55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_0309 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_0309  transcriptional regulator, PaaX family  100 
 
 		 302 aa  602  1.0000000000000001e-171  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6455  transcriptional regulator, PaaX family  42.28 
 
 		 260 aa  172  7.999999999999999e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5523  transcriptional regulator, PaaX family  41.98 
 
 		 267 aa  162  9e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.543092 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2859  transcriptional regulator, PaaX family  30 
 
 		 285 aa  149  4e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0588  transcriptional regulator, PaaX family  36.19 
 
 		 276 aa  149  5e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2009  transcriptional regulator, PaaX family  32.93 
 
 		 281 aa  123  3e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.429433  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2835  transcriptional regulator, PaaX family  26.64 
 
 		 285 aa  121  9.999999999999999e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0294  transcriptional regulator, PaaX family  34.01 
 
 		 318 aa  110  3e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0429653  hitchhiker  0.0000864342 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19070  phenylacetic acid-responsive transcriptional repressor  32.45 
 
 		 292 aa  108  8.000000000000001e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0202563  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2150  transcriptional regulator, PaaX family  30.62 
 
 		 289 aa  108  1e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.933136  normal  0.276366 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1685  PaaX family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 333 aa  105  1e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0710641  normal  0.260669 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0655  PaaX family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 272 aa  103  3e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0748596  hitchhiker  0.00291671 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1609  PaaX family transcriptional regulator  29.48 
 
 		 258 aa  103  3e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0787  transcriptional regulator, PaaX family  33.99 
 
 		 268 aa  100  3e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4899  transcriptional regulator, PaaX family  29.1 
 
 		 276 aa  100  3e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.425131  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0708  PaaX family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 272 aa  99  8e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.719013  normal  0.640912 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4146  PaaX family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 305 aa  96.3  6e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.85173 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0216  PaaX family transcriptional regulator  25.1 
 
 		 311 aa  94  3e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0165647 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0386  phenylacetic acid degradation operon negative regulatory protein PaaX  27.57 
 
 		 352 aa  93.6  4e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000187716  normal  0.0170462 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0703  transcriptional regulator, PaaX family  29.76 
 
 		 259 aa  91.3  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2623  PaaX family transcriptional regulator  25.38 
 
 		 334 aa  89  9e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.312733  normal  0.0873289 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2610  PaaX family transcriptional regulator  25 
 
 		 334 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.218497  normal  0.0704814 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1514  transcriptional regulator, PaaX family  28.22 
 
 		 316 aa  87  3e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.139923  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0980  transcriptional regulator, PaaX family  27.59 
 
 		 259 aa  86.3  6e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.148761 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2473  PaaX family transcriptional regulator  26.97 
 
 		 334 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.303711  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1206  PaaX domain-containing protein, C- domain  31.8 
 
 		 258 aa  84.7  0.000000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3103  PaaX family transcriptional regulator  25 
 
 		 307 aa  84  0.000000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.000000661945  decreased coverage  0.0000397547 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3083  PaaX family transcriptional regulator  25.51 
 
 		 312 aa  84  0.000000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.415086 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0289  transcriptional regulator, PaaX family  28.91 
 
 		 280 aa  84  0.000000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.010887  hitchhiker  0.0000784974 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3286  PaaX family transcriptional regulator  24.62 
 
 		 307 aa  83.2  0.000000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.17765  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2629  PaaX family transcriptional regulator  27.82 
 
 		 259 aa  83.2  0.000000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.495501  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0661  PaaX domain-containing protein, C- domain  23.66 
 
 		 285 aa  81.6  0.00000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2025  transcriptional regulator, PaaX family  26.92 
 
 		 306 aa  78.6  0.0000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0895  PaaX family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 305 aa  78.6  0.0000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.947925  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8420  putative transcriptional regulator, PaaX family  28.68 
 
 		 260 aa  78.6  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.289328  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1521  phenylacetic acid degradation operon negative regulatory protein PaaX  24.9 
 
 		 312 aa  77.8  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2864  phenylacetic acid degradation operon negative regulatory protein paaX  28.28 
 
 		 293 aa  75.9  0.0000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.00499823  normal  0.0484276 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3734  phenylacetic acid degradation operon negative regulatory protein PaaX  26.06 
 
 		 307 aa  73.6  0.000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7200  transcriptional regulator, PaaX family  30.43 
 
 		 292 aa  73.2  0.000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.803046  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3357  transcriptional regulator, PaaX family  27.82 
 
 		 301 aa  72  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0692  phenylacetic acid degradation operon negative regulatory protein PaaX  30.61 
 
 		 287 aa  70.9  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.717402  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4812  PaaX domain-containing protein  28.11 
 
 		 284 aa  69.3  0.00000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.33483 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1585  phenylacetic acid degradation operon negative regulatory protein PaaX  25.7 
 
 		 316 aa  67.4  0.0000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2246  transcriptional regulator, PaaX family  25.7 
 
 		 316 aa  66.6  0.0000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.218129  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1486  phenylacetic acid degradation operon negative regulatory protein PaaX  25.3 
 
 		 316 aa  65.1  0.000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2256  PaaX family transcriptional regulator  25.3 
 
 		 316 aa  65.1  0.000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.203735  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0094  PaaX family transcriptional regulator  27.06 
 
 		 289 aa  62  0.00000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.339453  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0196  transcriptional regulator, PaaX family  23.74 
 
 		 319 aa  61.2  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1864  PaaX family transcriptional regulator  30.07 
 
 		 252 aa  52  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3828  PaaX family transcriptional regulator  26.94 
 
 		 264 aa  44.3  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.648927  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0436  PaaX-like  25.19 
 
 		 301 aa  43.5  0.005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.581976 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3784  putative transcriptional regulator, PaaX family  29.53 
 
 		 277 aa  43.1  0.005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0995  PaaX domain-containing protein, C- domain  26.77 
 
 		 243 aa  42.7  0.007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1005  PaaX domain-containing protein, C- domain  26.77 
 
 		 243 aa  42.7  0.007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.457167 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0977  PaaX-like protein  26.77 
 
 		 243 aa  42.7  0.007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>