More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_0561 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_0561  SufBD protein  100 
 
 		 393 aa  768    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1697  FeS assembly protein SufD  36.23 
 
 		 434 aa  138  1e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5393  FeS assembly protein SufD  35.27 
 
 		 420 aa  128  1.0000000000000001e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0168  Iron-regulated ABC transporter permease protein SufD  33.77 
 
 		 453 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0472  FeS assembly protein SufD  35.61 
 
 		 450 aa  119  6e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.337092  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4170  FeS assembly protein SufD  39.87 
 
 		 445 aa  120  6e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1358  FeS assembly protein SufD  35.55 
 
 		 398 aa  117  5e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21940  Iron-regulated ABC transporter permease protein SufD  36.97 
 
 		 417 aa  116  6e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16140  Iron-regulated ABC transporter permease protein SufD  28.33 
 
 		 389 aa  116  7.999999999999999e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1005  FeS assembly protein SufD  38.3 
 
 		 435 aa  115  1.0000000000000001e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.868893 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2339  FeS assembly protein SufD  36.02 
 
 		 399 aa  115  1.0000000000000001e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.187608 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0781  FeS assembly protein SufD  34.48 
 
 		 444 aa  114  3e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0590112  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1672  FeS assembly protein SufD  35.55 
 
 		 434 aa  114  3e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.286601  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13350  Iron-regulated ABC transporter permease protein SufD  35.53 
 
 		 429 aa  114  4.0000000000000004e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2065  FeS assembly protein SufD  32.8 
 
 		 440 aa  113  5e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0537  FeS assembly protein SufD  39.05 
 
 		 445 aa  111  3e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2473  FeS assembly protein SufD  31.78 
 
 		 397 aa  110  5e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.164077  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2437  FeS assembly protein SufD  31.78 
 
 		 396 aa  110  6e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2482  FeS assembly protein SufD  31.78 
 
 		 396 aa  110  6e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5153  FeS assembly protein SufD  29.01 
 
 		 390 aa  109  7.000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0384  FeS assembly protein SufD  27.43 
 
 		 415 aa  109  1e-22  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3676  FeS assembly protein SufD  31.01 
 
 		 399 aa  109  1e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3082  FeS assembly protein SufD  34.17 
 
 		 398 aa  108  1e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0565637  normal  0.317622 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0976  iron-regulated ABC transporter, membrane-spanning permease  32.56 
 
 		 425 aa  108  2e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.307053  normal  0.223995 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2277  FeS assembly protein SufD  29.01 
 
 		 405 aa  107  3e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000190634  normal  0.0281523 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3309  FeS assembly protein SufD  33.88 
 
 		 398 aa  106  6e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000689429 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2104  FeS assembly protein SufD  33.02 
 
 		 416 aa  106  6e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3282  FeS assembly protein SufD  29.51 
 
 		 467 aa  106  8e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.534903  normal  0.136347 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2384  FeS assembly protein SufD  34.34 
 
 		 393 aa  105  1e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.426973  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2443  FeS assembly protein SufD  31.78 
 
 		 389 aa  105  1e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.83747  normal  0.102174 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1136  FeS assembly protein SufD  36.02 
 
 		 407 aa  105  1e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0309349 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0605  Fe-S cluster assembly ABC transporter permease  36.47 
 
 		 411 aa  105  2e-21  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0238111  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0727  FeS assembly protein SufD  33.5 
 
 		 441 aa  105  2e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1141  FeS assembly protein SufD  32.65 
 
 		 407 aa  105  2e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.303866  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2551  FeS assembly protein SufD  31 
 
 		 401 aa  102  8e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0174  FeS assembly protein SufD  30.68 
 
 		 441 aa  102  1e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000908978 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2916  FeS assembly protein SufD  34.67 
 
 		 410 aa  102  1e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.902273 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2391  FeS assembly protein SufD  34.48 
 
 		 455 aa  101  2e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3353  FeS assembly protein SufD  35.62 
 
 		 439 aa  100  3e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.315462 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5779  FeS assembly protein SufD  22.6 
 
 		 439 aa  100  3e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3967  SufBD protein  27.76 
 
 		 448 aa  100  3e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.835948  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2488  FeS assembly protein SufD  31.44 
 
 		 446 aa  100  4e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0891  FeS assembly protein SufD  31.28 
 
 		 439 aa  100  5e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0845  FeS assembly protein SufD  31.28 
 
 		 437 aa  100  6e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.431893  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1846  FeS assembly protein SufD  37.67 
 
 		 413 aa  100  7e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000255437 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2508  FeS assembly protein SufD  30.2 
 
 		 392 aa  99  1e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.62478  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2734  FeS assembly protein SufD  32.65 
 
 		 399 aa  99  1e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.349775  normal  0.246631 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0638  hypothetical protein  32.12 
 
 		 428 aa  98.2  2e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0895  FeS assembly protein SufD  31.22 
 
 		 437 aa  98.2  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0242  hypothetical protein  33.57 
 
 		 439 aa  98.6  2e-19  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5929  sufD, needed for fhuF Fe-S center production/stability  30.28 
 
 		 441 aa  97.8  3e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11490  hypothetical protein  36.63 
 
 		 397 aa  97.1  4e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.106141  normal  0.412126 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0489  SufBD protein  36.69 
 
 		 417 aa  97.1  5e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.31169 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5986  FeS assembly protein SufD  36.47 
 
 		 372 aa  96.7  6e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.207884  normal  0.24257 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2264  FeS assembly protein SufD  36.47 
 
 		 407 aa  96.7  6e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.125188 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2024  FeS assembly protein SufD  26.76 
 
 		 444 aa  96.7  7e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.554026  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3311  FeS assembly protein SufD  34.55 
 
 		 430 aa  96.3  8e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0379424 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3260  FeS assembly protein SufD  30.61 
 
 		 437 aa  96.3  9e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.854773 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0654  hypothetical protein  31.61 
 
 		 428 aa  95.9  1e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2086  FeS assembly protein SufD  31.84 
 
 		 381 aa  95.5  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.826381 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1661  FeS assembly protein SufD  35.93 
 
 		 419 aa  95.9  1e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.249285  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11500  Iron-regulated ABC transporter permease protein SufD  36.36 
 
 		 412 aa  95.5  1e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.165027  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1194  FeS assembly protein SufD  31.05 
 
 		 426 aa  95.1  2e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0412715  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1971  FeS assembly protein SufD  33.33 
 
 		 372 aa  94  4e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.388896 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1986  Iron-regulated ABC transporter permease protein SufD  33.17 
 
 		 384 aa  93.6  5e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1469  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  30.35 
 
 		 423 aa  93.6  6e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.866432  normal  0.0690013 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1485  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  30.35 
 
 		 423 aa  93.6  6e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000206713 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1235  FeS assembly protein SufD  31.6 
 
 		 445 aa  93.6  6e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.722398  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1799  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  30.35 
 
 		 423 aa  93.6  6e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.024835  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4271  FeS assembly protein SufD  34.75 
 
 		 447 aa  93.2  8e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.707837  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1862  FeS assembly protein SufD  28.97 
 
 		 442 aa  92.8  9e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3443  FeS assembly protein SufD  26.98 
 
 		 451 aa  92.4  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.656128  hitchhiker  0.0000000788125 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14630  Iron-regulated ABC transporter permease protein SufD  36.36 
 
 		 440 aa  92.4  1e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.981866  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1961  FeS assembly protein SufD  31.58 
 
 		 423 aa  91.3  2e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0846147  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2182  FeS assembly protein SufD  31.12 
 
 		 430 aa  92  2e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00372384  hitchhiker  0.000585375 
 
 
-
 
NC_002950  PG0259  hypothetical protein  27.93 
 
 		 447 aa  91.7  2e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2104  FeS assembly protein SufD  29.55 
 
 		 424 aa  91.7  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.111297 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2270  FeS assembly protein SufD  28.88 
 
 		 399 aa  91.3  3e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.197633  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2447  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  24.5 
 
 		 448 aa  90.9  3e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0918237  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01650  component of SufBCD complex  32.19 
 
 		 423 aa  90.5  5e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000917299  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4731  FeS assembly protein SufD  26.54 
 
 		 454 aa  90.1  5e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1950  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  32.19 
 
 		 423 aa  90.5  5e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0520002  hitchhiker  0.00000220398 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1515  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  32.19 
 
 		 423 aa  90.5  5e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.252227  hitchhiker  0.00000429728 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1762  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  32.19 
 
 		 423 aa  90.5  5e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0210181  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1897  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  32.19 
 
 		 423 aa  90.5  5e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00143509  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1504  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  29.85 
 
 		 423 aa  90.5  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.429921  hitchhiker  0.0000000349756 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01640  hypothetical protein  32.19 
 
 		 423 aa  90.5  5e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000779694  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2395  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  32.19 
 
 		 423 aa  90.1  6e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.087197  hitchhiker  0.000115041 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2749  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  24.37 
 
 		 448 aa  90.1  6e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0636938  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2225  FeS assembly protein SufD  31.68 
 
 		 373 aa  90.1  6e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000426532  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1763  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  32.19 
 
 		 423 aa  89.7  8e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.182167  hitchhiker  0.0000315224 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5846  FeS assembly protein SufD  32.72 
 
 		 439 aa  89.7  8e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00798373  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1506  FeS assembly protein SufD  34.72 
 
 		 475 aa  89.7  8e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.187123  normal  0.203513 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0798  FeS assembly protein SufD  25.62 
 
 		 448 aa  89.4  9e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0990  FeS assembly protein SufD  29.81 
 
 		 434 aa  89  1e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1882  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  31.58 
 
 		 423 aa  89.4  1e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.077757  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1897  FeS assembly protein SufD  31.14 
 
 		 454 aa  89.4  1e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1897  FeS assembly protein SufD  29.09 
 
 		 424 aa  89.4  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00363376 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1416  Iron-regulated ABC transporter permease protein SufD  29.52 
 
 		 439 aa  89  2e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.199083  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0496  FeS assembly protein SufD  25 
 
 		 466 aa  88.6  2e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>