58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_1860 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011891  A2cp1_1860  hypothetical protein  100 
 
 		 221 aa  434  1e-121  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1781  hypothetical protein  97.97 
 
 		 221 aa  389  1e-107  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.531778  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2097  hypothetical protein  88.24 
 
 		 150 aa  244  6.999999999999999e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.206741  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3625  flavocytochrome c  42.55 
 
 		 596 aa  77.4  0.0000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3597  flavocytochrome c  43.52 
 
 		 591 aa  77.8  0.0000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4036  flavocytochrome c  43.01 
 
 		 598 aa  70.9  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2786  hypothetical protein  40.59 
 
 		 113 aa  67.8  0.0000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.12053 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4127  flavocytochrome c  40.86 
 
 		 598 aa  67.4  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.431024 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0887  hypothetical protein  36.73 
 
 		 136 aa  66.2  0.0000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.590211  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3182  hypothetical protein  38.24 
 
 		 118 aa  66.2  0.0000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0946  fumarate reductase flavoprotein subunit precursor  39.42 
 
 		 122 aa  65.9  0.0000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3877  succinate dehydrogenase  42.22 
 
 		 596 aa  65.1  0.0000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000270258  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1004  hypothetical protein  46.34 
 
 		 165 aa  63.5  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3693  hypothetical protein  37.19 
 
 		 118 aa  63.2  0.000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.799168  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3388  hypothetical protein  36 
 
 		 116 aa  62  0.000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1444  fumarate reductase flavoprotein subunit precursor  36 
 
 		 114 aa  61.6  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000626372 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3683  hypothetical protein  50.6 
 
 		 137 aa  59.7  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2510  tetraheme cytochrome c  36.45 
 
 		 122 aa  59.7  0.00000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0722  flavocytochrome c  40 
 
 		 596 aa  60.1  0.00000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3690  flavocytochrome c  42.68 
 
 		 583 aa  59.3  0.00000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3541  flavocytochrome c  39.13 
 
 		 589 aa  58.9  0.00000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000144139  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3617  hypothetical protein  49.4 
 
 		 137 aa  59.3  0.00000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3112  flavocytochrome c  41.46 
 
 		 596 aa  58.9  0.00000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000541974 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0810  flavocytochrome c  37.5 
 
 		 589 aa  58.5  0.00000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1158  hypothetical protein  36.36 
 
 		 114 aa  57.8  0.0000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0137  fumarate reductase flavoprotein subunit  34.83 
 
 		 130 aa  57.8  0.0000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.100425  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3776  flavocytochrome c  37.78 
 
 		 596 aa  58.2  0.0000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00235124 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04270  hypothetical protein  36.45 
 
 		 182 aa  54.7  0.000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.379993  normal  0.356103 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2586  flavocytochrome c  38.1 
 
 		 588 aa  54.3  0.000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.110511  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0942  hypothetical protein  35.06 
 
 		 172 aa  54.7  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2085  flavocytochrome c heme subunit  30.22 
 
 		 146 aa  54.7  0.000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.952774  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0611  fumarate reductase flavoprotein subunit precursor  33.04 
 
 		 593 aa  53.1  0.000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.755689 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1445  flavocytochrome c heme subunit  37.78 
 
 		 153 aa  53.1  0.000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.390446  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3215  flavocytochrome c  40.96 
 
 		 596 aa  50.4  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.57421 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0808  flavocytochrome c  40.96 
 
 		 596 aa  50.4  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.587828  normal  0.0624147 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1393  hypothetical protein  33.63 
 
 		 186 aa  49.7  0.00004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0905  flavocytochrome c  40.96 
 
 		 597 aa  49.3  0.00005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.604755  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3318  flavocytochrome c  40.96 
 
 		 596 aa  49.3  0.00005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.5959  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3628  flavocytochrome c  40.48 
 
 		 596 aa  48.9  0.00006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3505  flavocytochrome c  40.48 
 
 		 596 aa  48.9  0.00006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0859  flavocytochrome c  40.48 
 
 		 596 aa  48.9  0.00006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3433  flavocytochrome c  40.48 
 
 		 596 aa  48.9  0.00006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0970  fumarate reductase flavoprotein subunit precursor  40.96 
 
 		 596 aa  48.5  0.00007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07630  hypothetical protein  26.67 
 
 		 229 aa  48.5  0.00007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.48578 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3769  hypothetical protein  37.21 
 
 		 155 aa  48.5  0.00007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0297  flavocytochrome c  32.67 
 
 		 112 aa  48.9  0.00007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000730502 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2528  hypothetical protein  28.39 
 
 		 216 aa  46.2  0.0004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3056  tetraheme cytochrome c  41.18 
 
 		 127 aa  45.4  0.0006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1421  fumarate reductase flavoprotein subunit  32.94 
 
 		 589 aa  45.4  0.0006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2585  hypothetical protein  29.03 
 
 		 232 aa  45.1  0.0009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.00000203897  normal  0.20088 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2734  cytochrome c nitrite reductase pentaheme subunit  25.87 
 
 		 189 aa  45.1  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2431  cytochrome c nitrite reductase pentaheme subunit  24.38 
 
 		 189 aa  44.3  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0509  tetraheme cytochrome c  30.93 
 
 		 118 aa  43.5  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2892  hypothetical protein  45.45 
 
 		 122 aa  42.7  0.004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0342  tetraheme cytochrome c  39.56 
 
 		 126 aa  42.4  0.005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2203  cytochrome c family protein  30.28 
 
 		 363 aa  42.4  0.005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0339  cytochrome c  35.23 
 
 		 116 aa  42  0.007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1491  tetraheme cytochrome c  36.56 
 
 		 127 aa  42  0.008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>