More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_0187 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011891  A2cp1_0187  DedA  100 
 
 
220 aa  418  1e-116  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0175955  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0176  DedA  98.64 
 
 
220 aa  412  1e-114  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.526593  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0167  hypothetical protein  97.83 
 
 
220 aa  319  1.9999999999999998e-86  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.951703  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0176  SNARE associated Golgi protein  65.91 
 
 
218 aa  240  1e-62  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.292267  normal  0.98297 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5727  SNARE associated Golgi protein-related protein  34.78 
 
 
206 aa  90.9  1e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.196886  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5402  SNARE associated Golgi protein-like protein  33.16 
 
 
224 aa  88.2  8e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.365478 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1070  ribosomal protein L22  24.52 
 
 
199 aa  79  0.00000000000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0819  DedA family protein  26.32 
 
 
202 aa  78.2  0.00000000000008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0514  alkaline phosphatase  34.01 
 
 
206 aa  78.2  0.0000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1084  DedA-like protein  26.44 
 
 
201 aa  77.4  0.0000000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.672419  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1183  DedA family protein  27.74 
 
 
200 aa  75.1  0.0000000000007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1302  DedA family protein  27.74 
 
 
212 aa  74.7  0.000000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.262932  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2135  DedA family protein  30.25 
 
 
202 aa  74.3  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18740  uncharacterized membrane-associated protein  28.35 
 
 
248 aa  73.9  0.000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.829246  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2342  SNARE associated Golgi protein-like protein  29.95 
 
 
228 aa  73.6  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.43138  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1078  DedA family protein  19.69 
 
 
195 aa  72.8  0.000000000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2081  putative integral membrane protein dedA-like protein  27.46 
 
 
202 aa  72.8  0.000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.253435  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2291  SNARE associated Golgi protein  30.25 
 
 
202 aa  72.4  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2381  SNARE associated Golgi protein  30.2 
 
 
224 aa  72  0.000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.273471 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1806  hypothetical protein  28.4 
 
 
203 aa  71.6  0.000000000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.87635  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3743  SNARE associated Golgi protein  26.4 
 
 
215 aa  71.6  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.362202  normal  0.890971 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2080  hypothetical protein  33.15 
 
 
199 aa  70.1  0.00000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0320169  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1027  SNARE associated Golgi protein  32.79 
 
 
325 aa  70.9  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.649143  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2975  SNARE associated Golgi protein  25.23 
 
 
216 aa  70.1  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0123855  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0191  alkaline phosphatase  24.75 
 
 
209 aa  69.3  0.00000000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.0996912 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1046  SNARE associated Golgi protein-related protein  26.19 
 
 
202 aa  69.7  0.00000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0747  alkaline phosphatase  25.5 
 
 
214 aa  69.3  0.00000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0119068  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0103  putative alkaline phosphatase-like protein  30.15 
 
 
219 aa  69.3  0.00000000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3867  DedA family protein  30.29 
 
 
198 aa  68.6  0.00000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.537439 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0079  membrane protein  32.16 
 
 
217 aa  68.6  0.00000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0282  DedA family protein  30.24 
 
 
202 aa  68.2  0.00000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1349  SNARE associated Golgi protein-like protein  27.32 
 
 
241 aa  67.8  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0147  putative alkaline phosphatase-like protein  28.14 
 
 
219 aa  67  0.0000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.629007  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2737  SNARE associated Golgi protein  28.23 
 
 
206 aa  67.4  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.388255  normal  0.958337 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0095  DedA family protein  29.38 
 
 
205 aa  67.4  0.0000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4049  alkaline phosphatase  30.11 
 
 
213 aa  65.9  0.0000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.257312  hitchhiker  0.00220744 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9346  alkaline phosphatase  32.43 
 
 
205 aa  65.9  0.0000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.965489  normal  0.785405 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25760  uncharacterized membrane-associated protein  29.8 
 
 
228 aa  65.9  0.0000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1142  SNARE associated Golgi protein  30.73 
 
 
216 aa  64.3  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1100  SNARE associated Golgi protein-related protein  30.33 
 
 
207 aa  63.5  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000000402259  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1201  DedA family alkaline phosphatase-like protein  25.44 
 
 
218 aa  63.9  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06150  uncharacterized membrane-associated protein  31.33 
 
 
205 aa  63.2  0.000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.430266  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17501  DedA family alkaline phosphatase-like protein  27.45 
 
 
220 aa  63.2  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1952  DedA family protein  27.59 
 
 
215 aa  62.8  0.000000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0453  SNARE associated Golgi protein  23.04 
 
 
204 aa  62.8  0.000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20761  DedA family alkaline phosphatase-like protein  25 
 
 
218 aa  62.8  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.167528  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3208  DedA protein (DSG-1 protein)  29.09 
 
 
215 aa  62.8  0.000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.043821  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1970  hypothetical protein  26.39 
 
 
232 aa  62.8  0.000000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3718  DedA family protein  23.53 
 
 
203 aa  62.8  0.000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.913537  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0606  SNARE associated Golgi protein-related protein  25.87 
 
 
231 aa  62  0.000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5170  dedA protein  23.56 
 
 
204 aa  62  0.000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1772  SNARE associated Golgi protein  24.1 
 
 
208 aa  62  0.000000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0130  hypothetical protein  28.12 
 
 
215 aa  61.6  0.000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0514  DedA family protein  22.06 
 
 
204 aa  62  0.000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0291  SNARE associated Golgi protein  31.65 
 
 
239 aa  61.6  0.000000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.702057  normal  0.0958134 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3543  DedA family protein  24.08 
 
 
203 aa  61.6  0.000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0412  DedA family protein  24.08 
 
 
203 aa  61.6  0.000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03490  uncharacterized membrane-associated protein  28.02 
 
 
216 aa  61.6  0.000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1759  hypothetical protein  30.3 
 
 
213 aa  61.2  0.00000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.335415  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1314  SNARE associated Golgi protein-related protein  22.63 
 
 
201 aa  61.2  0.00000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.38918  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5185  dedA protein  23.56 
 
 
204 aa  61.2  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0628  hypothetical protein  28.11 
 
 
199 aa  61.6  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.341746 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0427  SNARE associated Golgi protein  22.55 
 
 
204 aa  60.1  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.160448  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1525  SNARE associated Golgi protein  30.49 
 
 
228 aa  60.5  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.365911  hitchhiker  0.00841691 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4741  dedA protein  23.04 
 
 
204 aa  60.8  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.98218  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1474  SNARE associated Golgi protein  29.07 
 
 
214 aa  60.5  0.00000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1150  SNARE associated Golgi protein  27.22 
 
 
224 aa  60.5  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  3.66321e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46140  DedA family membrane-associated protein  27.05 
 
 
202 aa  60.5  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0874332  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1081  putative alkaline phosphatase  23.46 
 
 
198 aa  60.5  0.00000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.524919 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4856  SNARE associated Golgi protein  23.56 
 
 
204 aa  60.8  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5176  dedA protein  23.04 
 
 
204 aa  60.8  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0601  SNARE associated Golgi protein-related protein  28.11 
 
 
205 aa  60.5  0.00000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1693  SNARE associated Golgi protein  25.97 
 
 
203 aa  59.7  0.00000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1148  hypothetical protein  22.22 
 
 
211 aa  59.7  0.00000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0074  dedA protein  22.63 
 
 
204 aa  59.7  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3465  SNARE associated Golgi protein  28.84 
 
 
222 aa  59.3  0.00000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.133962  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4897  dedA protein  23.04 
 
 
204 aa  59.3  0.00000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4760  DedA family protein  23.04 
 
 
204 aa  59.3  0.00000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2768  hypothetical protein  27.19 
 
 
212 aa  59.3  0.00000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.375842  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0636  SNARE associated Golgi protein  30.73 
 
 
217 aa  59.3  0.00000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5272  dedA protein  23.04 
 
 
204 aa  59.3  0.00000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5141  dedA protein  23.04 
 
 
204 aa  59.3  0.00000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3305  DedA protein (DSG-1 protein)  29.72 
 
 
215 aa  59.3  0.00000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.25714  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1030  SNARE associated Golgi protein-like protein  25.68 
 
 
203 aa  58.9  0.00000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00380  uncharacterized membrane-associated protein  28.33 
 
 
225 aa  59.3  0.00000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.157749 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2075  DedA family protein  22.36 
 
 
204 aa  58.9  0.00000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.190236  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0665  SNARE associated Golgi protein  21.23 
 
 
212 aa  58.9  0.00000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.267065  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0439  SNARE associated Golgi protein  22.55 
 
 
204 aa  58.9  0.00000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0969745 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0625  SNARE associated Golgi protein  26.94 
 
 
203 aa  58.9  0.00000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  2.21493e-35 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0611  SNARE associated Golgi protein  26.77 
 
 
208 aa  58.9  0.00000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0454  hypothetical protein  28.5 
 
 
213 aa  58.9  0.00000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.62301 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3887  SNARE associated Golgi protein  22.17 
 
 
204 aa  58.5  0.00000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0310  DedA family protein  25.27 
 
 
207 aa  58.5  0.00000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4191  DedA family protein  23.12 
 
 
192 aa  58.2  0.0000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1401  hypothetical protein  26.95 
 
 
200 aa  58.2  0.0000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1977  SNARE associated Golgi protein  22.71 
 
 
201 aa  58.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.669435 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1167  DedA protein (DSG-1 protein)  29.17 
 
 
219 aa  57.8  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.482076  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0619  hypothetical protein  29.93 
 
 
211 aa  57.8  0.0000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.512378  normal  0.260875 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3933  DedA family transmembrane protein  24.54 
 
 
223 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.95062  hitchhiker  0.00056893 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2536  SNARE associated Golgi protein  21.28 
 
 
203 aa  57.8  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>