68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_4653 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_4653  hypothetical protein  100 
 
 
212 aa  414  9.999999999999999e-116  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.566627  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3343  membrane protein  28.73 
 
 
214 aa  82  0.000000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1606  membrane protein-like protein  25.42 
 
 
416 aa  62.8  0.000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2807  SNARE associated Golgi protein-related protein  30.43 
 
 
198 aa  59.3  0.00000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.034805  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04042  DedA family protein BAL199  25.57 
 
 
195 aa  58.2  0.00000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0479  DedA family protein  28.03 
 
 
193 aa  55.5  0.0000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2492  DedA family protein  28.82 
 
 
192 aa  54.3  0.000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0302048  normal  0.107524 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1959  hypothetical protein  30.07 
 
 
211 aa  53.5  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.822135 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0012  SNARE associated Golgi protein  26.28 
 
 
159 aa  52.8  0.000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.566831  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2300  hypothetical protein  24.04 
 
 
187 aa  52.4  0.000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000215162  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1274  hypothetical protein  23.33 
 
 
196 aa  52  0.000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1641  hypothetical protein  22.67 
 
 
196 aa  51.2  0.00001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.87156  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0722  SNARE associated Golgi protein  24 
 
 
201 aa  50.4  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000026283  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0048  DedA family protein  26.97 
 
 
193 aa  50.4  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.331366  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4083  hypothetical protein  24 
 
 
190 aa  50.8  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1589  hypothetical protein  22.67 
 
 
222 aa  50.8  0.00002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.356457  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2561  hypothetical protein  30.12 
 
 
209 aa  50.1  0.00003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1501  lipoprotein B  29.41 
 
 
191 aa  48.9  0.00006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0681914  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1749  hypothetical protein  23.88 
 
 
212 aa  48.5  0.00007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.17424 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0725  DedA family protein  25.81 
 
 
193 aa  48.5  0.00007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0738  DedA family protein  25.81 
 
 
193 aa  48.5  0.00007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1401  hypothetical protein  25.67 
 
 
200 aa  48.5  0.00007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0975  dedA family protein  22.22 
 
 
201 aa  48.1  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000365515  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1255  hypothetical protein  25.78 
 
 
192 aa  47.4  0.0001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0889015  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0699  DedA family  25.16 
 
 
193 aa  47.8  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1746  SNARE associated Golgi protein  27.56 
 
 
160 aa  47.8  0.0001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.535585  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0156  SNARE associated Golgi protein  28.21 
 
 
160 aa  47  0.0002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.461417  normal  0.0291058 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0791  hypothetical protein  30.33 
 
 
193 aa  46.2  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.864721  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1168  DedA family protein  24.03 
 
 
192 aa  46.2  0.0003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0232351 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0642  SNARE associated Golgi protein  28.57 
 
 
157 aa  46.2  0.0004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.7148  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0773  DedA family protein  26.36 
 
 
201 aa  45.8  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000448539  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3998  hypothetical protein  22.16 
 
 
196 aa  46.2  0.0004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0810  DedA family protein  26.36 
 
 
201 aa  45.8  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.621407  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0865  dedA family protein  26.36 
 
 
201 aa  45.8  0.0005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4471  dedA family protein  23.39 
 
 
201 aa  45.8  0.0005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.238489 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0906  dedA family protein  26.36 
 
 
201 aa  45.8  0.0005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.29745e-42 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0902  dedA family protein  23.39 
 
 
201 aa  45.8  0.0005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.209208  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0721  dedA family protein; alkaline phosphatase-like protein  26.36 
 
 
201 aa  45.8  0.0005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.223536  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0708  dedA family protein; alkaline phosphatase-like protein  26.36 
 
 
201 aa  45.8  0.0005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0751539  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1822  SNARE associated Golgi protein  26.62 
 
 
193 aa  45.4  0.0007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  unclonable  0.00000000131488  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0978  DedA family protein  22.29 
 
 
193 aa  44.7  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00254572  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2521  phospholipase D  22.22 
 
 
714 aa  44.3  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0716  hypothetical protein  25.64 
 
 
160 aa  44.7  0.001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5412  phospholipase D  26.01 
 
 
735 aa  44.7  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.965585 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1595  hypothetical protein  29.24 
 
 
227 aa  43.5  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5957  DedA family protein  25.77 
 
 
193 aa  43.5  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.597905  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1429  hypothetical protein  24.29 
 
 
191 aa  43.9  0.002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0402  SNARE associated Golgi protein  26.67 
 
 
198 aa  43.9  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0868  DedA family  21.71 
 
 
193 aa  43.5  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5212  DedA family protein  26.8 
 
 
193 aa  43.1  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.685047  normal  0.0291 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3548  membrane protein-like protein  32.67 
 
 
149 aa  43.1  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0415  DedA family protein  26.37 
 
 
196 aa  42.7  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0403  dedA family protein  26.37 
 
 
196 aa  42.7  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3551  putative transmembrane-associated alkaline phosphatase protein  27.15 
 
 
198 aa  42.4  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.846117  normal  0.490696 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1196  SNARE associated Golgi protein  26.67 
 
 
197 aa  42.4  0.006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000186388  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0203  SNARE associated Golgi protein  25.2 
 
 
214 aa  42  0.006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3732  phospholipase D  28.57 
 
 
720 aa  42  0.006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0715  DedA family  23.37 
 
 
205 aa  42.4  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.628845  normal  0.325797 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0390  hypothetical protein  25.95 
 
 
198 aa  42  0.007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1836  SNARE associated Golgi protein  24.42 
 
 
208 aa  42  0.007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3614  membrane protein-like protein  32.67 
 
 
149 aa  42  0.007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22210  hypothetical protein  31.93 
 
 
259 aa  41.6  0.008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1089  SNARE associated Golgi protein  27.17 
 
 
160 aa  41.6  0.008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1030  SNARE associated Golgi protein-like protein  25.16 
 
 
203 aa  41.6  0.008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0461  dedA family protein  25.95 
 
 
198 aa  41.6  0.009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0394  hypothetical protein  25.95 
 
 
198 aa  41.6  0.009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2679  hypothetical protein  24.57 
 
 
198 aa  41.2  0.01  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1693  SNARE associated Golgi protein  23.33 
 
 
203 aa  41.6  0.01  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>