More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_5751 on replicon NC_012792
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012792  Vapar_5751  hypothetical protein  100 
 
 		 327 aa  648    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0796477  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0843  hypothetical protein  79.01 
 
 		 324 aa  529  1e-149  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.593129  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2294  hypothetical protein  57.72 
 
 		 326 aa  351  1e-95  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.0000131413  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5273  extra-cytoplasmic solute receptor  52.19 
 
 		 322 aa  349  4e-95  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.320147  normal  0.0608959 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4641  hypothetical protein  57.52 
 
 		 327 aa  345  6e-94  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.647286  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  46.56 
 
 		 328 aa  297  2e-79  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0596  hypothetical protein  46.48 
 
 		 336 aa  293  3e-78  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4323  hypothetical protein  48.62 
 
 		 344 aa  287  2e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.957408  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5112  hypothetical protein  44.37 
 
 		 325 aa  287  2e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386337  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5741  hypothetical protein  50.17 
 
 		 339 aa  286  2.9999999999999996e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.286317  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2776  hypothetical protein  45.45 
 
 		 332 aa  286  4e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.918758  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4286  extra-cytoplasmatic solute receptor  47.32 
 
 		 353 aa  283  2.0000000000000002e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.85012 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  46.18 
 
 		 327 aa  283  4.0000000000000003e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0453  hypothetical protein  45.78 
 
 		 345 aa  283  4.0000000000000003e-75  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.533416  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0462  hypothetical protein  45.78 
 
 		 345 aa  282  5.000000000000001e-75  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.170176 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  46.23 
 
 		 328 aa  282  6.000000000000001e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  46.33 
 
 		 325 aa  281  7.000000000000001e-75  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  46.33 
 
 		 327 aa  281  9e-75  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4385  hypothetical protein  43.79 
 
 		 323 aa  280  2e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.944912  normal  0.325254 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3884  hypothetical protein  45.2 
 
 		 328 aa  279  5e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0489  hypothetical protein  44.48 
 
 		 344 aa  277  2e-73  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3614  hypothetical protein  46.74 
 
 		 355 aa  276  3e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.380289  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0284  hypothetical protein  46.74 
 
 		 323 aa  275  8e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4004  hypothetical protein  46.31 
 
 		 339 aa  274  1.0000000000000001e-72  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.506172  normal  0.0371737 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3949  hypothetical protein  46.58 
 
 		 339 aa  274  1.0000000000000001e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187886  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1017  hypothetical protein  45.51 
 
 		 304 aa  273  2.0000000000000002e-72  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.221773 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5221  Bug family extra-cytoplasmic solute receptor  43.13 
 
 		 347 aa  273  2.0000000000000002e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.334182 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0779  hypothetical protein  45.45 
 
 		 360 aa  273  2.0000000000000002e-72  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0080  hypothetical protein  43.5 
 
 		 343 aa  274  2.0000000000000002e-72  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.141434 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3966  hypothetical protein  43.34 
 
 		 356 aa  271  8.000000000000001e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0682449  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  43.38 
 
 		 330 aa  271  8.000000000000001e-72  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1197  hypothetical protein  47.47 
 
 		 324 aa  271  1e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  43.33 
 
 		 330 aa  270  2e-71  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2999  hypothetical protein  46.03 
 
 		 324 aa  270  2e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.272534 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5035  hypothetical protein  42.95 
 
 		 339 aa  270  2.9999999999999997e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.401942  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0801  hypothetical protein  45.48 
 
 		 323 aa  270  2.9999999999999997e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.618864  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3798  hypothetical protein  44.14 
 
 		 338 aa  269  5e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.366926  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  43.38 
 
 		 328 aa  268  8.999999999999999e-71  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6217  hypothetical protein  46.98 
 
 		 322 aa  268  1e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0641942  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  43.38 
 
 		 328 aa  268  1e-70  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5932  hypothetical protein  43.35 
 
 		 328 aa  267  2e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0842  hypothetical protein  42.11 
 
 		 325 aa  266  2.9999999999999995e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4957  hypothetical protein  46.69 
 
 		 331 aa  266  2.9999999999999995e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0102082  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5895  hypothetical protein  42.01 
 
 		 324 aa  266  4e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0219552  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0823  hypothetical protein  38.82 
 
 		 325 aa  265  5.999999999999999e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0213458 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2095  hypothetical protein  48.46 
 
 		 324 aa  265  7e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1161  hypothetical protein  43.83 
 
 		 323 aa  265  7e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.334484  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3792  extra-cytoplasmic solute receptor  45.4 
 
 		 326 aa  265  8e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6278  hypothetical protein  45.67 
 
 		 322 aa  265  8e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000130922  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1019  hypothetical protein  44.38 
 
 		 334 aa  265  1e-69  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.100584  normal  0.433272 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6145  hypothetical protein  45.54 
 
 		 332 aa  264  1e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.8095  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6131  hypothetical protein  46.1 
 
 		 314 aa  264  2e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.554613  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1908  hypothetical protein  42.24 
 
 		 336 aa  263  2e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.781517  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0969  putative lipoprotein  45.96 
 
 		 322 aa  264  2e-69  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.288033  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3163  hypothetical protein  45.61 
 
 		 334 aa  264  2e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000218374 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3145  hypothetical protein  44.22 
 
 		 333 aa  263  2e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.261814  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3678  hypothetical protein  42.99 
 
 		 327 aa  263  3e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1026  hypothetical protein  45.82 
 
 		 333 aa  263  3e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.346833  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4389  hypothetical protein  42.33 
 
 		 321 aa  263  3e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.907682 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2777  hypothetical protein  44.3 
 
 		 322 aa  262  4.999999999999999e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.89737  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2991  hypothetical protein  43.46 
 
 		 333 aa  262  6e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.36978  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  42.72 
 
 		 331 aa  262  6e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3664  hypothetical protein  44.9 
 
 		 324 aa  262  6.999999999999999e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5894  extra-cytoplasmic solute receptor  44.31 
 
 		 358 aa  261  1e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2113  hypothetical protein  42.3 
 
 		 318 aa  260  2e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.723108  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1635  hypothetical protein  41.44 
 
 		 333 aa  260  2e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.345549  normal  0.902401 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5733  hypothetical protein  44.44 
 
 		 341 aa  261  2e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.558781 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0143  hypothetical protein  45 
 
 		 330 aa  260  3e-68  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.627963 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0161  hypothetical protein  45 
 
 		 330 aa  260  3e-68  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3470  hypothetical protein  43.3 
 
 		 330 aa  259  3e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4047  extra-cytoplasmic solute receptor  40.89 
 
 		 329 aa  259  3e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0364236  normal  0.64466 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2898  hypothetical protein  40.98 
 
 		 334 aa  260  3e-68  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.000220815  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2753  hypothetical protein  41.98 
 
 		 327 aa  259  3e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0378897 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1906  hypothetical protein  43.59 
 
 		 325 aa  259  4e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.375062  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2444  hypothetical protein  44.37 
 
 		 334 aa  259  5.0000000000000005e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0828  hypothetical protein  42.67 
 
 		 335 aa  259  5.0000000000000005e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.136447  normal  0.157407 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0038  hypothetical protein  43.34 
 
 		 332 aa  259  5.0000000000000005e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.914226 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1818  hypothetical protein  47.35 
 
 		 326 aa  259  6e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00429449 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4081  hypothetical protein  46.31 
 
 		 335 aa  259  6e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1083  hypothetical protein  39.01 
 
 		 337 aa  259  6e-68  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.371432  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2092  twin-arginine translocation pathway signal  40.95 
 
 		 331 aa  258  7e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.061194  normal  0.4929 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0994  hypothetical protein  41.39 
 
 		 341 aa  258  8e-68  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1078  hypothetical protein  41.39 
 
 		 344 aa  258  9e-68  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.058258  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0112  hypothetical protein  42.28 
 
 		 338 aa  258  1e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.25815  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2765  hypothetical protein  41.81 
 
 		 332 aa  258  1e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.555979  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0125  hypothetical protein  42.14 
 
 		 332 aa  258  1e-67  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.232724  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2872  hypothetical protein  41.61 
 
 		 334 aa  257  2e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.446965 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4458  hypothetical protein  43.97 
 
 		 332 aa  257  2e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.60746  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4511  hypothetical protein  43.18 
 
 		 337 aa  257  2e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4501  extra-cytoplasmic solute receptor  42.81 
 
 		 327 aa  256  3e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.034407  normal  0.0507087 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3548  hypothetical protein  44.63 
 
 		 334 aa  256  4e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0576712  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5278  extra-cytoplasmic solute receptor  42.03 
 
 		 331 aa  256  4e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.777708  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  41.95 
 
 		 339 aa  256  5e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2485  hypothetical protein  40 
 
 		 346 aa  256  5e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0644524  normal  0.0188147 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5438  hypothetical protein  43.35 
 
 		 326 aa  255  7e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0300  hypothetical protein  43.62 
 
 		 337 aa  255  8e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.911939  normal  0.367492 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4073  extra-cytoplasmic solute receptor  42.99 
 
 		 332 aa  255  9e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000509768  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3665  hypothetical protein  43.49 
 
 		 326 aa  255  9e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.155683  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3371  twin-arginine translocation pathway signal  45.42 
 
 		 341 aa  255  9e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1992  hypothetical protein  44.97 
 
 		 317 aa  255  9e-67  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.108122  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>