More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_5526 on replicon NC_012792
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012792  Vapar_5526  ABC transporter domain protein  100 
 
 		 587 aa  1174    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.776813  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1490  transporter, putative  45.66 
 
 		 621 aa  494  9.999999999999999e-139  Brucella suis 1330  Bacteria  decreased coverage  0.00776533  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4936  ABC transporter  45.63 
 
 		 606 aa  492  9.999999999999999e-139  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00595955  normal  0.404726 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1444  putative transporter  45.66 
 
 		 621 aa  495  9.999999999999999e-139  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3300  ABC transporter component  45.14 
 
 		 629 aa  479  1e-134  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0407  ABC transporter domain protein  43.52 
 
 		 609 aa  476  1e-133  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1678  ABC transporter  44.42 
 
 		 623 aa  473  1e-132  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3806  ABC transporter domain protein  39.63 
 
 		 621 aa  442  1e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.953277 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4135  ABC transporter domain protein  40.18 
 
 		 616 aa  436  1e-121  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.343456 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4264  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  42.91 
 
 		 590 aa  433  1e-120  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.26783  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1832  ABC transporter-like  35.12 
 
 		 583 aa  313  6.999999999999999e-84  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0566621 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4132  ABC transporter-like  34.01 
 
 		 630 aa  308  2.0000000000000002e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.588155 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4731  ABC transporter-like  34.37 
 
 		 579 aa  307  3e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.612585  normal  0.660257 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1326  ABC transporter domain protein  33.91 
 
 		 586 aa  301  2e-80  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0429  ABC transporter related  35.26 
 
 		 621 aa  293  4e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0620153  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0331  ABC transporter domain protein  34.13 
 
 		 614 aa  292  1e-77  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.441162  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0346  ABC transporter domain protein  34.13 
 
 		 614 aa  292  1e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.274021 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1667  putative ABC transporter (fused ATP-binding and permease components)  30.17 
 
 		 588 aa  288  2e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0638  ABC transporter  33.53 
 
 		 610 aa  287  2.9999999999999996e-76  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.226962  normal  0.140923 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0735  ABC transporter-like  34.55 
 
 		 613 aa  286  1.0000000000000001e-75  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.678208  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0369  ABC transporter-like protein  33.63 
 
 		 636 aa  286  1.0000000000000001e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.455646  normal  0.778619 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3843  ABC transporter  33.33 
 
 		 578 aa  282  1e-74  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2461  ABC transporter  31.92 
 
 		 606 aa  282  1e-74  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.142821  normal  0.345293 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0327  ABC transporter  32.84 
 
 		 589 aa  281  2e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0336  ABC transporter  32.84 
 
 		 589 aa  282  2e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.294433  normal  0.265185 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0456  ATP-binding transport ABC transporter protein  32.64 
 
 		 614 aa  281  3e-74  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.709933  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1064  ABC transporter domain protein  32.73 
 
 		 593 aa  280  4e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0822  ABC transporter-like  31.96 
 
 		 575 aa  278  2e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.296195  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4551  ABC transporter, ATP-binding protein  34.09 
 
 		 577 aa  276  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.859512  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0388  ABC transporter  32.09 
 
 		 589 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2698  ABC transporter-like  32.09 
 
 		 589 aa  274  3e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0409  ABC transporter  32.09 
 
 		 589 aa  274  3e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0847307  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3507  ABC transporter, fused ATPase and inner membrane subunits  31.72 
 
 		 589 aa  272  1e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.311803  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0737  ABC transporter-like  32.53 
 
 		 614 aa  269  1e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4229  ABC transporter:ABC transporter, N-terminal  33.27 
 
 		 572 aa  268  2e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0152  ABC transporter domain protein  30.89 
 
 		 590 aa  264  3e-69  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0199241  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0552  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  29.79 
 
 		 587 aa  261  3e-68  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0707  ABC transporter domain protein  29.79 
 
 		 587 aa  261  3e-68  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000255653 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0312  ABC transporter  31.72 
 
 		 589 aa  256  8e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.221904  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0233  putative ABC transporter (fused ATP-binding and permease components)  31.13 
 
 		 651 aa  254  3e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.525703  normal  0.627984 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4366  ABC transporter related  31.91 
 
 		 660 aa  254  4.0000000000000004e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2775  ABC transporter  31.11 
 
 		 577 aa  251  2e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3991  ABC transporter related  31.77 
 
 		 642 aa  249  8e-65  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4485  ABC transporter  31.09 
 
 		 712 aa  247  4.9999999999999997e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.991125  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1048  ABC transporter, fused ATPase and inner membrane subunits  31.74 
 
 		 599 aa  247  4.9999999999999997e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.518844  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4948  ABC transporter domain protein  31.09 
 
 		 704 aa  247  6e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.44049 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0863  ABC transporter domain protein  34.65 
 
 		 602 aa  246  6e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.207874  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4198  ABC transporter related  31.59 
 
 		 591 aa  245  9.999999999999999e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00760523  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5001  ABC transporter domain protein  30.55 
 
 		 704 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.650966 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3684  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  31.5 
 
 		 588 aa  245  1.9999999999999999e-63  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3430  ABC transporter  30.74 
 
 		 708 aa  244  3e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.18221 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3009  ABC transporter, ATP-binding protein  31.31 
 
 		 588 aa  244  3e-63  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3741  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  31.51 
 
 		 588 aa  244  3.9999999999999997e-63  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.699706  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3576  ABC transporter domain protein  30.52 
 
 		 583 aa  244  3.9999999999999997e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0754799  hitchhiker  0.00000117282 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2731  ABC transporter, ATP-binding protein  31.51 
 
 		 588 aa  244  5e-63  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3711  ABC transporter, ATP-binding protein  31.51 
 
 		 588 aa  244  5e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1771  ABC transporter, ATP-binding protein  31.51 
 
 		 588 aa  244  5e-63  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.425769  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2783  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  31.51 
 
 		 584 aa  243  5e-63  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3221  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  31.51 
 
 		 588 aa  244  5e-63  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0382  ABC efflux pump, fused ATPase and inner membrane subunits  29.96 
 
 		 592 aa  242  1e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.260963  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1179  ABC transporter domain protein  30.34 
 
 		 595 aa  242  1e-62  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0559  ABC transporter  30.73 
 
 		 588 aa  238  2e-61  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.393268  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0163  Sigma 54 interacting domain protein  30.53 
 
 		 666 aa  238  3e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1740  ABC transporter  30.06 
 
 		 712 aa  235  2.0000000000000002e-60  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000825117 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07140  ABC-type transport system permease and ATPase component  32.93 
 
 		 588 aa  234  3e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.377405  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4654  ABC transporter domain protein  28.7 
 
 		 713 aa  233  5e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.435698 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3329  ABC transporter domain protein  32.97 
 
 		 560 aa  233  7.000000000000001e-60  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.46957  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0667  ABC transporter domain protein  29.9 
 
 		 596 aa  233  8.000000000000001e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0157  ABC transporter related  29.58 
 
 		 674 aa  233  9e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0036118 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0799  ABC transporter related  30.39 
 
 		 701 aa  232  1e-59  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0267156 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1219  ABC transporter  30.43 
 
 		 595 aa  229  9e-59  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1852  ABC transporter  29.94 
 
 		 596 aa  226  7e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0298007  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2634  ABC transporter domain protein  30.62 
 
 		 563 aa  224  3e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0401  putative ABC transporter ATP-binding protein  28.98 
 
 		 549 aa  216  8e-55  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0762  ABC transporter domain protein  30.37 
 
 		 557 aa  214  3.9999999999999995e-54  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6112  ABC transporter  31.66 
 
 		 603 aa  212  2e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.863799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0999  ABC transporter domain protein  30.34 
 
 		 557 aa  210  7e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1864  ABC transporter  29.69 
 
 		 602 aa  200  6e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.653168 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3285  ABC transporter domain protein  29.11 
 
 		 553 aa  198  2.0000000000000003e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3498  ABC transporter  29.48 
 
 		 615 aa  197  5.000000000000001e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.661743 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2240  ABC transporter  29.28 
 
 		 626 aa  195  2e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1710  ABC transporter  28.94 
 
 		 605 aa  194  4e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.732673  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4019  ABC transporter  28.01 
 
 		 606 aa  189  1e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0431407  normal  0.349748 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1677  inner membrane ABC transporter ATP-binding protein  24.06 
 
 		 561 aa  185  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2161  ABC transporter related  23.67 
 
 		 561 aa  183  8.000000000000001e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.918171 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1686  inner membrane ABC transporter ATP-binding protein yddA  23.67 
 
 		 561 aa  183  8.000000000000001e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2150  ABC transporter related protein  23.67 
 
 		 561 aa  183  9.000000000000001e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.675746  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1581  inner membrane ABC transporter ATP-binding protein  23.67 
 
 		 561 aa  182  1e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.477042  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2109  inner membrane ABC transporter ATP-binding protein  23.67 
 
 		 561 aa  182  2e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.356794  normal  0.522774 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1469  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  24.6 
 
 		 598 aa  181  2.9999999999999997e-44  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01454  fused predicted multidrug transporter subunits of ABC superfamily: membrane component/ATP-binding component  23.47 
 
 		 561 aa  180  5.999999999999999e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01467  hypothetical protein  23.47 
 
 		 561 aa  180  5.999999999999999e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2854  ABC transporter-like protein  27.52 
 
 		 634 aa  180  7e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2898  ABC transporter  27.52 
 
 		 636 aa  180  7e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.273614  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1760  inner membrane ABC transporter ATP-binding protein  23.47 
 
 		 561 aa  179  1e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0603  ABC transporter domain protein  29.21 
 
 		 596 aa  179  1e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2885  ABC transporter  28.08 
 
 		 636 aa  179  2e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.306309  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1330  ABC transporter domain protein  24.55 
 
 		 663 aa  178  3e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1359  ABC transporter domain protein  24.55 
 
 		 663 aa  178  3e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00164606 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3410  ABC transporter  28.35 
 
 		 635 aa  174  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.362077  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>