252 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_0648 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010159  YpAngola_A0218  flagellar hook-associated protein FlgK  88.52 
 
 		 453 aa  827    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0648  flagellar hook-associated protein FlgK  100 
 
 		 453 aa  922    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0272  lateral flagellar hook associated protein 1  38.51 
 
 		 458 aa  305  1.0000000000000001e-81  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.508781 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3362  flagellar hook-associated protein FlgK  38.29 
 
 		 458 aa  302  7.000000000000001e-81  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04918  flagellar hook-associated protein  35.81 
 
 		 457 aa  288  1e-76  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000731  flagellar hook-associated protein FlgK  34.28 
 
 		 457 aa  270  4e-71  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0215  flagellar hook-associated protein FlgK  37.11 
 
 		 455 aa  266  4e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.727542  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0066  flagellar hook-associated protein FlgK  35.29 
 
 		 457 aa  262  1e-68  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3569  flagellar hook-associated protein FlgK  34.21 
 
 		 454 aa  246  4.9999999999999997e-64  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.303644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0060  flagellar hook-associated protein FlgK  34.64 
 
 		 457 aa  243  5e-63  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3459  flagellar hook-associated protein FlgK  33.48 
 
 		 457 aa  211  3e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4680  flagellar hook-associated protein FlgK  30.25 
 
 		 429 aa  208  1e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000296928 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3962  flagellar hook-associated protein FlgK  33.48 
 
 		 457 aa  209  1e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0246  flagellar hook-associated protein FlgK  31.02 
 
 		 452 aa  207  4e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3642  flagellar hook-associated protein  32.24 
 
 		 457 aa  196  1e-48  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0193  flagellar hook-associated protein FlgK  30.37 
 
 		 452 aa  192  1e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.363354  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0746  flagellar hook-associated protein FlgK  28.93 
 
 		 486 aa  162  8.000000000000001e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0451  flagellar hook-associated protein FlgK  28.42 
 
 		 480 aa  151  2e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3942  flagellar hook-associated protein FlgK  33.23 
 
 		 680 aa  147  5e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3043  flagellar hook-associated protein FlgK  26.92 
 
 		 477 aa  145  2e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2841  flagellar hook-associated protein FlgK  30.12 
 
 		 681 aa  144  2e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.673988  normal  0.205437 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4381  flagellar hook-associated protein FlgK  32.92 
 
 		 680 aa  144  3e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.920436 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50360  flagellar hook-associated protein FlgK  30.12 
 
 		 683 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0589172  hitchhiker  0.000676236 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0902  flagellar hook-associated protein FlgK  30.09 
 
 		 695 aa  141  1.9999999999999998e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.125146  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1111  flagellar hook-associated protein FlgK  31.48 
 
 		 688 aa  140  3.9999999999999997e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0676298  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2930  flagellar hook-associated protein  27.51 
 
 		 458 aa  138  2e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.685458  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4291  flagellar hook-associated protein FlgK  29.19 
 
 		 682 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.800386  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2204  hypothetical protein  29.93 
 
 		 920 aa  135  9.999999999999999e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1149  flagellar hook-associated protein  25.59 
 
 		 464 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4182  flagellar hook-associated protein FlgK  28.69 
 
 		 652 aa  135  1.9999999999999998e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1233  flagellar hook-associated protein FlgK  31.4 
 
 		 649 aa  134  3e-30  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1233  flagellar hook-associated protein FlgK  30.81 
 
 		 649 aa  133  6e-30  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0758  flagellar hook-associated protein FlgK  29.24 
 
 		 683 aa  133  6.999999999999999e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1969  flagellar hook-associated protein  29.17 
 
 		 539 aa  132  9e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1226  flagellar hook-associated protein FlgK  30.43 
 
 		 637 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.548532  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3722  flagellar hook-associated protein FlgK  30.55 
 
 		 682 aa  129  7.000000000000001e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0912504  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0438  flagellar hook-associated protein  26.81 
 
 		 477 aa  129  2.0000000000000002e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3743  flagellar hook-associated protein FlgK  27.52 
 
 		 631 aa  125  2e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2243  flagellar hook-associated protein FlgK  28.87 
 
 		 547 aa  124  5e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.39076  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1474  flagellar hook-associated protein FlgK  29.54 
 
 		 676 aa  123  6e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0329611  normal  0.363224 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01078  flagellar hook-associated protein K  28.87 
 
 		 547 aa  123  8e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0929939  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2564  flagellar hook-associated protein FlgK  28.87 
 
 		 547 aa  123  8e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.141155  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01086  hypothetical protein  28.87 
 
 		 547 aa  123  8e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0870613  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2518  flagellar hook-associated protein FlgK  28.57 
 
 		 547 aa  122  9.999999999999999e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.38905  hitchhiker  0.00149416 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1205  flagellar hook-associated protein FlgK  28.57 
 
 		 547 aa  122  9.999999999999999e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0984648  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2046  flagellar hook-associated protein FlgK  28.87 
 
 		 547 aa  122  9.999999999999999e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.147605  normal  0.0499745 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1461  flagellar hook-associated protein FlgK  28.57 
 
 		 547 aa  122  9.999999999999999e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.597207  hitchhiker  0.00000199333 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5634  flagellar hook-associated protein FlgK  27.83 
 
 		 631 aa  122  1.9999999999999998e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1205  flagellar hook-associated protein FlgK  28.57 
 
 		 547 aa  121  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.223316  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06163  flagellar hook-associated protein FlgK  30.45 
 
 		 624 aa  121  3e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.557443  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01003  flagellar hook-associated protein FlgK  30.45 
 
 		 624 aa  121  3e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.163579  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2357  flagellar hook-associated protein FlgK  25.33 
 
 		 459 aa  121  3e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24090  flagellar hook-associated protein  27.91 
 
 		 541 aa  120  6e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.160366  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1562  flagellar hook-associated protein FlgK  30.37 
 
 		 640 aa  120  6e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.776714  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2369  hypothetical protein  30.09 
 
 		 647 aa  119  9e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0989  flagellar hook-associated protein FlgK  26.2 
 
 		 482 aa  119  1.9999999999999998e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.100834  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0832  flagellar hook-associated protein FlgK  26.81 
 
 		 463 aa  119  1.9999999999999998e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2239  flagellar hook-associated protein FlgK  25.05 
 
 		 464 aa  119  1.9999999999999998e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0511  flagellar hook-associated protein FlgK  28.2 
 
 		 685 aa  118  1.9999999999999998e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.288267  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3574  flagellar hook-associated protein FlgK  29.79 
 
 		 658 aa  117  3e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2958  flagellar hook-associated protein FlgK  29.04 
 
 		 657 aa  117  5e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.360284 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17140  flagellar hook-associated protein FlgK  24.18 
 
 		 471 aa  116  1.0000000000000001e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3078  flagellar hook-associated protein FlgK  29.66 
 
 		 638 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0935  flagellar hook-associated protein FlgK  31.95 
 
 		 640 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.789193  normal  0.776781 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2041  flagellar hook-associated protein FlgK  26.91 
 
 		 463 aa  115  2.0000000000000002e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.848147 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2915  flagellar hook-associated protein FlgK  27.79 
 
 		 660 aa  113  5e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.43042  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1628  flagellar hook-associated protein FlgK  30.5 
 
 		 629 aa  113  7.000000000000001e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.770281 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2961  flagellar hook-associated protein FlgK  28.87 
 
 		 548 aa  113  8.000000000000001e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1596  flagellar hook-associated protein FlgK  28.57 
 
 		 546 aa  113  9e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2244  flagellar hook-associated protein FlgK  23.91 
 
 		 489 aa  111  3e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31330  flagellar hook-associated protein FlgK  24.27 
 
 		 475 aa  110  5e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0682409 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4099  flagellar hook-associated protein FlgK  24.89 
 
 		 478 aa  110  6e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2416  flagellar hook-associated protein FlgK  28.36 
 
 		 554 aa  110  6e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.524278  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2314  flagellar hook-associated protein FlgK  28.36 
 
 		 554 aa  110  6e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2007  flagellar hook-associated protein FlgK  28.36 
 
 		 554 aa  110  6e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1767  flagellar hook-associated protein FlgK  27.41 
 
 		 549 aa  110  7.000000000000001e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3455  flagellar hook-associated protein FlgK  25.65 
 
 		 456 aa  110  7.000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0351  flagellar hook-associated protein FlgK  30.12 
 
 		 642 aa  108  2e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.309905  normal  0.119919 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1280  flagellar hook-associated protein FlgK  27.96 
 
 		 553 aa  107  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.227106  hitchhiker  0.000609554 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1295  flagellar hook-associated protein FlgK  27.96 
 
 		 553 aa  107  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.216547  hitchhiker  0.000168062 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2005  flagellar hook-associated protein FlgK  27.96 
 
 		 553 aa  107  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00869488  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1963  flagellar hook-associated protein FlgK  28.48 
 
 		 645 aa  107  4e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2189  flagellar hook-associated protein FlgK  27.96 
 
 		 553 aa  107  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000358653 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1251  flagellar hook-associated protein FlgK  27.96 
 
 		 553 aa  107  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.577758  normal  0.294007 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3705  flagellar hook-associated protein FlgK  29.57 
 
 		 645 aa  107  6e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.117062 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1944  flagellar hook-associated protein FlgK  27.71 
 
 		 686 aa  107  6e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0163464  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4782  flagellar hook-associated protein FlgK  29.57 
 
 		 645 aa  107  6e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.419966 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3471  flagellar hook-associated protein FlgK  25.85 
 
 		 686 aa  106  1e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.230935  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1344  flagellar hook-associated protein  24.28 
 
 		 469 aa  106  1e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0451355  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1606  flagellar hook-associated protein FlgK  27.63 
 
 		 637 aa  105  2e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0566107  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3000  flagellar hook-associated protein FlgK  25 
 
 		 472 aa  102  1e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000379276 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1330  flagellar hook-associated protein FlgK  27.91 
 
 		 638 aa  102  1e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0022  flagellar hook-associated protein FlgK  25.64 
 
 		 443 aa  101  3e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1170  flagellar hook-associated protein FlgK  26.77 
 
 		 642 aa  100  4e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.793737  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2422  flagellar hook-associated protein FlgK  28.19 
 
 		 698 aa  100  4e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.314403 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1349  flagellar hook-associated protein FlgK  29.88 
 
 		 640 aa  100  5e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1675  flagellar hook-associated protein FlgK  28.09 
 
 		 525 aa  100  7e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3228  flagellar hook-associated protein FlgK  23.99 
 
 		 531 aa  99.8  8e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4195  flagellar hook-associated protein FlgK  30.3 
 
 		 583 aa  98.6  2e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2725  flagellar hook-associated protein FlgK  26.43 
 
 		 640 aa  99  2e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000557458 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>