161 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_3026 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_3026  hypothetical protein  100 
 
 
277 aa  548  1e-155  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0879  alpha/beta hydrolase fold  56.17 
 
 
273 aa  263  2e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.46004  normal  0.445527 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4655  Alpha/beta hydrolase  55.08 
 
 
273 aa  261  8e-69  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.875827 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0742  alpha/beta hydrolase fold  55.51 
 
 
273 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0748  alpha/beta family hydrolase  54.15 
 
 
267 aa  241  7.999999999999999e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2949  alpha/beta hydrolase fold  50 
 
 
271 aa  222  6e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.545682  normal  0.28971 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4372  alpha/beta family hydrolase  47.86 
 
 
270 aa  203  2e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.686172 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3654  alpha/beta hydrolase fold  44.83 
 
 
272 aa  202  5e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0215  alpha/beta hydrolase  47.06 
 
 
271 aa  201  8e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.296554  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2830  Alpha/beta hydrolase fold  46.75 
 
 
257 aa  201  9.999999999999999e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1328  Alpha/beta hydrolase fold  45.87 
 
 
271 aa  198  9e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0882  hypothetical protein  48.16 
 
 
276 aa  198  9e-50  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1544  alpha/beta hydrolase fold protein  46.41 
 
 
284 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0897  putative lactonase (box pathway)  46.86 
 
 
287 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0425746  normal  0.277892 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2701  alpha/beta hydrolase fold  48.65 
 
 
284 aa  196  3e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.832615  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1418  putative lactonase (box pathway)  44.92 
 
 
282 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.104299  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0088  alpha/beta hydrolase fold protein  44.96 
 
 
267 aa  194  1e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1623  alpha/beta hydrolase fold  42.8 
 
 
280 aa  192  4e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4734  alpha/beta hydrolase fold  43.7 
 
 
264 aa  186  4e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.590817  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1225  alpha/beta hydrolase fold  45.98 
 
 
271 aa  180  2e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.16662  normal  0.108175 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1010  alpha/beta family hydrolase  58 
 
 
176 aa  179  4e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.47639 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2862  Alpha/beta hydrolase fold  42.64 
 
 
271 aa  177  2e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0670  alpha/beta hydrolase  42.23 
 
 
258 aa  176  4e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3406  putative hydrolase-related protein  40.24 
 
 
266 aa  160  2e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3398  Alpha/beta hydrolase fold  36.99 
 
 
255 aa  159  4e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2393  Alpha/beta hydrolase  40 
 
 
286 aa  158  1e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.590588  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3803  alpha/beta hydrolase fold  37.55 
 
 
265 aa  157  2e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.695303 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4108  alpha/beta hydrolase fold  39.18 
 
 
270 aa  155  5.0000000000000005e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.24138 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4220  alpha/beta hydrolase fold protein  39.18 
 
 
270 aa  155  5.0000000000000005e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4645  alpha/beta hydrolase fold  36.4 
 
 
265 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.917363  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3718  alpha/beta hydrolase fold  36.4 
 
 
265 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0380543 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3602  alpha/beta hydrolase fold  35.14 
 
 
280 aa  142  4e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.949623  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4621  alpha/beta hydrolase fold  35.79 
 
 
285 aa  143  4e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.312074 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0322  lactonase  34.73 
 
 
277 aa  142  7e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5458  alpha/beta hydrolase fold  38.26 
 
 
285 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4964  alpha/beta hydrolase fold  37.23 
 
 
275 aa  140  1.9999999999999998e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.102964  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5009  alpha/beta hydrolase fold  36.12 
 
 
288 aa  139  3e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.97318  normal  0.569979 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0554  lactonase  35.34 
 
 
390 aa  138  7.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0377  alpha/beta fold family hydrolase  35.34 
 
 
277 aa  138  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0364  alpha/beta fold family hydrolase  35.34 
 
 
277 aa  137  2e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1771  alpha/beta hydrolase fold protein  32.79 
 
 
279 aa  135  9e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26310  Alpha/beta hydrolase fold protein  35.68 
 
 
275 aa  133  3e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.201822  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3299  alpha/beta hydrolase fold  33.92 
 
 
259 aa  120  3e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0552  proline-specific peptidase  31.23 
 
 
319 aa  64.7  0.000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.698473 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7536  Alpha/beta hydrolase  33.82 
 
 
270 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5863  alpha/beta hydrolase fold  33.01 
 
 
270 aa  54.7  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.648074  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0011  alpha/beta hydrolase fold protein  23.27 
 
 
278 aa  54.7  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00883263 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2922  alpha/beta hydrolase fold protein  33.05 
 
 
282 aa  53.9  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3174  alpha/beta hydrolase fold protein  33.05 
 
 
282 aa  53.9  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1095  alpha/beta hydrolase fold  23.66 
 
 
302 aa  53.1  0.000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1559  alpha/beta hydrolase fold protein  30.57 
 
 
284 aa  52.8  0.000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0478161  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4082  alpha/beta hydrolase fold  27.54 
 
 
272 aa  52.8  0.000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0646  3-oxoadipate enol-lactonase (pcaD)  26.28 
 
 
263 aa  52.4  0.000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.063322 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2446  alpha/beta hydrolase fold protein  28.21 
 
 
309 aa  51.2  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.969901  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0693  alpha/beta hydrolase fold  35.96 
 
 
258 aa  50.4  0.00003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3844  alpha/beta hydrolase fold protein  27 
 
 
289 aa  49.7  0.00006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.185404  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2405  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  27.44 
 
 
369 aa  49.3  0.00006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0222007  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4002  alpha/beta hydrolase fold  36.7 
 
 
351 aa  49.3  0.00006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.228982  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0174  cyclic nucleotide-binding protein  26.22 
 
 
456 aa  49.7  0.00006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000271627  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4315  3-oxoadipate enol-lactonase  24.91 
 
 
263 aa  49.3  0.00007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.781035  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2964  alpha/beta hydrolase fold  34.65 
 
 
282 aa  48.9  0.00008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.80837 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4043  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  23.72 
 
 
372 aa  49.3  0.00008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.140528  normal  0.0217743 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5307  alpha/beta hydrolase fold  25.56 
 
 
295 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.224347 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2257  alpha/beta hydrolase fold  34.48 
 
 
412 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.315769  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1433  alpha/beta hydrolase fold protein  34.59 
 
 
302 aa  48.5  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0800  alpha/beta hydrolase fold  28 
 
 
267 aa  48.1  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.156653 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4460  3-oxoadipate enol-lactonase  26.57 
 
 
263 aa  47.8  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.312255 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0858  proline-specific peptidase  23.37 
 
 
303 aa  47.4  0.0003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1078  alpha/beta hydrolase fold protein  25.32 
 
 
253 aa  47.4  0.0003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5717  alpha/beta hydrolase fold  33.17 
 
 
270 aa  47.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4708  alpha/beta hydrolase fold  26.82 
 
 
299 aa  47.4  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6081  alpha/beta hydrolase fold  33.17 
 
 
270 aa  47.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4794  alpha/beta hydrolase fold  26.82 
 
 
299 aa  47.4  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5458  alpha/beta hydrolase fold protein  35.77 
 
 
270 aa  47  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.306625  normal  0.0166355 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1253  alpha/beta hydrolase fold  22.56 
 
 
298 aa  47.4  0.0003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.188153  normal  0.590935 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5093  alpha/beta hydrolase fold  26.82 
 
 
299 aa  47.4  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.284245 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0534  putative peroxidase  27.08 
 
 
281 aa  47  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.476086  normal  0.88579 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2079  alpha/beta hydrolase fold protein  36.56 
 
 
360 aa  47  0.0004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6488  alpha/beta hydrolase fold  28.42 
 
 
299 aa  46.6  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6723  alpha/beta hydrolase fold  28.42 
 
 
299 aa  46.6  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0361  alpha/beta hydrolase fold  25.83 
 
 
290 aa  46.2  0.0005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5020  putative alpha/beta hydrolase  24.75 
 
 
334 aa  46.2  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.479747 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3723  alpha/beta hydrolase fold  32.32 
 
 
281 aa  46.6  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0906881  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0643  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase  27.34 
 
 
267 aa  46.2  0.0006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3690  alpha/beta hydrolase fold  26.12 
 
 
298 aa  46.2  0.0006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.557915  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4148  alpha/beta hydrolase fold protein  25.19 
 
 
278 aa  46.2  0.0006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0778335  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5048  alpha/beta hydrolase fold protein  28.52 
 
 
279 aa  46.2  0.0006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.614525  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5407  Alpha/beta hydrolase  34.19 
 
 
296 aa  45.8  0.0007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.632759  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2138  alpha/beta hydrolase fold  34.19 
 
 
296 aa  45.8  0.0007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2011  alpha/beta hydrolase fold  34.19 
 
 
296 aa  45.8  0.0007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000219515 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02210  proline imino-peptidase  26.09 
 
 
313 aa  46.2  0.0007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.100587  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5976  alpha/beta hydrolase fold  34.19 
 
 
296 aa  45.8  0.0008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.609999  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2101  alpha/beta hydrolase fold  34.19 
 
 
296 aa  45.8  0.0008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2119  alpha/beta hydrolase fold  34.19 
 
 
296 aa  45.8  0.0008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0124464 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3492  alpha/beta hydrolase fold  24.91 
 
 
270 aa  45.8  0.0008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6565  alpha/beta hydrolase fold  32.68 
 
 
270 aa  45.8  0.0009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.250077 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0950  alpha/beta hydrolase fold  36.89 
 
 
284 aa  45.1  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1491  alpha/beta hydrolase fold  23.66 
 
 
297 aa  45.1  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00412587  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4206  3-oxoadipate enol-lactonase  25.77 
 
 
268 aa  45.1  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1565  alpha/beta hydrolase fold  34.78 
 
 
363 aa  45.4  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.461626  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>