More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_3967 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_3967  integral membrane protein MviN  100 
 
 
540 aa  1075    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.19098  normal  0.429609 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1033  integral membrane protein MviN  36.08 
 
 
522 aa  256  5e-67  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.105478  hitchhiker  0.00337134 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3067  virulence factor MVIN family protein  35.91 
 
 
538 aa  235  2.0000000000000002e-60  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4685  virulence factor MVIN family protein  35.35 
 
 
553 aa  234  4.0000000000000004e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.562732 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2468  integral membrane protein MviN  34.48 
 
 
529 aa  228  2e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.135874  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1882  integral membrane protein MviN  32.47 
 
 
527 aa  222  9.999999999999999e-57  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0736  virulence factor MVIN family protein  33.33 
 
 
537 aa  218  2e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1584  integral membrane protein MviN  30.62 
 
 
521 aa  193  5e-48  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0236223  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3098  integral membrane protein MviN  31.46 
 
 
523 aa  191  2.9999999999999997e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0997  integral membrane protein MviN  29.53 
 
 
531 aa  169  1e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000225654  hitchhiker  0.00636735 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4312  integral membrane protein MviN  29.64 
 
 
521 aa  165  2.0000000000000002e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000871225  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1966  integral membrane protein MviN  28.37 
 
 
524 aa  157  4e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1610  integral membrane protein MviN  29.29 
 
 
514 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2088  integral membrane protein MviN  29.89 
 
 
526 aa  147  6e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.160318  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1470  integral membrane protein MviN  26.74 
 
 
523 aa  147  6e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2636  integral membrane protein MviN  26.21 
 
 
512 aa  144  3e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1654  integral membrane protein MviN  28.34 
 
 
521 aa  143  8e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0114  integral membrane protein MviN  24.68 
 
 
521 aa  141  3e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000331362  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2355  integral membrane protein MviN  27 
 
 
514 aa  139  2e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1051  integral membrane protein MviN  26.45 
 
 
525 aa  138  3.0000000000000003e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000233092  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3261  integral membrane protein MviN  27.12 
 
 
522 aa  137  6.0000000000000005e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.118117  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0565  integral membrane protein MviN  27.13 
 
 
534 aa  136  9.999999999999999e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2191  integral membrane protein MviN  24.29 
 
 
494 aa  134  3.9999999999999996e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0116874  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3425  integral membrane protein MviN  29.1 
 
 
529 aa  134  5e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3225  integral membrane protein MviN  29.06 
 
 
517 aa  131  4.0000000000000003e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.104496  normal  0.394976 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1786  integral membrane protein MviN  25.44 
 
 
494 aa  129  9.000000000000001e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1495  integral membrane protein MviN  27.25 
 
 
497 aa  127  4.0000000000000003e-28  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0370  integral membrane protein MviN  28.19 
 
 
519 aa  127  6e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.601407  normal  0.501558 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0967  integral membrane protein MviN  29.42 
 
 
501 aa  127  6e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.218762  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0216  integral membrane protein MviN  28.4 
 
 
533 aa  126  8.000000000000001e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0761  integral membrane protein MviN  25.47 
 
 
495 aa  126  1e-27  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2039  integral membrane protein MviN  25.25 
 
 
516 aa  125  1e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0629584  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2400  virulence factor MVIN-like  25.99 
 
 
521 aa  125  3e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000204704  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3339  integral membrane protein MviN  25.07 
 
 
522 aa  124  4e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1758  MviN family virulence factor  25.25 
 
 
516 aa  123  9e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.155059  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1417  integral membrane protein MviN  25.85 
 
 
526 aa  123  9e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.00326e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1172  virulence factor mviN protein  25.45 
 
 
521 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4854  virulence factor MVIN-like  29.11 
 
 
512 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.572015  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2490  integral membrane protein MviN  26.96 
 
 
521 aa  122  9.999999999999999e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000480713  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2048  integral membrane protein MviN  26.21 
 
 
521 aa  122  1.9999999999999998e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.767053  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0675  integral membrane protein MviN  23.42 
 
 
549 aa  121  3e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.136729  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0510  integral membrane protein MviN  24.37 
 
 
516 aa  120  6e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.721239  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0132  integral membrane protein MviN  29.6 
 
 
528 aa  119  9.999999999999999e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1855  virulence factor MVIN-like protein  29.86 
 
 
512 aa  119  9.999999999999999e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1583  integral membrane protein MviN  28.4 
 
 
511 aa  119  9.999999999999999e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4561  integral membrane protein MviN  30.05 
 
 
512 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.434356  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2905  integral membrane protein MviN  27.83 
 
 
534 aa  119  9.999999999999999e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2272  integral membrane protein MviN  27.93 
 
 
511 aa  119  1.9999999999999998e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0712  integral membrane protein MviN  28 
 
 
511 aa  119  1.9999999999999998e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.83297  normal  0.491449 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0703  integral membrane protein MviN  28.17 
 
 
511 aa  118  3e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.220129  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0502  integral membrane protein MviN  25.45 
 
 
515 aa  117  3.9999999999999997e-25  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2046  integral membrane protein MviN  27.05 
 
 
511 aa  117  5e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.234316  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4034  integral membrane protein MviN  26.5 
 
 
528 aa  117  5e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.419875  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0647  integral membrane protein MviN  29.98 
 
 
512 aa  117  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0843167 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0601  MviN family membrane protein  29.98 
 
 
512 aa  116  8.999999999999998e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0642  integral membrane protein MviN  29.98 
 
 
512 aa  116  8.999999999999998e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.180976 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3819  integral membrane protein MviN  27.23 
 
 
519 aa  115  1.0000000000000001e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.859074  normal  0.431062 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0804  membrane protein, MviN family  27.32 
 
 
512 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0938016  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1676  virulence factor  25.23 
 
 
515 aa  115  2.0000000000000002e-24  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0707  integral membrane protein MviN  27 
 
 
514 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60390  putative virulence factor, membrane protein  28.85 
 
 
512 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000610736 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2158  integral membrane protein MviN  26.39 
 
 
542 aa  115  3e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.33814  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2440  integral membrane protein MviN  26.39 
 
 
511 aa  114  3e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00101371  normal  0.0161102 
 
 
-
 
NC_002978  WD1010  integral membrane protein MviN  22.87 
 
 
495 aa  114  4.0000000000000004e-24  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0666785  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11760  integral membrane protein MviN  29.98 
 
 
514 aa  114  5e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.717987  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5202  integral membrane protein MviN  28.19 
 
 
512 aa  114  5e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.869199  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2176  integral membrane protein MviN  28.14 
 
 
511 aa  113  7.000000000000001e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0907  integral membrane protein MviN  23.28 
 
 
522 aa  113  7.000000000000001e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.3399500000000005e-32 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2836  integral membrane protein MviN  25.75 
 
 
539 aa  113  8.000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.743699 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0291  integral membrane protein MviN  25.62 
 
 
613 aa  113  8.000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0195514  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1235  integral membrane protein MviN  25.89 
 
 
526 aa  113  8.000000000000001e-24  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1267  integral membrane protein MviN  27.63 
 
 
524 aa  112  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0487336 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1282  integral membrane protein MviN  27.63 
 
 
524 aa  112  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.226684 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2018  integral membrane protein MviN  27.63 
 
 
524 aa  112  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2202  integral membrane protein MviN  27.63 
 
 
524 aa  112  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.582397  hitchhiker  0.00351914 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1238  integral membrane protein MviN  27.63 
 
 
524 aa  112  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.196455 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0342  integral membrane protein MviN  22.51 
 
 
537 aa  112  2.0000000000000002e-23  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2245  integral membrane protein MviN  25.97 
 
 
521 aa  112  2.0000000000000002e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2558  integral membrane protein MviN  25.62 
 
 
522 aa  112  2.0000000000000002e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.900363  normal  0.0167676 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0532  integral membrane protein MviN  26.79 
 
 
516 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4232  integral membrane protein MviN  24.09 
 
 
522 aa  112  2.0000000000000002e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0229332  hitchhiker  0.00000767469 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1296  integral membrane protein MviN  25.06 
 
 
538 aa  111  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004421  hypothetical protein  26.25 
 
 
520 aa  111  3e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000372973  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2083  integral membrane protein MviN  30.06 
 
 
511 aa  111  3e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.244759  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01065  predicted inner membrane protein  31.65 
 
 
511 aa  111  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2577  integral membrane protein MviN  31.65 
 
 
511 aa  111  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01073  hypothetical protein  31.65 
 
 
511 aa  111  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0559  integral membrane protein MviN  25.28 
 
 
517 aa  110  4.0000000000000004e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1806  integral membrane protein MviN  28.03 
 
 
511 aa  111  4.0000000000000004e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0960933  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1448  integral membrane protein MviN  31.65 
 
 
511 aa  111  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00196842 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0714  integral membrane protein MviN  25.28 
 
 
517 aa  110  4.0000000000000004e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000185253 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0708  virulence factor MVIN-like  27 
 
 
528 aa  110  5e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.933126  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1192  integral membrane protein MviN  31.65 
 
 
511 aa  110  5e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2210  integral membrane protein MviN  25.32 
 
 
513 aa  110  5e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2060  integral membrane protein MviN  31.65 
 
 
511 aa  110  5e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.178549 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2257  integral membrane protein MviN  31.65 
 
 
511 aa  110  5e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2531  integral membrane protein MviN  31.65 
 
 
511 aa  110  5e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.415764  normal  0.0831768 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1192  integral membrane protein MviN  31.65 
 
 
511 aa  110  5e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2557  MVIN_ECOLI homolog transmembrane protein  26.81 
 
 
517 aa  110  6e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0307884  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3026  putative transmembrane protein  26.4 
 
 
521 aa  110  9.000000000000001e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>