More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_4844 on replicon NC_009717
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009717  Xaut_4844  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 375 aa  750    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0699099 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5749  ABC-2 type transporter  52.53 
 
 		 375 aa  403  1e-111  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.166668  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16770  ABC-2 type transporter, permease component  51.91 
 
 		 372 aa  380  1e-104  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00841824  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0758  ABC-2 type transporter  52.07 
 
 		 376 aa  379  1e-104  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3659  putative ABC transporter (permease protein)  52.59 
 
 		 370 aa  376  1e-103  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.00759514  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0811  ABC-2 type transporter  52.46 
 
 		 375 aa  373  1e-102  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1496  ABC-2 type transporter  50.14 
 
 		 382 aa  372  1e-102  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.679397  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2181  ABC-2 type transporter  50.41 
 
 		 374 aa  370  1e-101  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.64312  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0169  hypothetical protein  49.86 
 
 		 371 aa  368  1e-101  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.466784  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2362  ABC-2 type transporter  50.14 
 
 		 382 aa  371  1e-101  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0759041  normal  0.863187 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4914  ABC-2 type transporter  51.23 
 
 		 370 aa  369  1e-101  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1349  ABC transporter, permease protein, putative  50.41 
 
 		 370 aa  367  1e-100  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1825  ABC-2 type transporter  51.51 
 
 		 370 aa  366  1e-100  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0526143  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3789  ABC-2 type transporter  51.08 
 
 		 390 aa  366  1e-100  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2341  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  50.55 
 
 		 374 aa  364  2e-99  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.612393  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69060  putative permease of ABC transporter  51.38 
 
 		 374 aa  364  2e-99  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1307  putative ABC transporter, permease protein  49.86 
 
 		 370 aa  363  3e-99  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1951  ABC-2 type transporter  49.86 
 
 		 373 aa  363  3e-99  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.171698  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5973  ABC transporter permease  51.38 
 
 		 374 aa  362  6e-99  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0750  ABC-2 type transporter  50.54 
 
 		 375 aa  361  1e-98  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.212958  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2685  hypothetical protein  50.14 
 
 		 373 aa  360  2e-98  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3576  hypothetical protein  49.86 
 
 		 370 aa  359  5e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1505  ABC-2 type transporter  50.41 
 
 		 373 aa  358  9.999999999999999e-98  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.366767  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0988  hypothetical protein  50.96 
 
 		 374 aa  357  1.9999999999999998e-97  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.564547  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3418  ABC-2 type transporter  50.96 
 
 		 373 aa  355  5e-97  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3447  ABC-2 type transporter  46.74 
 
 		 376 aa  354  2e-96  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0565648  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1683  multidrug ABC transporter permease component  49.04 
 
 		 397 aa  353  2.9999999999999997e-96  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0017586  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1562  ABC-2 type transporter  47.83 
 
 		 374 aa  353  2.9999999999999997e-96  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.986622  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4687  ABC-2 type transporter  48.77 
 
 		 370 aa  353  2.9999999999999997e-96  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.696171  normal  0.325536 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7848  putative ABC transporter (permease protein)  53.04 
 
 		 376 aa  352  5.9999999999999994e-96  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.00792305  normal  0.174905 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0166  hypothetical protein  47.43 
 
 		 374 aa  351  1e-95  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000154077 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3957  ABC transporter ATP-binding protein  50.41 
 
 		 374 aa  351  1e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1150  ABC-2 type transporter  51.51 
 
 		 412 aa  351  1e-95  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.13202  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3777  ABC transporter ATP-binding protein  50.14 
 
 		 374 aa  350  2e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.439357  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3854  ABC transporter ATP-binding protein  50.69 
 
 		 374 aa  350  2e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0437  ABC transporter, permease  48.34 
 
 		 374 aa  349  4e-95  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3787  ABC transporter, ATP-binding protein  50.41 
 
 		 374 aa  349  4e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0019  ABC-2 type transporter  48.91 
 
 		 373 aa  349  4e-95  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3897  ABC transporter ATP-binding protein  50.14 
 
 		 374 aa  348  7e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1431  hypothetical protein  50.14 
 
 		 371 aa  348  7e-95  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0626  ABC-2 type transporter  50.68 
 
 		 373 aa  348  7e-95  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0080  ABC-2 type transporter  49.31 
 
 		 379 aa  348  9e-95  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0879828  normal  0.577589 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1040  ABC transporter, permease  47.98 
 
 		 374 aa  348  9e-95  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2634  ABC transporter, permease protein  47.71 
 
 		 374 aa  347  2e-94  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2777  ABC-type multidrug transport system, permease component  47.71 
 
 		 374 aa  347  2e-94  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0138  ABC transporter, permease  47.44 
 
 		 374 aa  346  4e-94  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0164  ABC transporter, permease protein  47.44 
 
 		 374 aa  346  4e-94  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0920361  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1308  ABC transporter, permease protein  47.44 
 
 		 374 aa  346  4e-94  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0557  hypothetical protein  49.46 
 
 		 379 aa  345  7e-94  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0209  ABC-2 type transporter  48.64 
 
 		 393 aa  342  5e-93  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.223728  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1742  ABC-2 type transporter  47.81 
 
 		 401 aa  342  8e-93  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00338931 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2949  ABC-2 type transporter  51.72 
 
 		 382 aa  342  9e-93  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0171  hypothetical protein  49.05 
 
 		 375 aa  342  9e-93  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.330821  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03287  hypothetical protein  49.59 
 
 		 374 aa  341  1e-92  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03335  predicted transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  49.59 
 
 		 374 aa  341  1e-92  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0229  ABC-2 type transporter  49.59 
 
 		 374 aa  341  1e-92  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3837  ABC transporter, ATP-binding protein  49.59 
 
 		 374 aa  341  1e-92  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5443  hypothetical protein  49.73 
 
 		 372 aa  340  2e-92  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00889571 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0501  ABC-2 type transporter  49.18 
 
 		 399 aa  340  2e-92  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3967  ABC transporter, ATP-binding protein  49.32 
 
 		 374 aa  340  2e-92  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4663  hypothetical protein  50.96 
 
 		 370 aa  340  2e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.736815  normal  0.215518 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4830  ABC transporter, ATP-binding protein  49.59 
 
 		 374 aa  340  2e-92  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0566  ABC-2 type transporter  49.18 
 
 		 399 aa  340  2e-92  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.222842  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3774  ABC transporter, ATP-binding protein  49.32 
 
 		 374 aa  340  2e-92  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3684  ABC transporter, ATP-binding protein  49.32 
 
 		 374 aa  339  4e-92  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0230  ABC-2 type transporter  49.32 
 
 		 374 aa  339  4e-92  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0537  ABC-2 type transporter  48.91 
 
 		 398 aa  338  9.999999999999999e-92  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5116  ABC-2 type transporter  49.59 
 
 		 370 aa  338  9.999999999999999e-92  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.75858  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5269  ABC-2 type transporter  49.86 
 
 		 370 aa  337  9.999999999999999e-92  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.139137  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5208  ABC transporter  49.86 
 
 		 370 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.325379  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0315  ABC-2 type transporter  51.23 
 
 		 374 aa  336  3.9999999999999995e-91  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6205  ABC-2 type transporter  48.08 
 
 		 374 aa  335  9e-91  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.261883 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00132  putative ABC transport protein  48.22 
 
 		 373 aa  334  2e-90  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5884  ABC-2 type transporter  49.17 
 
 		 374 aa  330  2e-89  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1613  ABC-2 type transporter  46.2 
 
 		 374 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3879  ABC transporter  48.71 
 
 		 350 aa  319  6e-86  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9218  ABC transporter  41.44 
 
 		 374 aa  302  6.000000000000001e-81  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.797463  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3215  hypothetical protein  44.47 
 
 		 374 aa  288  8e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3157  ABC transporter, inner membrane subunit  44.05 
 
 		 374 aa  279  6e-74  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  decreased coverage  0.00527406  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3895  ABC-2 type transporter  43.78 
 
 		 374 aa  276  3e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.505485  normal  0.0804287 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1136  hypothetical protein  32.53 
 
 		 381 aa  186  6e-46  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0811  ABC-2 type transporter  28.91 
 
 		 377 aa  152  8.999999999999999e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3272  ABC-2 type transporter  29.43 
 
 		 376 aa  147  3e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0977  ABC-2 type transporter  29.43 
 
 		 376 aa  145  1e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.750139 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1151  ABC-2 type transporter  30.08 
 
 		 376 aa  143  4e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.382414  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0655  hypothetical protein  30.71 
 
 		 376 aa  140  3.9999999999999997e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00126989 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0698  putative transmembrane protein  29.16 
 
 		 376 aa  138  1e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0165  hypothetical protein  28.18 
 
 		 381 aa  132  9e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0147217  normal  0.470058 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2826  hypothetical protein  27.99 
 
 		 376 aa  131  2.0000000000000002e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0054  ABC-2 type transporter  29.18 
 
 		 388 aa  130  4.0000000000000003e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3460  hypothetical protein  28.18 
 
 		 373 aa  129  7.000000000000001e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0810  ABC-2 type transporter  24.44 
 
 		 366 aa  128  2.0000000000000002e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1746  ABC efflux pump, inner membrane subunit  29.27 
 
 		 384 aa  126  5e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0249268  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2423  ABC-2 type transporter  28.41 
 
 		 366 aa  125  1e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0514426  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0113  ABC-2 type transporter  27.1 
 
 		 376 aa  125  1e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.816984  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3689  ABC-2 type transporter  29 
 
 		 384 aa  125  1e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.093618  normal  0.708678 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2920  ABC-2 type transporter  26.3 
 
 		 371 aa  124  2e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.827824  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1721  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  26.42 
 
 		 380 aa  124  2e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.759741  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0407  hypothetical protein  28.8 
 
 		 382 aa  124  4e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.10374  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0504  ABC-2 type transporter  27.37 
 
 		 368 aa  124  4e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0820778  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>