25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_1864 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_1864  PaaX family transcriptional regulator  100 
 
 		 252 aa  497  1e-140  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2859  transcriptional regulator, PaaX family  30.88 
 
 		 285 aa  84.7  0.000000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2835  transcriptional regulator, PaaX family  26.84 
 
 		 285 aa  80.1  0.00000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2009  transcriptional regulator, PaaX family  31.96 
 
 		 281 aa  75.1  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.429433  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1609  PaaX family transcriptional regulator  34.9 
 
 		 258 aa  69.3  0.00000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0980  transcriptional regulator, PaaX family  31.68 
 
 		 259 aa  65.9  0.0000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.148761 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19070  phenylacetic acid-responsive transcriptional repressor  30.34 
 
 		 292 aa  63.2  0.000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0202563  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4899  transcriptional regulator, PaaX family  35.42 
 
 		 276 aa  57.4  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.425131  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2629  PaaX family transcriptional regulator  28.05 
 
 		 259 aa  57.4  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.495501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1685  PaaX family transcriptional regulator  29.96 
 
 		 333 aa  55.1  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0710641  normal  0.260669 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6455  transcriptional regulator, PaaX family  28.57 
 
 		 260 aa  52.8  0.000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2150  transcriptional regulator, PaaX family  31.13 
 
 		 289 aa  52.4  0.000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.933136  normal  0.276366 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0294  transcriptional regulator, PaaX family  29.05 
 
 		 318 aa  51.2  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0429653  hitchhiker  0.0000864342 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0309  transcriptional regulator, PaaX family  30.26 
 
 		 302 aa  50.4  0.00003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0655  PaaX family transcriptional regulator  28.41 
 
 		 272 aa  49.7  0.00005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0748596  hitchhiker  0.00291671 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2025  transcriptional regulator, PaaX family  32.45 
 
 		 306 aa  49.3  0.00006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0787  transcriptional regulator, PaaX family  28.38 
 
 		 268 aa  48.9  0.00007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0708  PaaX family transcriptional regulator  28.25 
 
 		 272 aa  48.5  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.719013  normal  0.640912 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0588  transcriptional regulator, PaaX family  29.11 
 
 		 276 aa  48.1  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3083  PaaX family transcriptional regulator  24.1 
 
 		 312 aa  47.8  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.415086 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0661  PaaX domain-containing protein, C- domain  22.98 
 
 		 285 aa  46.2  0.0005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0289  transcriptional regulator, PaaX family  27.34 
 
 		 280 aa  45.8  0.0006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.010887  hitchhiker  0.0000784974 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1005  PaaX domain-containing protein, C- domain  25.66 
 
 		 243 aa  42  0.01  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.457167 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0977  PaaX-like protein  25.66 
 
 		 243 aa  42  0.01  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0995  PaaX domain-containing protein, C- domain  25.66 
 
 		 243 aa  42  0.01  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>