More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_0712 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_0712  branched chain amino acid aminotransferase / branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  100 
 
 
312 aa  642    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.157131  normal  0.557772 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3219  branched-chain amino acid aminotransferase  62.71 
 
 
306 aa  422  1e-117  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000260212  normal  0.0812213 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1550  branched-chain amino acid aminotransferase  60.46 
 
 
309 aa  397  1e-109  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.11991  normal  0.203059 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1962  branched-chain amino acid aminotransferase  60.06 
 
 
308 aa  396  1e-109  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.981543 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2679  branched-chain amino acid aminotransferase  60.8 
 
 
312 aa  378  1e-104  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4443  branched-chain amino acid aminotransferase  57.1 
 
 
307 aa  375  1e-103  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4234  branched-chain amino acid aminotransferase  55.7 
 
 
309 aa  368  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.754469  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1601  branched-chain amino acid aminotransferase  59.46 
 
 
303 aa  368  1e-101  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.720294 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4128  branched-chain amino acid aminotransferase  55.7 
 
 
309 aa  368  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4185  branched-chain amino acid aminotransferase  55.7 
 
 
309 aa  368  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4293  branched-chain amino acid aminotransferase  55.7 
 
 
309 aa  368  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4206  branched-chain amino acid aminotransferase  54.37 
 
 
309 aa  365  1e-100  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.884547  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0607  branched-chain amino acid aminotransferase  58.53 
 
 
303 aa  365  1e-100  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000582891  decreased coverage  0.00306589 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4136  branched-chain amino acid aminotransferase  54.37 
 
 
309 aa  365  1e-100  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.405484  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4150  branched-chain amino acid aminotransferase  54.37 
 
 
309 aa  365  1e-100  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4281  branched-chain amino acid aminotransferase  54.37 
 
 
309 aa  365  1e-100  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4232  branched-chain amino acid aminotransferase  54.37 
 
 
309 aa  365  1e-100  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.583001  normal  0.603299 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5204  branched-chain amino acid aminotransferase  54.37 
 
 
309 aa  365  1e-100  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3987  branched-chain amino acid aminotransferase  54.37 
 
 
309 aa  365  1e-100  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4113  branched-chain amino acid aminotransferase  55.37 
 
 
309 aa  367  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03648  branched-chain amino acid aminotransferase  54.05 
 
 
309 aa  363  1e-99  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00137757  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03597  hypothetical protein  54.05 
 
 
309 aa  363  1e-99  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0014654  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0549  branched-chain amino acid aminotransferase  57.19 
 
 
303 aa  363  2e-99  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000680418  normal  0.228454 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0588  branched-chain amino acid aminotransferase  57.77 
 
 
303 aa  363  2e-99  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4013  branched-chain amino acid aminotransferase  55.19 
 
 
309 aa  362  3e-99  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0147074 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1869  branched-chain amino acid aminotransferase  57.19 
 
 
303 aa  361  1e-98  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000706765  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0716  branched-chain amino acid aminotransferase  58.78 
 
 
303 aa  359  3e-98  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.470563  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0140  branched-chain amino acid aminotransferase  54.46 
 
 
308 aa  358  5e-98  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3774  branched-chain amino acid aminotransferase  54.82 
 
 
308 aa  357  1.9999999999999998e-97  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.694412  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4758  branched-chain amino acid aminotransferase  54.82 
 
 
308 aa  355  5.999999999999999e-97  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.456918  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4030  branched-chain amino acid aminotransferase  54.79 
 
 
308 aa  353  2e-96  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.597878  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1779  branched-chain amino acid aminotransferase  55.33 
 
 
303 aa  351  1e-95  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.059153  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4219  branched-chain amino acid aminotransferase  54.46 
 
 
308 aa  351  1e-95  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4059  branched-chain amino acid aminotransferase  54.49 
 
 
308 aa  350  2e-95  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0484  branched-chain amino acid aminotransferase  54.49 
 
 
308 aa  350  2e-95  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.308997 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0156  branched-chain amino acid aminotransferase  54.49 
 
 
308 aa  350  2e-95  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00412  branched-chain amino acid aminotransferase  52.3 
 
 
312 aa  340  1e-92  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002039  branched-chain amino acid aminotransferase  51.97 
 
 
312 aa  340  2e-92  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2490  branched-chain amino acid aminotransferase  52.3 
 
 
319 aa  339  2.9999999999999998e-92  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0291  branched-chain amino acid aminotransferase  51.64 
 
 
307 aa  335  7.999999999999999e-91  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0286  branched-chain amino acid aminotransferase  52.43 
 
 
318 aa  335  7.999999999999999e-91  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0618931  normal  0.476236 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0347  branched-chain amino acid aminotransferase  50.8 
 
 
309 aa  334  1e-90  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0444  branched-chain amino acid aminotransferase  51.96 
 
 
307 aa  330  2e-89  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.976398 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4163  branched-chain amino acid aminotransferase  50.98 
 
 
307 aa  325  5e-88  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0379  branched-chain amino acid aminotransferase  53.09 
 
 
307 aa  320  1.9999999999999998e-86  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4845  branched-chain amino acid aminotransferase  49.03 
 
 
308 aa  315  5e-85  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0893  branched-chain amino acid aminotransferase  50.49 
 
 
320 aa  315  6e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2457  branched-chain amino acid aminotransferase  50.49 
 
 
320 aa  315  6e-85  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2593  branched-chain amino acid aminotransferase  50.49 
 
 
320 aa  315  6e-85  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0567  branched-chain amino acid aminotransferase  51.32 
 
 
314 aa  315  7e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3547  branched-chain amino acid aminotransferase  48.51 
 
 
311 aa  304  2.0000000000000002e-81  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0316  branched-chain amino acid aminotransferase  48.32 
 
 
312 aa  303  3.0000000000000004e-81  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0304  branched-chain amino acid aminotransferase  47.73 
 
 
307 aa  300  3e-80  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1533  branched-chain amino acid aminotransferase  48.67 
 
 
307 aa  298  6e-80  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1818  branched-chain amino acid aminotransferase  48.67 
 
 
307 aa  296  3e-79  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.774485  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0203  branched-chain amino acid aminotransferase  47.65 
 
 
312 aa  296  4e-79  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1863  branched chain amino acid aminotransferase / branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  48.32 
 
 
305 aa  296  4e-79  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0264  branched-chain amino acid aminotransferase  46.98 
 
 
312 aa  296  4e-79  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2686  branched-chain amino acid aminotransferase  45.51 
 
 
309 aa  296  4e-79  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2143  branched-chain amino acid aminotransferase  48.33 
 
 
306 aa  295  5e-79  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1449  branched-chain amino acid aminotransferase  46.41 
 
 
308 aa  295  5e-79  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.295507  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3552  branched-chain amino acid aminotransferase  47.32 
 
 
307 aa  295  7e-79  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3631  branched chain amino acid aminotransferase / branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  46.75 
 
 
308 aa  295  9e-79  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.331322 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2475  branched-chain amino acid aminotransferase  47.83 
 
 
313 aa  295  9e-79  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0567  branched-chain amino acid aminotransferase  49.66 
 
 
309 aa  294  1e-78  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.83417 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0201  branched-chain amino acid aminotransferase  46.98 
 
 
312 aa  294  1e-78  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1099  branched-chain amino acid aminotransferase  47.35 
 
 
307 aa  294  1e-78  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0182  branched-chain amino acid aminotransferase  46.64 
 
 
312 aa  295  1e-78  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.392478  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0947  branched-chain amino acid aminotransferase  45.51 
 
 
309 aa  293  2e-78  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.506532  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1537  branched-chain amino acid aminotransferase  47.71 
 
 
308 aa  292  5e-78  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1109  branched-chain amino acid aminotransferase  46.64 
 
 
312 aa  292  5e-78  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  hitchhiker  0.00000000000646452  normal  0.0889333 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0065  branched-chain amino acid aminotransferase  48.49 
 
 
307 aa  291  7e-78  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0493  branched-chain amino acid aminotransferase  51.34 
 
 
306 aa  291  8e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.785071  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2109  branched-chain amino acid aminotransferase  47.44 
 
 
304 aa  291  9e-78  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0353  branched-chain amino acid aminotransferase  45.48 
 
 
304 aa  291  1e-77  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.733524  normal  0.170926 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1209  branched-chain amino acid aminotransferase  47.49 
 
 
306 aa  290  2e-77  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3280  branched-chain amino acid aminotransferase  49.16 
 
 
307 aa  290  3e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0456  branched-chain amino acid aminotransferase  49.16 
 
 
307 aa  289  3e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.940058  normal  0.29974 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0660  branched-chain amino acid aminotransferase  49.5 
 
 
307 aa  289  4e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.256122  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0855  branched-chain amino acid aminotransferase  45.57 
 
 
304 aa  289  4e-77  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0686  branched-chain amino acid aminotransferase  49.16 
 
 
307 aa  288  6e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.285453 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1301  branched-chain amino acid aminotransferase  46.44 
 
 
296 aa  288  1e-76  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0767028 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2934  branched-chain amino acid aminotransferase  46.56 
 
 
339 aa  288  1e-76  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0293  branched-chain amino acid aminotransferase  49.5 
 
 
307 aa  288  1e-76  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3294  branched-chain amino acid aminotransferase  46.15 
 
 
306 aa  287  1e-76  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.845143 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0830  branched-chain amino acid aminotransferase  49.5 
 
 
307 aa  288  1e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0992  branched-chain amino acid aminotransferase  49.5 
 
 
307 aa  288  1e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.631035  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1404  branched-chain amino acid aminotransferase  48.16 
 
 
304 aa  288  1e-76  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0034  branched-chain amino acid aminotransferase  49.5 
 
 
307 aa  288  1e-76  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0588  branched-chain amino acid aminotransferase  49.5 
 
 
307 aa  288  1e-76  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2019  branched-chain amino acid aminotransferase  47.14 
 
 
302 aa  288  1e-76  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2421  branched-chain amino acid aminotransferase  49.5 
 
 
307 aa  288  1e-76  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0834  branched-chain amino acid aminotransferase  49.5 
 
 
307 aa  288  1e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.245498  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5962  branched-chain amino acid aminotransferase  49.16 
 
 
307 aa  286  4e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.275506 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2020  branched-chain amino acid aminotransferase  48.83 
 
 
307 aa  286  5e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2631  branched-chain amino acid aminotransferase  48.83 
 
 
307 aa  286  5e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.66412  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0180  branched-chain amino acid aminotransferase  47.4 
 
 
304 aa  285  7e-76  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2268  branched-chain amino acid aminotransferase  48.99 
 
 
307 aa  285  9e-76  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2660  branched-chain amino acid aminotransferase  48.83 
 
 
307 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.351839  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2994  branched-chain amino acid aminotransferase  47.68 
 
 
319 aa  285  1.0000000000000001e-75  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.127266  normal  0.646226 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>