201 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_2469 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_2469  porin  100 
 
 		 258 aa  509  1e-143  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.583463  decreased coverage  0.00325147 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2468  porin  86.05 
 
 		 248 aa  369  1e-101  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.750857  normal  0.029017 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2467  porin  82.69 
 
 		 250 aa  344  7e-94  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0722012 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2342  porin  48.67 
 
 		 232 aa  174  9.999999999999999e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1622  outer membrane protein Omp31  43.49 
 
 		 261 aa  173  1.9999999999999998e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2146  porin  41.85 
 
 		 255 aa  162  7e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.368485 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0423  outer membrane protein, 31 kDa  40.45 
 
 		 240 aa  156  2e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.91759  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0366  outer membrane protein Omp31  40.53 
 
 		 240 aa  155  5.0000000000000005e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.658451  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2343  porin  40.38 
 
 		 207 aa  139  4.999999999999999e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0475  porin  41.79 
 
 		 283 aa  139  6e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0556645  normal  0.835122 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2341  porin  40.72 
 
 		 236 aa  130  2.0000000000000002e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.608955  normal  0.297853 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1941  outer membrane protein  36.68 
 
 		 254 aa  128  8.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0133  porin  35.38 
 
 		 229 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.679493  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0239  putative outer membrane protein  36.5 
 
 		 452 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4312  porin  33.72 
 
 		 228 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0888  porin  39.47 
 
 		 239 aa  126  4.0000000000000003e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0164958 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0889  porin  35.45 
 
 		 254 aa  122  6e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.115506 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0188  outer membrane protein  33.96 
 
 		 453 aa  122  8e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0566764  normal  0.419379 
 
 
-
 
NC_004310  BR0971  outer membrane protein, putative  33.08 
 
 		 236 aa  119  3.9999999999999996e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0890  porin  34.07 
 
 		 255 aa  119  3.9999999999999996e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.113086 
 
 
-
 
NC_004310  BR0118  outer membrane protein, putative  32.82 
 
 		 230 aa  119  6e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.350872  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0115  putative outer membrane protein  32.82 
 
 		 230 aa  119  6e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0116  putative outer membrane protein  32.31 
 
 		 228 aa  117  9.999999999999999e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1001  porin  35.69 
 
 		 288 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.221202  normal  0.319403 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2815  outer membrane insertion C-terminal signal  34.48 
 
 		 997 aa  116  3e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.71405  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0419  porin  33.21 
 
 		 225 aa  115  5e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.647021 
 
 
-
 
NC_004310  BR0119  outer membrane protein, putative  32.31 
 
 		 228 aa  115  7.999999999999999e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.109473  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0748  putative outer membrane protein  39.19 
 
 		 447 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.272117 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5167  putative outer-membrane immunogenic protein precursor  33.71 
 
 		 236 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.165594  normal  0.271837 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4957  porin  35.02 
 
 		 302 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.100669 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7453  OmpA-like transmembrane domain-containing protein  33.75 
 
 		 710 aa  110  3e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0722321  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0873  porin  35.23 
 
 		 449 aa  109  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0140955  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4191  porin  35.03 
 
 		 277 aa  108  9.000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.572189  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3103  OmpA-like transmembrane region  34.85 
 
 		 236 aa  108  9.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.309907  normal  0.21357 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4615  outer membrane protein  37.23 
 
 		 449 aa  108  1e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3853  porin  34.72 
 
 		 240 aa  107  1e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4377  putative outer-membrane protein  35.88 
 
 		 245 aa  107  1e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.222597  normal  0.062323 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0132  porin  34.62 
 
 		 229 aa  107  2e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2199  putative outer membrane protein  36.23 
 
 		 237 aa  107  3e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.127788 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0096  outer membrane protein, 31 kDa  34.23 
 
 		 237 aa  107  3e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6698  porin  39.93 
 
 		 246 aa  106  4e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0108  porin  32.2 
 
 		 244 aa  106  4e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.243352  normal  0.0665959 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4826  OmpA-like transmembrane region  35.58 
 
 		 251 aa  106  5e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.997688  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1286  porin  34.63 
 
 		 288 aa  105  5e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5409  porin  35.84 
 
 		 279 aa  105  1e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.801907  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4568  porin  33.88 
 
 		 274 aa  104  1e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.170806  normal  0.117161 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5028  porin  33.88 
 
 		 274 aa  104  1e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.654238  normal  0.049005 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1415  porin  37.3 
 
 		 276 aa  104  2e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000118187 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4378  putative outer-membrane protein, putative secreted protein  36.36 
 
 		 212 aa  103  3e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.71482  normal  0.0231919 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2845  outer membrane autotransporter barrel  33.07 
 
 		 652 aa  103  4e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.171202  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2756  putative outer membrane protein  36.65 
 
 		 247 aa  102  6e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0841875  normal  0.703235 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3155  OmpA domain protein transmembrane region-containing protein  35.09 
 
 		 246 aa  102  8e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0244  outer membrane protein  33.59 
 
 		 241 aa  101  1e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3292  porin  34.88 
 
 		 296 aa  101  1e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.11718 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0513  porin  33.22 
 
 		 279 aa  101  1e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.263575  hitchhiker  0.00240622 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0866  putative outer-membrane immunogenic protein precursor  36.84 
 
 		 243 aa  101  1e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0649997 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6124  porin  34 
 
 		 288 aa  100  2e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5086  porin  34.18 
 
 		 274 aa  100  2e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.62657  normal  0.99686 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0795  putative outer membrane protein  35.37 
 
 		 454 aa  100  3e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.755835 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4523  putative outer-membrane protein precursor  37.16 
 
 		 237 aa  99.8  4e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2567  hypothetical protein  33.78 
 
 		 234 aa  99  7e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2756  putative outer membrane protein  37.55 
 
 		 241 aa  98.6  8e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3147  putative outer-membrane immunogenic protein precursor  31.84 
 
 		 206 aa  98.6  8e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0657581  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0125  porin  33.11 
 
 		 283 aa  98.6  8e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3299  porin  35.29 
 
 		 287 aa  98.6  9e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.466189  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2294  porin  35.56 
 
 		 250 aa  98.6  9e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4375  putative outer-membrane protein  30.77 
 
 		 251 aa  98.2  1e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.434769  normal  0.0632497 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3142  OmpA domain protein transmembrane region-containing protein  36.57 
 
 		 240 aa  98.2  1e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0841  putative outer membrane protein  32.21 
 
 		 242 aa  97.1  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.227029 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1292  porin  35.89 
 
 		 276 aa  97.1  3e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1214  omp25/ropB family outer membrane protein  26.16 
 
 		 300 aa  96.3  4e-19  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  1.09355e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4247  porin  35.43 
 
 		 278 aa  96.7  4e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.740101  normal  0.319403 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4777  porin  39.46 
 
 		 243 aa  95.9  5e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2527  putative outer-membrane immunogenic protein precursor  36.41 
 
 		 206 aa  95.9  6e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.442194 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2428  porin  31.27 
 
 		 284 aa  95.5  8e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.799812  normal  0.536449 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2145  outer membrane protein  36.13 
 
 		 274 aa  95.1  9e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.225218  normal  0.619069 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0474  porin  33.66 
 
 		 302 aa  95.1  9e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.682837  hitchhiker  0.00624927 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4443  porin  33.44 
 
 		 296 aa  94.7  1e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.877928  normal  0.484649 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3234  putative outer membrane protein  33.96 
 
 		 237 aa  95.1  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4907  porin  33.44 
 
 		 296 aa  94.7  1e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.279354  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1182  porin  33.45 
 
 		 289 aa  94.4  2e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.798606  normal  0.0724335 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2714  outer membrane protein  34.67 
 
 		 243 aa  94.4  2e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.155382  normal  0.61221 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0900  putative outer-membrane immunogenic protein precursor  32.38 
 
 		 207 aa  94  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.801875  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3164  porin  32.68 
 
 		 255 aa  94.4  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.393923  normal  0.238658 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3005  porin  33.55 
 
 		 290 aa  94  2e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1340  porin  33.45 
 
 		 289 aa  94.4  2e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2882  porin  33.55 
 
 		 290 aa  93.6  3e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.174474  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3108  porin  33.55 
 
 		 290 aa  93.6  3e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0475237 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7274  hypothetical protein  29.08 
 
 		 693 aa  93.6  3e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0925  porin  33.08 
 
 		 243 aa  92.8  4e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.743956  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4374  putative outer-membrane protein  33.48 
 
 		 248 aa  92.4  6e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0950016 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2745  porin  30.92 
 
 		 285 aa  92.4  7e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2972  porin  30.92 
 
 		 285 aa  92  8e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4335  porin  35.45 
 
 		 294 aa  91.7  1e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.274353 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5256  porin  33.1 
 
 		 287 aa  91.3  1e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1238  outer membrane protein, 31 kDa  34.82 
 
 		 234 aa  91.3  1e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0836  porin  39.6 
 
 		 254 aa  91.7  1e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0404918  normal  0.853535 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4560  outer membrane protein  32.2 
 
 		 238 aa  90.9  2e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.400354  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2780  hypothetical protein  31.09 
 
 		 570 aa  90.5  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.531202  normal  0.746954 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0278  OmpA-like transmembrane region  33.21 
 
 		 245 aa  90.9  2e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.670906  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>