More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_3118 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_3118  30S ribosomal protein S6  100 
 
 		 152 aa  306  5e-83  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.158791  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1054  30S ribosomal protein S6  65.49 
 
 		 155 aa  179  9.000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.285791 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1197  30S ribosomal protein S6  65.49 
 
 		 155 aa  179  9.000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.358566  normal  0.0253087 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3487  30S ribosomal protein S6  68.38 
 
 		 158 aa  175  2e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.289777  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4637  30S ribosomal protein S6  74.55 
 
 		 134 aa  173  9e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.329942  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0741  30S ribosomal protein S6  69.64 
 
 		 145 aa  172  9.999999999999999e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.429444  normal  0.125363 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2303  30S ribosomal protein S6  72.07 
 
 		 151 aa  171  2.9999999999999996e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.458714  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1520  30S ribosomal protein S6  71.7 
 
 		 153 aa  169  2e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.162884  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2590  30S ribosomal protein S6  72.73 
 
 		 134 aa  169  2e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0306533 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2985  30S ribosomal protein S6  70.75 
 
 		 160 aa  166  7e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.620365 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2464  30S ribosomal protein S6  70.75 
 
 		 159 aa  166  1e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3815  30S ribosomal protein S6  71.7 
 
 		 153 aa  165  2e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.247483  normal  0.0901852 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2355  30S ribosomal protein S6  66.94 
 
 		 147 aa  164  5.9999999999999996e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.22878  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1352  30S ribosomal protein S6  57.03 
 
 		 132 aa  163  5.9999999999999996e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0105388  normal  0.169061 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3942  30S ribosomal protein S6  70.75 
 
 		 151 aa  161  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.262713 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4310  30S ribosomal protein S6  70.75 
 
 		 151 aa  161  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0751589 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4417  30S ribosomal protein S6  70.75 
 
 		 151 aa  160  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.316855 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0898  30S ribosomal protein S6  68.87 
 
 		 146 aa  160  5.0000000000000005e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0179425 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1691  30S ribosomal protein S6  69.81 
 
 		 139 aa  159  1e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1916  30S ribosomal protein S6  60.16 
 
 		 148 aa  159  1e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.136895  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0569  30S ribosomal protein S6  70.19 
 
 		 151 aa  159  1e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0455  30S ribosomal protein S6  70.19 
 
 		 148 aa  157  3e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0189276  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0461  30S ribosomal protein S6  70.19 
 
 		 156 aa  158  3e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2296  30S ribosomal protein S6  68.87 
 
 		 168 aa  156  9e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.220775  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0494  30S ribosomal protein S6  64.86 
 
 		 136 aa  155  1e-37  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5421  30S ribosomal protein S6  69.52 
 
 		 154 aa  154  3e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0549173  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3361  ribosomal protein S6  61.9 
 
 		 155 aa  149  1e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2512  30S ribosomal protein S6  55.93 
 
 		 126 aa  140  6e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.281012  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1416  30S ribosomal protein S6  60.19 
 
 		 120 aa  139  9.999999999999999e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1772  30S ribosomal protein S6  54.63 
 
 		 135 aa  135  2e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.468472  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0139  30S ribosomal protein S6  54.63 
 
 		 132 aa  135  2e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2186  30S ribosomal protein S6  52.83 
 
 		 117 aa  135  3.0000000000000003e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0891  30S ribosomal protein S6  55.66 
 
 		 131 aa  134  5e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.194189  normal  0.483607 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1045  30S ribosomal protein S6  53.77 
 
 		 117 aa  133  9.999999999999999e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.146697 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1622  30S ribosomal protein S6  52.83 
 
 		 117 aa  132  1.9999999999999998e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0541746  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1212  30S ribosomal protein S6  55.65 
 
 		 117 aa  131  3.9999999999999996e-30  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.134172  normal  0.709191 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3038  30S ribosomal protein S6  52.14 
 
 		 161 aa  127  4.0000000000000003e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.59116  normal  0.184677 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0414  30S ribosomal protein S6  52.83 
 
 		 160 aa  126  1.0000000000000001e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1900  30S ribosomal protein S6  49.53 
 
 		 122 aa  116  9e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.168881 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1512  30S ribosomal protein S6  50 
 
 		 158 aa  115  3e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.589185  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0695  30S ribosomal protein S6  37.14 
 
 		 109 aa  87.8  5e-17  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.308714  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1383  ribosomal protein S6  43.56 
 
 		 142 aa  87.4  6e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.760847  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0308  30S ribosomal protein S6  36.19 
 
 		 109 aa  87.4  7e-17  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.389439  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3592  30S ribosomal protein S6  37.6 
 
 		 130 aa  82.8  0.000000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.518893  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3435  30S ribosomal protein S6  37.6 
 
 		 130 aa  82.8  0.000000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0120822  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2446  30S ribosomal protein S6  39.02 
 
 		 134 aa  82.4  0.000000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0045402 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2824  30S ribosomal protein S6  39.02 
 
 		 134 aa  82.4  0.000000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.254018  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0794  30S ribosomal protein S6  36.72 
 
 		 130 aa  82  0.000000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00576366  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0371  30S ribosomal protein S6  38.1 
 
 		 131 aa  81.3  0.000000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.080214  normal  0.0305615 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0981  ribosomal protein S6  37.29 
 
 		 141 aa  80.9  0.000000000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2193  30S ribosomal protein S6  38.89 
 
 		 121 aa  81.3  0.000000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0141741  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0774  30S ribosomal protein S6  36.8 
 
 		 130 aa  80.9  0.000000000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000163074  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1818  30S ribosomal protein S6  38.89 
 
 		 124 aa  80.5  0.000000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.195181  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5229  30S ribosomal protein S6  39.81 
 
 		 120 aa  79.7  0.00000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2386  30S ribosomal protein S6  34.44 
 
 		 137 aa  80.1  0.00000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2395  30S ribosomal protein S6  38.89 
 
 		 121 aa  79  0.00000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3216  30S ribosomal protein S6  39.81 
 
 		 125 aa  79.3  0.00000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2569  30S ribosomal protein S6  39.81 
 
 		 125 aa  79.3  0.00000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0446  30S ribosomal protein S6  37.01 
 
 		 132 aa  78.6  0.00000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00453306 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3037  30S ribosomal protein S6  38.89 
 
 		 121 aa  78.6  0.00000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00243043  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0683  30S ribosomal protein S6  35.2 
 
 		 130 aa  77.8  0.00000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3784  30S ribosomal protein S6  35.2 
 
 		 130 aa  77.8  0.00000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3639  30S ribosomal protein S6  35.2 
 
 		 130 aa  77.8  0.00000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1228  30S ribosomal protein S6  37.96 
 
 		 125 aa  77.4  0.00000000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0123058 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1364  ribosomal protein S6  36.61 
 
 		 114 aa  77  0.00000000000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.151938  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0753  30S ribosomal protein S6  38.33 
 
 		 131 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000769486  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03778  30S ribosomal protein S6  33.59 
 
 		 133 aa  76.6  0.0000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3260  30S ribosomal protein S6  38.33 
 
 		 131 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000012398  hitchhiker  0.0000109167 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0687  30S ribosomal protein S6  38.33 
 
 		 131 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000703568  hitchhiker  0.000317476 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0911  30S ribosomal protein S6  35.85 
 
 		 124 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.320797 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2456  30S ribosomal protein S6  34.26 
 
 		 124 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0929827  normal  0.188014 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1786  30S ribosomal protein S6  34.26 
 
 		 124 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.58345  normal  0.226907 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3351  30S ribosomal protein S6  39.13 
 
 		 130 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000000274411  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1526  30S ribosomal protein S6  37.96 
 
 		 122 aa  75.1  0.0000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.153289  normal  0.214349 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0220  ribosomal protein S6  34.59 
 
 		 156 aa  75.1  0.0000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0415  30S ribosomal protein S6  38.05 
 
 		 143 aa  74.7  0.0000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0111096  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1404  30S ribosomal protein S6  34.91 
 
 		 124 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0497703  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1168  30S ribosomal protein S6  34.91 
 
 		 124 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.115875  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1897  30S ribosomal protein S6  34.91 
 
 		 124 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0154353  hitchhiker  0.0000000595408 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2416  30S ribosomal protein S6  34.91 
 
 		 124 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1895  30S ribosomal protein S6  34.91 
 
 		 124 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2252  30S ribosomal protein S6  34.91 
 
 		 124 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0770355  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2179  30S ribosomal protein S6  34.91 
 
 		 124 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0002  30S ribosomal protein S6  34.91 
 
 		 124 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.143432  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1326  SSU ribosomal protein S6P  36.27 
 
 		 131 aa  74.7  0.0000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.24985  normal  0.887492 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0888  SSU ribosomal protein S6P  34.19 
 
 		 135 aa  74.7  0.0000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2777  30S ribosomal protein S6  38.1 
 
 		 122 aa  74.7  0.0000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000778979  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0701  30S ribosomal protein S6  37.5 
 
 		 131 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000757321  hitchhiker  0.000144082 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2291  30S ribosomal protein S6  34.91 
 
 		 124 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0333903  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04067  30S ribosomal protein S6  34.92 
 
 		 131 aa  74.3  0.0000000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04029  hypothetical protein  34.92 
 
 		 131 aa  74.3  0.0000000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1400  30S ribosomal protein S6  34.91 
 
 		 124 aa  74.3  0.0000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3930  30S ribosomal protein S6  37.5 
 
 		 131 aa  74.3  0.0000000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5174  30S ribosomal protein S6  34.91 
 
 		 124 aa  74.3  0.0000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0582  30S ribosomal protein S6  35.19 
 
 		 119 aa  73.9  0.0000000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.147466  hitchhiker  0.0000000000000103542 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0515  30S ribosomal protein S6  37.39 
 
 		 130 aa  73.9  0.0000000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.38245  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1783  30S ribosomal protein S6  34.91 
 
 		 124 aa  73.6  0.0000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6205  30S ribosomal protein S6  34.91 
 
 		 124 aa  73.6  0.0000000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1811  30S ribosomal protein S6  34.91 
 
 		 124 aa  73.6  0.0000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.844657  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1874  30S ribosomal protein S6  34.91 
 
 		 124 aa  73.6  0.0000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>