189 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_3735 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_3735  periplasmic binding protein  100 
 
 
361 aa  719    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3935  periplasmic binding protein  71.05 
 
 
373 aa  528  1e-149  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.427342  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22080  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  47.56 
 
 
358 aa  299  4e-80  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.311428  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26550  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  41.28 
 
 
348 aa  268  1e-70  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.511837  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22070  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  44.85 
 
 
383 aa  260  3e-68  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.162415 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2580  periplasmic binding protein  44.75 
 
 
354 aa  242  9e-63  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.540975  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4296  periplasmic binding protein  39.82 
 
 
346 aa  234  2.0000000000000002e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19080  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  42.77 
 
 
347 aa  229  5e-59  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.895091  normal  0.13403 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2317  periplasmic binding protein  40.39 
 
 
345 aa  225  8e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2085  periplasmic binding protein  35.01 
 
 
354 aa  217  2e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000968789  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3522  periplasmic binding protein  37.7 
 
 
333 aa  212  9e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2930  periplasmic binding protein  37.32 
 
 
365 aa  211  2e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3331  transport system permease protein  38.83 
 
 
324 aa  211  2e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.411353  normal  0.472078 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3909  periplasmic binding protein  40.27 
 
 
341 aa  209  5e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0611865 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2827  periplasmic binding protein  37.99 
 
 
332 aa  207  2e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.420364  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1491  putative ABC transporter, periplasmic iron-siderophore binding protein  36.42 
 
 
347 aa  203  5e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00253008  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3636  periplasmic binding protein  38.46 
 
 
325 aa  201  1.9999999999999998e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00284754 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3061  periplasmic binding protein  38.11 
 
 
325 aa  200  3.9999999999999996e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.260153  normal  0.218558 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3416  ABC Fe+3-siderophore transporter, periplasmic binding protein  37.79 
 
 
325 aa  199  7.999999999999999e-50  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17020  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  36.28 
 
 
346 aa  194  3e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.745589 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2819  periplasmic binding protein  33.43 
 
 
349 aa  192  6e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2011  periplasmic binding protein  36.68 
 
 
662 aa  192  1e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00756421  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07950  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  36.24 
 
 
349 aa  183  3e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0346758  normal  0.343375 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3071  ferric enterobactin ABC transporter, ferric enterobactin-binding periplasmic protein FepB  35.8 
 
 
350 aa  182  1e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.24257 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36350  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  34.04 
 
 
356 aa  176  5e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06470  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  34.29 
 
 
353 aa  173  5e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3694  periplasmic binding protein  35 
 
 
341 aa  167  2.9999999999999998e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.792098  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2441  ferric enterobactin ABC transporter, ferric enterobactin-binding periplasmic protein FepB  30.74 
 
 
359 aa  166  4e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3183  ferric enterobactin ABC transporter ferric enterobactin-binding periplasmic protein FepB  30.74 
 
 
359 aa  166  5e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.197139 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2540  periplasmic binding protein  30.74 
 
 
359 aa  166  5.9999999999999996e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.501058  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0428  periplasmic binding protein  34.01 
 
 
342 aa  162  8.000000000000001e-39  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0856962  normal  0.313337 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22710  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  33.23 
 
 
345 aa  157  3e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2175  periplasmic binding protein  31.87 
 
 
352 aa  154  2.9999999999999998e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.038626  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0200  periplasmic binding protein  33.83 
 
 
322 aa  150  5e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3470  periplasmic binding protein  34.39 
 
 
356 aa  149  7e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00150315  hitchhiker  0.00510017 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0385  periplasmic binding protein  31.73 
 
 
365 aa  149  8e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0418  twin-arginine translocation pathway signal  31.21 
 
 
347 aa  144  2e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.71368  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5939  periplasmic binding protein  32.95 
 
 
330 aa  144  2e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.587353  normal  0.774281 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0853  ABC transporter, periplasmic solute-binding protein  31.91 
 
 
349 aa  144  3e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.899813  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0419  periplasmic binding protein  32.12 
 
 
344 aa  143  5e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.182541  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0807  periplasmic binding protein  34.18 
 
 
343 aa  142  9.999999999999999e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0138  iron-siderophore ABC transporter, periplasmic binding protein  31.55 
 
 
316 aa  139  6e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4288  periplasmic binding protein  34.88 
 
 
359 aa  137  2e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.515343  normal  0.467407 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2437  periplasmic binding protein  32.15 
 
 
351 aa  138  2e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.255476  normal  0.0637289 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0269  periplasmic binding protein  33.33 
 
 
338 aa  135  9.999999999999999e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.448293  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4230  periplasmic binding protein  30.88 
 
 
341 aa  134  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.973317  normal  0.0372991 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0308  periplasmic binding protein  32.29 
 
 
316 aa  126  7e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1591  periplasmic binding protein  31.99 
 
 
334 aa  124  3e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0300116 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5065  periplasmic binding protein  29.9 
 
 
336 aa  121  1.9999999999999998e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5337  periplasmic binding protein  31.86 
 
 
338 aa  118  9.999999999999999e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.992033  normal  0.734809 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0708  periplasmic binding protein  31.25 
 
 
318 aa  117  3.9999999999999997e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.792334  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2692  periplasmic binding protein  29.51 
 
 
349 aa  115  1.0000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.154596  normal  0.0870735 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0375  periplasmic binding protein  31.13 
 
 
315 aa  113  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0140866 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2670  periplasmic binding protein  31.68 
 
 
351 aa  113  6e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0270  twin-arginine translocation pathway signal  31.05 
 
 
321 aa  112  9e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0280  periplasmic binding protein  31.05 
 
 
321 aa  112  9e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0971022 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0260  periplasmic binding protein  31.05 
 
 
321 aa  112  9e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.778386 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2592  periplasmic binding protein  31.04 
 
 
357 aa  104  3e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0366339  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3759  periplasmic binding protein  27.99 
 
 
316 aa  88.2  2e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.445069  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4037  periplasmic binding protein  25.95 
 
 
339 aa  83.2  0.000000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4018  periplasmic binding protein  27.93 
 
 
310 aa  82.4  0.00000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.293424  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2749  periplasmic binding protein  25.25 
 
 
314 aa  79.7  0.00000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.947562  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10269  periplasmic iron-transport lipoprotein  26 
 
 
330 aa  79.3  0.00000000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.110209 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0102  periplasmic binding protein  28.91 
 
 
330 aa  79  0.0000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000014163  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4685  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  25.66 
 
 
322 aa  79  0.0000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0132289  hitchhiker  2.7045999999999996e-21 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0106  periplasmic binding protein  28.91 
 
 
330 aa  79  0.0000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000100605  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0652  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  25.66 
 
 
322 aa  79  0.0000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000476646  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0683  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  25.26 
 
 
321 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2099  substrate-binding family protein  26.38 
 
 
320 aa  70.5  0.00000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000270129  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2255  substrate-binding family protein  26.38 
 
 
320 aa  70.5  0.00000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00818777  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2280  putative iron compound-binding protein  26.38 
 
 
320 aa  70.5  0.00000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.1737099999999999e-45 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0581  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  25.08 
 
 
321 aa  70.5  0.00000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000673134  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2038  iron(III) dicitrate-binding protein  26.45 
 
 
320 aa  70.1  0.00000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000000324878  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0615  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  25.08 
 
 
321 aa  70.5  0.00000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000282355  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0743  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  24.66 
 
 
321 aa  70.1  0.00000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000897265  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2365  putative iron compound-binding protein  26.27 
 
 
320 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00267184  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3087  putative iron compound-binding protein  26.38 
 
 
320 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.32473  hitchhiker  9.18537e-17 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2078  periplasmic binding protein  26.54 
 
 
320 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0923581  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2036  iron(III) dicitrate-binding protein  25.9 
 
 
320 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000010516  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0529  periplasmic binding protein  23.88 
 
 
322 aa  67.4  0.0000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00029355  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2264  periplasmic binding protein  23.3 
 
 
324 aa  67.4  0.0000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2422  periplasmic binding protein  26.58 
 
 
300 aa  67  0.0000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0413  periplasmic binding protein  26.62 
 
 
319 aa  66.6  0.0000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1777  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  25.45 
 
 
331 aa  66.2  0.0000000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0670  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  23.25 
 
 
321 aa  66.6  0.0000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.07774e-37 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0525  iron(III) dicitrate ABC transporter, periplasmic protein  23.25 
 
 
321 aa  66.6  0.0000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  3.3382899999999997e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2237  putative iron compound-binding protein  25.91 
 
 
305 aa  66.2  0.0000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0793747  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1987  periplasmic binding protein  24.52 
 
 
324 aa  65.5  0.000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000125239  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0525  iron(III) dicitrate ABC transporter, periplasmic protein  23.25 
 
 
321 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000268482  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0778  lipoprotein  25.87 
 
 
316 aa  65.5  0.000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.662712  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3501  periplasmic binding protein  27.57 
 
 
322 aa  64.7  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.897036  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4907  periplasmic binding protein  27.42 
 
 
318 aa  64.7  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2283  substrate-binding family protein, putative  26.05 
 
 
321 aa  63.5  0.000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00918063  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2219  periplasmic binding protein  26.19 
 
 
335 aa  63.5  0.000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0176424  normal  0.307442 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2413  periplasmic binding protein  22.45 
 
 
351 aa  62.8  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.456703 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1810  periplasmic binding protein  27.75 
 
 
328 aa  60.8  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000098406  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4264  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  25.34 
 
 
324 aa  60.5  0.00000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4636  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  25.34 
 
 
324 aa  60.5  0.00000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.471711  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4766  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  25.34 
 
 
324 aa  60.5  0.00000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00286539  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4641  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  25.34 
 
 
324 aa  60.5  0.00000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>