa  139  4.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.99298  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3248  two component transcriptional regulator  41.44 
 
 		 232 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.743  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2437  two component transcriptional regulator  41.56 
 
 		 233 aa  138  6e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1312  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.89 
 
 		 232 aa  138  7.999999999999999e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.1865 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3717  KDP operon transcriptional regulatory protein KdpE  38.96 
 
 		 244 aa  138  8.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0509  two component transcriptional regulator  41.06 
 
 		 232 aa  137  1e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.163629  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0195  two component transcriptional regulator  37.95 
 
 		 243 aa  137  1e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00716616 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1461  response regulator receiver  34.07 
 
 		 233 aa  137  2e-31  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000661728  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2822  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.75 
 
 		 230 aa  136  2e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0465  DNA-binding response regulator  36.94 
 
 		 230 aa  137  2e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000321608  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3023  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.41 
 
 		 234 aa  137  2e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3778  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.56 
 
 		 232 aa  137  2e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0820994  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3370  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.41 
 
 		 234 aa  137  2e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4344  two component transcriptional regulator  37.5 
 
 		 239 aa  137  2e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.325933  normal  0.345767 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2343  two component transcriptional regulator  37.95 
 
 		 243 aa  136  3.0000000000000003e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00929975  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2116  two component transcriptional regulator  35.34 
 
 		 231 aa  135  5e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.291778  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2307  two component transcriptional regulator  40.54 
 
 		 232 aa  135  5e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3104  two component transcriptional regulator  40.79 
 
 		 233 aa  135  5e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.317177  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2154  response regulator receiver  35.34 
 
 		 231 aa  135  5e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0828561  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1672  two component transcriptional regulator  40.54 
 
 		 232 aa  135  5e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.193412  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4230  two component transcriptional regulator  40.48 
 
 		 226 aa  135  5e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.285059  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4608  two component transcriptional regulator  40.48 
 
 		 226 aa  135  5e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2284  two component transcriptional regulator  40.54 
 
 		 232 aa  135  5e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.21195  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4296  two component transcriptional regulator  40.48 
 
 		 226 aa  135  5e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0135013  normal  0.794825 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0987  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.13 
 
 		 233 aa  135  6.0000000000000005e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.195539  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4546  two component transcriptional regulator  40.79 
 
 		 229 aa  135  6.0000000000000005e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.926448 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4088  response regulator receiver  41.18 
 
 		 231 aa  135  7.000000000000001e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0386  two component transcriptional regulator  40.91 
 
 		 229 aa  135  8e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04383  two-component system regulatory protein  39.65 
 
 		 226 aa  134  9e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0939  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.89 
 
 		 231 aa  134  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.102691  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1435  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.77 
 
 		 233 aa  134  9.999999999999999e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0742  two component transcriptional regulator  37.89 
 
 		 245 aa  134  9.999999999999999e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1587  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.27 
 
 		 231 aa  134  9.999999999999999e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2324  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.24 
 
 		 223 aa  134  9.999999999999999e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.237639  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5611  two component transcriptional regulator  39.64 
 
 		 232 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0731674  normal  0.970504 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3017  two component transcriptional regulator  42.29 
 
 		 225 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0042  two component transcriptional regulator  40.62 
 
 		 231 aa  133  3e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.189828  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1214  DNA-binding response regulator KdpE  33.18 
 
 		 237 aa  132  3e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000130813  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0942  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.44 
 
 		 231 aa  132  3e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0532517  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2289  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  40.18 
 
 		 231 aa  132  3.9999999999999996e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0000420296  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0891  two component transcriptional regulator  40.36 
 
 		 231 aa  132  3.9999999999999996e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.391375  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1606  two component transcriptional regulator  39.74 
 
 		 230 aa  132  3.9999999999999996e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.307098  normal  0.688459 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0666  response regulator receiver  41.53 
 
 		 240 aa  132  5e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1746  two component transcriptional regulator  39.01 
 
 		 224 aa  132  6e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000480188  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2990  two component transcriptional regulator  37.61 
 
 		 230 aa  132  6e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.839569  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1464  two component transcriptional regulator  42.41 
 
 		 222 aa  132  6e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.286623  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0053  two component transcriptional regulator  35.29 
 
 		 229 aa  131  6.999999999999999e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000176822 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2322  two component transcriptional regulator  39.91 
 
 		 232 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.521655  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0371  DNA-binding response regulator KdpE  41.52 
 
 		 234 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>