More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_3300 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_3300  camphor resistance protein CrcB  100 
 
 
126 aa  244  3e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.266386  normal  0.647357 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2340  camphor resistance protein CrcB  63.93 
 
 
154 aa  156  9e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.613317 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1516  camphor resistance protein CrcB  59.68 
 
 
128 aa  153  8e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1606  camphor resistance protein CrcB  65.55 
 
 
125 aa  152  2e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1559  camphor resistance protein CrcB  60 
 
 
146 aa  149  2e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1770  camphor resistance protein CrcB  58.4 
 
 
128 aa  148  2e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.565268  normal  0.101895 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1374  camphor resistance protein CrcB  61.9 
 
 
131 aa  127  5.0000000000000004e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2486  camphor resistance protein CrcB  61.9 
 
 
131 aa  127  5.0000000000000004e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0836398 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4047  camphor resistance protein CrcB  56.25 
 
 
128 aa  117  4.9999999999999996e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2451  camphor resistance protein CrcB  53.91 
 
 
147 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0795887  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0908  camphor resistance protein CrcB  53.91 
 
 
128 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0467  camphor resistance protein CrcB  53.91 
 
 
128 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0946  camphor resistance protein CrcB  53.91 
 
 
128 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.329935  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0816  camphor resistance protein CrcB  53.12 
 
 
128 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2862  camphor resistance protein CrcB  51.64 
 
 
127 aa  110  6e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.891613  normal  0.24707 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0805  camphor resistance protein CrcB  52.34 
 
 
137 aa  110  6e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0477  CrcB protein  55.08 
 
 
125 aa  108  2.0000000000000002e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.355934  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3030  camphor resistance protein CrcB  51.56 
 
 
128 aa  107  6e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.934421  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3085  camphor resistance protein CrcB  51.56 
 
 
128 aa  107  6e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2160  camphor resistance protein CrcB  51.56 
 
 
128 aa  107  7.000000000000001e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.105328  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2030  camphor resistance protein CrcB  51.56 
 
 
128 aa  107  7.000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0749  camphor resistance protein CrcB  51.56 
 
 
128 aa  107  7.000000000000001e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2583  camphor resistance protein CrcB  51.56 
 
 
128 aa  107  7.000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1520  camphor resistance protein CrcB  50.78 
 
 
128 aa  105  3e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000607454  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4954  camphor resistance protein CrcB  55.86 
 
 
127 aa  103  1e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0812  CrcB protein  50.45 
 
 
129 aa  102  2e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1125  CrcB protein  48.31 
 
 
129 aa  99.4  1e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56980  camphor resistance protein CrcB  53.21 
 
 
127 aa  99  2e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1192  CrcB protein  43.09 
 
 
127 aa  98.6  2e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1333  camphor resistance protein CrcB  45.76 
 
 
126 aa  97.1  8e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.164905  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1961  camphor resistance protein CrcB  53.54 
 
 
126 aa  96.3  1e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000668068  normal  0.290782 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1208  camphor resistance protein CrcB  50 
 
 
126 aa  96.3  1e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.115552  normal  0.0927816 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1269  camphor resistance protein CrcB  49.55 
 
 
126 aa  94.7  3e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.174734  normal  0.798877 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2870  camphor resistance protein CrcB  46.15 
 
 
150 aa  94  6e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1762  camphor resistance protein CrcB  45.08 
 
 
126 aa  94  7e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1600  camphor resistance protein CrcB  46.55 
 
 
126 aa  93.2  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.41093  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2957  camphor resistance protein CrcB  49.5 
 
 
127 aa  92.4  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00612605  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3446  camphor resistance protein CrcB  48.28 
 
 
135 aa  92.8  2e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.500198  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3030  camphor resistance protein CrcB  49.5 
 
 
127 aa  92.4  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0482718  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1857  camphor resistance protein CrcB  49.5 
 
 
127 aa  91.7  3e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0249161  normal  0.58099 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2589  camphor resistance protein CrcB  49.49 
 
 
132 aa  90.5  7e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1036  camphor resistance protein CrcB  56.98 
 
 
124 aa  89.7  1e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.222937  normal  0.100089 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3613  camphor resistance protein CrcB  41.44 
 
 
126 aa  89.4  1e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00000876303  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1988  camphor resistance protein CrcB  49.49 
 
 
126 aa  89  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.227599  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00594  camphor resistance protein CrcB  43.86 
 
 
127 aa  87.8  4e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.243224  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0676  camphor resistance protein CrcB  43.86 
 
 
127 aa  87.8  4e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000462452  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0649  camphor resistance protein CrcB  43.86 
 
 
127 aa  87.8  4e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00715235  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0645  camphor resistance protein CrcB  43.86 
 
 
127 aa  87.8  4e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0119753  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00583  hypothetical protein  43.86 
 
 
127 aa  87.8  4e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.208023  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0713  camphor resistance protein CrcB  43.86 
 
 
127 aa  87.8  4e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000937309  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3001  CrcB protein  43.86 
 
 
127 aa  87.4  6e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0511618  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3020  camphor resistance protein CrcB  42.98 
 
 
127 aa  86.3  1e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00755665  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1160  camphor resistance protein CrcB  48 
 
 
127 aa  86.7  1e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.478973 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0539  camphor resistance protein CrcB  42.98 
 
 
127 aa  86.3  1e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1562  crcB protein  47.17 
 
 
128 aa  85.5  2e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0731  camphor resistance protein CrcB  42.11 
 
 
127 aa  84.3  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0685  camphor resistance protein CrcB  42.11 
 
 
127 aa  84.3  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0745  camphor resistance protein CrcB  42.11 
 
 
127 aa  84.3  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.311218  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0789  camphor resistance protein CrcB  42.11 
 
 
127 aa  84.3  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.136709  normal  0.909292 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0671  camphor resistance protein CrcB  42.11 
 
 
127 aa  84.3  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00156465  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3158  CrcB protein  40.35 
 
 
127 aa  73.6  0.0000000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000188116  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1084  CrcB protein  40.86 
 
 
127 aa  73.6  0.000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0776  camphor resistance protein CrcB  39.13 
 
 
127 aa  73.2  0.000000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0583654  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1173  CrcB protein  42.57 
 
 
127 aa  72.8  0.000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000663248  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2973  CrcB protein  39.78 
 
 
127 aa  70.9  0.000000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0130018  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1548  camphor resistance protein CrcB  45.45 
 
 
129 aa  68.9  0.00000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3474  camphor resistance protein CrcB  46 
 
 
127 aa  67.8  0.00000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0814  CrcB protein  40.18 
 
 
129 aa  67  0.00000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2979  camphor resistance protein CrcB  40.52 
 
 
133 aa  65.9  0.0000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1023  camphor resistance protein CrcB  32.74 
 
 
124 aa  65.9  0.0000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3253  CrcB protein  37.78 
 
 
123 aa  65.1  0.0000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00499061  hitchhiker  0.0000000448266 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2599  camphor resistance protein CrcB  37.11 
 
 
126 aa  65.1  0.0000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06121  putative Protein CrcB-like protein  43.66 
 
 
87 aa  65.1  0.0000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0202562  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01045  putative Protein CrcB-like protein  43.66 
 
 
87 aa  65.1  0.0000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0985412  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3346  crcB family protein  35.29 
 
 
124 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0956724  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2766  CrcB protein  40.21 
 
 
127 aa  63.9  0.0000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.757747 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0950  CrcB protein  36 
 
 
128 aa  62.8  0.000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.238115  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0954  camphor resistance protein CrcB  35.09 
 
 
125 aa  62.4  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20960  CrcB protein  35.96 
 
 
122 aa  62.4  0.000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000428043  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3583  camphor resistance protein CrcB  36.13 
 
 
124 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0447685  normal  0.437395 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0812  camphor resistance protein CrcB  38.82 
 
 
123 aa  62.4  0.000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.00673919  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3176  camphor resistance protein CrcB  34.45 
 
 
124 aa  61.6  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.709971  normal  0.0941711 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0714  camphor resistance protein CrcB  34.45 
 
 
124 aa  61.6  0.000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.51179e-22 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2021  camphor resistance protein CrcB  33.33 
 
 
124 aa  60.8  0.000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000176643  hitchhiker  0.000131067 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3454  hypothetical protein  39.67 
 
 
136 aa  61.2  0.000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.767422  normal  0.0839513 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1711  CrcB protein  31.48 
 
 
126 aa  61.2  0.000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00823549  normal  0.187821 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1338  camphor resistance protein CrcB  38.04 
 
 
121 aa  60.8  0.000000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0111697  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1422  CrcB protein  41.18 
 
 
130 aa  60.8  0.000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3606  camphor resistance protein CrcB  37.5 
 
 
124 aa  60.5  0.000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.898209 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1284  camphor resistance protein CrcB  33.62 
 
 
128 aa  60.1  0.000000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0693229  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0524  camphor resistance protein CrcB  36.07 
 
 
122 aa  60.1  0.000000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.184364  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2087  camphor resistance protein CrcB  35.65 
 
 
125 aa  59.7  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0239295  normal  0.26829 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0313  camphor resistance protein CrcB  35.25 
 
 
122 aa  59.7  0.00000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1258  camphor resistance protein CrcB  31.03 
 
 
124 aa  59.7  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.415853  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1885  camphor resistance protein CrcB  35.96 
 
 
125 aa  59.7  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.230802  normal  0.0214416 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2843  camphor resistance protein CrcB  36.27 
 
 
130 aa  59.7  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0364  CrcB protein  44.74 
 
 
123 aa  59.7  0.00000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000174023  hitchhiker  0.000495 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2473  CrcB protein  35.45 
 
 
124 aa  59.7  0.00000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1835  camphor resistance protein CrcB  38.04 
 
 
147 aa  58.9  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2259  camphor resistance protein  36.36 
 
 
125 aa  58.9  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.913857  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>