64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_2152 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_2152  molecular chaperone  100 
 
 
124 aa  247  4e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1656  heat shock protein Hsp20  62.02 
 
 
152 aa  151  2e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.687584  normal  0.354925 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2381  heat shock protein HSP20  63.28 
 
 
126 aa  151  2.9999999999999998e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.531579  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2822  CS protein  58.52 
 
 
146 aa  145  1.0000000000000001e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.661839  normal  0.344601 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2311  CS protein  58.52 
 
 
132 aa  145  2.0000000000000003e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3518  heat shock protein Hsp20  48.41 
 
 
123 aa  106  9.000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3264  heat shock protein Hsp20  43.18 
 
 
133 aa  100  8e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.609526  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1396  molecular chaperone-like protein  37 
 
 
152 aa  58.9  0.00000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.610569 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1856  heat shock protein Hsp20  31.82 
 
 
176 aa  54.7  0.0000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3125  heat shock protein Hsp20  30.3 
 
 
149 aa  52  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3113  heat shock protein Hsp20  35.96 
 
 
142 aa  51.6  0.000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.800815  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2459  heat shock protein Hsp20  33.71 
 
 
142 aa  50.1  0.00001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.134169  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0774  heat shock protein Hsp20  29.67 
 
 
139 aa  49.7  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3093  heat shock protein  28.44 
 
 
144 aa  48.9  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1059  stress response protein  28.44 
 
 
144 aa  49.3  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1345  stress response protein  28.44 
 
 
144 aa  49.3  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.260788  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3219  heat shock protein  28.44 
 
 
144 aa  48.9  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2325  stress response protein  28.44 
 
 
141 aa  48.9  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.908249  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1432  HSP20/alpha crystallin family protein  28.44 
 
 
144 aa  48.9  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.614633  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2035  stress response protein  28.44 
 
 
144 aa  49.3  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1528  heat shock protein Hsp20  32.99 
 
 
153 aa  48.5  0.00003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00309172  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2316  heat shock protein Hsp20  30.85 
 
 
139 aa  48.5  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0611291  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1869  putative small heat shock protein  28.57 
 
 
142 aa  47  0.00009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.309197  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1706  heat shock protein Hsp20  27 
 
 
132 aa  46.6  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00808314  hitchhiker  0.000432661 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5914  heat shock protein Hsp20  27.27 
 
 
144 aa  46.6  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0664313  normal  0.562292 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4649  heat shock protein Hsp20  32.18 
 
 
137 aa  45.8  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.54341  normal  0.729236 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1110  heat shock protein Hsp20  29.25 
 
 
145 aa  46.2  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.339847  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2058  heat shock protein Hsp20  31.82 
 
 
141 aa  45.8  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2312  heat shock protein Hsp20  27.59 
 
 
149 aa  45.1  0.0003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1445  putative heat shock protein  30.34 
 
 
167 aa  45.1  0.0003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000891901  normal  0.866362 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6187  heat shock protein Hsp20  27.08 
 
 
144 aa  45.1  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.306682 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1167  heat shock protein Hsp20  28.09 
 
 
149 aa  45.4  0.0003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6221  heat shock protein Hsp20  32.1 
 
 
151 aa  44.7  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1292  heat shock protein Hsp20  29.9 
 
 
170 aa  44.7  0.0004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0518729  normal  0.504399 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0250  HSP20 family protein  23.91 
 
 
139 aa  44.7  0.0004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.962825  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3376  heat shock protein Hsp20  32.18 
 
 
130 aa  44.7  0.0005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2321  stress response protein  27.27 
 
 
513 aa  44.3  0.0006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1165  heat shock protein Hsp20  27.59 
 
 
145 aa  43.9  0.0007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.245253  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0102  heat shock protein Hsp20  27.96 
 
 
142 aa  43.9  0.0007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1537  heat shock protein Hsp20  28.89 
 
 
142 aa  43.9  0.0008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0543  heat shock protein Hsp20  26.04 
 
 
147 aa  43.5  0.0009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0340696  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2301  heat shock protein Hsp20  26.67 
 
 
142 aa  43.1  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.46681  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0672  heat shock protein Hsp20  28.57 
 
 
159 aa  43.1  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000109595  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_25657  22-kDa heat-shock protein  27.17 
 
 
138 aa  43.1  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.136563  normal  0.824287 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2056  heat shock protein Hsp20  32.94 
 
 
137 aa  42.4  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2302  heat shock protein Hsp20  32.89 
 
 
153 aa  42.4  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.276703 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0557  heat shock protein Hsp20  26.14 
 
 
147 aa  42  0.003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0117197  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2043  putative heat shock protein  30 
 
 
127 aa  41.6  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.778686  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6319  heat shock protein Hsp20  24.81 
 
 
149 aa  42  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0762  heat shock protein Hsp20  24 
 
 
134 aa  41.6  0.003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3350  heat shock protein Hsp20  33.33 
 
 
172 aa  41.6  0.004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1122  heat shock protein Hsp20  25.23 
 
 
170 aa  41.2  0.005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.421321  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0184  molecular chaperone (small heat shock protein)  23.02 
 
 
149 aa  41.2  0.005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000642495  hitchhiker  0.000185759 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_35158  heat shock protein Hsp20  27.84 
 
 
163 aa  41.2  0.005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.860566  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1153  heat shock protein Hsp20  36.78 
 
 
138 aa  40.8  0.006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.405022 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3091  HSP20 family protein  28.21 
 
 
122 aa  40.8  0.006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0720  heat shock protein Hsp20  28.89 
 
 
120 aa  40.4  0.007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00436062  normal  0.512737 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1141  heat shock protein Hsp20  36.78 
 
 
139 aa  40.8  0.007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0391  heat shock protein Hsp20  26.25 
 
 
143 aa  40.4  0.008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000478859  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4859  heat shock protein Hsp20  24.27 
 
 
204 aa  40.4  0.008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1977  heat shock protein Hsp20  21.82 
 
 
139 aa  40.4  0.008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.334288  normal  0.643075 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1324  heat shock protein Hsp20  29.55 
 
 
195 aa  40.4  0.008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.317374  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5261  heat shock protein Hsp20  32.18 
 
 
135 aa  40  0.01  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.071325 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6253  heat shock protein Hsp20  29.75 
 
 
141 aa  40  0.01  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.101875  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>