More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_2540 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_2540  4-phytase  100 
 
 		 561 aa  1135    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000102543 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2822  extracellular solute-binding protein  57.3 
 
 		 547 aa  620  1e-176  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.630772  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1125  4-phytase  48.84 
 
 		 585 aa  497  1e-139  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.2304 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11050  ABC-type oligopeptide transport system, periplasmic component  46.74 
 
 		 552 aa  466  9.999999999999999e-131  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.273822  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13696  periplasmic dipeptide-binding lipoprotein dppA  41.8 
 
 		 541 aa  419  1e-116  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.17104 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0252  oligopeptide ABC transporter periplasmic protein  44.55 
 
 		 546 aa  408  1.0000000000000001e-112  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.213679  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0565  oligopeptide ABC transporter periplasmic protein  39.96 
 
 		 546 aa  398  1e-109  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12610  ABC-type oligopeptide transport system, periplasmic component  42.42 
 
 		 586 aa  394  1e-108  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.183632 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0486  extracellular solute-binding protein  41.28 
 
 		 542 aa  393  1e-108  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.410451 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3915  extracellular solute-binding protein family 5  38.95 
 
 		 543 aa  376  1e-103  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4176  4-phytase  37.9 
 
 		 534 aa  352  1e-95  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00061687 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3796  4-phytase  39.77 
 
 		 533 aa  349  9e-95  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.207613  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0952  4-phytase  37.34 
 
 		 554 aa  345  8.999999999999999e-94  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1079  extracellular solute-binding protein family 5  37.34 
 
 		 552 aa  337  5e-91  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.133059  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0676  4-phytase  38.68 
 
 		 541 aa  331  2e-89  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26170  ABC-type oligopeptide transport system, periplasmic component  47.75 
 
 		 537 aa  330  3e-89  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.369222  normal  0.443852 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3311  extracellular solute-binding protein family 5  36.69 
 
 		 560 aa  318  2e-85  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2462  4-phytase  36.47 
 
 		 543 aa  315  9.999999999999999e-85  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.36886  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3823  4-phytase  37.13 
 
 		 541 aa  311  2e-83  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2461  4-phytase  36.28 
 
 		 543 aa  309  1.0000000000000001e-82  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.792128  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4213  extracellular solute-binding protein  36.03 
 
 		 543 aa  306  7e-82  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0562482  normal  0.0711224 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4381  extracellular solute-binding protein  34.4 
 
 		 543 aa  305  2.0000000000000002e-81  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000255213 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3630  extracellular solute-binding protein family 5  32.94 
 
 		 522 aa  300  7e-80  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8934  ABC-type oligopeptide transport system periplasmic component-like protein  35.79 
 
 		 543 aa  291  1e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3150  ABC-type oligopeptide transport system periplasmic component-like protein  34.14 
 
 		 537 aa  281  2e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.447408  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4144  extracellular solute-binding protein family 5  33.4 
 
 		 527 aa  255  2.0000000000000002e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.482132  hitchhiker  0.00782841 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5516  extracellular solute-binding protein family 5  32.35 
 
 		 528 aa  242  1e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.581672 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3657  4-phytase  31.93 
 
 		 536 aa  224  2e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0190  extracellular solute-binding protein  26.79 
 
 		 533 aa  157  6e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0209  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  26.26 
 
 		 536 aa  152  1e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5110  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  26.29 
 
 		 536 aa  150  4e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0190  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  26.07 
 
 		 536 aa  150  6e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0189  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  26.07 
 
 		 536 aa  150  6e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0233  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  26.1 
 
 		 536 aa  149  9e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0214  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  25.7 
 
 		 536 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0209  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  25.92 
 
 		 536 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0067  extracellular solute-binding protein family 5  25.63 
 
 		 532 aa  147  4.0000000000000006e-34  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1798  murein tripeptide ABC transporter, periplasmic murein peptide-binding protein  27.26 
 
 		 538 aa  145  1e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2389  murein tripeptide ABC transporter periplasmic murein peptide-binding protein  27.21 
 
 		 538 aa  145  3e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.536818  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1906  extracellular solute-binding protein  27.21 
 
 		 538 aa  145  3e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0174  extracellular solute-binding protein  26.8 
 
 		 536 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3851  extracellular solute-binding protein family 5  26.6 
 
 		 530 aa  142  9.999999999999999e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000180183  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2742  extracellular solute-binding protein family 5  25.24 
 
 		 541 aa  136  9.999999999999999e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0609  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  25.82 
 
 		 543 aa  136  9.999999999999999e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1735  extracellular solute-binding protein family 5  27.65 
 
 		 538 aa  135  3e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4404  extracellular solute-binding protein  27.97 
 
 		 536 aa  134  5e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2385  extracellular solute-binding protein family 5  25.1 
 
 		 594 aa  133  6.999999999999999e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2834  extracellular solute-binding protein family 5  28.31 
 
 		 526 aa  133  7.999999999999999e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.360597 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1792  periplasmic murein peptide-binding protein  26.37 
 
 		 537 aa  132  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1977  periplasmic murein peptide-binding protein  26.55 
 
 		 537 aa  132  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.526776 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2611  extracellular solute-binding protein  27.07 
 
 		 544 aa  132  1.0000000000000001e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.502409 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1471  periplasmic murein peptide-binding protein  26.37 
 
 		 537 aa  132  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.857837  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1804  periplasmic murein peptide-binding protein  26.37 
 
 		 537 aa  133  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.048276  normal  0.542022 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1865  periplasmic murein peptide-binding protein  26.55 
 
 		 537 aa  133  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.529105  normal  0.987558 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1653  periplasmic murein peptide-binding protein  26.55 
 
 		 537 aa  133  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0552012 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01307  murein tripeptide (L-ala-gamma-D-glutamyl-meso-DAP) transporter subunit  26.55 
 
 		 537 aa  132  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.466837  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2316  extracellular solute-binding protein family 5  26.55 
 
 		 537 aa  132  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.151568  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1542  periplasmic murein peptide-binding protein  26.55 
 
 		 537 aa  132  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1569  periplasmic murein peptide-binding protein  26.55 
 
 		 537 aa  132  2.0000000000000002e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2295  extracellular solute-binding protein  26.55 
 
 		 537 aa  132  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1446  periplasmic murein peptide-binding protein  26.55 
 
 		 537 aa  132  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01317  hypothetical protein  26.55 
 
 		 537 aa  132  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.441272  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2961  extracellular solute-binding protein  26.09 
 
 		 541 aa  131  3e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001004  oligopeptide ABC transporter periplasmic oligopeptide-binding protein OppA  27.18 
 
 		 541 aa  130  6e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1984  extracellular solute-binding protein family 5  24.5 
 
 		 556 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1803  periplasmic murein peptide-binding protein  26.18 
 
 		 537 aa  129  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00501366 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3103  extracellular solute-binding protein family 5  28.28 
 
 		 526 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.529212  normal  0.177978 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2601  extracellular solute-binding protein family 5  26.11 
 
 		 538 aa  128  3e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1770  extracellular solute-binding protein family 5  25.7 
 
 		 560 aa  128  3e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2012  ABC-type dipeptide transport system periplasmic component-like protein  27.23 
 
 		 545 aa  128  3e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1946  oligopeptide transport system permease protein B  24.73 
 
 		 554 aa  127  4.0000000000000003e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07058  hypothetical protein  24.77 
 
 		 559 aa  127  5e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0009  extracellular solute-binding protein family 5  26.51 
 
 		 544 aa  127  6e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.327799  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0044  extracellular solute-binding protein family 5  25.42 
 
 		 538 aa  126  9e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0008  extracellular solute-binding protein family 5  25.54 
 
 		 544 aa  126  9e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00260142  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02949  hypothetical protein  24.28 
 
 		 555 aa  126  1e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2285  extracellular solute-binding protein family 5  24.31 
 
 		 556 aa  125  2e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.946227  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3850  extracellular solute-binding protein family 5  23.81 
 
 		 522 aa  125  2e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2195  extracellular solute-binding protein family 5  25.91 
 
 		 547 aa  125  2e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.337162  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0467  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  27.52 
 
 		 525 aa  124  3e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002959  oligopeptide ABC transporter periplasmic oligopeptide-binding protein OppA  24.29 
 
 		 558 aa  124  4e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2701  extracellular solute-binding protein  26.91 
 
 		 545 aa  123  7e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.301975  hitchhiker  0.00251286 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0547  extracellular solute-binding protein  24.86 
 
 		 531 aa  123  7e-27  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0537  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  27.52 
 
 		 525 aa  123  9e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.75807  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3271  extracellular solute-binding protein  24.14 
 
 		 571 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00499057  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0469  extracellular solute-binding protein family 5  25.84 
 
 		 552 aa  123  9.999999999999999e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1569  extracellular solute-binding protein  27.33 
 
 		 534 aa  122  9.999999999999999e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.199164  normal  0.0577205 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2302  extracellular solute-binding protein  26.2 
 
 		 544 aa  122  9.999999999999999e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.00365913  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3695  oligopeptide-binding protein OppA  24.91 
 
 		 571 aa  121  3e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00658046  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2319  extracellular solute-binding protein family 5  26.52 
 
 		 538 aa  121  3e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1483  extracellular solute-binding protein  25.75 
 
 		 542 aa  121  3e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2148  extracellular solute-binding protein  25.84 
 
 		 538 aa  121  3e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1897  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  26.67 
 
 		 558 aa  121  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.340522  normal  0.197408 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2247  extracellular solute-binding protein  26.22 
 
 		 535 aa  121  3.9999999999999996e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0125251  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3016  extracellular solute-binding protein family 5  25.09 
 
 		 545 aa  121  3.9999999999999996e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0244604  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2405  extracellular solute-binding protein family 5  26.46 
 
 		 558 aa  120  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000900492  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0019  extracellular solute-binding protein  26.61 
 
 		 533 aa  120  7e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1328  extracellular solute-binding protein  27.33 
 
 		 534 aa  120  7e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3843  extracellular solute-binding protein family 5  25.24 
 
 		 530 aa  120  7e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0512301  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3609  putative oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  24.31 
 
 		 568 aa  120  7.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0365619  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>