172 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene WD0255 on replicon NC_002978
Organism: Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002978  WD0255  transcriptional regulator, putative  100 
 
 
308 aa  607  1e-173  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0623  transcriptional regulator, putative  85.15 
 
 
302 aa  463  1e-129  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0864444  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0626  transcriptional regulator, putative  73.56 
 
 
303 aa  427  1e-118  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0882771  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0508  transcriptional regulator, putative  55.89 
 
 
312 aa  268  1e-70  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0622  transcriptional regulator, putative  43.58 
 
 
303 aa  212  7e-54  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.436499  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0254  transcriptional regulator, putative  39.9 
 
 
215 aa  132  6.999999999999999e-30  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0564  hypothetical protein  47.27 
 
 
111 aa  87  3e-16  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1892  XRE family transcriptional regulator  33.93 
 
 
120 aa  64.7  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0540  XRE family transcriptional regulator  33.93 
 
 
120 aa  64.7  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0675  XRE family transcriptional regulator  33.93 
 
 
120 aa  64.7  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00325967 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1909  XRE family transcriptional regulator  33.04 
 
 
123 aa  62  0.00000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1232  XRE family transcriptional regulator  32.17 
 
 
126 aa  60.5  0.00000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.236768  normal  0.265611 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1388  XRE family transcriptional regulator  31.53 
 
 
119 aa  60.5  0.00000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.346177 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2775  putative transcriptional regulator  32.17 
 
 
123 aa  60.5  0.00000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9533  transcriptional regulator Cro/CI family  29.37 
 
 
141 aa  57.8  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.140693  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1349  immunity repressor protein  32.5 
 
 
144 aa  57.4  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1627  XRE family transcriptional regulator  25.57 
 
 
300 aa  56.6  0.0000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000332957  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3177  XRE family transcriptional regulator  33.63 
 
 
142 aa  56.2  0.0000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0647326  normal  0.0138701 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_67  hypothetical protein  34.29 
 
 
72 aa  55.1  0.000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0894  transcriptional regulator  28.15 
 
 
215 aa  54.7  0.000002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1458  transcriptional regulator, XRE family  31.68 
 
 
114 aa  54.7  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7073  transcriptional regulator  31.67 
 
 
138 aa  54.7  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5594  XRE family transcriptional regulator  45 
 
 
92 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5414  XRE family transcriptional regulator  45 
 
 
92 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.207419  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0154  helix-turn-helix domain-containing protein  30.97 
 
 
134 aa  54.7  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0066  XRE family transcriptional regulator  29.46 
 
 
146 aa  54.3  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0319384  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2958  transcriptional regulator HTH family  31.25 
 
 
134 aa  54.3  0.000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0753  XRE family transcriptional regulator  28.81 
 
 
135 aa  54.3  0.000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.057083  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6504  transcriptional regulator, XRE family  29.2 
 
 
152 aa  53.5  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0230  transcriptional regulator, XRE family  29.17 
 
 
137 aa  53.5  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.737224  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2429  XRE family transcriptional regulator  25 
 
 
143 aa  53.5  0.000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.214939  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2806  putative transcriptional regulatory protein  29.82 
 
 
131 aa  52.8  0.000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1555  DNA-binding protein  32.86 
 
 
72 aa  52.4  0.00001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00000236293  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3125  XRE family transcriptional regulator  29.73 
 
 
162 aa  52  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.412901  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0447  transcriptional regulator, XRE family  28.69 
 
 
139 aa  51.2  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4795  transcriptional regulator, XRE family  30 
 
 
134 aa  51.6  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0939257  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2456  XRE family transcriptional regulator  27.48 
 
 
134 aa  51.6  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.214066  normal  0.20041 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2160  transcriptional regulator, XRE family  26.72 
 
 
134 aa  51.6  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.468793  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1118  putative transcriptional regulator  27.61 
 
 
213 aa  50.8  0.00003  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3777  XRE family transcriptional regulator  31.62 
 
 
125 aa  50.8  0.00003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0903  helix-turn-helix domain-containing protein  22.01 
 
 
255 aa  50.8  0.00003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000193278  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0591  XRE family transcriptional regulator  30.43 
 
 
113 aa  50.8  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0237  XRE family transcriptional regulator  27.87 
 
 
139 aa  50.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0971  transcriptional regulator, XRE family  29.52 
 
 
135 aa  50.4  0.00004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.508784  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1168  transcriptional regulator, XRE family  29.52 
 
 
142 aa  50.4  0.00004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.092853  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1041  helix-turn-helix domain-containing protein  29.52 
 
 
142 aa  50.4  0.00004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0368815 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3242  XRE family transcriptional regulator  43.33 
 
 
149 aa  50.1  0.00005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0595  XRE family transcriptional regulator  27.87 
 
 
139 aa  50.1  0.00005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.958783  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0885  XRE family transcriptional regulator  40.98 
 
 
83 aa  49.7  0.00006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0019  XRE family transcriptional regulator  25.18 
 
 
139 aa  49.3  0.00007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0558597 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0051  XRE family transcriptional regulator  27.73 
 
 
138 aa  49.3  0.00007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3686  transcriptional regulator, XRE family  33.75 
 
 
133 aa  49.3  0.00009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1419  Cro/CI family transcriptional regulator  41.94 
 
 
142 aa  48.5  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3208  transcriptional regulator, XRE family  32.56 
 
 
141 aa  48.5  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3762  transcriptional regulator, XRE family  30.33 
 
 
135 aa  48.5  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.117326  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1668  transcriptional regulator, XRE family  25.54 
 
 
256 aa  48.9  0.0001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000231765  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2104  transcriptional regulator, XRE family  25 
 
 
174 aa  48.9  0.0001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1221  XRE family transcriptional regulator  26.92 
 
 
173 aa  48.5  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000921846 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1827  XRE family transcriptional regulator  25.6 
 
 
252 aa  47.8  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0400601  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2259  transcriptional regulator, XRE family  23.27 
 
 
255 aa  48.1  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00208232 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2696  transcriptional regulator, XRE family  29.41 
 
 
117 aa  48.1  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0473  XRE family transcriptional regulator  28.33 
 
 
138 aa  48.1  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.54052 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0026  XRE family transcriptional regulator  24.46 
 
 
139 aa  48.1  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0422  transcriptional regulator  38.1 
 
 
146 aa  48.1  0.0002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3268  XRE family transcriptional regulator  37.66 
 
 
104 aa  47.8  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6091  transcriptional regulator, XRE family  28.89 
 
 
152 aa  48.1  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1563  transcriptional regulator, XRE family  29.81 
 
 
135 aa  48.1  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6981  transcriptional regulator, XRE family  35.48 
 
 
245 aa  48.1  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1529  transcriptional regulator, XRE family  37.31 
 
 
139 aa  47.4  0.0003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.17746 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0443  transcriptional regulator  28.93 
 
 
140 aa  47.4  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  unclonable  0.0000554716  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1061  XRE family transcriptional regulator  36.51 
 
 
155 aa  47.4  0.0003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.161431  normal  0.803902 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2142  XRE family transcriptional regulator  38.24 
 
 
175 aa  47.4  0.0003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2371  transcriptional regulator, XRE family  36.25 
 
 
165 aa  47.4  0.0003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.111191  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2727  transcriptional regulator, XRE family  26.42 
 
 
133 aa  47.4  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0082  DNA-binding protein  38.71 
 
 
67 aa  47.4  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.815457  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4530  XRE family transcriptional regulator  34.62 
 
 
152 aa  47.4  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5326  transcriptional regulator, XRE family  37.93 
 
 
68 aa  47.4  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.134062 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0169  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 
141 aa  47.4  0.0003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6040  transcriptional regulator, XRE family  28.23 
 
 
134 aa  47.4  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.591688 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6290  transcriptional regulator, XRE family  26.72 
 
 
121 aa  47.8  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5234  DNA-binding protein  38.71 
 
 
67 aa  47.8  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000302998 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0073  DNA-binding protein  38.71 
 
 
67 aa  47  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0074  DNA-binding protein  38.71 
 
 
67 aa  47  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0070  transcriptional regulator  38.71 
 
 
67 aa  47  0.0004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0070  transcriptional regulator  38.71 
 
 
67 aa  47  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0074  DNA-binding protein  38.71 
 
 
67 aa  47  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0083  DNA-binding protein  38.71 
 
 
67 aa  47  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000440854 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0551  transcriptional regulator, XRE family  40.35 
 
 
210 aa  47  0.0004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.401249  hitchhiker  0.0000933135 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4237  transcriptional regulator, XRE family  36.76 
 
 
140 aa  47  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.55821  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0086  DNA-binding protein  38.71 
 
 
67 aa  47  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.786766  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7198  transcriptional regulator, XRE family  28.23 
 
 
134 aa  47  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0637638 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3622  XRE family transcriptional regulator  26.83 
 
 
147 aa  47  0.0004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1815  XRE family transcriptional regulator  26.55 
 
 
137 aa  47  0.0004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0843474  normal  0.166838 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0267  XRE family transcriptional regulator  26.61 
 
 
118 aa  46.6  0.0005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.257195  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1502  XRE family transcriptional regulator  27.52 
 
 
136 aa  46.6  0.0005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.662366  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3695  XRE family transcriptional regulator  29.57 
 
 
397 aa  46.6  0.0005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3746  XRE family transcriptional regulator  29.57 
 
 
397 aa  46.6  0.0005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1221  XRE family transcriptional regulator  29.73 
 
 
127 aa  46.6  0.0005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.309245  normal  0.121494 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2959  transcriptional regulator, XRE family  31.97 
 
 
141 aa  46.6  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.676432  normal  0.753241 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0278  XRE family transcriptional regulator  32.1 
 
 
145 aa  46.2  0.0007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>