76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_0079 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_0079  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  100 
 
 
246 aa  504  9.999999999999999e-143  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0517  coenzyme PQQ biosynthesis protein C  72.03 
 
 
361 aa  358  5e-98  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1770  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  72.88 
 
 
362 aa  357  9.999999999999999e-98  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.836859 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1818  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  72.46 
 
 
366 aa  356  1.9999999999999998e-97  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2154  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  72.46 
 
 
372 aa  355  2.9999999999999997e-97  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.113038 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5990  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  72.46 
 
 
266 aa  354  7.999999999999999e-97  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.62561  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0846  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  69.87 
 
 
255 aa  352  2.9999999999999997e-96  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5766  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  72.03 
 
 
302 aa  351  5e-96  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.646779 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1980  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  72.77 
 
 
249 aa  331  8e-90  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1801  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  68.09 
 
 
266 aa  326  2.0000000000000001e-88  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0718323  normal  0.890279 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01590  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  64.05 
 
 
250 aa  323  1e-87  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.700679  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1739  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  65.13 
 
 
252 aa  319  1.9999999999999998e-86  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.686029 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2031  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  67.8 
 
 
251 aa  317  7.999999999999999e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.439972 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2159  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  64.73 
 
 
254 aa  313  9.999999999999999e-85  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3421  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  66.53 
 
 
251 aa  313  1.9999999999999998e-84  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0157933  normal  0.705605 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0881  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  65.55 
 
 
258 aa  312  3.9999999999999997e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3321  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  63.71 
 
 
254 aa  307  1.0000000000000001e-82  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.304052 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6302  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  63.71 
 
 
251 aa  305  3e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0792  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  63.98 
 
 
255 aa  301  5.000000000000001e-81  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2448  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  63.98 
 
 
255 aa  300  1e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0193829 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0388  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  63.14 
 
 
255 aa  297  1e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0651674  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1149  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  62.71 
 
 
253 aa  288  5.0000000000000004e-77  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00427046 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0691  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  56.2 
 
 
283 aa  271  5.000000000000001e-72  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.363937  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0452  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  56.3 
 
 
250 aa  270  1e-71  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2361  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  57.58 
 
 
264 aa  262  4.999999999999999e-69  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3917  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  55.1 
 
 
256 aa  258  9e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2454  coenzyme PQQ biosynthesis protein C  50.9 
 
 
232 aa  212  3.9999999999999995e-54  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.237207  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2177  coenzyme PQQ biosynthesis protein C  50 
 
 
230 aa  209  3e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.744366  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1967  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  47.77 
 
 
250 aa  204  7e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.0099529  normal  0.324624 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1447  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  43.83 
 
 
241 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.00984795  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38800  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  47.56 
 
 
250 aa  196  3e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2251  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  44.44 
 
 
249 aa  196  3e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0593082  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3307  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  47.56 
 
 
270 aa  196  3e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0511  coenzyme PQQ synthesis protein C  45.98 
 
 
251 aa  195  5.000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5159  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  45.54 
 
 
250 aa  195  5.000000000000001e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.141854 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4672  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  45.54 
 
 
251 aa  194  1e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4036  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  46.12 
 
 
244 aa  194  2e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.368072  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0403  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  45.09 
 
 
251 aa  191  7e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.865476  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0378  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  45.09 
 
 
251 aa  191  8e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5967  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  44.89 
 
 
239 aa  191  9e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.614403  normal  0.0196017 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0407  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  45.09 
 
 
251 aa  191  1e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5121  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  45.45 
 
 
239 aa  190  2e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.14672  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4825  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  44.64 
 
 
251 aa  190  2e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.864658 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1780  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  45.95 
 
 
230 aa  190  2e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.612673  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0859  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  44.39 
 
 
251 aa  189  2e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3247  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  45.45 
 
 
239 aa  190  2e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5160  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  45 
 
 
239 aa  188  9e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.666649 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6166  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  43.95 
 
 
239 aa  186  3e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0997558  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5899  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  43.5 
 
 
239 aa  186  4e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.545322 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6510  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  43.95 
 
 
235 aa  185  6e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.838235  normal  0.029031 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2621  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  42.67 
 
 
240 aa  185  6e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2096  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  42.92 
 
 
236 aa  184  9e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.49419  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2490  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  42.92 
 
 
236 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0689284 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0290  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  43.69 
 
 
237 aa  181  7e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.939123  normal  0.620425 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1682  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  42.53 
 
 
250 aa  180  2e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.993196 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1700  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  43.3 
 
 
231 aa  180  2e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.446294 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2468  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  42.08 
 
 
250 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.171563 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41660  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  43.57 
 
 
250 aa  179  4e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.177841  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2586  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  44.49 
 
 
243 aa  178  5.999999999999999e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0193551  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3055  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  43.29 
 
 
254 aa  178  8e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0246  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  42.6 
 
 
259 aa  177  1e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00212827 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0323  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  42.36 
 
 
255 aa  171  9e-42  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0541289  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0731  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  39.47 
 
 
243 aa  159  4e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.171697  normal  0.030389 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0845  TENA/THI-4 protein  23.81 
 
 
234 aa  61.2  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0900  coenzyme PQQ synthesis protein c, putative  25.63 
 
 
236 aa  57.8  0.0000002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0755189  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2636  coenzyme PQQ synthesis C  21.52 
 
 
247 aa  56.2  0.0000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  0.000000230903  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4350  TENA/THI-4 domain-containing protein  25.94 
 
 
243 aa  55.1  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0078  TENA/THI-4 protein  26.96 
 
 
226 aa  53.9  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3762  coenzyme PQQ synthesis C  25.21 
 
 
243 aa  52.4  0.000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0369  TENA/THI-4 protein  24.2 
 
 
234 aa  51.6  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.180108  normal  0.882306 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3633  transcriptional activator, TenA family  23.4 
 
 
238 aa  48.9  0.00006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0880  coenzyme PQQ synthesis protein C, putative  21.46 
 
 
219 aa  48.9  0.00006  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4284  putative coenzyme PQQ synthesis protein  22.86 
 
 
254 aa  46.6  0.0004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0229607  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0288  TENA/THI-4 domain-containing protein  24.34 
 
 
246 aa  45.1  0.001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000063147 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1325  TenA/THI-4 protein  20.41 
 
 
239 aa  44.7  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1825  hypothetical protein  23.55 
 
 
243 aa  42.7  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.429837  normal  0.202092 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>