231 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_1765 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_1765  ferredoxin  100 
 
 		 110 aa  226  6e-59  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.495419  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0615  ferredoxin  84.16 
 
 		 104 aa  179  1e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.477659  normal  0.0438216 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2026  ferredoxin  62.04 
 
 		 109 aa  151  2.9999999999999998e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.894903  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0297  iron-sulfur cluster binding protein  61.32 
 
 		 111 aa  139  9.999999999999999e-33  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0405  ferredoxin  57.8 
 
 		 116 aa  135  2e-31  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.6086  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0634  iron-sulfur cluster binding protein  56.88 
 
 		 116 aa  134  6.0000000000000005e-31  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.322123  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3057  ferredoxin  59.26 
 
 		 110 aa  127  6e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00530572  hitchhiker  0.00000956362 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_55369  mitochondrial matrix iron-sulfur protein  52.34 
 
 		 144 aa  124  3e-28  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.5587 
 
 
-
 
NC_006692  CNG00160  conserved hypothetical protein  59.14 
 
 		 217 aa  122  2e-27  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.737268  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0846  ferredoxin, iron-sulfur cluster assembly system  53.64 
 
 		 119 aa  120  9e-27  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_8463  predicted protein  57.14 
 
 		 118 aa  117  3.9999999999999996e-26  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0775115 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40562  predicted protein  57.14 
 
 		 118 aa  117  3.9999999999999996e-26  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0733354 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2796  ferredoxin  49.07 
 
 		 110 aa  116  9e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.048499  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0053  ferredoxin  54.13 
 
 		 111 aa  116  9.999999999999999e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0123989  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0795  ferredoxin  53.27 
 
 		 111 aa  113  6.9999999999999995e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0332757 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_14478  predicted protein  50 
 
 		 112 aa  106  1e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0197536  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5299  ferredoxin  50 
 
 		 106 aa  99.4  1e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.321771  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2127  ferredoxin  47.57 
 
 		 107 aa  99  2e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.712912  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1949  ferredoxin  51.46 
 
 		 130 aa  99.4  2e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0777291 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2731  ferredoxin-6  50.49 
 
 		 107 aa  99  2e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00573481  normal  0.020314 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4466  ferredoxin  46.6 
 
 		 106 aa  97.4  6e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.982343 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4835  ferredoxin  50 
 
 		 106 aa  97.1  7e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4980  ferredoxin  47.57 
 
 		 106 aa  97.1  8e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.117052 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0081  ferredoxin  46.08 
 
 		 106 aa  95.5  2e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.402763 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2520  ferredoxin  47.06 
 
 		 106 aa  95.1  3e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0324676 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2185  ferredoxin  47.06 
 
 		 106 aa  95.1  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.826066  hitchhiker  0.00658828 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1946  ferredoxin  44.12 
 
 		 106 aa  94.4  4e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0707513 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2346  ferredoxin  47.06 
 
 		 106 aa  94.7  4e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.401056 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3549  ferredoxin  47.06 
 
 		 106 aa  94  7e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1536  ferredoxin  46.08 
 
 		 106 aa  93.6  8e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.471115  normal  0.820565 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3168  ferredoxin  47.57 
 
 		 107 aa  92.8  2e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.60364  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4930  ferredoxin  44.66 
 
 		 106 aa  92  2e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4124  ferredoxin  46.08 
 
 		 106 aa  92  2e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.168786  normal  0.289688 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2112  ferredoxin  47.57 
 
 		 107 aa  92.4  2e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.212456  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1973  ferredoxin  46.08 
 
 		 106 aa  92.8  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.668901  normal  0.534577 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0352  ferredoxin  48.54 
 
 		 107 aa  91.7  3e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4027  ferredoxin  46.6 
 
 		 107 aa  91.7  3e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.461873  normal  0.657708 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0998  ferredoxin  42.31 
 
 		 105 aa  91.7  3e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.16414  normal  0.2542 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1996  ferredoxin  48.54 
 
 		 107 aa  91.7  3e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0944  ferredoxin  46.6 
 
 		 107 aa  91.3  4e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.330757 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3131  ferredoxin  44.12 
 
 		 106 aa  90.9  6e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6065  ferredoxin  44.66 
 
 		 106 aa  90.1  9e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.258928 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6602  ferredoxin  43.14 
 
 		 106 aa  90.1  9e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.274707  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1026  ferredoxin, 2Fe-2S  46.6 
 
 		 107 aa  89.7  1e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.533328  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5552  2Fe-2S ferredoxin (FdII)  45.1 
 
 		 106 aa  89.7  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.312295 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0992  ferredoxin, 2Fe-2S  46.6 
 
 		 107 aa  89.7  1e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1320  ferredoxin  43.14 
 
 		 106 aa  89.7  1e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0285  ferredoxin  44.12 
 
 		 107 aa  89.7  1e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.527532  normal  0.171436 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1088  ferredoxin  42.16 
 
 		 106 aa  89  2e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.614521 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1643  ferredoxin  44.12 
 
 		 106 aa  89  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4477  ferredoxin  43.14 
 
 		 106 aa  88.6  2e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.431384  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3614  ferredoxin  48.54 
 
 		 107 aa  88.6  3e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.468682  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3843  ferredoxin  44.12 
 
 		 106 aa  88.6  3e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.499595  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6980  ferredoxin  45.63 
 
 		 107 aa  88.2  3e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1457  ferredoxin  43.14 
 
 		 106 aa  88.2  3e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2243  ferrodoxin  45.1 
 
 		 106 aa  88.2  4e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.318756  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1410  ferredoxin  42.16 
 
 		 106 aa  87  8e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.907706  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2352  ferredoxin  43.14 
 
 		 106 aa  86.3  1e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3592  putative ferredoxin  41.35 
 
 		 106 aa  86.7  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2523  ferredoxin  45.92 
 
 		 107 aa  86.3  1e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0855476 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_7342  predicted protein  46.6 
 
 		 106 aa  85.9  2e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1115  ferredoxin  43.56 
 
 		 105 aa  85.1  3e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1759  ferredoxin  44.12 
 
 		 106 aa  84.3  5e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0730  2Fe-2S ferredoxin (FdII)  45.63 
 
 		 107 aa  84.3  5e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.36059  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3026  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  45.87 
 
 		 111 aa  84  6e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1249  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  45.87 
 
 		 111 aa  84  7e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.840287  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6886  ferredoxin  44.12 
 
 		 106 aa  84  7e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0835  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  44.95 
 
 		 112 aa  83.6  8e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.967876  normal  0.385713 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4593  ferredoxin  40.2 
 
 		 106 aa  83.2  0.000000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.93416 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1558  ferredoxin, 2Fe-2S type  52.87 
 
 		 113 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0549119  normal  0.219971 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8461  ferredoxin  43.69 
 
 		 107 aa  83.2  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2574  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  52.87 
 
 		 113 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.44606  hitchhiker  0.00922015 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1243  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  45.95 
 
 		 112 aa  82.4  0.000000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0126  ferredoxin  42.16 
 
 		 106 aa  82.4  0.000000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000199304  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0601  putative ferredoxin  44.23 
 
 		 107 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.245768  normal  0.113964 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17820  ferredoxin  44.12 
 
 		 105 aa  81.6  0.000000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.872315 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0286  ferredoxin  41.96 
 
 		 113 aa  80.9  0.000000000000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01705  Ferredoxin  42 
 
 		 107 aa  80.9  0.000000000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.059878  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1428  ferredoxin, 2Fe-2S  43.12 
 
 		 113 aa  80.5  0.000000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1109  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  43.12 
 
 		 111 aa  80.1  0.000000000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.800718  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2746  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  42.2 
 
 		 111 aa  79.7  0.00000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3658  ferredoxin  37.5 
 
 		 110 aa  80.1  0.00000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.392033  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1453  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  50.57 
 
 		 113 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.821654 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1843  ferredoxin  49.51 
 
 		 106 aa  79.3  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0299  ferredoxin  45.63 
 
 		 107 aa  79  0.00000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2182  ferredoxin, 2Fe-2S type  51.16 
 
 		 112 aa  79  0.00000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.267182  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40350  Isc ferredoxin  44.95 
 
 		 113 aa  78.6  0.00000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.992781  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5427  ferredoxin, 2Fe-2S type  47.25 
 
 		 113 aa  78.2  0.00000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.175775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1173  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  43.24 
 
 		 111 aa  78.2  0.00000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3217  ferredoxin  39.22 
 
 		 106 aa  78.6  0.00000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.485329  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0430  adrenodoxin family ferredoxin  43.24 
 
 		 111 aa  78.2  0.00000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00877719 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3279  ferredoxin  39.22 
 
 		 106 aa  78.6  0.00000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3022  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  41.44 
 
 		 111 aa  78.6  0.00000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.124489  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3228  ferredoxin  39.22 
 
 		 106 aa  78.6  0.00000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.119013  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1242  ferredoxin, 2Fe-2S type  42.2 
 
 		 113 aa  78.2  0.00000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.265779  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3506  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  41.28 
 
 		 113 aa  77.8  0.00000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1281  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  43.24 
 
 		 111 aa  78.2  0.00000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1703  ferredoxin, 2Fe-2S  47.13 
 
 		 113 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0360093  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5956  ferredoxin, 2Fe-2S type  47.25 
 
 		 113 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2138  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  47.25 
 
 		 113 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.513456 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>