183 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aaci_1856 on replicon NC_013205
Organism: Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013205  Aaci_1856  Radical SAM domain protein  100 
 
 
288 aa  577  1e-164  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.587316  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2906  radical SAM family protein  29.96 
 
 
306 aa  132  9e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0630267 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1472  Radical SAM domain protein  36.27 
 
 
270 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0327  Radical SAM domain protein  32.99 
 
 
281 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0182  radical SAM domain-containing protein  31.61 
 
 
256 aa  112  6e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0685  radical SAM domain-containing protein  38.15 
 
 
294 aa  108  8.000000000000001e-23  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0316247 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1991  radical SAM domain-containing protein  38.02 
 
 
294 aa  107  2e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0830  radical SAM domain-containing protein  32.16 
 
 
242 aa  106  5e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0807  radical SAM domain-containing protein  32.16 
 
 
242 aa  106  5e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2459  hypothetical protein  31.98 
 
 
354 aa  104  2e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0853217 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1252  radical SAM domain-containing protein  36.42 
 
 
298 aa  104  2e-21  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0196  radical SAM domain-containing protein  36.99 
 
 
297 aa  103  4e-21  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1409  radical SAM domain-containing protein  38.14 
 
 
267 aa  99.8  5e-20  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.47505  normal  0.209816 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1011  radical SAM domain-containing protein  37.29 
 
 
301 aa  99  7e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1167  radical SAM family protein  36.22 
 
 
261 aa  98.6  1e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000379498  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2078  hypothetical protein  37.87 
 
 
182 aa  97.8  2e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.583376 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0959  radical SAM domain-containing protein  36.21 
 
 
258 aa  97.8  2e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00609549  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03695  radical SAM domain protein  34.43 
 
 
356 aa  96.7  4e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1769  Radical SAM domain protein  35.75 
 
 
352 aa  96.3  5e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1137  Radical SAM domain protein  31.34 
 
 
357 aa  95.1  1e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.712968  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0268  radical SAM domain-containing protein  35.09 
 
 
301 aa  94.7  1e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.698085  normal  0.0396119 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0556  Radical SAM domain protein  34.05 
 
 
258 aa  93.6  3e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.162631  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1480  hypothetical protein  31.79 
 
 
356 aa  92.8  6e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000411506  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0942  radical SAM domain-containing protein  32.34 
 
 
392 aa  92.8  7e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.672209  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0946  radical SAM domain-containing protein  32.34 
 
 
392 aa  92.4  8e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1314  Radical SAM domain protein  30.27 
 
 
311 aa  91.7  1e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.263305 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4180  radical SAM family protein  32.34 
 
 
391 aa  91.7  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0587  radical SAM family protein  31.84 
 
 
392 aa  90.9  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1066  radical SAM domain-containing protein  31.84 
 
 
392 aa  90.9  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1743  Radical SAM domain protein  35.87 
 
 
375 aa  91.3  2e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.106017  normal  0.444535 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1071  Radical SAM domain protein  34.2 
 
 
360 aa  90.5  3e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1025  radical SAM domain-containing protein  31.84 
 
 
388 aa  90.1  3e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2341  hypothetical protein  35.36 
 
 
377 aa  90.5  3e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.2896 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0707  radical SAM domain-containing protein  37.02 
 
 
421 aa  90.5  3e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0399019  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3325  radical SAM family protein  34.21 
 
 
368 aa  89.7  4e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  unclonable  0.000000113455 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0286  radical SAM domain-containing protein  37.04 
 
 
269 aa  90.1  4e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2237  radical SAM domain-containing protein  32.34 
 
 
392 aa  89.7  4e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1721  radical SAM domain-containing protein  29.79 
 
 
302 aa  89.7  5e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4284  Radical SAM domain protein  34.17 
 
 
352 aa  89.7  5e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.948479 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2972  radical SAM domain-containing protein  31.34 
 
 
385 aa  89.4  6e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2549  radical SAM domain-containing protein  31.34 
 
 
385 aa  89.7  6e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.22398  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0923  radical SAM domain-containing protein  31.34 
 
 
385 aa  89.4  6e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2862  radical SAM domain-containing protein  31.34 
 
 
383 aa  89.7  6e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.22952  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2923  radical SAM domain-containing protein  31.34 
 
 
385 aa  89.4  6e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0224  radical SAM domain-containing protein  31.34 
 
 
385 aa  89.4  6e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.687698  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2104  Radical SAM domain protein  35.91 
 
 
380 aa  89.4  6e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.124136  normal  0.781731 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2299  radical SAM domain-containing protein  31.96 
 
 
309 aa  89  8e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  hitchhiker  0.002919  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1782  radical SAM domain-containing protein  34.95 
 
 
281 aa  89  8e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.425379  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1658  radical SAM domain-containing protein  31.34 
 
 
376 aa  88.6  1e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3138  radical SAM family protein  40 
 
 
355 aa  88.6  1e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1768  radical SAM domain-containing protein  35.91 
 
 
374 aa  89  1e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.938086 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0083  radical SAM family protein  35 
 
 
352 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0620  radical SAM family Fe-S protein  33.03 
 
 
350 aa  87.4  2e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.88573 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3951  radical SAM domain-containing protein  35.59 
 
 
360 aa  87.8  2e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.934636  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0547  radical SAM domain-containing protein  37.02 
 
 
362 aa  87.8  2e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0406  radical SAM domain-containing protein  30.85 
 
 
374 aa  87.4  3e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0799  Radical SAM domain protein  34.09 
 
 
374 aa  87  3e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.737474  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1419  radical SAM domain-containing protein  36.46 
 
 
359 aa  87  3e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1281  radical SAM domain-containing protein  35.47 
 
 
294 aa  86.7  4e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.558444  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0113  radical SAM domain-containing protein  34.38 
 
 
352 aa  86.3  5e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000412834 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4362  radical SAM family protein  34.62 
 
 
387 aa  86.3  6e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.16102  normal  0.0230577 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4095  radical SAM domain-containing protein  33.33 
 
 
362 aa  85.5  9e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.138855  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0334  Radical SAM domain protein  34.24 
 
 
357 aa  85.5  0.000000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4818  Radical SAM domain protein  30.3 
 
 
350 aa  84.7  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.66643  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1225  Radical SAM domain protein  34.07 
 
 
386 aa  85.1  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.931656  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0452  radical SAM domain-containing protein  35.16 
 
 
385 aa  85.1  0.000000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.290609 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3517  Radical SAM domain protein  36.07 
 
 
390 aa  85.5  0.000000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.546912  normal  0.918389 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0928  hypothetical protein  32.95 
 
 
375 aa  84.7  0.000000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.125101 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2545  radical SAM family protein  32.84 
 
 
417 aa  84.3  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1206  radical SAM family protein  34.07 
 
 
393 aa  84.7  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.649327 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3222  radical SAM family protein  33.7 
 
 
387 aa  84.3  0.000000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0742  radical SAM family protein  31.88 
 
 
361 aa  84.3  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.669971  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1083  Radical SAM domain protein  29.18 
 
 
300 aa  84.3  0.000000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.156196  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2980  Radical SAM domain protein  32.2 
 
 
381 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0187919 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1725  radical SAM domain-containing protein  30.98 
 
 
349 aa  83.6  0.000000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.200641  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0704  radical SAM family protein  33.52 
 
 
384 aa  84  0.000000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.503182  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05793  radical SAM domain protein  33.15 
 
 
375 aa  84  0.000000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1946  radical SAM domain-containing protein  35.16 
 
 
437 aa  84  0.000000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0041965 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0739  Radical SAM domain protein  30.8 
 
 
245 aa  83.6  0.000000000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.93142  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1266  radical SAM family protein  32.62 
 
 
360 aa  83.6  0.000000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.249898 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2509  hypothetical protein  32.46 
 
 
366 aa  83.6  0.000000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.690045 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3135  radical SAM family protein  34.44 
 
 
365 aa  83.2  0.000000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.787669  normal  0.057986 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1003  hypothetical protein  32.67 
 
 
381 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.850299 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2296  radical SAM family protein  29.26 
 
 
341 aa  83.2  0.000000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2343  radical SAM domain-containing protein  29.26 
 
 
341 aa  83.2  0.000000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.513503 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2335  radical SAM domain-containing protein  29.26 
 
 
358 aa  83.2  0.000000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.799816  hitchhiker  0.00678012 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2600  DNA repair photolyase  34.46 
 
 
386 aa  82.8  0.000000000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.64054  normal  0.361396 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1080  radical SAM family protein  33.15 
 
 
386 aa  82.8  0.000000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.981176  normal  0.301506 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1500  radical SAM family protein  32.22 
 
 
358 aa  82.8  0.000000000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0117  radical SAM domain-containing protein  34.44 
 
 
352 aa  82.8  0.000000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.190485 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2549  radical SAM family protein  32.78 
 
 
362 aa  82  0.000000000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1926  radical SAM domain-containing protein  35.29 
 
 
288 aa  82.4  0.000000000000009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0235565 
 
 
-
 
NC_004310  BR0387  hypothetical protein  33.52 
 
 
390 aa  82  0.00000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.595283  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2176  radical SAM domain-containing protein  33.17 
 
 
372 aa  81.6  0.00000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0767  radical SAM domain-containing protein  30.2 
 
 
386 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.338567 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0399  hypothetical protein  33.52 
 
 
390 aa  82  0.00000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0508  radical SAM domain-containing protein  33.7 
 
 
390 aa  81.6  0.00000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.233922  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1829  radical SAM domain-containing protein  33.15 
 
 
276 aa  81.6  0.00000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2803  radical SAM domain-containing protein  31.66 
 
 
402 aa  80.9  0.00000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.246146 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3317  radical SAM domain-containing protein  32.59 
 
 
355 aa  81.3  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.355052 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>