More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_1269 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_1269  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  100 
 
 		 400 aa  829    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3603  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  34 
 
 		 761 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6592  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  33.58 
 
 		 789 aa  211  2e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00642843 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5656  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  34.33 
 
 		 789 aa  209  6e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.240642  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1496  glycine cleavage system T protein  35.65 
 
 		 371 aa  209  8e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3316  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  35.15 
 
 		 789 aa  208  1e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3184  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  33.92 
 
 		 772 aa  205  1e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.932347  normal  0.101013 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1202  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  32.92 
 
 		 752 aa  204  2e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3460  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  34.31 
 
 		 781 aa  203  5e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0155  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  33.25 
 
 		 790 aa  202  7e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5134  aminomethyltransferase  34 
 
 		 757 aa  198  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0949  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  31.75 
 
 		 433 aa  196  5.000000000000001e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0232  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  30.93 
 
 		 368 aa  191  2e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23440  glycine cleavage system T protein  32.96 
 
 		 357 aa  180  4.999999999999999e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000137386  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0406  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  33.24 
 
 		 359 aa  177  2e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.885714  normal  0.283909 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0470  aminomethyltransferase  29.12 
 
 		 440 aa  176  4e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.0000173433  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1945  aminomethyltransferase  31.65 
 
 		 366 aa  176  5e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000285507 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0767  glycine cleavage system T protein  29.12 
 
 		 442 aa  176  5e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2915  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  31.07 
 
 		 366 aa  173  3.9999999999999995e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.75153  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0720  glycine cleavage system T protein  31.55 
 
 		 364 aa  172  1e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4039  glycine cleavage system T protein  28.95 
 
 		 365 aa  167  2.9999999999999998e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000142158  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4082  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  30.29 
 
 		 366 aa  167  4e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1526  glycine cleavage system T protein  30.68 
 
 		 371 aa  166  5.9999999999999996e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.293085 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2285  glycine cleavage system T protein  30.39 
 
 		 370 aa  165  2.0000000000000002e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00010894 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3981  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  30.29 
 
 		 366 aa  164  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4358  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  30.29 
 
 		 366 aa  163  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.51819  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4305  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  30.29 
 
 		 366 aa  163  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1912  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  29.01 
 
 		 441 aa  162  1e-38  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.0000389017  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2361  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  28.75 
 
 		 364 aa  162  1e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.365627  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2868  glycine cleavage system T protein  32.39 
 
 		 361 aa  161  2e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0901  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  30.03 
 
 		 366 aa  161  2e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.281219  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19710  glycine cleavage system T protein (aminomethyltransferase)  32.35 
 
 		 425 aa  161  2e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.207697  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4247  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  30.03 
 
 		 366 aa  160  3e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4131  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  30.03 
 
 		 366 aa  160  3e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3971  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  30.03 
 
 		 366 aa  160  3e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4449  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  30.03 
 
 		 366 aa  160  3e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.268637  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0737  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  30.77 
 
 		 364 aa  159  1e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2522  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  30.14 
 
 		 360 aa  158  1e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.167801 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0764  aminomethyltransferase  30.95 
 
 		 401 aa  157  3e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.214671  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0713  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  29.57 
 
 		 364 aa  157  4e-37  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1173  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  30.94 
 
 		 380 aa  156  5.0000000000000005e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.113377  normal  0.236681 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0253  glycine cleavage system T protein  32.42 
 
 		 367 aa  156  7e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1245  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  31.83 
 
 		 360 aa  156  7e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1800  glycine cleavage system T protein  28.76 
 
 		 367 aa  155  2e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2620  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  31.22 
 
 		 360 aa  154  2.9999999999999998e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.398044  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2714  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  31.22 
 
 		 360 aa  154  4e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0214  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  29.95 
 
 		 364 aa  153  4e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0976  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  29.63 
 
 		 430 aa  152  7e-36  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2054  glycine cleavage system T protein  30.4 
 
 		 374 aa  151  2e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4339  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  30.29 
 
 		 366 aa  151  2e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.485786  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0961  glycine cleavage system T protein  30.34 
 
 		 364 aa  150  3e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.132468  normal  0.780252 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2824  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  29.14 
 
 		 369 aa  150  4e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00490  aminomethyltransferase  29.14 
 
 		 381 aa  150  5e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.155954 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4141  glycine cleavage system T protein  28.21 
 
 		 366 aa  150  5e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1349  aminomethyltransferase  30 
 
 		 961 aa  149  7e-35  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0486795  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1559  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  29.41 
 
 		 362 aa  148  1.0000000000000001e-34  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4451  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  29.49 
 
 		 369 aa  149  1.0000000000000001e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0599  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  30.08 
 
 		 362 aa  146  5e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.611166 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2562  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  28.23 
 
 		 360 aa  146  6e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13330  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  28.69 
 
 		 370 aa  146  7.0000000000000006e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2751  aminomethyltransferase  26.61 
 
 		 365 aa  146  7.0000000000000006e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1595  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  27.84 
 
 		 363 aa  144  2e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0825414  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2461  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  28.57 
 
 		 380 aa  145  2e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1818  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  29.5 
 
 		 403 aa  144  2e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1628  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  27.84 
 
 		 363 aa  144  2e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0426  glycine cleavage system T protein  29.2 
 
 		 372 aa  143  4e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.473658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1885  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  25.93 
 
 		 363 aa  143  5e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3845  glycine cleavage system T protein  29.36 
 
 		 369 aa  143  6e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4046  glycine cleavage system T protein  28.01 
 
 		 391 aa  142  8e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00578846  normal  0.203925 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0716  glycine cleavage system T protein  28.42 
 
 		 365 aa  142  9.999999999999999e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3364  glycine cleavage system T protein  29.51 
 
 		 369 aa  141  1.9999999999999998e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2222  aminomethyltransferase  28.27 
 
 		 968 aa  141  3e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.282485  normal  0.38236 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1804  glycine cleavage system T protein  32.23 
 
 		 375 aa  140  3e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.280258  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1756  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  29.49 
 
 		 362 aa  140  3.9999999999999997e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.971274  normal  0.141351 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0923  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  28.99 
 
 		 379 aa  140  4.999999999999999e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0094  glycine cleavage system T protein  28.99 
 
 		 401 aa  139  6e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11173  aminomethyltransferase  29.3 
 
 		 360 aa  139  7e-32  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.324081  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4550  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  29.75 
 
 		 360 aa  139  8.999999999999999e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.669623 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3299  glycine cleavage system T protein  28.31 
 
 		 389 aa  139  1e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.212433  normal  0.550694 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2450  sarcosine oxidase, alpha subunit  28.27 
 
 		 968 aa  137  2e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0353624  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3187  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  28.2 
 
 		 376 aa  138  2e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.149022 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1656  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  29.59 
 
 		 366 aa  137  3.0000000000000003e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.200164  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1983  aminomethyltransferase  29.24 
 
 		 366 aa  137  3.0000000000000003e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00232491  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2455  glycine cleavage system T protein  29.28 
 
 		 363 aa  137  4e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0417  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  30.68 
 
 		 362 aa  137  4e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0882  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  28.86 
 
 		 382 aa  137  4e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5660  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  28.85 
 
 		 365 aa  137  5e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1102  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  27.56 
 
 		 363 aa  136  6.0000000000000005e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.547647  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3316  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  30.98 
 
 		 387 aa  136  6.0000000000000005e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0709071  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2351  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  31.2 
 
 		 372 aa  136  7.000000000000001e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.417081  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18191  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  30.56 
 
 		 359 aa  136  8e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3184  aminomethyltransferase  29.64 
 
 		 372 aa  135  9e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000207434  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3155  glycine cleavage system T protein  29.55 
 
 		 362 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1559  glycine cleavage system T protein  28.73 
 
 		 359 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.338769 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3474  aminomethyltransferase  27.54 
 
 		 965 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0173  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  27.11 
 
 		 376 aa  134  1.9999999999999998e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0395  glycine cleavage system T protein  31.27 
 
 		 363 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1000  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  29.38 
 
 		 1019 aa  135  1.9999999999999998e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.99192  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2232  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  28.77 
 
 		 365 aa  134  3e-30  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0998  sarcosine oxidase, alpha subunit  28.65 
 
 		 1002 aa  134  3e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>