228 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_1798 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_1798  PadR family transcriptional regulator  100 
 
 		 121 aa  240  5e-63  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0304108  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4325  PadR-like family transcriptional regulator  65.71 
 
 		 109 aa  142  1e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.405564  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1103  transcriptional regulator, PadR-like family  49.09 
 
 		 118 aa  103  1e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.369684  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0494  transcriptional regulator, PadR-like family  52.04 
 
 		 113 aa  102  1e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.396761  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0734  hypothetical protein  55.66 
 
 		 118 aa  102  2e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5742  transcriptional regulator, PadR-like family  49.06 
 
 		 112 aa  101  3e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.92312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0690  PadR-like family transcriptional regulator  52.68 
 
 		 132 aa  101  3e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.112925  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5391  transcriptional regulator, PadR family  49.54 
 
 		 115 aa  101  4e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0917422  normal  0.395452 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3696  PadR-like family transcriptional regulator  52.29 
 
 		 128 aa  100  6e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0681  transcriptional regulator, PadR-like family  52.29 
 
 		 128 aa  99.8  1e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0691  PadR-like family transcriptional regulator  52.29 
 
 		 128 aa  99.8  1e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0660  PadR-like family transcriptional regulator  52.29 
 
 		 128 aa  99.8  1e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04310  transcriptional regulator, PadR family  51.52 
 
 		 115 aa  97.8  4e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2537  PadR family transcriptional regulator  49.52 
 
 		 115 aa  97.4  6e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.33456  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1533  transcriptional regulator, PadR-like family  46.15 
 
 		 120 aa  97.4  6e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.310263 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2817  hypothetical protein  49.52 
 
 		 114 aa  96.7  9e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2621  hypothetical protein  49.52 
 
 		 114 aa  96.7  1e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.065619  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2570  PadR family transcriptional regulator  49.52 
 
 		 115 aa  96.3  1e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000223824  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2812  hypothetical protein  49.52 
 
 		 114 aa  96.7  1e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0612725  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2473  hypothetical protein  49.52 
 
 		 114 aa  96.3  1e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.140746  normal  0.551576 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2819  hypothetical protein  49.52 
 
 		 114 aa  96.7  1e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000193161 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2859  hypothetical protein  48.57 
 
 		 115 aa  95.5  2e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000516824  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2613  PadR-like family transcriptional regulator  49.52 
 
 		 115 aa  95.5  2e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000539702  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2191  transcriptional regulator, PadR-like family  42.2 
 
 		 115 aa  94.7  3e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  3.02647e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2527  PadR-like family transcriptional regulator  46.08 
 
 		 117 aa  93.6  8e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0218249  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4235  transcriptional regulator, PadR family  44.34 
 
 		 111 aa  76.6  0.00000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.324298  normal  0.0938031 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2348  PadR family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 119 aa  70.5  0.000000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.14892 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1974  transcriptional regulator, PadR-like family  37.5 
 
 		 117 aa  66.6  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.37722 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1070  transcriptional regulator, PadR-like family  40.45 
 
 		 104 aa  64.7  0.0000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.188637  hitchhiker  0.000000498444 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0735  PadR-like family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 111 aa  63.9  0.0000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33800  transcriptional regulator, PadR family  37.04 
 
 		 126 aa  63.5  0.0000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.377597  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0435  transcriptional regulator, PadR-like family  32.38 
 
 		 110 aa  61.2  0.000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000000949974  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4394  PadR family transcriptional regulator  33.98 
 
 		 119 aa  60.8  0.000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0853  PadR family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 103 aa  60.8  0.000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.293414  normal  0.533668 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0909  transcriptional regulator, PadR-like family  36.89 
 
 		 114 aa  60.8  0.000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3483  hypothetical protein  34.29 
 
 		 109 aa  58.9  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.134487  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3757  hypothetical protein  34.29 
 
 		 109 aa  58.9  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0755  PadR family transcriptional regulator  33.98 
 
 		 125 aa  59.3  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.916558  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2347  PadR-like family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 103 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.68087  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3448  transcriptional regulator  34.29 
 
 		 109 aa  58.9  0.00000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3584  PadR-like family transcriptional regulator  42.39 
 
 		 112 aa  58.5  0.00000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3399  transcriptional regulator  34.29 
 
 		 109 aa  58.9  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.314118  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3563  PadR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 125 aa  58.5  0.00000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3281  PadR-like family transcriptional regulator  42.39 
 
 		 112 aa  58.5  0.00000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.206991 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4588  transcriptional regulator, PadR-like family  41.3 
 
 		 125 aa  58.2  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00658109  normal  0.0547899 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0195  PadR-like family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 110 aa  58.2  0.00000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.523005  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3730  hypothetical protein  33.65 
 
 		 107 aa  57.8  0.00000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3711  hypothetical protein  33.33 
 
 		 107 aa  57.4  0.00000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.0645400000000003e-18 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3753  hypothetical protein  33.65 
 
 		 107 aa  57.4  0.00000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.722643  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3802  hypothetical protein  32.69 
 
 		 107 aa  57.4  0.00000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.991383  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3380  PadR-like family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 107 aa  57.4  0.00000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.114558  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1513  hypothetical protein  32.69 
 
 		 107 aa  57.4  0.00000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0927138 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3822  transcriptional regulator, PadR-like family  40.23 
 
 		 114 aa  57.4  0.00000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0175  transcriptional regulator, PadR-like family  36.36 
 
 		 110 aa  57  0.00000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1497  PadR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 107 aa  57  0.00000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.452189  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3814  transcriptional regulator, PadR-like family  41.38 
 
 		 106 aa  56.6  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.375382  normal  0.563614 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2935  transcriptional regulator, PadR-like family  32.67 
 
 		 116 aa  56.6  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000047727  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4304  hypothetical protein  28.32 
 
 		 119 aa  56.6  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0884  transcriptional regulator, PadR-like family  36 
 
 		 113 aa  55.8  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.803221  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8234  transcriptional regulator, PadR-like family  38.2 
 
 		 123 aa  55.5  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5114  PadR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 121 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4845  PadR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 188 aa  55.8  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5211  PadR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 109 aa  55.5  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0763  PadR-like family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 108 aa  56.2  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.31288  normal  0.603278 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5082  transcriptional regulator, PadR family  36.67 
 
 		 109 aa  55.5  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3281  PadR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 109 aa  56.2  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1858  PadR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 104 aa  55.1  0.0000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000000789415  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09563  hypothetical protein  33.33 
 
 		 114 aa  54.7  0.0000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.193917  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2744  transcriptional regulator, PadR-like family  31.78 
 
 		 135 aa  54.7  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.167996  hitchhiker  0.000000256971 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0045  transcriptional regulator, PadR-like family  37.76 
 
 		 110 aa  54.7  0.0000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4828  30S ribosomal protein S14 homolog-related  31.25 
 
 		 114 aa  54.3  0.0000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4516  PadR-like family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 114 aa  54.3  0.0000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4741  transcriptional regulator, PadR-like family  36.08 
 
 		 116 aa  54.3  0.0000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1102  transcriptional regulator, PadR family  34.74 
 
 		 110 aa  54.3  0.0000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1068  transcriptional regulator, PadR family  36.67 
 
 		 110 aa  54.3  0.0000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00406829  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3858  PadR-like family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 110 aa  53.5  0.0000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3462  PadR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 121 aa  53.5  0.0000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00016944  hitchhiker  0.00778578 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0318  PadR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 110 aa  53.5  0.0000009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.490678  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2728  PadR-like family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 110 aa  53.5  0.0000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.323988  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0204  transcriptional regulator, PadR-like family  30.19 
 
 		 111 aa  53.1  0.000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.100896 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4136  transcriptional regulator, PadR family  34.74 
 
 		 110 aa  53.5  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.345707  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3375  transcriptional regulator, PadR-like family  33 
 
 		 114 aa  53.1  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000695283  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1270  PadR-like family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 105 aa  53.1  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000169455  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2026  PadR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 102 aa  53.5  0.000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000000771993  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2076  transcriptional regulator, PadR-like family  33.98 
 
 		 126 aa  53.1  0.000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.668384  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0475  transcriptional regulator, PadR family  35.42 
 
 		 109 aa  53.5  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2928  transcriptional regulator, PadR-like family  34.62 
 
 		 106 aa  52.8  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.425588  hitchhiker  0.00045831 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0346  PadR-like family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 108 aa  52.8  0.000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4083  PadR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 110 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0211  transcriptional regulator, PadR-like family  34.26 
 
 		 114 aa  52.8  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.635433  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12940  predicted transcriptional regulator  35.79 
 
 		 128 aa  52.4  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2175  transcriptional regulator, PadR-like family  31.68 
 
 		 114 aa  52.8  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000935551  normal  0.0245277 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3940  PadR family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 110 aa  52  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4248  PadR family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 110 aa  52  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1963  PadR-like family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 103 aa  51.6  0.000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0360  transcriptional regulator, PadR-like family  34.12 
 
 		 107 aa  52  0.000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_710  transcriptional regulator, PadR-type  35 
 
 		 99 aa  51.6  0.000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0242268  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13523  hypothetical protein  37.97 
 
 		 107 aa  52  0.000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00194413 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3772  PadR family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 110 aa  51.2  0.000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4418  PadR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 114 aa  51.6  0.000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>