54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_2187 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011891  A2cp1_2187  hypothetical protein  100 
 
 		 173 aa  330  9e-90  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.772007  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1745  hypothetical protein  91.19 
 
 		 173 aa  244  3e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2094  hypothetical protein  86.16 
 
 		 173 aa  229  1e-59  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.175818  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5572  hypothetical protein  43.97 
 
 		 170 aa  114  5e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5817  putative flavodoxin  40.26 
 
 		 175 aa  103  9e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.117225 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1855  hypothetical protein  41.18 
 
 		 191 aa  102  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.250406  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6055  hypothetical protein  39.44 
 
 		 178 aa  102  3e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000113838 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5938  putative flavodoxin  41.94 
 
 		 177 aa  99.8  2e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2453  hypothetical protein  41.46 
 
 		 163 aa  96.3  2e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  decreased coverage  0.00273719  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0391  putative flavodoxin  40.58 
 
 		 175 aa  94  9e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0187  hypothetical protein  26.86 
 
 		 176 aa  69.3  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0330126 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4431  hypothetical protein  28.14 
 
 		 176 aa  64.7  0.0000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4564  hypothetical protein  28.14 
 
 		 176 aa  64.7  0.0000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.256174 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1997  hypothetical protein  33.33 
 
 		 162 aa  63.9  0.0000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000000282274  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1109  hypothetical protein  29.31 
 
 		 161 aa  63.2  0.000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000082959  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3000  hypothetical protein  24.41 
 
 		 143 aa  63.5  0.000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000000872751  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1078  putative flavodoxin  29.1 
 
 		 172 aa  62.4  0.000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3810  hypothetical protein  27.41 
 
 		 196 aa  60.5  0.00000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0474372  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3716  hypothetical protein  29.85 
 
 		 176 aa  59.7  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.116511 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2171  ArsR family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 164 aa  53.9  0.0000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2384  hypothetical protein  29.2 
 
 		 161 aa  53.9  0.000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0903  hypothetical protein  38.2 
 
 		 157 aa  53.5  0.000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000048234 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1204  putative flavodoxin  31.25 
 
 		 164 aa  52.4  0.000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1212  hypothetical protein  26.62 
 
 		 179 aa  52  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.189155  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0478  putative flavodoxin  30.21 
 
 		 164 aa  51.6  0.000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1078  flavodoxin  28.68 
 
 		 221 aa  51.6  0.000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2892  flavodoxin  30.43 
 
 		 173 aa  51.6  0.000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0279  flavodoxin  24.03 
 
 		 160 aa  49.7  0.00002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16830  hypothetical protein  33.67 
 
 		 164 aa  50.1  0.00002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.547063  normal  0.789104 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3241  twin-arginine translocation pathway signal  34.06 
 
 		 189 aa  49.3  0.00003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.99136 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0173  putative dialkylrecorsinol condensing enzyme  35.51 
 
 		 309 aa  48.5  0.00005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1430  putative flavodoxin  30.21 
 
 		 164 aa  48.5  0.00005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.89499  normal  0.109028 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0351  pyruvate carboxyltransferase  28.97 
 
 		 142 aa  47.8  0.00007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.63457  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1119  flavodoxin, putative  25.95 
 
 		 186 aa  47.8  0.00009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0781  hypothetical protein  31.91 
 
 		 230 aa  47  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000507812 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3899  twin-arginine translocation pathway signal  29.13 
 
 		 196 aa  46.2  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.942744  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3134  TrpR binding protein WrbA  31.75 
 
 		 199 aa  46.2  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0712  ArsR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 160 aa  44.7  0.0006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2633  flavodoxin  25 
 
 		 141 aa  44.7  0.0006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.215143  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1418  putative flavodoxin  33.33 
 
 		 164 aa  44.7  0.0006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0495  hypothetical protein  29.9 
 
 		 193 aa  44.7  0.0006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0447  protein of unknown function DUF323  27.37 
 
 		 489 aa  44.7  0.0007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3236  putative flavodoxin  25.95 
 
 		 160 aa  44.3  0.0008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2510  flavodoxin  23.66 
 
 		 185 aa  44.3  0.0009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0482  ArsR family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 163 aa  43.5  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.280132  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1644  ArsR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 297 aa  43.1  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0445  flavodoxin  24.43 
 
 		 169 aa  42.7  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32510  flavodoxin protein  32.58 
 
 		 197 aa  42.4  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.752902  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1509  hypothetical protein  31.46 
 
 		 106 aa  42.4  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0519  flavodoxin  29.37 
 
 		 159 aa  42.4  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1284  hypothetical protein  37.04 
 
 		 163 aa  42  0.004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.201836  normal  0.37398 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3791  flavodoxin  28.45 
 
 		 159 aa  41.6  0.005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1242  TrpR binding protein WrbA  32.98 
 
 		 198 aa  41.6  0.006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18190  flavodoxin  31.34 
 
 		 157 aa  41.2  0.008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.568663  normal  0.949186 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>