47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A9601_11511 on replicon NC_008816
Organism: Prochlorococcus marinus str. AS9601



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009091  P9301_11521  major facilitator superfamily multidrug-efflux transporter  97.56 
 
 		 409 aa  733    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11511  major facilitator superfamily multidrug-efflux transporter  100 
 
 		 409 aa  803    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.852941  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1057  major facilitator superfamily multidrug-efflux transporter-like  90.71 
 
 		 409 aa  694    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.464122  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11371  major facilitator superfamily multidrug-efflux transporter  73.33 
 
 		 408 aa  596  1e-169  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11461  major facilitator superfamily multidrug-efflux transporter  41.44 
 
 		 416 aa  281  1e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0988673  normal  0.118541 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0699  major facilitator superfamily multidrug-efflux transporter  36.77 
 
 		 432 aa  238  2e-61  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0364966  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15411  major facilitator superfamily multidrug-efflux transporter  35.98 
 
 		 412 aa  225  1e-57  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.37944  normal  0.866892 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1962  major facilitator superfamily multidrug-efflux transporter  37.39 
 
 		 400 aa  224  3e-57  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.593105  normal  0.441111 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0707  major facilitator superfamily permease  34.51 
 
 		 412 aa  218  2e-55  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.745936  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4917  major facilitator transporter  24.43 
 
 		 419 aa  97.8  3e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0995629 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3416  major facilitator transporter  22.79 
 
 		 397 aa  64.7  0.000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0372119  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4571  major facilitator transporter  22.51 
 
 		 397 aa  62  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4862  putative permease  22.95 
 
 		 397 aa  60.5  0.00000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4473  permease; multidrug resistance protein  22.95 
 
 		 397 aa  60.5  0.00000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4992  permease  21.94 
 
 		 397 aa  59.3  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.976695  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4491  permease; multidrug resistance protein  21.65 
 
 		 397 aa  59.7  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.341266  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4638  permease  21.94 
 
 		 397 aa  59.3  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.3147  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0385  putative permease  22.38 
 
 		 397 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4876  putative permease  22.66 
 
 		 397 aa  58.9  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2482  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.33 
 
 		 493 aa  57.8  0.0000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.15461  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4852  putative permease  22.38 
 
 		 397 aa  57.8  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.320137  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4883  permease, putative  22.38 
 
 		 397 aa  57.8  0.0000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06960  major facilitator family transporter  22.22 
 
 		 396 aa  52.8  0.00001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2765  major facilitator superfamily MFS_1  21.2 
 
 		 397 aa  52  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000543377  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0896  major facilitator transporter  19.34 
 
 		 395 aa  51.2  0.00004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_880  major facilitator family transporter  21.22 
 
 		 423 aa  50.4  0.00005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4854  major facilitator superfamily MFS_1  23.74 
 
 		 395 aa  48.9  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.011677  normal  0.12131 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0184  major facilitator transporter  35.14 
 
 		 401 aa  48.5  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.133276  normal  0.55787 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2851  transporter, putative  23.01 
 
 		 512 aa  48.5  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0493  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.29 
 
 		 478 aa  47  0.0005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1814  major facilitator transporter  21.64 
 
 		 393 aa  46.2  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.142704  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2972  major facilitator transporter  28.11 
 
 		 422 aa  45.8  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1319  drug transporter, putative  23.49 
 
 		 404 aa  45.8  0.001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1849  major facilitator transporter  21.64 
 
 		 393 aa  46.2  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.200534  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1052  major facilitator transporter  20.74 
 
 		 510 aa  45.1  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2319  major facilitator superfamily MFS_1  25.9 
 
 		 407 aa  45.1  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2794  major facilitator superfamily MFS_1  27.64 
 
 		 419 aa  44.7  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.572754  normal  0.513078 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0797  major facilitator transporter  27.74 
 
 		 411 aa  45.1  0.003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3913  major facilitator transporter  27.91 
 
 		 421 aa  44.3  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0222  major facilitator transporter  21.6 
 
 		 424 aa  44.3  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0278  major facilitator family transporter  21.81 
 
 		 423 aa  43.9  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.248198  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0412  putative fosmidomycin resistance antibiotic resistance transmembrane protein  25.95 
 
 		 411 aa  43.9  0.005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.22156  normal  0.519743 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2076  major facilitator transporter  22.53 
 
 		 426 aa  43.5  0.006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.754596  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4112  major facilitator transporter  29.35 
 
 		 397 aa  43.5  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0806371  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1258  major facilitator transporter  20.41 
 
 		 513 aa  43.9  0.006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2319  major facilitator superfamily MFS_1  22.3 
 
 		 396 aa  43.5  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0805208  normal  0.902577 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0387  major facilitator transporter  29 
 
 		 467 aa  43.1  0.009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.285838  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>