More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_3286 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_3286  histidine kinase  100 
 
 		 450 aa  898    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00148382  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1952  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  64.01 
 
 		 451 aa  495  1e-139  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.536058 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1753  histidine kinase  63.55 
 
 		 451 aa  492  9.999999999999999e-139  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1144  histidine kinase  46.12 
 
 		 475 aa  345  8.999999999999999e-94  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.931606  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1464  histidine kinase  46.45 
 
 		 469 aa  323  3e-87  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.173941  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1286  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.5 
 
 		 441 aa  212  1e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0460995  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3218  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.5 
 
 		 441 aa  211  2e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.0024043  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2734  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.8 
 
 		 426 aa  206  5e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2207  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.77 
 
 		 461 aa  206  9e-52  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6258  two component sensor kinase  32.58 
 
 		 440 aa  189  5.999999999999999e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0553015  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3975  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.31 
 
 		 438 aa  183  4.0000000000000006e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.242416  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4962  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.03 
 
 		 448 aa  183  5.0000000000000004e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.480861  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3095  histidine kinase  33.71 
 
 		 457 aa  182  1e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0228  sensor histidine kinase  31.52 
 
 		 446 aa  181  2e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0558  sensor histidine kinase  33.56 
 
 		 453 aa  181  2e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0785  sensor histidine kinase  33.56 
 
 		 453 aa  181  2e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.190623  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0209  sensor histidine kinase  31.52 
 
 		 446 aa  181  2e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0670  sensor histidine kinase  33.56 
 
 		 453 aa  181  2e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.539179  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1623  sensor histidine kinase  33.56 
 
 		 453 aa  181  2e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0767878  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3814  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.69 
 
 		 438 aa  179  1e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.823775  normal  0.178217 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6028  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.71 
 
 		 450 aa  178  2e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0315018 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0904  sensor histidine kinase  34.99 
 
 		 454 aa  177  3e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.616336  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1976  sensor histidine kinase  33.11 
 
 		 453 aa  176  7e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2073  sensor histidine kinase  33.11 
 
 		 453 aa  176  7e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5169  sensor histidine kinase  33.33 
 
 		 451 aa  175  9.999999999999999e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0489  sensor histidine kinase  33.11 
 
 		 722 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.620999  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3086  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.92 
 
 		 438 aa  171  2e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3149  sensor histidine kinase  38.69 
 
 		 440 aa  171  3e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.28591  hitchhiker  0.000661771 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3398  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.63 
 
 		 451 aa  170  4e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3444  histidine kinase  33.41 
 
 		 464 aa  171  4e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.032757 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3283  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.48 
 
 		 456 aa  168  2e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0188318 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0223  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.47 
 
 		 445 aa  167  2.9999999999999998e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.127602  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5393  two-component signal transduction histidine kinase  31.72 
 
 		 450 aa  165  1.0000000000000001e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.983917  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2155  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.45 
 
 		 449 aa  161  2e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1601  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.47 
 
 		 456 aa  151  3e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.698259 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0576  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.99 
 
 		 458 aa  147  6e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.176736 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4875  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.08 
 
 		 461 aa  145  1e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.699508  normal  0.275506 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6336  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.52 
 
 		 450 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.337613  normal  0.66239 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5325  sensor histidine kinase  32.29 
 
 		 444 aa  139  8.999999999999999e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.769735  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2816  sensor histidine kinase  29.3 
 
 		 449 aa  138  2e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1254  hypothetical protein  31.13 
 
 		 471 aa  137  4e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1253  hypothetical protein  30.87 
 
 		 471 aa  135  9.999999999999999e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5797  two-component regulatory system sensory histidine kinase  37.16 
 
 		 443 aa  135  9.999999999999999e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.14729 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0504  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.09 
 
 		 450 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4357  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.94 
 
 		 458 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000114485  unclonable  0.00000640449 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2755  sensor protein qseC  31.53 
 
 		 454 aa  134  3.9999999999999996e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.276799  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1359  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.79 
 
 		 452 aa  133  6.999999999999999e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.166082  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4874  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.1 
 
 		 458 aa  133  7.999999999999999e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000686699  hitchhiker  0.00000000293708 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1184  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.86 
 
 		 480 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2385  histidine kinase  31.9 
 
 		 442 aa  131  3e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.247211  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2595  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.98 
 
 		 441 aa  131  3e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.580815  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5362  histidine kinase  33.42 
 
 		 455 aa  130  6e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0042038  normal  0.08787 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4905  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.35 
 
 		 445 aa  130  7.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.121062  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1536  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.77 
 
 		 449 aa  129  8.000000000000001e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3690  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.44 
 
 		 456 aa  129  9.000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000509903  normal  0.82327 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0470  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.54 
 
 		 453 aa  128  3e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4925  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.15 
 
 		 455 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000806381  normal  0.0598737 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1076  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.3 
 
 		 444 aa  127  4.0000000000000003e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.72241  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3442  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.15 
 
 		 455 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000282703  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4358  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.82 
 
 		 446 aa  126  7e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.66153  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3989  sensor protein QseC  30.23 
 
 		 452 aa  126  9e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.302589  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1373  sensor protein qseC  29.83 
 
 		 478 aa  126  9e-28  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000622972  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0767  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.33 
 
 		 461 aa  125  1e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000842214  hitchhiker  0.00217616 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1782  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.94 
 
 		 466 aa  126  1e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1313  sensor protein  29.56 
 
 		 478 aa  125  1e-27  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.00000254318  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6232  histidine kinase  38.31 
 
 		 459 aa  124  5e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4140  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.44 
 
 		 438 aa  120  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0125  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.04 
 
 		 438 aa  120  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0421257 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3460  sensor protein QseC  27.47 
 
 		 449 aa  120  6e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4335  sensor protein QseC  27.47 
 
 		 449 aa  120  7e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02898  sensory histidine kinase in two-component regulatory system with QseB  26.93 
 
 		 449 aa  119  9.999999999999999e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.760394  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0674  histidine kinase  26.93 
 
 		 449 aa  119  9.999999999999999e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0430  sensor histidine kinase  28.1 
 
 		 501 aa  119  9.999999999999999e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00032493 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3491  sensor protein QseC  27.15 
 
 		 449 aa  119  9.999999999999999e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3204  sensor protein QseC  26.93 
 
 		 449 aa  119  9.999999999999999e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0671  sensor protein QseC  26.93 
 
 		 449 aa  119  9.999999999999999e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0679985 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02848  hypothetical protein  26.93 
 
 		 449 aa  119  9.999999999999999e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.684564  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0549  transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  32.88 
 
 		 513 aa  118  1.9999999999999998e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0648  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.55 
 
 		 515 aa  119  1.9999999999999998e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2701  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.95 
 
 		 517 aa  119  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.64728  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0957  sensor histidine kinase  32.75 
 
 		 459 aa  117  3e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000000000080857  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1766  sensor histidine kinase  34.59 
 
 		 449 aa  118  3e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00053599  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0137  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.15 
 
 		 438 aa  117  3e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03385  sensor histidine kinase  27.86 
 
 		 411 aa  117  3e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.367883  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2623  histidine kinase  28.7 
 
 		 519 aa  118  3e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0681  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.98 
 
 		 448 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.953793  normal  0.661096 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0829  sensor histidine kinase  32.75 
 
 		 459 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000370117  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1571  sensor histidine kinase  32.75 
 
 		 459 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00000849213  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2575  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.55 
 
 		 519 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0049  sensor histidine kinase  32.75 
 
 		 459 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000000331015  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6227  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.23 
 
 		 462 aa  117  5e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.89546  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4553  sensor protein BasS/PmrB  33.11 
 
 		 349 aa  116  6e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4830  two-component regulatory system sensory histidine kinase  30.62 
 
 		 457 aa  116  6.9999999999999995e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00276208  normal  0.0320947 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4546  sensor protein BasS/PmrB  32.99 
 
 		 359 aa  116  7.999999999999999e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2683  histidine kinase  33.22 
 
 		 517 aa  116  7.999999999999999e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5981  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.55 
 
 		 515 aa  116  7.999999999999999e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0679423 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4637  sensor protein BasS/PmrB  32.99 
 
 		 359 aa  116  7.999999999999999e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.576296  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2327  histidine kinase  29.76 
 
 		 467 aa  116  7.999999999999999e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.205174 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4686  sensor protein BasS/PmrB  32.99 
 
 		 359 aa  116  7.999999999999999e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.103767  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4637  sensor protein BasS/PmrB  32.99 
 
 		 359 aa  116  7.999999999999999e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>