More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpp2557 on replicon NC_006368
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006368  lpp2557  hypothetical protein  100 
 
 
149 aa  293  8e-79  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0248  putative signal transduction protein with CBS domains  53.02 
 
 
149 aa  155  2e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0583  CBS domain-containing protein  45.64 
 
 
150 aa  136  1e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.00772647  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1388  hypothetical protein  50 
 
 
149 aa  134  5e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1528  signal-transduction protein  42.57 
 
 
153 aa  127  6e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3850  signal-transduction protein  42.76 
 
 
153 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0067  putative inosine monophosphate dehydrogenase  44.97 
 
 
149 aa  124  5e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1169  signal-transduction protein  45.27 
 
 
149 aa  116  9.999999999999999e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0920  CBS domain-containing protein  42.28 
 
 
149 aa  111  3e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5919  signal-transduction protein  43.54 
 
 
162 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.512609  normal  0.346148 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2033  CBS domain-containing protein  36.49 
 
 
149 aa  107  8.000000000000001e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2323  CBS domain-containing protein  36.49 
 
 
149 aa  107  8.000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.195763  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1343  CBS domain-containing protein  36.49 
 
 
149 aa  107  8.000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1057  CBS domain-containing protein  36.49 
 
 
149 aa  107  8.000000000000001e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.486416  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3216  CBS domain-containing protein  36.49 
 
 
149 aa  106  1e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6177  CBS domain-containing protein  40.94 
 
 
149 aa  104  3e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3091  CBS domain-containing protein  36.55 
 
 
291 aa  105  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.105353  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1429  CBS domain-containing protein  36.55 
 
 
211 aa  103  6e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5931  CBS domain-containing protein  39.6 
 
 
149 aa  103  7e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2317  CBS domain-containing protein  36.49 
 
 
149 aa  103  7e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.754062  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7035  CBS domain-containing protein  36 
 
 
150 aa  102  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.819335  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2342  CBS domain-containing protein  37.33 
 
 
150 aa  103  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.72552 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1141  signal-transduction protein  36.18 
 
 
150 aa  96.7  9e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.403559  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0695  putative signal-transduction protein with CBS domains  32.85 
 
 
140 aa  93.2  1e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0173289  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0642  putative signal transduction protein with CBS domains  37.32 
 
 
140 aa  92.4  2e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.413978  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0345  signal-transduction protein  33.33 
 
 
150 aa  89.4  2e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3679  signal-transduction protein  38.26 
 
 
150 aa  89  2e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0389  signal-transduction protein  38.1 
 
 
150 aa  86.7  1e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3235  hypothetical protein  40.19 
 
 
130 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1150  CBS  32.88 
 
 
154 aa  79.7  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3565  CBS domain-containing protein  35.83 
 
 
138 aa  79.3  0.00000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4551  putative signal transduction protein with CBS domains  32.41 
 
 
154 aa  79  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.610614  normal  0.0178706 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4435  putative signal-transduction protein with CBS domains  29.53 
 
 
155 aa  79  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4418  putative signal-transduction protein with CBS domains  32.41 
 
 
154 aa  79  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.577015  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4568  putative signal transduction protein with CBS domains  29.53 
 
 
155 aa  79  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0446023  normal  0.17585 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0305  signal-transduction protein  38.52 
 
 
185 aa  77.8  0.00000000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0743786  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3669  putative signal transduction protein with CBS domains  31.69 
 
 
141 aa  77  0.00000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3944  signal-transduction protein  35 
 
 
138 aa  76.6  0.00000000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.898238  normal  0.165624 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1809  putative signal-transduction protein with CBS domains  30.77 
 
 
478 aa  75.9  0.0000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0764  CBS domain-containing protein  28.7 
 
 
605 aa  75.5  0.0000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0514021 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5203  CBS domain containing protein  30.99 
 
 
141 aa  74.7  0.0000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0183  hypothetical protein  30.71 
 
 
165 aa  73.9  0.0000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0517579 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2234  putative signal transduction protein with CBS domains  30.28 
 
 
139 aa  73.2  0.000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0447  signal-transduction protein  30.58 
 
 
145 aa  72.8  0.000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.285729  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0631  signal-transduction protein  28.46 
 
 
189 aa  72  0.000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7033  signal-transduction protein  30.71 
 
 
154 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.365249  normal  0.472984 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3773  putative signal transduction protein with CBS domains  33.85 
 
 
144 aa  71.6  0.000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7015  CBS domain-containing protein  33.61 
 
 
143 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2798  putative signal transduction protein with CBS domains  35.45 
 
 
140 aa  70.9  0.000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0139355  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0026  CBS domain-containing protein  32.23 
 
 
141 aa  70.5  0.000000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1358  CBS domain-containing protein  31.5 
 
 
143 aa  69.3  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6471  CBS domain-containing protein  31.5 
 
 
143 aa  69.3  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0745469  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2231  signal-transduction protein  30.83 
 
 
188 aa  70.1  0.00000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.943647  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3605  hypothetical protein  28.78 
 
 
139 aa  69.3  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.103373  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06340  putative signal-transduction protein with CBS domains  31.29 
 
 
141 aa  69.3  0.00000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000465197  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1360  CBS domain-containing protein  33.61 
 
 
143 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.565308  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2011  CBS domain-containing protein  30.71 
 
 
286 aa  68.6  0.00000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3011  CBS domain-containing protein  33.61 
 
 
143 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.162521  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3139  CBS domain-containing protein  33.61 
 
 
143 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.533561  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6352  CBS domain-containing protein  30.95 
 
 
143 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.88577 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5621  CBS domain-containing protein  30.95 
 
 
143 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0984367 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2620  putative signal transduction protein with CBS domains  33.1 
 
 
480 aa  68.2  0.00000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0774627  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6060  CBS domain-containing protein  30.71 
 
 
143 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.613406  normal  0.175834 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2950  signal transduction protein  32.85 
 
 
141 aa  67.4  0.00000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.211508 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5465  CBS domain-containing protein  31.75 
 
 
143 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00381239 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3292  signal transduction protein  31.71 
 
 
142 aa  67.4  0.00000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.792405 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2439  CBS domain-containing protein  30.47 
 
 
145 aa  66.6  0.0000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1780  putative signal transduction protein with CBS domains  33.61 
 
 
141 aa  66.2  0.0000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3096  signal-transduction protein  31.2 
 
 
139 aa  65.5  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2788  CBS domain-containing protein  32.52 
 
 
151 aa  66.2  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.190959  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2352  signal-transduction protein  32.79 
 
 
142 aa  65.9  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.103406  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0239  signal transduction protein  31.25 
 
 
128 aa  65.1  0.0000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.371768 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2219  CBS domain containing protein  29.69 
 
 
145 aa  65.1  0.0000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.338208  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1198  CBS  31.15 
 
 
139 aa  64.7  0.0000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0364  signal-transduction protein  31.3 
 
 
139 aa  64.7  0.0000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.612757 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1249  CBS domain-containing protein  28.67 
 
 
141 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6583  CBS domain-containing protein  28.67 
 
 
141 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.460187  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6186  CBS domain-containing protein  28.67 
 
 
141 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1332  signal-transduction protein  32.06 
 
 
139 aa  63.9  0.0000000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.660277  normal  0.443449 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0565  signal-transduction protein  26.72 
 
 
188 aa  63.9  0.0000000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0673  signal-transduction protein  28.33 
 
 
165 aa  63.5  0.0000000008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2290  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  30.83 
 
 
589 aa  63.2  0.000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2675  CBS:HPP  29.37 
 
 
379 aa  63.2  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4395  CBS  33.61 
 
 
164 aa  63.2  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0203487  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3439  putative signal transduction protein with CBS domains  36.21 
 
 
141 aa  62  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.72224  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0214  putative signal transduction protein with CBS domains  26.98 
 
 
207 aa  62.4  0.000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1676  signal-transduction protein  33.61 
 
 
147 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.780489  normal  0.354622 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4974  putative signal-transduction protein with CBS domains  32.79 
 
 
147 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0816417 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0262  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  30 
 
 
586 aa  62.4  0.000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.141081  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3375  putative signal-transduction protein with CBS domains  36.21 
 
 
141 aa  62  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0964  putative signal transduction protein with CBS domains  30.16 
 
 
132 aa  61.6  0.000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0699  CBS domain-containing protein  30.56 
 
 
625 aa  62  0.000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0116377  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0022  signal-transduction protein  28.69 
 
 
141 aa  62  0.000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2035  CBS domain-containing protein  31.15 
 
 
143 aa  61.6  0.000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5536  CBS domain-containing protein  26.57 
 
 
141 aa  62  0.000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0354137 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3316  CBS domain-containing protein  30.51 
 
 
144 aa  62  0.000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00011902  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1475  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  32.31 
 
 
321 aa  61.6  0.000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2185  signal transduction protein  34.17 
 
 
170 aa  61.6  0.000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.51071  normal  0.552255 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1740  signal transduction protein  26.81 
 
 
138 aa  61.2  0.000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.247067 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1429  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  32.31 
 
 
321 aa  61.6  0.000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>