More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aasi_0156 on replicon NC_010830
Organism: Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010830  Aasi_0156  single-strand binding protein  100 
 
 		 136 aa  277  4e-74  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3685  single-stranded DNA binding protein  57.27 
 
 		 152 aa  147  7e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.283411  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0130  single-strand binding protein  51.39 
 
 		 142 aa  144  6e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2151  single-strand binding protein  48.89 
 
 		 139 aa  137  3.9999999999999997e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0200  single-strand binding protein  48.89 
 
 		 139 aa  136  1e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0643  ssDNA-binding protein  57.14 
 
 		 157 aa  135  2e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.25623e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0255  single-strand binding protein  47.41 
 
 		 139 aa  133  7.000000000000001e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0936  single-strand binding protein  46.05 
 
 		 151 aa  133  7.000000000000001e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4397  single-strand binding protein  56.07 
 
 		 149 aa  133  8e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000143406  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4062  single-strand binding protein  53.64 
 
 		 148 aa  130  3.9999999999999996e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3411  single-strand binding protein  56.07 
 
 		 146 aa  131  3.9999999999999996e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1569  single-strand binding protein  51.82 
 
 		 164 aa  130  6e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.285989  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3975  single-strand binding protein  52.73 
 
 		 146 aa  129  9e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000156614  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2227  single-strand binding protein  44.08 
 
 		 152 aa  128  2.0000000000000002e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.261214  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0140  single-strand binding protein  50.91 
 
 		 164 aa  129  2.0000000000000002e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3117  single-strand binding protein  54.21 
 
 		 146 aa  126  8.000000000000001e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1260  single-strand binding protein  50.44 
 
 		 161 aa  126  8.000000000000001e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0616311  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2466  single-strand binding protein  54.21 
 
 		 156 aa  125  2.0000000000000002e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.34674  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1280  single-strand binding protein  51.4 
 
 		 164 aa  125  2.0000000000000002e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00522699 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01895  Single-strand binding protein  57.28 
 
 		 110 aa  125  2.0000000000000002e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.326894  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2845  single-strand binding protein  54.21 
 
 		 156 aa  125  2.0000000000000002e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.101348  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0449  single-strand binding protein  53.64 
 
 		 143 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000857397  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0362  single-strand binding protein  53.27 
 
 		 147 aa  124  3e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000141012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0868  single-strand binding protein  56.31 
 
 		 108 aa  124  4.0000000000000003e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.585273  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3772  single-strand binding protein  50 
 
 		 167 aa  124  4.0000000000000003e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2424  single-strand binding protein  48.6 
 
 		 167 aa  122  1e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00208547  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0571  single-strand binding protein  51.35 
 
 		 222 aa  122  2e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00000000499632  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03931  single-strand DNA-binding protein  53.1 
 
 		 178 aa  121  3e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0479609  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3933  single-strand binding protein  53.1 
 
 		 178 aa  121  3e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03891  hypothetical protein  53.1 
 
 		 178 aa  121  3e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0417311  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4573  single-stranded DNA-binding protein  52.63 
 
 		 171 aa  121  3e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0438  single-strand binding protein  49.09 
 
 		 157 aa  121  3e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.367584 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4521  single-stranded DNA-binding protein  53.1 
 
 		 178 aa  121  3e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4301  single-stranded DNA-binding protein  53.1 
 
 		 178 aa  121  3e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3968  single-stranded DNA-binding protein  53.1 
 
 		 178 aa  121  3e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0530108 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4611  single-stranded DNA-binding protein  53.1 
 
 		 178 aa  121  3e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4439  single-strand binding protein  52.78 
 
 		 170 aa  121  3e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5562  single-stranded DNA-binding protein  53.1 
 
 		 178 aa  121  3e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.214992  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1608  single-strand binding protein  41.72 
 
 		 151 aa  120  5e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.409638  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1964  single-strand binding protein  51.85 
 
 		 166 aa  120  6e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0586806  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3313  single-strand binding protein  49.55 
 
 		 231 aa  120  6e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0358843  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0640  single-strand binding protein  51.35 
 
 		 236 aa  120  7e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.021198  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2576  single-strand binding protein  49.53 
 
 		 158 aa  120  9e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4028  single-strand binding protein  51.35 
 
 		 238 aa  120  9e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0581  single-strand binding protein  51.35 
 
 		 234 aa  120  9e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00543875  normal  0.0620215 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0556  single-strand binding protein  51.35 
 
 		 234 aa  120  9e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00736875  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3753  single-strand binding protein  51.35 
 
 		 234 aa  120  9e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000011541  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0746  single-strand binding protein  48.6 
 
 		 161 aa  119  9.999999999999999e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.00000000549741  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0587  single-strand binding protein  51.35 
 
 		 236 aa  119  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0173283  normal  0.785333 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0533  single-strand binding protein  55.1 
 
 		 236 aa  119  9.999999999999999e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0176705  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0516  single-strand binding protein  54.08 
 
 		 234 aa  119  9.999999999999999e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.490928  normal  0.543357 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3419  single-strand binding protein  55.1 
 
 		 236 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0354621  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0111  single-strand binding protein  50 
 
 		 173 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00797744  hitchhiker  0.00729769 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3590  single-strand binding protein  55.1 
 
 		 235 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0152827  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03522  Single-strand binding protein (SSB) (Helix-destabilizing protein)  50.88 
 
 		 161 aa  118  3e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.721181  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03473  hypothetical protein  50.88 
 
 		 161 aa  118  3e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.953641  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0223  single-strand binding protein  47.32 
 
 		 172 aa  117  3.9999999999999996e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1903  single-strand binding protein  48.65 
 
 		 151 aa  117  3.9999999999999996e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3710  single-strand binding protein  49.55 
 
 		 242 aa  117  3.9999999999999996e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000568362  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0421  single-strand binding protein (SSB) (helix-destabilizing protein)  44.26 
 
 		 159 aa  117  7e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0723  single-strand binding protein  55.56 
 
 		 180 aa  116  7.999999999999999e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0749  single-stranded DNA-binding protein  56.57 
 
 		 182 aa  116  7.999999999999999e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0561709 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3850  single-stranded DNA-binding protein  56.57 
 
 		 182 aa  116  7.999999999999999e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3760  single-stranded DNA-binding protein  56.57 
 
 		 182 aa  116  7.999999999999999e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.637198  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0397  single-strand binding protein (SSB) (helix-destabilizing protein)  38.46 
 
 		 159 aa  116  9e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4025  single-strand binding protein  50.46 
 
 		 231 aa  116  9.999999999999999e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000941126  unclonable  0.000000000110243 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00235  single-strand binding protein  48.57 
 
 		 196 aa  115  9.999999999999999e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.508026  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0691  single-strand binding protein  55.56 
 
 		 182 aa  116  9.999999999999999e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0044  single-strand binding protein  43.48 
 
 		 137 aa  116  9.999999999999999e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.139232  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0148  single-strand binding protein  47.62 
 
 		 200 aa  116  9.999999999999999e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000650066  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0930  single-strand binding protein  51.43 
 
 		 233 aa  115  1.9999999999999998e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2200  single-strand binding protein  49.07 
 
 		 157 aa  115  1.9999999999999998e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.886044 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4565  single-strand binding protein  49.11 
 
 		 162 aa  115  1.9999999999999998e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.111222 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0640  single-strand binding protein  49.54 
 
 		 225 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000164603  unclonable  0.0000000189971 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4650  single-stranded DNA-binding protein  54.08 
 
 		 176 aa  114  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4105  single-strand binding protein  53.57 
 
 		 181 aa  114  3e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.512282  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4512  single-stranded DNA-binding protein  54.08 
 
 		 176 aa  114  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4598  single-stranded DNA-binding protein  54.08 
 
 		 176 aa  114  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.454444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4439  single-strand binding protein  56.57 
 
 		 181 aa  114  3e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.580245  normal  0.977465 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4504  single-stranded DNA-binding protein  54.08 
 
 		 176 aa  114  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.580839  normal  0.345309 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4599  single-stranded DNA-binding protein  54.08 
 
 		 176 aa  114  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0351  single-stranded DNA-binding protein  51.85 
 
 		 169 aa  114  3.9999999999999997e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0967385  normal  0.582722 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0325  single-strand binding protein  46.49 
 
 		 160 aa  114  3.9999999999999997e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09200  single-stranded DNA-binding protein  50.88 
 
 		 165 aa  114  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0140345  normal  0.797582 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0868  single-stranded DNA-binding protein  50.88 
 
 		 165 aa  114  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.949427  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2303  single-strand binding protein  49.07 
 
 		 171 aa  114  3.9999999999999997e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0375599  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0312  single-strand binding protein  52.68 
 
 		 168 aa  114  5e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000035276 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03705  single-stranded DNA-binding protein  53.4 
 
 		 178 aa  114  5e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2815  single-stranded DNA-binding protein  48.28 
 
 		 177 aa  114  6e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0025  single-strand binding protein  49.06 
 
 		 185 aa  114  6e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.326087  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0261  single-strand binding protein  47.66 
 
 		 163 aa  114  6e-25  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0918801  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3662  single-stranded DNA-binding protein  55.56 
 
 		 180 aa  114  6e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.311594  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0535  single-strand binding protein  49.54 
 
 		 220 aa  114  6e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000686084  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3512  single-stranded DNA-binding protein  55.56 
 
 		 176 aa  113  6.9999999999999995e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.534706  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0107  single-strand binding protein  48.25 
 
 		 165 aa  113  6.9999999999999995e-25  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0655467  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3720  single-strand binding protein  50.91 
 
 		 143 aa  113  6.9999999999999995e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0748  single-strand binding protein  52.59 
 
 		 174 aa  113  7.999999999999999e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.810085  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002363  single-stranded DNA-binding protein  53.4 
 
 		 178 aa  113  7.999999999999999e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.298235  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2149  single-strand binding protein  46.43 
 
 		 165 aa  113  8.999999999999998e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2069  single-strand binding protein  52.59 
 
 		 180 aa  113  8.999999999999998e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.551865  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>